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The map label for this gene is PerM2 [C]

Identifier: 20807695

GI number: 20807695

Start: 1245555

End: 1246574

Strand: Direct

Name: PerM2 [C]

Synonym: TTE1245

Alternate gene names: 20807695

Gene position: 1245555-1246574 (Clockwise)

Preceding gene: 20807694

Following gene: 20807696

Centisome position: 46.31

GC content: 32.45

Gene sequence:

>1020_bases
ATGAAAAACAAGGTTTACATTATATGGTTTTTGATTGTATTAGGGATTTTTTATATTTTCATAAAAAACTGGGTGAGTAT
CAAAAGCATACTTTCCCCTTTTTTTGTTTCTATACTTATGGCGTATCTTTTGAATCCATTTGTAAGATACTTTACTTCAA
AAGGTTTTACACTAACTTTTTCTATACTGACAGTGTTTTTCATAGTGGCAGCAGCAATTTTGATTTTTTCTTACTACGTT
TTTCCTATTTTAATAGGAGAACTAGCTTCTTTTGTGAAAGTGGCTCCAAAATATTTGCGAGAATTAAATTCGGTTTTAAA
TCATTTTAAATTTAATTACCTTTCTAATCTTCCACCTAATATTGAAAGTGCTGTAGAAAAAAATTTAAATGTGCTAACTG
CAGGAGTTGCTTCCTCTATTGATACATTTTTTAAATCTGCAGTTGGAATGCTGAAAGGATTTGTAGACATTGTAATTATT
CCAATTCTTACCTTCTATTTTTTGAAAGATAAAGACATTTTTTTGACGCAGGTTGAGTGTTTGATTCCATTAAAATACCG
AGAAAAAATTTTTTCACTGCTTTTTAAAGTGGACAGGATATTGAGCAAATACTTGAGAGCGCAAGCTTATTTGTCTATTT
TTGTAGGAGCGTTTACAGGTTTAGGATTGGCTCTCGTAAAAGTAAGATATGCTTTTTTGTTGGGAGTGATAGCAGGTATT
TTAAATATAATTCCGTATATTGGGCCAATTCTTTCTATCCTTCCAGCGGTTGCGATTGGGCTTATGGATTCAATTTTTAA
AGGCTTGTGGGCTTTTGCCATCTGCCTTCTAATACAGCAGGTTGAAAATGTGTTTGTGACTCCTAAAGTGATGGGAGATA
GTGTTGGACTACACCCTGTTACAGTAATTTTTGTGCTTATTTTAGGAGAAGAACTTTTTGGAGTATGGGGGCTTTTATTC
TCTGTGCCTGTTGCGGCAATTTTAAAGGAGGTTTTTACAGAAATTTTTTTAGACAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTCCAAAGATGGACCTTAAAAAGTACAGGCGTTACAAGGACATGTTTGAGAAAAATTTTTCAAAAGTGTGGAGGGTA
GTTAAACAGATAAAATTGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACATAGTGTAAAATTATCGTAGGATTTTTAAAGTGAAAAAACAAGAGACAACCCCTGTGATAAAATAGATTGTGGAAAAC
AAAAAACACGAAAGGGGTGT

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 339; Mature: 339

Protein sequence:

>339_residues
MKNKVYIIWFLIVLGIFYIFIKNWVSIKSILSPFFVSILMAYLLNPFVRYFTSKGFTLTFSILTVFFIVAAAILIFSYYV
FPILIGELASFVKVAPKYLRELNSVLNHFKFNYLSNLPPNIESAVEKNLNVLTAGVASSIDTFFKSAVGMLKGFVDIVII
PILTFYFLKDKDIFLTQVECLIPLKYREKIFSLLFKVDRILSKYLRAQAYLSIFVGAFTGLGLALVKVRYAFLLGVIAGI
LNIIPYIGPILSILPAVAIGLMDSIFKGLWAFAICLLIQQVENVFVTPKVMGDSVGLHPVTVIFVLILGEELFGVWGLLF
SVPVAAILKEVFTEIFLDK

Sequences:

>Translated_339_residues
MKNKVYIIWFLIVLGIFYIFIKNWVSIKSILSPFFVSILMAYLLNPFVRYFTSKGFTLTFSILTVFFIVAAAILIFSYYV
FPILIGELASFVKVAPKYLRELNSVLNHFKFNYLSNLPPNIESAVEKNLNVLTAGVASSIDTFFKSAVGMLKGFVDIVII
PILTFYFLKDKDIFLTQVECLIPLKYREKIFSLLFKVDRILSKYLRAQAYLSIFVGAFTGLGLALVKVRYAFLLGVIAGI
LNIIPYIGPILSILPAVAIGLMDSIFKGLWAFAICLLIQQVENVFVTPKVMGDSVGLHPVTVIFVLILGEELFGVWGLLF
SVPVAAILKEVFTEIFLDK
>Mature_339_residues
MKNKVYIIWFLIVLGIFYIFIKNWVSIKSILSPFFVSILMAYLLNPFVRYFTSKGFTLTFSILTVFFIVAAAILIFSYYV
FPILIGELASFVKVAPKYLRELNSVLNHFKFNYLSNLPPNIESAVEKNLNVLTAGVASSIDTFFKSAVGMLKGFVDIVII
PILTFYFLKDKDIFLTQVECLIPLKYREKIFSLLFKVDRILSKYLRAQAYLSIFVGAFTGLGLALVKVRYAFLLGVIAGI
LNIIPYIGPILSILPAVAIGLMDSIFKGLWAFAICLLIQQVENVFVTPKVMGDSVGLHPVTVIFVLILGEELFGVWGLLF
SVPVAAILKEVFTEIFLDK

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=309, Percent_Identity=28.4789644012945, Blast_Score=120, Evalue=2e-28,
Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=297, Percent_Identity=26.2626262626263, Blast_Score=79, Evalue=4e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1787885, Length=329, Percent_Identity=27.355623100304, Blast_Score=63, Evalue=3e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 38118; Mature: 38118

Theoretical pI: Translated: 9.75; Mature: 9.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 7.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]