| Definition | Thermoanaerobacter tengcongensis MB4, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003869 |
| Length | 2,689,445 |
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The map label for this gene is 20808943
Identifier: 20808943
GI number: 20808943
Start: 2480655
End: 2481995
Strand: Reverse
Name: 20808943
Synonym: TTE2594
Alternate gene names: NA
Gene position: 2481995-2480655 (Counterclockwise)
Preceding gene: 20808944
Following gene: 20808942
Centisome position: 92.29
GC content: 36.02
Gene sequence:
>1341_bases TTGAGGGATCCGGAAAAACTCAATAAAAATTTAAGGAGGGTTTTTATGAGTGTCCAAGGTATTTTAATCATTTTAGTGTT TGTCTTCTTTGCATACTTAATGGTTACGCAAAAAATGCCTGCGCTTTTAGCACTACCATCAATGGCTATTGTTATTGCTA TAATAGCTGGGATGCCTTTAAATTACATTTTTTCCAACATAATTGGAGCTGGCGCTGTAAGACTTCAGGGTGCTATGGCC GCTGCAATATTTGGCGCAATATTGGCGCAAATAATAAACAAAACGGGAATTTCTGATAATATTGTGAGAACTGCTGCTGA GTTAGGAGGAGATAGACCAATTGCTGTTGCATTAGCTATAACTTTTGCAGTTGCTTTAATATTTACTTCTCTTGGTGGAT TAGGTTCTGTTATAATGGTAGGAACTATTGTTTTACCTATTTTAATGTCGGTAGGAATCGAACCAGTTATTGCTGCTTCA TTGTTGCTCATGGGGTTAAATTTAGGAGGTTTATTTAATGTTATGAACTATGCTTTTTACCAAAGTGCTTTAAACCTTGA TATGGCAACGATAAAAAGTTTTGCATTAGCTTTTGGAATAATTGCAGCAGTTGTTCTTCTATTGTTTATATTTATCAATG TACCGAAAAAGAAGACTGTTGCTGCTTGGGCGATGTCCACAGAAACCCATGAGGAAAAGCCTCGTGTTTCTTGGTATGCT CTTTTGACACCAATCATACCCGTTTTACTGCTTTTTATATGGCCATTAATCTTTAAAGATGCAGAAGGTAAACCAATTCA GATAGATATCATATCAGCAATGTTAATAGGTATTCTTTATGGTATTTTGACAACGAAACCTCGTGAAATAAAAAATCTAC TTACAAGCTCAATTATTGAGGGAATAAAAGATGTCGCACCTGCGCTGGGTTTGATGATAGGGATTGGTATGCTTTTACTT GCTGTTATGGATAAAACAACTGCAGCACTAATTTCTCCAATTATTTCCAAAATCTTACCAACTTCGAAAATTGGATATGT ATTATTTTTTATTATATTATCACCACTAGCACTTTACAGAGGACCTTTAAACTTATGGGGACTGGGGAGTGGTGTCGCTG CTCTCATGATTTCAGCGGGTACATTACCCCCTCAGGCTATTATGGGTGCATTGATTGCTACAGGCAATATTCAAGGGGTG TGCGACCCTACTAATACTCATAACGTTTGGACTGCATACTTTACAAATACGGATACAACGACCATTTTGAAGAAGACATT ACCATATATGTTAATTGTTGTATTATTAGATATTATATACGTAGCGCTTTTTAAATGGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTCCTATTTATAATTTTCTTTGCTGAAAATACTGGAAAACAAATAAAACAAGGGAATCCCTTTGGAAATAAATATGGAA TCCCTCAATCAGTATGAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGAAGTAAAGGGGAGGGGGGTTATTCCCCCCTTTTATAGGATAATATAACTATAAATTTTTTGAGGAGGGCAGATACA GTGCTAAAGATAGCGTATAT
Product: putative transporter protein
Products: NA
Alternate protein names: Transporter Protein; H+/Gluconate Symporter Related Permease; H+/Gluconate Symporter; H+/Gluconate Symporter Or Related Permease; Divalent Ion Symporter; High-Affinity Gluconate Transporter; C4-Dicarboxylate Anaerobic Carrier-Like Protein
Number of amino acids: Translated: 446; Mature: 446
Protein sequence:
>446_residues MRDPEKLNKNLRRVFMSVQGILIILVFVFFAYLMVTQKMPALLALPSMAIVIAIIAGMPLNYIFSNIIGAGAVRLQGAMA AAIFGAILAQIINKTGISDNIVRTAAELGGDRPIAVALAITFAVALIFTSLGGLGSVIMVGTIVLPILMSVGIEPVIAAS LLLMGLNLGGLFNVMNYAFYQSALNLDMATIKSFALAFGIIAAVVLLLFIFINVPKKKTVAAWAMSTETHEEKPRVSWYA LLTPIIPVLLLFIWPLIFKDAEGKPIQIDIISAMLIGILYGILTTKPREIKNLLTSSIIEGIKDVAPALGLMIGIGMLLL AVMDKTTAALISPIISKILPTSKIGYVLFFIILSPLALYRGPLNLWGLGSGVAALMISAGTLPPQAIMGALIATGNIQGV CDPTNTHNVWTAYFTNTDTTTILKKTLPYMLIVVLLDIIYVALFKW
Sequences:
>Translated_446_residues MRDPEKLNKNLRRVFMSVQGILIILVFVFFAYLMVTQKMPALLALPSMAIVIAIIAGMPLNYIFSNIIGAGAVRLQGAMA AAIFGAILAQIINKTGISDNIVRTAAELGGDRPIAVALAITFAVALIFTSLGGLGSVIMVGTIVLPILMSVGIEPVIAAS LLLMGLNLGGLFNVMNYAFYQSALNLDMATIKSFALAFGIIAAVVLLLFIFINVPKKKTVAAWAMSTETHEEKPRVSWYA LLTPIIPVLLLFIWPLIFKDAEGKPIQIDIISAMLIGILYGILTTKPREIKNLLTSSIIEGIKDVAPALGLMIGIGMLLL AVMDKTTAALISPIISKILPTSKIGYVLFFIILSPLALYRGPLNLWGLGSGVAALMISAGTLPPQAIMGALIATGNIQGV CDPTNTHNVWTAYFTNTDTTTILKKTLPYMLIVVLLDIIYVALFKW >Mature_446_residues MRDPEKLNKNLRRVFMSVQGILIILVFVFFAYLMVTQKMPALLALPSMAIVIAIIAGMPLNYIFSNIIGAGAVRLQGAMA AAIFGAILAQIINKTGISDNIVRTAAELGGDRPIAVALAITFAVALIFTSLGGLGSVIMVGTIVLPILMSVGIEPVIAAS LLLMGLNLGGLFNVMNYAFYQSALNLDMATIKSFALAFGIIAAVVLLLFIFINVPKKKTVAAWAMSTETHEEKPRVSWYA LLTPIIPVLLLFIWPLIFKDAEGKPIQIDIISAMLIGILYGILTTKPREIKNLLTSSIIEGIKDVAPALGLMIGIGMLLL AVMDKTTAALISPIISKILPTSKIGYVLFFIILSPLALYRGPLNLWGLGSGVAALMISAGTLPPQAIMGALIATGNIQGV CDPTNTHNVWTAYFTNTDTTTILKKTLPYMLIVVLLDIIYVALFKW
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47843; Mature: 47843
Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 4.5 %Met (Translated Protein) 4.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 4.5 %Met (Mature Protein) 4.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRDPEKLNKNLRRVFMSVQGILIILVFVFFAYLMVTQKMPALLALPSMAIVIAIIAGMPL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH NYIFSNIIGAGAVRLQGAMAAAIFGAILAQIINKTGISDNIVRTAAELGGDRPIAVALAI HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH TFAVALIFTSLGGLGSVIMVGTIVLPILMSVGIEPVIAASLLLMGLNLGGLFNVMNYAFY HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH QSALNLDMATIKSFALAFGIIAAVVLLLFIFINVPKKKTVAAWAMSTETHEEKPRVSWYA HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH LLTPIIPVLLLFIWPLIFKDAEGKPIQIDIISAMLIGILYGILTTKPREIKNLLTSSIIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH GIKDVAPALGLMIGIGMLLLAVMDKTTAALISPIISKILPTSKIGYVLFFIILSPLALYR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GPLNLWGLGSGVAALMISAGTLPPQAIMGALIATGNIQGVCDPTNTHNVWTAYFTNTDTT CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHH TILKKTLPYMLIVVLLDIIYVALFKW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MRDPEKLNKNLRRVFMSVQGILIILVFVFFAYLMVTQKMPALLALPSMAIVIAIIAGMPL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH NYIFSNIIGAGAVRLQGAMAAAIFGAILAQIINKTGISDNIVRTAAELGGDRPIAVALAI HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH TFAVALIFTSLGGLGSVIMVGTIVLPILMSVGIEPVIAASLLLMGLNLGGLFNVMNYAFY HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH QSALNLDMATIKSFALAFGIIAAVVLLLFIFINVPKKKTVAAWAMSTETHEEKPRVSWYA HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH LLTPIIPVLLLFIWPLIFKDAEGKPIQIDIISAMLIGILYGILTTKPREIKNLLTSSIIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH GIKDVAPALGLMIGIGMLLLAVMDKTTAALISPIISKILPTSKIGYVLFFIILSPLALYR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GPLNLWGLGSGVAALMISAGTLPPQAIMGALIATGNIQGVCDPTNTHNVWTAYFTNTDTT CCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHH TILKKTLPYMLIVVLLDIIYVALFKW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA