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The map label for this gene is 57236920

Identifier: 57236920

GI number: 57236920

Start: 6707

End: 8008

Strand: Direct

Name: 57236920

Synonym: CJE0006

Alternate gene names: NA

Gene position: 6707-8008 (Clockwise)

Preceding gene: 57236917

Following gene: 57236921

Centisome position: 0.38

GC content: 31.72

Gene sequence:

>1302_bases
TTGACTTTACTTACTAATCCTATCATTATCAGTGTTGTTTTGATGACTTTACTTTGTTTGTTTCGTTTTAATGTACTTTT
GAGTCTTTTGATCTCAGCTCTTGTTGCAGGTGTATTTTCTCATCTTGAACTCGTAGATACTATGAATATACTTATAAGCG
GAATGAAAGAAAATTTAAAAACAGCTCTTAGCTATATACTTTTAGGGGCCATTGCCGCAGCGATTTCAAAGACAAATTTA
ACTGCATATTTGATTAAGATAGTAAGTCATTTTATATCTCATAAAAAATATTTATTGCTTTTGTCTATAGCTTTGATTTC
TTGTTTTTCTCAAAATTTAATTCCTATTCATGTAGCTTTTATACCTTTGTTGATTCCACCTCTTTTAAGTCTTTTTAATA
AACTTAAAATCGATCGTAGAGCGGTTGCTTGTGCTTTAACTTTTGGACTTACTACGCCTTATATGGTTTTGCCAGTAGGC
TTTGGACTTACTTTTCAAGATCTTTTAAAAGATAATTTAAATGCAAATAATGTAAGTGTATCTTTAAATGATGTTACAAA
TACTATGTATTTCGCTGCTATTTGTATGATAGCAGGACTTTTTCTAGCGCTTTTTGTGTTTTATCGTAAGTCAAGAGAGT
ATCAAGAAGTAGAAATTGCTAAAGTGGATTTAGAAAATCTTGAAATGACGCGTAAAGAATGGGGTGTTTTAGCTGGGCTT
GTTTTAACTTTAATTTTGCAAATTTTGACTATGAATTTACCTTTATCAGGGCTTTTGGGTTTTGTTTTAATGGTTATTTT
GGGTGGAGTTGAATTTTCAAAAGTCAATGAAGTTTTTGATGATGGGCTTAAAATGATGGGTTTTATAGCTTTTGTTATCC
TTGTTGCTGCAGGATATGGAGAAGTTTTAAAAGAAAGTGGATCAGTAGTAGATCTTGTAAATTCAGTCGTTCCTTGGATG
GAGCAAAGTAAATTTTTAGCAGTATTTTTCATGCTTTTAATAGGACTTATCATCACTATGGGTATAGGTACTTCTTTTGG
AACTATACCTATCATAGCTACGCTTTTTTGTCCTATTTGTTTGGAACTTGGTTTTAGTACAGCACTTATTATATTTATCT
TAGGAGTAGCAGGAGCTTTAGGAGATGCAGGAAGTCCAGCCAGTGAAACAACCATGGGAACTACTGTAGGATTAAATGCT
GATAAACAACACGATCACATTAAAGATACTTGCATACCAACTTTTATTTTTTATAATGGCCCATTATTGATTTTAGGTAG
TATTATCGCCATGTTTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTACATATTAAAATAAAATCATCATATGTTCGAGTTTTATTACATTTTAACTAAGTTTTTTCTACAATTAAATTTTTA
AAATTATTTAAGGAATGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTACAAATCTATCAAAATATTTTTTAATTTATTTATTTTTAAGATAAAAATTATATCGATTTTAAAAAAATGTATGC
TATAATCCTTATAAAGCTAA

Product: Na+/H+ antiporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF3 [H]

Number of amino acids: Translated: 433; Mature: 432

Protein sequence:

>433_residues
MTLLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLKTALSYILLGAIAAAISKTNL
TAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAFIPLLIPPLLSLFNKLKIDRRAVACALTFGLTTPYMVLPVG
FGLTFQDLLKDNLNANNVSVSLNDVTNTMYFAAICMIAGLFLALFVFYRKSREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFVLMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYGEVLKESGSVVDLVNSVVPWM
EQSKFLAVFFMLLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPICLELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNA
DKQHDHIKDTCIPTFIFYNGPLLILGSIIAMFL

Sequences:

>Translated_433_residues
MTLLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLKTALSYILLGAIAAAISKTNL
TAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAFIPLLIPPLLSLFNKLKIDRRAVACALTFGLTTPYMVLPVG
FGLTFQDLLKDNLNANNVSVSLNDVTNTMYFAAICMIAGLFLALFVFYRKSREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFVLMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYGEVLKESGSVVDLVNSVVPWM
EQSKFLAVFFMLLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPICLELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNA
DKQHDHIKDTCIPTFIFYNGPLLILGSIIAMFL
>Mature_432_residues
TLLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLKTALSYILLGAIAAAISKTNLT
AYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAFIPLLIPPLLSLFNKLKIDRRAVACALTFGLTTPYMVLPVGF
GLTFQDLLKDNLNANNVSVSLNDVTNTMYFAAICMIAGLFLALFVFYRKSREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGLV
LTLILQILTMNLPLSGLLGFVLMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYGEVLKESGSVVDLVNSVVPWME
QSKFLAVFFMLLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPICLELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNAD
KQHDHIKDTCIPTFIFYNGPLLILGSIIAMFL

Specific function: Unknown

COG id: COG2056

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001991
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47049; Mature: 46918

Theoretical pI: Translated: 6.24; Mature: 6.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
3.9 %Met     (Translated Protein)
5.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
5.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TALSYILLGAIAAAISKTNLTAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
IPLLIPPLLSLFNKLKIDRRAVACALTFGLTTPYMVLPVGFGLTFQDLLKDNLNANNVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEE
SLNDVTNTMYFAAICMIAGLFLALFVFYRKSREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFVLMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
EVLKESGSVVDLVNSVVPWMEQSKFLAVFFMLLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPIC
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNADKQHDHIKDTCIPTFIFYNG
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLLILGSIIAMFL
HHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure 
TLLTNPIIISVVLMTLLCLFRFNVLLSLLISALVAGVFSHLELVDTMNILISGMKENLK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TALSYILLGAIAAAISKTNLTAYLIKIVSHFISHKKYLLLLSIALISCFSQNLIPIHVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
IPLLIPPLLSLFNKLKIDRRAVACALTFGLTTPYMVLPVGFGLTFQDLLKDNLNANNVSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEE
SLNDVTNTMYFAAICMIAGLFLALFVFYRKSREYQEVEIAKVDLENLEMTRKEWGVLAGL
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLTLILQILTMNLPLSGLLGFVLMVILGGVEFSKVNEVFDDGLKMMGFIAFVILVAAGYG
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
EVLKESGSVVDLVNSVVPWMEQSKFLAVFFMLLIGLIITMGIGTSFGTIPIIATLFCPIC
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LELGFSTALIIFILGVAGALGDAGSPASETTMGTTVGLNADKQHDHIKDTCIPTFIFYNG
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLLILGSIIAMFL
HHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12620739; 8021208 [H]