| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237208
Identifier: 57237208
GI number: 57237208
Start: 197273
End: 199267
Strand: Direct
Name: 57237208
Synonym: CJE0197
Alternate gene names: NA
Gene position: 197273-199267 (Clockwise)
Preceding gene: 57237200
Following gene: 57237209
Centisome position: 11.1
GC content: 33.18
Gene sequence:
>1995_bases ATGTACAAAAAACAAAATTTACCAGAACTTACCTTAAGGGGTTTGATTTTGGGAAGTATTTTAACTATTATTTTTACAGC TTCAAATGTATATTTGGGGTTAAAAGTGGGACTTACTTTTTCATCATCAATTCCAGCTGTGGTCATCTCCATGGCGGTTT TGAGTCTTTTTAAGACTTCAAATATTTTAGAAAATAATATGGTTCAAACTCAAGCTTCAGCAGCAGGAACTTTATCATCA GTTATTTTTGTTATCCCAGGACTTTTTATGTGTGGGTATTGGAGTGAATTTCCACTTTGGCAAACTTTTATGATATGTCT TTGTGGTGGCGGACTTGGAGTGCTTTTTACTATACCATTAAGAAGGACTATGGTGGTTGAAAGCAAGCTTGCTTATCCTG AAGGTAGAGCTGCAGCTGAAATTTTAAAAGTAGCCAATAAAGATCAGAGTAGTAAAAAAGGAAAACAAGGCATTAAAGAA ATAGCATTAGGCTCTTTTATAGCTGCTATTTTTAGTTTGTTAAGCAATGGTTTCAAGCTCGCTGCAAGTGAGAGTAATTT TGCTTTTATTTGGAATAAAATGGCTTTTGGTTTTTCTATGGGATATTCTTTGGCACTTTTAGGGGCAGGTTATTTAGTTG GTTTAGCAGGTGCTATAGCTCTTTTTGTAGGTATGTTTTTAGCTTGGGGTATTTTTACTCCCTATCTTTCAAATTTTGAA TTCGATAGTGCAAAAAATGCCGTAGATTTAGCTTCTAGTGTATGGAGTTCTAAAGTAAGGCTTATAGGAACAGGAGCTAT TGCTATAGCAGCGCTTTGGACTTTAATAGAACTTTTAAAACCCGTTATTGAAGGTATTAAAGAAATTGTTAAAAATGTTA AAATTACTAATCAAGAAAAAAATGAAAGAACAAATATAGACCTTTCTTTAAAAAGTATTTTTATACTTTTTGTTTTAATG GTTGTGGGTTTATTTATTACTTTTTATAGTTTTGTTGAAGATGCTAACTTAAGTATTTATTATCAAATGCTATTTTCATT TGTTGGAACTTTAGTTTCTGTTTTAATAGGTTTTTTTGTTGCAGCAGCTTGCGGATATATGGCAGGACTTGTAGGATCTT CTTCTAGTCCTATTTCTGGAATCGGACTTATTGGTGTTATTATTTCTTCTATTGTTTTTTTGGTTTTAGGTGTGGAACTT TTTCAAGATCCTATGCTTTCTAAATTTGCAGTAGCATTAGCTATTTTTACTACTAGTGTTATTTTAGCTACAGCTGCTAT TTCGAATGATAATTTACAAGATTTAAAGACAGGACATTTAGTCGGAGCTACTCCTTGGAAACAACAAGTTGCTTTACTTG TAGGCTGTGTTTTTGGTGCTTTGGCTATAGTTCCTGTTTTAAATTTGCTTTATCAAGCCTATGGTTTTGTCGGAGCAATG CCAAGAGAAGGTATGGATGCTTCATCAGCTTTAGCAGCACCGCAAGCAAATTTAATGAGCACTATCGCCCAAGGAATTTT TCATCACAATATAGAGTGGGGTTATATGGCTCTTGGTGTATTTGTAGGAATTTTAATGATTATTATAGATAAAATTTTAA AAGGAACACAGAAAATGTCTTTGCCGCCTTTAGCCGTTGGAATAGGTATTTACCTTCCCCCTGCTGTAAATATACCTTTA GTTATAGGCGGAATTTTAAAATATATTGTAATGCAACACTTGACTAAAAAGTATGCAAAAAATTCTCATAAAGAAGAAAA ACTTGCAAGTTGTGAGCAAAGAGGCACGCTTTTTGCTTCAGGGCTTATAGTGGGTGAAAGTATTTTTGGGGTAATTATCG CAGGAATTACTGTATTTTCAGTAAGTATGGGTGGTAGTGAAAATCCTTTAGCTTTAAATTTAGCAAATTTTCATGATAGC GAGCTTTTCGCACTTATCTTTTTTGTGGGAGTTGTATTATATTTCATTAAGCGTATTGTTAAAAAAGATGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CGTTTTTTTGTATTATTTTATTTTGCTTTAGAGAAAATTATAAATTTAAACTTATAAGAATATTTTTTAAGTTGAAAGTA AATTTTAAAACGGAGAAATG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTGGGGTTAAAACCCCATTTAATCCATTCTGATATAATTTTTCTTTTGCAATTATCATTCAAGGATTAAAATGGAAA ATTTATATGCTTTAATACTT
Product: OPT family oligopeptide transporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 664; Mature: 664
Protein sequence:
>664_residues MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKE IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL FQDPMLSKFAVALAIFTTSVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL VIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDS ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA
Sequences:
>Translated_664_residues MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKE IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL FQDPMLSKFAVALAIFTTSVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL VIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDS ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA >Mature_664_residues MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTSNILENNMVQTQASAAGTLSS VIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPLRRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKE IALGSFIAAIFSLLSNGFKLAASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEKNERTNIDLSLKSIFILFVLM VVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFVAAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVEL FQDPMLSKFAVALAIFTTSVILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMSLPPLAVGIGIYLPPAVNIPL VIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFASGLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDS ELFALIFFVGVVLYFIKRIVKKDA
Specific function: Unknown
COG id: COG1297
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]
Homologues:
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321324, Length=450, Percent_Identity=22.8888888888889, Blast_Score=67, Evalue=1e-11,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004814 - InterPro: IPR004813 [H]
Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71213; Mature: 71213
Theoretical pI: Translated: 9.24; Mature: 9.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 4.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTS CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NILENNMVQTQASAAGTLSSVIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECH RRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKEIALGSFIAAIFSLLSNGFKL HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE AASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEK CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC NERTNIDLSLKSIFILFVLMVVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVELFQDPMLSKFAVALAIFTTSV HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH ILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM HHHHHHCCCCCHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMS CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCC LPPLAVGIGIYLPPAVNIPLVIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFAS CCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH GLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDSELFALIFFVGVVLYFIKRIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKDA HCCC >Mature Secondary Structure MYKKQNLPELTLRGLILGSILTIIFTASNVYLGLKVGLTFSSSIPAVVISMAVLSLFKTS CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHH NILENNMVQTQASAAGTLSSVIFVIPGLFMCGYWSEFPLWQTFMICLCGGGLGVLFTIPL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECH RRTMVVESKLAYPEGRAAAEILKVANKDQSSKKGKQGIKEIALGSFIAAIFSLLSNGFKL HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE AASESNFAFIWNKMAFGFSMGYSLALLGAGYLVGLAGAIALFVGMFLAWGIFTPYLSNFE EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC FDSAKNAVDLASSVWSSKVRLIGTGAIAIAALWTLIELLKPVIEGIKEIVKNVKITNQEK CCCCCHHHHHHHHHHHCCHHEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC NERTNIDLSLKSIFILFVLMVVGLFITFYSFVEDANLSIYYQMLFSFVGTLVSVLIGFFV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAACGYMAGLVGSSSSPISGIGLIGVIISSIVFLVLGVELFQDPMLSKFAVALAIFTTSV HHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH ILATAAISNDNLQDLKTGHLVGATPWKQQVALLVGCVFGALAIVPVLNLLYQAYGFVGAM HHHHHHCCCCCHHHHCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC PREGMDASSALAAPQANLMSTIAQGIFHHNIEWGYMALGVFVGILMIIIDKILKGTQKMS CCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCC LPPLAVGIGIYLPPAVNIPLVIGGILKYIVMQHLTKKYAKNSHKEEKLASCEQRGTLFAS CCCHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH GLIVGESIFGVIIAGITVFSVSMGGSENPLALNLANFHDSELFALIFFVGVVLYFIKRIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKDA HCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]