| Definition | Streptococcus pyogenes MGAS8232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003485 |
| Length | 1,895,017 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 19747012
GI number: 19747012
Start: 1852054
End: 1854327
Strand: Reverse
Name: yhgE [H]
Synonym: spyM18_2213
Alternate gene names: 19747012
Gene position: 1854327-1852054 (Counterclockwise)
Preceding gene: 19747014
Following gene: 19747008
Centisome position: 97.85
GC content: 39.62
Gene sequence:
>2274_bases ATGTTAGAAGAATTGAAAACACTTATTAAAAATCCAAAATTAATGATTACAATGATTGGTGTGGCCCTAGTGCCTGCCTT ATATAATTTATCCTTTCTAGGCTCAATGTGGGATCCTTATGGTCGGGTCAATGACCTTCCCATTGCTGTTGTTAATCATG ATAAGCCTGCAAAGAGAGCTGATAAGTCATTGACAATTGGGAATGATATGGTGGACAAGATGTCTAAAAGTAAAGATTTA GACTATCATTTTGTATCTTCAAAAAGTGCTCAAAAAGGTCTTAAAAAAGGTGATTATTATATGGTCATTACTTTACCCGA AGATCTTTCTCAGCGAGCAACAACCTTATTAAATCCCGAACCCCAAAAACTAACTATCCGTTACCAAACTAGTAAAGGAC ATGGAATGGTCGCTGCTAAGATGGGGGAAACAGCGATGGCTAAGCTGAAAGAGTCTGTTTCGCAAAACATTACGAAGACT TATACCTCAGCAGTTTTTAGCAGTATGACAGACCTCCAATCAGGATTAAAAGAAGCCTCAACTGGTAGTCAAGCATTGGA TTCAGGAGCGAAGACAGCCCAAATGGGTAGTCAAATGCTCTCAGATAACTTAGCAGGTTTATCTAGTGCTAGTTGGCAAT TTCAACAAGGAACTAATCGTTTAACTTCAGGATTAACGGCCTATACAGCTGGTGTTAGTCAAGTAAAGGACGGACTAGGG CAGCTCTCAACCGATATGCCAGTTTACCTGAATGGGGTTTCTCGGTTATCACAAGGAGCTTCTCAACTTAATCAGGGTCT TTCACAGTTGACACAATCAACAACACTTTCTGATGATAAAGCTAAAAGAATCCAATCTTTGGAGGTAGGATTACCAGTTT TAAATCAAGGTATTCAGCAACTAAATGAAAATCTCTCAACGATGCAGGTACCAAAACTTAATACCGATGAGTTAGGGAAT AACTTGGCTGCCATTGCTCAAGCTGCGCAACAGTTACTTGTTAAAGAAGCTGCTGCTCACAAGGAACAACTAGCAGTCTT ACAAGCCACTAGCGCTTATCAGTCACTAACTGCTGAGCAACAAGGGGAATTAACTGCTGCTCTTACCCAAACTGATAAGG GTGAAGCTGTGGCTCCTGCTCAAACGATTTTAAGGTCTGTTCAAACTTTGTCAACAAGTTTACAGTCTCTCTCTCAAGAA GATCAGTCAAAACAGTTGGAGCAACTTAAGGAAGCTGTTGCACAGATTGCTAATCAATCCAATCAAGCTTTGCCGGGAGC AAGTTCTGCTTTAACTGAATTATCAACGGGATTAGCAAAGGTAAATGGTAGCTTAAATCAACAAGTTCTACCAGGAAGTA ATCAATTGACAACAGGATTAGCACAATTAAACAGGTATAATACTGCCATTGGTTCTGGGGTAATAAAACTCTCAGAAGGT GCCAATGCCTTGTCATCCAAGTCCGGAGAATTACTAGATGGTAGCCATCAATTATCAGAAGGTGCTACTAAACTAGCTGA TGGTAGTTCTCAATTGAGTCAGGGTGGTCATCAATTAACGAGCGGATTGACTGAATTATCAACAGGATTGTCAATCTTAA ATGGTTCCTTAGCCAAAGCCTCTCAGCAGTTATCGCTTGTTTCTGTGACTGATAAAAATGCTAAAGCTGTCGCAAAACCT CTTGTGTTAAATGAGAAAGACAAAGATGGTGTTAAGACGAATGGGATCGGGATGGCACCTTATATGATTGCTGTTTCTCT AATGGTTGTGGCCCTTTCAACCAACGTCATTTTTGCTAATTCTTTATCTGGTCGTCCGGTCAAAGATAAATGGGATTGGG CTAAACAAAAATTTGTTATTAATGGTTTTATTTCGACTATGGGATCCATTGTTCTCTACTTAGCTATTCAATTATTAGGG TTTGAAGCCCGTTATGGTATGGAAACCTTAGGATTTATTATGCTAAGTGGTTGGACGTTTATGGCTCTTGTCACAGCTTT GGTCGGTTGGGATGATCGATATGGCTCTTTTGCTTCTTTGGTTATGTTATTGCTTCAGGTTGGCTCTTCAGGTGGCTCTT ACCCCATTGAGTTAAGTGGAGCATTTTTCCAAAAGTTACATCCTTTCTTACCAATGACTTATGTGGTATCTGGTTTACGA CAAACCATTTCATTATCAGGTCATATTGGAGTAGAAGTGAAAGTCTTAACTGGTTTCTTACTGGCATTTATGGTATTATC ACTACTCATTTATCGTCCCAAGAAAACAGTCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTCCAAAAGTGAAATTTTTTCTCTTGTAAATTTAAATTTAAATTGTATAATATATTTTATCATAATTTTTGAACACCA TGTCCATTTTAGGAGAAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAAATAACCTCAAAAAAACAGCATCTAAGGCAGTTACACTAGATGCTGTTTATTGTCTTGTTAAGATCATTTGATAGT AATGTCTCCCTTATTGAGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 757; Mature: 757
Protein sequence:
>757_residues MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRADKSLTIGNDMVDKMSKSKDL DYHFVSSKSAQKGLKKGDYYMVITLPEDLSQRATTLLNPEPQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKT YTSAVFSSMTDLQSGLKEASTGSQALDSGAKTAQMGSQMLSDNLAGLSSASWQFQQGTNRLTSGLTAYTAGVSQVKDGLG QLSTDMPVYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQSTTLSDDKAKRIQSLEVGLPVLNQGIQQLNENLSTMQVPKLNTDELGN NLAAIAQAAQQLLVKEAAAHKEQLAVLQATSAYQSLTAEQQGELTAALTQTDKGEAVAPAQTILRSVQTLSTSLQSLSQE DQSKQLEQLKEAVAQIANQSNQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSILNGSLAKASQQLSLVSVTDKNAKAVAKP LVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFANSLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLG FEARYGMETLGFIMLSGWTFMALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLSLLIYRPKKTV
Sequences:
>Translated_757_residues MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRADKSLTIGNDMVDKMSKSKDL DYHFVSSKSAQKGLKKGDYYMVITLPEDLSQRATTLLNPEPQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKT YTSAVFSSMTDLQSGLKEASTGSQALDSGAKTAQMGSQMLSDNLAGLSSASWQFQQGTNRLTSGLTAYTAGVSQVKDGLG QLSTDMPVYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQSTTLSDDKAKRIQSLEVGLPVLNQGIQQLNENLSTMQVPKLNTDELGN NLAAIAQAAQQLLVKEAAAHKEQLAVLQATSAYQSLTAEQQGELTAALTQTDKGEAVAPAQTILRSVQTLSTSLQSLSQE DQSKQLEQLKEAVAQIANQSNQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSILNGSLAKASQQLSLVSVTDKNAKAVAKP LVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFANSLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLG FEARYGMETLGFIMLSGWTFMALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLSLLIYRPKKTV >Mature_757_residues MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRADKSLTIGNDMVDKMSKSKDL DYHFVSSKSAQKGLKKGDYYMVITLPEDLSQRATTLLNPEPQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKT YTSAVFSSMTDLQSGLKEASTGSQALDSGAKTAQMGSQMLSDNLAGLSSASWQFQQGTNRLTSGLTAYTAGVSQVKDGLG QLSTDMPVYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQSTTLSDDKAKRIQSLEVGLPVLNQGIQQLNENLSTMQVPKLNTDELGN NLAAIAQAAQQLLVKEAAAHKEQLAVLQATSAYQSLTAEQQGELTAALTQTDKGEAVAPAQTILRSVQTLSTSLQSLSQE DQSKQLEQLKEAVAQIANQSNQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSILNGSLAKASQQLSLVSVTDKNAKAVAKP LVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFANSLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLG FEARYGMETLGFIMLSGWTFMALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLSLLIYRPKKTV
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80623; Mature: 80623
Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRA CHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHC DKSLTIGNDMVDKMSKSKDLDYHFVSSKSAQKGLKKGDYYMVITLPEDLSQRATTLLNPE CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCC PQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKTYTSAVFSSMTDLQSGLKEAS CCEEEEEEECCCCCCEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TGSQALDSGAKTAQMGSQMLSDNLAGLSSASWQFQQGTNRLTSGLTAYTAGVSQVKDGLG CCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH QLSTDMPVYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQSTTLSDDKAKRIQSLEVGLPVLNQGIQQ HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LNENLSTMQVPKLNTDELGNNLAAIAQAAQQLLVKEAAAHKEQLAVLQATSAYQSLTAEQ HHCCCCCEECCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGELTAALTQTDKGEAVAPAQTILRSVQTLSTSLQSLSQEDQSKQLEQLKEAVAQIANQS CCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCC ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSILNGSLAKA CCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH SQQLSLVSVTDKNAKAVAKPLVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFAN HHHEEEEEECCCCHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE SLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLGFEARYGMETLGFIMLSGWTF CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH MALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLSLLIYRPKKTV HHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRA CHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHC DKSLTIGNDMVDKMSKSKDLDYHFVSSKSAQKGLKKGDYYMVITLPEDLSQRATTLLNPE CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCC PQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKTYTSAVFSSMTDLQSGLKEAS CCEEEEEEECCCCCCEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC TGSQALDSGAKTAQMGSQMLSDNLAGLSSASWQFQQGTNRLTSGLTAYTAGVSQVKDGLG CCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH QLSTDMPVYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQSTTLSDDKAKRIQSLEVGLPVLNQGIQQ HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH LNENLSTMQVPKLNTDELGNNLAAIAQAAQQLLVKEAAAHKEQLAVLQATSAYQSLTAEQ HHCCCCCEECCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGELTAALTQTDKGEAVAPAQTILRSVQTLSTSLQSLSQEDQSKQLEQLKEAVAQIANQS CCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCC ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSILNGSLAKA CCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH SQQLSLVSVTDKNAKAVAKPLVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFAN HHHEEEEEECCCCHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE SLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLGFEARYGMETLGFIMLSGWTF CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH MALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLSLLIYRPKKTV HHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]