Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57237592

Identifier: 57237592

GI number: 57237592

Start: 529595

End: 532237

Strand: Direct

Name: 57237592

Synonym: CJE0590

Alternate gene names: NA

Gene position: 529595-532237 (Clockwise)

Preceding gene: 57237591

Following gene: 57237593

Centisome position: 29.79

GC content: 25.5

Gene sequence:

>2643_bases
ATGGGAACAAGCTTAAATGAATTAAAAACAGGTAGAGAAAAACTTGAAATCATAAATCAAGTTTTAGCTAGAATAAACAG
CATTTCAGAAGCAATAGACAATACAAGACTTGATGAAGTTGTAGGCTTAAAACAAGCTTGCGAATCTTTAAAAAATGAAT
GTTTAAAATTTAAAAATGATATTGTAGATAAAAATGATGATATTTTAAGCAAATATGATGATATTAATAAAAAATATTCA
AATATAAGTGAAAAATACAACAATGTAAATGCAAAATTTGATTATATTAAAGAAGCGTATGAAGATTTTTCTTTAAATAA
ACAAGAAATACAAAACATTAAAGATTTTTTAGAAAATAATACAGAAGAGTTTGAGAATTTAAAAAAAGATATACAGAAAT
ATGAAGAAATAAAATTTAATTTAGATAATTATATTAATGAAATTAAACAAAATAAAGATTTTGTAAAAGAATATTTTGAT
TTGAACACAAAAATTAAAGATGAAATTTTAAGTGAACTTAATCATGCTTTAGAAATTGTAGATAGCTTACATTTAAATGT
TGATGAATTAAAAGAAATAAAACCTGAATTAATAAGTATTAAAAAAGAAGTAAAAGATTTAGCAAATGAAGCAAAATTAG
TAGTAAGTAAAGCAAGCGAAATTATAAAAAATAAAATTAACACTATATTCTTTGAAAACCAAAGATTAAATCAAGAAATG
ATAGATAGTGTTAAAAAGCTAGAAGAAATTAAATTTGATATTGGAGTTAAATATAAAGAAATAGCTAGTGCATATGAACT
ACTTTTAGAAAGCAAGCAAAATATAGAAGATTTAAGAGAAGTTATAGCTTTATATAAAGAATTTGAAAATGATATAACAT
CTTATTCCCAAATTATAAAAGATTTTAAAAGTAAAATAGAAAATTTAGAACGAGATTTAAAATCACAGTCTGAAAGTATC
TACTCTTCTTTAAATGATAAACAAAATGAAATATTAAAAAAATTAAATGAAGTAAAAAATGAAGCTTTAGTTAAATTTGA
TGAACTTACAGCAAAATGTGAAGGGTATAAAATACATTTTGAGCAAAGTTATGATAGGTTTAATCAAAGAGCTTTGATAG
CTAATGAAGATTTAGGTAGGTTAGCTGAAGTTGCTAAAAAAGAACTAGGTAATGATAAGTTAATTTATGAAACAGAATTA
AAAGTTTTAGCTGAAGAAACAATAAAACAAATGGAAGAAATGCTCAAAGGTTTAAGTGATGAAAGAAATGAAGTCACAGA
GGTTTTTGAAACTCAAAAGAAAGAATTTACTACTCTTGTAGATACTTCTAAAGTTATGATTGACAACTTAAATCATATTT
TTAATGCGAATTATCAAGCAAAGAAAAATGAGTTTAGTATTATTTTTAATGAAAAATTACATAGTTTAAACGAGAATAAG
CAAGATTTTTTAAATGAGCTTGTGAGCGCAAAAGAAAACGGACTCAATAAAATAAATGAAACAAAAGAGCAAAGCCTTAA
TGAAATAATCCAAACAAAAGAACAAGGACTTAATGAGCTTGAAACTAAAAAAGGTGAGTGTATAGATGAGATTGACAATC
AAGCAAGAATCTATGATATAAGTGGTGTTAAGGCTAATGTTGAATATCTTCTTTCTTTGCTTAATGATAAAGATGATGGT
AAAGATGATGGAATTAAAGATGAAATTGCAAATATAGAGCAAGGTATAAAAGATAAAGAACAAGAGCTTGAAGAGATAAA
AAAGCAAATTGAAGAAGCTTTAAATAATAATGATGAATTAAAGCAAAAAAATGAGGAATTAAAGGAAATTAAAAATCAAA
TCGATGAGGCTTTAAGTCAAGAACCACCTGCTGATACAAGCGAACTTGAAGAGAGAAAAGAAGAACTTGAAAATCAAATT
GCTGAGCTTGAACAAGAGATTGCTGGTGAATTAATTAACAAAAAAGAGGAAATTGAAAAAGAACTTGAAGAAGCTAATCA
AAACTTAGAGGACAAAAACAATGAGTTAGAGCAAAATGAAAAAGATAAAAAGCTAATTACACAAAAAGTATTAGATATAA
CTATTAAAACTTTAGAAGCACTTATAGATACAAAAGTAAGTTTAAATGGCGATGAAGAGATAAATGGAAATAAAACTTTT
GCTAATCCTATTTTAGTAAAAGTAGATCCAACTAATGATAACCATTTAACAAATAAAATCTATGTAGATACCACTTTAAA
TACAAAAGCAAATTTAAATGGAGATAATATATTTAATGGCACAAATACTTTTAATCAGGCATTAACTTCTCCAACCAATC
CAACAAATGATAATCACTTAACCAGAAAATGGTATGTAGATTATGGTGGTGGAATTAAAAATCTTGGCACAACTGGCAGT
ATAAATCTAGATTTAAGACAAGCTCAACATTTTATTTTAACAGCAAATGCAGGAACAAGCATAGGAATAGCTAATTTTGG
AGGAGTAGGAAAAAGCGGAACAATAACCATAAATAATTGTCAAAATGTAGTAGCTTTTAATGCCCCTTTTAAATTTAGAA
TAGCTCAAAGTGGATTTAGTGGCACTGAAACTTTTGCTTATTTTTGCATAGCTTCGAATAATGTAAGATTAGTAAGGACT
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGCTTATTTAGATGATAAAAAATGGCTTTTAGCCATGGATGATCTGCTTTTCTTTTGCGAAAAGAGAATTAAAGATAGT
GATTATTATGAAGGTTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGAACTGCCTCCTTCTTTCTAATAATGGCATAGCACTAAATTTACCTCCATCTTTAGGAGGCTCGGTTGCAAATTATA
ATTATATGTTAAAGCTAGAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 880; Mature: 879

Protein sequence:

>880_residues
MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYS
NISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFD
LNTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM
IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESI
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QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNDKDDG
KDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQI
AELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF
ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGS
INLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT

Sequences:

>Translated_880_residues
MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYS
NISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFD
LNTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM
IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESI
YSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHFEQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETEL
KVLAEETIKQMEEMLKGLSDERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENK
QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNDKDDG
KDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQI
AELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF
ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGS
INLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT
>Mature_879_residues
GTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYSN
ISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDL
NTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEMI
DSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESIY
SSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHFEQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELK
VLAEETIKQMEEMLKGLSDERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENKQ
DFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNDKDDGK
DDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQIA
ELEQEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTFA
NPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGSI
NLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101020; Mature: 100889

Theoretical pI: Translated: 4.47; Mature: 4.47

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
0.5 %Met     (Mature Protein)
1.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKND
CCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVDKNDDILSKYDDINKKYSNISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENN
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
TEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDLNTKIKDEILSELNHALEIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHH
IDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIK
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DFKSKIENLERDLKSQSESIYSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
EQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELKVLAEETIKQMEEMLKGLSD
HHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCCH
QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDI
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCHHHHHCCCCEEEEC
SGVKANVEYLLSLLNDKDDGKDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDEL
CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
KQKNEELKEIKNQIDEALSQEPPADTSELEERKEELENQIAELEQEIAGELINKKEEIEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
ELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDTKVSLNGDEEINGNKTF
HHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEE
ANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTTLNTKANLNGDNIFNGTNTFNQALTSPTNPTNDNHL
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TRKWYVDYGGGIKNLGTTGSINLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNC
EEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCC
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CCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure 
GTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKND
CCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVDKNDDILSKYDDINKKYSNISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENN
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
TEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDLNTKIKDEILSELNHALEIV
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DSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEM
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EQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELKVLAEETIKQMEEMLKGLSD
HHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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QDFLNELVSAKENGLNKINETKEQSLNEIIQTKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDI
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QNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT
CCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA