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Definition Thermoanaerobacter tengcongensis MB4, complete genome.
Accession NC_003869
Length 2,689,445

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The map label for this gene is 20808397

Identifier: 20808397

GI number: 20808397

Start: 1942483

End: 1943982

Strand: Reverse

Name: 20808397

Synonym: TTE1994

Alternate gene names: NA

Gene position: 1943982-1942483 (Counterclockwise)

Preceding gene: 20808398

Following gene: 20808396

Centisome position: 72.28

GC content: 33.73

Gene sequence:

>1500_bases
ATGTCTCAGGATGAAATAAAGAAATTGAGAGAAAAACTTCACGAGTCTTTGAAAAGCCCTGAGAAATTTTCTCAATTTCT
GAAGGAGATAATAAAAAAGCAGAAAGAGATAGTGCAAATTATAAGTTTATTGGAAGCTTACAACGAAGCTACTTATTTAA
ACTACGTGCTTTTTAGAAAAAGGGAGGTTGTTAAGGCTTTAGAATACATGGATGATAAAAATAGGGGTATTTTAGAGGTA
GTGAAAAACGTAGTAAACGACGTATATCATTACCAGGTTGCAGAAAAAAAGATAAGGGATAACGTAGAAAAGGCGATGAG
GGAATACAAAGACTATTTGGAAGACGCAATTGAGGTGTTATACGGCTATTACGTTGAGGCAAAATATGTGAATGAAGTTT
TTAGTGATAAGCTGAGGGATTCGTTTGCTGCAGAGGCTATAGACGAGGAGAGTTTTTATGAAAGCGTTTTTAATTTTGTG
AATGAGGTAGAGGAAGAAAAGGAAGAAAGGATAAAAGAAATTTTGAGTTCTCTTCCATTTGCTATGTCTAGAAGGCGTTT
TTATGATTATTTGCAAAAGGCTTTAGAAAGAGAATATTCTACCTATGAATCCTTTTTAGCCAGCGTGATAAACATTGAAG
AAAATTTCTATGGCAAACTGGTAGAAGGATATGGAGATATTTTCCCTTCTATAGCAAGTAAGATTGAAAGCCTTCAATCT
CTGGATTTAAAGCTTCTTTCAAAAGAAGAGATAGAAATGTATTTAGAAGAGAGCTCAGAGCTTGTAAAAGCGATTCACTC
ATTAAGAGAAATAATTTTTTCTGTACGTCGTGTAATCAACAGGCTTTTAATAGTTTTTTTAGGAGAAGAGGATATTCAAT
CTCTGATAAAAAAAGAACCTTTTATAAAGCAGTATATAGAGTTTTACAAGCGGCTTATGAGAAATGAGATAAAAAGCAGT
AAAGAAATTGAAAAAAGTGTTAAAAAGTGCGACAGTATCATTTCAAGCTGGTATTTTGAGCTTTACAGGTATAATTTGCT
TTTAGGAGAGATAGAGTCTTCTGACCACAATTTGATAGAGATCGTGGATGAAAGCATAATTGGGGAAGTAGAAATTCTAG
CCGAATATGAGAACTTGCTCAATGACGCTACTGAGATAGTGATTGAAAGCGATAAGTTTGGAGAGGACCCTGTAGATGAG
ATGATAATAAAAAACGAGATAAAAAATGTGATCTATTTAATCGAGGAATTGTCTAAAAAGATGACAAATGAGTACAGGAA
AGCTAGGTTAAAGAGGCTAATGGGCATAATTCCTGTCCCAGTGGATTTTGACAAGGAGCTTCTTCACTATGTGAGAAACG
CTTTGGAACTTGATAATTCTTACAGCAGGAAGCTTTCTTACATGCACACCATTAAGAAAAAAATGGATCTTTACAGAGAA
CTTAGAAAGCAGAAGAATTTTTATGAGAGTTTAATAAAAAATTCAAAGGATGTAATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTTTAAAGGCCTGGCCTGTGCCGGGCTTTTTTTAATTGATTTAAAATGAAAAAAAGAATATAATCAAATTATAGAAAAG
TATTGCAAAGAGGTGTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTATGAGGAAAGTGAAAAAAATCTTTATATGGGTTGTCACTTTTGTAATGGCTTTTTCATTAATTTTGTGGTTATTTTTA
TTTAATTTGGAACATGTAGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 499; Mature: 498

Protein sequence:

>499_residues
MSQDEIKKLREKLHESLKSPEKFSQFLKEIIKKQKEIVQIISLLEAYNEATYLNYVLFRKREVVKALEYMDDKNRGILEV
VKNVVNDVYHYQVAEKKIRDNVEKAMREYKDYLEDAIEVLYGYYVEAKYVNEVFSDKLRDSFAAEAIDEESFYESVFNFV
NEVEEEKEERIKEILSSLPFAMSRRRFYDYLQKALEREYSTYESFLASVINIEENFYGKLVEGYGDIFPSIASKIESLQS
LDLKLLSKEEIEMYLEESSELVKAIHSLREIIFSVRRVINRLLIVFLGEEDIQSLIKKEPFIKQYIEFYKRLMRNEIKSS
KEIEKSVKKCDSIISSWYFELYRYNLLLGEIESSDHNLIEIVDESIIGEVEILAEYENLLNDATEIVIESDKFGEDPVDE
MIIKNEIKNVIYLIEELSKKMTNEYRKARLKRLMGIIPVPVDFDKELLHYVRNALELDNSYSRKLSYMHTIKKKMDLYRE
LRKQKNFYESLIKNSKDVI

Sequences:

>Translated_499_residues
MSQDEIKKLREKLHESLKSPEKFSQFLKEIIKKQKEIVQIISLLEAYNEATYLNYVLFRKREVVKALEYMDDKNRGILEV
VKNVVNDVYHYQVAEKKIRDNVEKAMREYKDYLEDAIEVLYGYYVEAKYVNEVFSDKLRDSFAAEAIDEESFYESVFNFV
NEVEEEKEERIKEILSSLPFAMSRRRFYDYLQKALEREYSTYESFLASVINIEENFYGKLVEGYGDIFPSIASKIESLQS
LDLKLLSKEEIEMYLEESSELVKAIHSLREIIFSVRRVINRLLIVFLGEEDIQSLIKKEPFIKQYIEFYKRLMRNEIKSS
KEIEKSVKKCDSIISSWYFELYRYNLLLGEIESSDHNLIEIVDESIIGEVEILAEYENLLNDATEIVIESDKFGEDPVDE
MIIKNEIKNVIYLIEELSKKMTNEYRKARLKRLMGIIPVPVDFDKELLHYVRNALELDNSYSRKLSYMHTIKKKMDLYRE
LRKQKNFYESLIKNSKDVI
>Mature_498_residues
SQDEIKKLREKLHESLKSPEKFSQFLKEIIKKQKEIVQIISLLEAYNEATYLNYVLFRKREVVKALEYMDDKNRGILEVV
KNVVNDVYHYQVAEKKIRDNVEKAMREYKDYLEDAIEVLYGYYVEAKYVNEVFSDKLRDSFAAEAIDEESFYESVFNFVN
EVEEEKEERIKEILSSLPFAMSRRRFYDYLQKALEREYSTYESFLASVINIEENFYGKLVEGYGDIFPSIASKIESLQSL
DLKLLSKEEIEMYLEESSELVKAIHSLREIIFSVRRVINRLLIVFLGEEDIQSLIKKEPFIKQYIEFYKRLMRNEIKSSK
EIEKSVKKCDSIISSWYFELYRYNLLLGEIESSDHNLIEIVDESIIGEVEILAEYENLLNDATEIVIESDKFGEDPVDEM
IIKNEIKNVIYLIEELSKKMTNEYRKARLKRLMGIIPVPVDFDKELLHYVRNALELDNSYSRKLSYMHTIKKKMDLYREL
RKQKNFYESLIKNSKDVI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59431; Mature: 59300

Theoretical pI: Translated: 4.86; Mature: 4.86

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SQDEIKKLREKLHESLKSPEKFSQFLKEIIKKQKEIVQIISLLEAYNEATYLNYVLFRK
CHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REVVKALEYMDDKNRGILEVVKNVVNDVYHYQVAEKKIRDNVEKAMREYKDYLEDAIEVL
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGYYVEAKYVNEVFSDKLRDSFAAEAIDEESFYESVFNFVNEVEEEKEERIKEILSSLPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
AMSRRRFYDYLQKALEREYSTYESFLASVINIEENFYGKLVEGYGDIFPSIASKIESLQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDLKLLSKEEIEMYLEESSELVKAIHSLREIIFSVRRVINRLLIVFLGEEDIQSLIKKEP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCH
FIKQYIEFYKRLMRNEIKSSKEIEKSVKKCDSIISSWYFELYRYNLLLGEIESSDHNLIE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
IVDESIIGEVEILAEYENLLNDATEIVIESDKFGEDPVDEMIIKNEIKNVIYLIEELSKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MTNEYRKARLKRLMGIIPVPVDFDKELLHYVRNALELDNSYSRKLSYMHTIKKKMDLYRE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRKQKNFYESLIKNSKDVI
HHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA