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The map label for this gene is exoT [H]

Identifier: 21227237

GI number: 21227237

Start: 1338694

End: 1340172

Strand: Reverse

Name: exoT [H]

Synonym: MM_1135

Alternate gene names: 21227237

Gene position: 1340172-1338694 (Counterclockwise)

Preceding gene: 21227238

Following gene: 21227235

Centisome position: 32.72

GC content: 37.12

Gene sequence:

>1479_bases
GTGATGTCATATCAAAAATTTGCAAGGGATGTAGGCTTTATCGGTACAGTTCAGATACTTACGAGTCTGAGCAGCTTTTT
TTTACTCCCTATTATCACAAAAACCCTTGGAGCGTATGATTACGGACTCTGGGCGCAGATAAATATTACAGTATCTTTAA
TTTCTTCCCTTGCACTTATGGGACTTTCCATGAGTTTCGTCAGATTTTTATCTTCCGAAACTGATAAGAAGAAAATAAGA
GAAGCAGTATACTCAATTCTTTTTTTTGTCACAGTATCGGGCTTTCTGGCTTCATTTGTGTTATATACTTTTGCAGAACC
ACTTGCAACTTTTGGCTTTAAGGATCCTGCAGCAACCTATTTTGTCCAGGCAGGCTCCCTGTTAATCCTTGTGAATGTAA
TAGAGTCCATATCTCTTTTTTATTTCAGGATTTTCAGGCAGATTGAAAAATATTCTTATTTTACATTTTTTGAAACTTTT
GGTAAACTGCTATTTATATTGATTTTCCTTAAAATGGGATATGGACTTCTTGGAGTAATTACCGCTACTTTAATTGTACA
GGGACTGATATTTTTAATTACCTTTATCATTATAATTTCGCAGATAGGATTTGTCATACCGCGGTTTACTTATATAAAAG
AATATCTGGAGTTTTCTCTTCCCTTAACCCCAAATGCGCTTATCAGGTGGGTTACGGAATCGAGTGACAGGTATATGGTC
ACTTATTTCCTTGGTCTTGGCAGCGTAGGTATATATTCTGCGGCATGTTCAATTGGAAACCTTATTCAGCTCTTTGTAAA
CCCGTTACAGCTTATTCTCTTCCCTGAGCTTTCAAAGCTATTTGATCAGAATAGAATGGATGAAGTAAGAATTTACATGT
CCCATTCTCTGAGGTATTTCCTTATCATCTCTATCCCGGCAGTCTTTGGACTTTCAGCTCTTGCAAAACCTTTGCTTGCG
GTTCTTACCACTCCGGATTTTATTTCTGGCTGGTTTGTCATCCCTATTATCGCTTTTGCCGGACTTATGGCAGGAATATT
CCAGATTTTTATAAATACGATGTACCTTATTAAAGAAACGAGACCTGCTACATATATCAATATCATTGCCGCAGTTTCGA
ACGTATTAATAAATCTTATTCTTATTCCCATACCTTCAATAGGAATTCTGGGTGCAGCTTTTTCCACCCTCGTATCATAT
TTTTTGATGGCTGCATTTTGCGTTCACATTTCTCTGAAACACTTCAAGCTCGATTTTTATTATATGGATATTGCAAAAAG
TATCCTCTCGTCCATTGCAATGTACCTTTTTGTTTCGAGCTTTTCCATTTCAGGCATTCTTGAGCTATTTGAAGCGGCAG
GAGCAGGTACGCTAATCTATCTGATTGTAATGTTTATGGTTGGCGGATTCACTGACCATGAAATGTACTTAATAAAAAGA
TATTTATTCAGGTCAGAGGTGAGCCCTGACACCAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTGAGAAGTACTCTCGAATTTTCGGCCCCTTTTCTTACAGTCAAAAGGTGTTTTTGATGCCATTTACAGCGGAAAAGAG
GCAGTTCCTTTTAAGGTGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACATTCCCAATTTACCGTATTTTGGTTTTTTTAAATGGGAAACCACAGTACCAGACGCTAACGCTAACAGATTCTTTTCA
TCTCCGAGAATTACTATAGA

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 492; Mature: 492

Protein sequence:

>492_residues
MMSYQKFARDVGFIGTVQILTSLSSFFLLPIITKTLGAYDYGLWAQINITVSLISSLALMGLSMSFVRFLSSETDKKKIR
EAVYSILFFVTVSGFLASFVLYTFAEPLATFGFKDPAATYFVQAGSLLILVNVIESISLFYFRIFRQIEKYSYFTFFETF
GKLLFILIFLKMGYGLLGVITATLIVQGLIFLITFIIIISQIGFVIPRFTYIKEYLEFSLPLTPNALIRWVTESSDRYMV
TYFLGLGSVGIYSAACSIGNLIQLFVNPLQLILFPELSKLFDQNRMDEVRIYMSHSLRYFLIISIPAVFGLSALAKPLLA
VLTTPDFISGWFVIPIIAFAGLMAGIFQIFINTMYLIKETRPATYINIIAAVSNVLINLILIPIPSIGILGAAFSTLVSY
FLMAAFCVHISLKHFKLDFYYMDIAKSILSSIAMYLFVSSFSISGILELFEAAGAGTLIYLIVMFMVGGFTDHEMYLIKR
YLFRSEVSPDTK

Sequences:

>Translated_492_residues
MMSYQKFARDVGFIGTVQILTSLSSFFLLPIITKTLGAYDYGLWAQINITVSLISSLALMGLSMSFVRFLSSETDKKKIR
EAVYSILFFVTVSGFLASFVLYTFAEPLATFGFKDPAATYFVQAGSLLILVNVIESISLFYFRIFRQIEKYSYFTFFETF
GKLLFILIFLKMGYGLLGVITATLIVQGLIFLITFIIIISQIGFVIPRFTYIKEYLEFSLPLTPNALIRWVTESSDRYMV
TYFLGLGSVGIYSAACSIGNLIQLFVNPLQLILFPELSKLFDQNRMDEVRIYMSHSLRYFLIISIPAVFGLSALAKPLLA
VLTTPDFISGWFVIPIIAFAGLMAGIFQIFINTMYLIKETRPATYINIIAAVSNVLINLILIPIPSIGILGAAFSTLVSY
FLMAAFCVHISLKHFKLDFYYMDIAKSILSSIAMYLFVSSFSISGILELFEAAGAGTLIYLIVMFMVGGFTDHEMYLIKR
YLFRSEVSPDTK
>Mature_492_residues
MMSYQKFARDVGFIGTVQILTSLSSFFLLPIITKTLGAYDYGLWAQINITVSLISSLALMGLSMSFVRFLSSETDKKKIR
EAVYSILFFVTVSGFLASFVLYTFAEPLATFGFKDPAATYFVQAGSLLILVNVIESISLFYFRIFRQIEKYSYFTFFETF
GKLLFILIFLKMGYGLLGVITATLIVQGLIFLITFIIIISQIGFVIPRFTYIKEYLEFSLPLTPNALIRWVTESSDRYMV
TYFLGLGSVGIYSAACSIGNLIQLFVNPLQLILFPELSKLFDQNRMDEVRIYMSHSLRYFLIISIPAVFGLSALAKPLLA
VLTTPDFISGWFVIPIIAFAGLMAGIFQIFINTMYLIKETRPATYINIIAAVSNVLINLILIPIPSIGILGAAFSTLVSY
FLMAAFCVHISLKHFKLDFYYMDIAKSILSSIAMYLFVSSFSISGILELFEAAGAGTLIYLIVMFMVGGFTDHEMYLIKR
YLFRSEVSPDTK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55357; Mature: 55357

Theoretical pI: Translated: 8.93; Mature: 8.93

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8226645; 8226646; 8118055; 11481431 [H]