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The map label for this gene is 18977664

Identifier: 18977664

GI number: 18977664

Start: 1218577

End: 1219869

Strand: Reverse

Name: 18977664

Synonym: PF1292

Alternate gene names: NA

Gene position: 1219869-1218577 (Counterclockwise)

Preceding gene: 18977669

Following gene: 18977661

Centisome position: 63.93

GC content: 38.52

Gene sequence:

>1293_bases
ATGGACAGAAAGAAAGTTATGGTGAGGCATTCAATTGCAAGTTTAGTAGCCTTAGGAATATTTGGGGGGAGCAGATTCCT
ATATAACGTCATCATAGGGAGAAAGTATGGGGTTGAAACCCTTGGATATACTAACTCTATAATTTCGCAAGCATTTTTTG
TAGCTGGATTTTTGGCATTTTTCTCAGTTGGCCTGGGGAAATTTACCTCCGAATTCCTGGGAAAAGGAGAATACAATAGG
ATAAAAAAGCTCACCGGAATTTCCTTCACGTTTCCCTTTCTGGGTTTAATTCTAATTCCCTTAAACTTTCATGTCGCTCT
GCTTTCAGTACTAAGGGCAATTCAACTAACTTTTAGAAGCTTTATTTATGGACTTCACAAAGGCGAACTTTATGCTTATT
CTGTTATATTAGCCTTCCCATTTTTCCTCCTTGGCTTTTTAGATGGACCTCTTCTTCCTTATTATCTCCTCCTGGGAACA
ATTGGAATTTTCTCACTCTCTTACCTTGTATCGAGAAGCTTAATTGGTCTCCCAGGGAGAGAAGATACTAAAGCACTTAT
TGGCTTTTCAACATGGGCATTTCTAGGCACTATTGCGGGGATATTTCTACTACAAGCACCCTATTTTCTTACGGAAAAGC
TTGCAGGAAACATCGAGGCGGGAATAGTCTCTGTGGCGCTCTCAACGGCGTTCCTACTTTCTTACCTCCCACAAATACTC
CAATCTGCGATAGTCCCTCTCTATGCCTATGACTACGCTAAAGGGGATGATAAAGCAATAAAAGAACTGGCCGAAAACTC
AACTTTACTTTTATCTCTTTTCTCCTCCCTACTAGTCTTTGGATTAATTTTTGCAAAGTCATTTGTTGAGGTGCTGTTTA
ACATTAAGATGGGAGCAGAACTTCTTTTAGCTCTAATAGGAGTTGAGTTGTACATAGCATACAATCCACTGATTAACCTT
CTAACAGCAACGAAGTTTGTGAAAAAATCAGCAATATTTTCTCTGATTGGTGCCATGGTGTCAGGAATATTTTGGATTCT
TTTAATCCCCAGATTAGGAGCTATAGGAACCCTTTTAGGCCTCACCCTTGGTTACGCAATAATTTTTGCACTGGTCTTGT
GGGAAAGCAAGAGAAAATTCAATATAAACGCGAAAATACTAAAACCAACCCTTTTAGCTATTCCTCTACAATTGTTGTCC
CTAAAATTCCCTTATACAATTTTGATTTACCTTATTACAGAAATAAAGGATATAGAAAAAGTTATGGCCTTCCTCCGTGA
TATAAGATCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAGTTTTCACTCCACTTCTTTCTCTCTACCATCCAACCCACCTAAGGTAAAGCGGGAGATTATTTTTAAATAAGTTTTG
TTAATTTTCGCTCGATATCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATTTCCTCAGGTAAGCCTTCTGCCCTAATTCTTTCCTCGATTATCTTCTTATCGTATTCAACCTCTATGAACTTTGGT
TTTAAGGTATCTACATCAAC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 430; Mature: 430

Protein sequence:

>430_residues
MDRKKVMVRHSIASLVALGIFGGSRFLYNVIIGRKYGVETLGYTNSIISQAFFVAGFLAFFSVGLGKFTSEFLGKGEYNR
IKKLTGISFTFPFLGLILIPLNFHVALLSVLRAIQLTFRSFIYGLHKGELYAYSVILAFPFFLLGFLDGPLLPYYLLLGT
IGIFSLSYLVSRSLIGLPGREDTKALIGFSTWAFLGTIAGIFLLQAPYFLTEKLAGNIEAGIVSVALSTAFLLSYLPQIL
QSAIVPLYAYDYAKGDDKAIKELAENSTLLLSLFSSLLVFGLIFAKSFVEVLFNIKMGAELLLALIGVELYIAYNPLINL
LTATKFVKKSAIFSLIGAMVSGIFWILLIPRLGAIGTLLGLTLGYAIIFALVLWESKRKFNINAKILKPTLLAIPLQLLS
LKFPYTILIYLITEIKDIEKVMAFLRDIRS

Sequences:

>Translated_430_residues
MDRKKVMVRHSIASLVALGIFGGSRFLYNVIIGRKYGVETLGYTNSIISQAFFVAGFLAFFSVGLGKFTSEFLGKGEYNR
IKKLTGISFTFPFLGLILIPLNFHVALLSVLRAIQLTFRSFIYGLHKGELYAYSVILAFPFFLLGFLDGPLLPYYLLLGT
IGIFSLSYLVSRSLIGLPGREDTKALIGFSTWAFLGTIAGIFLLQAPYFLTEKLAGNIEAGIVSVALSTAFLLSYLPQIL
QSAIVPLYAYDYAKGDDKAIKELAENSTLLLSLFSSLLVFGLIFAKSFVEVLFNIKMGAELLLALIGVELYIAYNPLINL
LTATKFVKKSAIFSLIGAMVSGIFWILLIPRLGAIGTLLGLTLGYAIIFALVLWESKRKFNINAKILKPTLLAIPLQLLS
LKFPYTILIYLITEIKDIEKVMAFLRDIRS
>Mature_430_residues
MDRKKVMVRHSIASLVALGIFGGSRFLYNVIIGRKYGVETLGYTNSIISQAFFVAGFLAFFSVGLGKFTSEFLGKGEYNR
IKKLTGISFTFPFLGLILIPLNFHVALLSVLRAIQLTFRSFIYGLHKGELYAYSVILAFPFFLLGFLDGPLLPYYLLLGT
IGIFSLSYLVSRSLIGLPGREDTKALIGFSTWAFLGTIAGIFLLQAPYFLTEKLAGNIEAGIVSVALSTAFLLSYLPQIL
QSAIVPLYAYDYAKGDDKAIKELAENSTLLLSLFSSLLVFGLIFAKSFVEVLFNIKMGAELLLALIGVELYIAYNPLINL
LTATKFVKKSAIFSLIGAMVSGIFWILLIPRLGAIGTLLGLTLGYAIIFALVLWESKRKFNINAKILKPTLLAIPLQLLS
LKFPYTILIYLITEIKDIEKVMAFLRDIRS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47532; Mature: 47532

Theoretical pI: Translated: 10.09; Mature: 10.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA