Definition Pyrococcus furiosus DSM 3638, complete genome.
Accession NC_003413
Length 1,908,256

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The map label for this gene is 18976783

Identifier: 18976783

GI number: 18976783

Start: 417264

End: 419495

Strand: Direct

Name: 18976783

Synonym: PF0411

Alternate gene names: NA

Gene position: 417264-419495 (Clockwise)

Preceding gene: 18976782

Following gene: 18976786

Centisome position: 21.87

GC content: 39.34

Gene sequence:

>2232_bases
ATGAAGATTGATAAAAGGTTGATGGTTATTGTTGCAATTGCCACCCTTTTTAGGATGATACCTTTTAGGCTTAAATATCT
AGTCGGTTCTGATCCTTACTTTCATCTGGCTTACATTGAAGAGGCTCTCAAGGCTGGAGAATGGTTCAACTTCTTTACCT
ATGCTGGAGGTCCCTGGGGATTACAAGTTAGGCTGTTTCACCCCTTAGGATTGTGGGCGACTCCTGCCTACATTTACAAA
CTCTTCAGCTTCCTGGGAATTTCGCTTTATACGGCTTTTAGGGTAACTCCAGTCATATTTGGAGTTCTAACTGTTGTGTT
CTTCTATTTAAGCCTTAAAAAACTCTACAACAGAGACGTGGCCTTTATAGTTGGTCTATTTCTTGGTGTGAACTATGGGC
ATATTTTCAGATCGATGGCGAACTATTATAGGGGAGATAATTACATGCTTTTCTGGTATTCAGTGGCTTTATTGGGGATT
GCCCTGGGATTAAAAACAAGAAGTAAGTATAGATACTTATTTTACTTGCTCCCTGGGATAGCAACAGGGTTTGCTTCAGC
ATTCTGGCAGGCTTATTATCCAATTTTTGTTTTCGTACTTGCAGGTGGCCTGCTCCTTGGAGTTTATGCATACCTTAAAA
GTCCAAAGCTATTCCTTGATTCAATTTTAATAGTTCTATCTACCGGTCTTGGGGTCCTAATAGCTAACATCTTGGGGGAT
AAAGTTGGATACGGGATGTTAGGATATACGGATTGGATGGGAAAGAAGGTTGCCGAGACCTTTGGTTTGGAGTTTGGCTT
CATAAAAGATGCATATTTGTTAATTCACGTAAAGTATCTCCTCCCTCTCTCTTTAGTCTTTCTGGGATTTTTGATCATTA
CAAAGAAATTAAATCCAAAAATTAAGGTGGGGGTATTGGTTGGAGGATCAATTTTGGCGTTTATAGTTATGCTAGTCAAG
TTTCCAGCATTAAAGGACTTATCAACAGGCTTTGGCACATTTAGGGAAGTTCCAATTTCTGAAACGCTCCCTCCCACTTT
GGATGATCTATGGAGAGCATACAATATTGCAATTTTTCTTGCTGCTCTTTACATTTTGAGACTAAGAAAAATTAGGAGTG
GAGATGCAATTTTATTAGGGTACGTTATTACTTCGCTTTGGATGCTAAGGTACTGGACAAGGTTCCTCTTCACTGCAGCA
CCAGCAGTTGCGTTCCTTTCTGGGATTGGAGTTTACGAGCTAACAAGGCGTATAAAGGAGAACAAAATTAGAATAACCTC
TTTGGGAGTTGTAATTTTGCTATCTTCGGCATTTTCTCTTGGAGAAGTCTACAGCGTAAAACCGTTTATGAATGAAAACT
GGGAGAAAGCTTTGATATTCATAAGGGAAAATTCAAATGAAAACGATATCGTGTTGACTTGGTGGGATTGGGGACACTTC
GTGACTTATTATGCAAGAAGAAGTCCTGTAGCCCAGGGAAGTCCAAATTCTGGGGTTGCTGGATACTATCTTGGATTAGT
TGATAATGGGTGGGCGCAGAGTTTGGGAGTGGATTATGTGATAGTGTCCCTCTATGATATCCTAAAGTTTGAGGCGATAG
TCGATACGGCAAAGCTCTCCCGAAAATGGGAGAATATTAGCAGGGCCGACTATGGGGTTGATTTCTTAAAGTTAACGGAA
AGCACAGGGAGCATTTTAAGATTTGATTCTCAATATTCTACCCTAATTGTGAAAGAGGGAAATATTAGGGTCATTTTAAG
TGGAAAGGTTGTGTATCCGAGGGAGGCTATAATTGAAAGTAATGGAAGAATAAAAAATCTGAAATATCCTGCCAGGAGTG
GGGTATATGTATATGTAAATCTTGATTATGGCTACGCTATCCTTGCGAATGAAAAAGCTTGGGAGACTAATTTGCTCAGA
CTGTTCACCCAGAGGACAGGAGAAAATTACGAGCTTGTTTATTCTGATGGTGGATTTGTAAAAGTATTTAGGTTTGTTCA
TCCAAACGTGGTTTTTAGGGGAAATAAGTTTATCTTAACTGGGAACGGGACAGGATTGGGGTTATATGGGTATTTAGACA
ATGGAACTTTAGTCTTCAAGAAATGGTATTCAGTAAAGAACATGCAAGAGTTTGAGCTTCCAAATAATTTAAATGGAAGT
GTCGTTGTGAGATACGTTTATACTCAGGGAAAAATTGTATTGGATAGAGGAATTGTGAGGGTAAAGAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCCAAAGAGCAAAAAGAAAATATGAAGCCTCTAATTGAGATTCTTCTGGTGGCCTTTGTCATAATTGTTCTAAAAAAG
GTCTATGAGGTGTTGAGTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTTCAAGCTTCACTCTAAGTTCTTCGGCGAACCAATTTACCCTCTGTGGGAACGGGATTTCGATTCCTTCTCTGTC
CAGGGCTTCTTTTATTTTCT

Product: protein-export membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: Transmembrane Oligosaccharyl Transferase; Protein-Export Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 743; Mature: 743

Protein sequence:

>743_residues
MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWGLQVRLFHPLGLWATPAYIYK
LFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDVAFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGI
ALGLKTRSKYRYLFYLLPGIATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD
KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPKIKVGVLVGGSILAFIVMLVK
FPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFLAALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAA
PAVAFLSGIGVYELTRRIKENKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF
VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLSRKWENISRADYGVDFLKLTE
STGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIESNGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLR
LFTQRTGENYELVYSDGGFVKVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS
VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN

Sequences:

>Translated_743_residues
MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWGLQVRLFHPLGLWATPAYIYK
LFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDVAFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGI
ALGLKTRSKYRYLFYLLPGIATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD
KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPKIKVGVLVGGSILAFIVMLVK
FPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFLAALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAA
PAVAFLSGIGVYELTRRIKENKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF
VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLSRKWENISRADYGVDFLKLTE
STGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIESNGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLR
LFTQRTGENYELVYSDGGFVKVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS
VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN
>Mature_743_residues
MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWGLQVRLFHPLGLWATPAYIYK
LFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDVAFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGI
ALGLKTRSKYRYLFYLLPGIATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD
KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPKIKVGVLVGGSILAFIVMLVK
FPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFLAALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAA
PAVAFLSGIGVYELTRRIKENKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF
VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLSRKWENISRADYGVDFLKLTE
STGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIESNGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLR
LFTQRTGENYELVYSDGGFVKVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS
VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN

Specific function: Unknown

COG id: COG1287

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84343; Mature: 84343

Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCE
LQVRLFHPLGLWATPAYIYKLFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDV
EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
AFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGIALGLKTRSKYRYLFYLLPGI
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHH
ATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPK
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
IKVGVLVGGSILAFIVMLVKFPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFL
EEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AALYILRLRKIRSGDAILLGYVITSLWMLRYWTRFLFTAAPAVAFLSGIGVYELTRRIKE
HHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
NKIRITSLGVVILLSSAFSLGEVYSVKPFMNENWEKALIFIRENSNENDIVLTWWDWGHF
CCEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEECCHHH
VTYYARRSPVAQGSPNSGVAGYYLGLVDNGWAQSLGVDYVIVSLYDILKFEAIVDTAKLS
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKWENISRADYGVDFLKLTESTGSILRFDSQYSTLIVKEGNIRVILSGKVVYPREAIIES
HHHHHCCHHHCCCEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEEECCCEEEEEECCEECCHHHHHCC
NGRIKNLKYPARSGVYVYVNLDYGYAILANEKAWETNLLRLFTQRTGENYELVYSDGGFV
CCCEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCE
KVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS
EEEEECCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEHHCCCCCHHHCCCCCCCCC
VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN
EEEEEEEECCEEEEECCEEEECC
>Mature Secondary Structure
MKIDKRLMVIVAIATLFRMIPFRLKYLVGSDPYFHLAYIEEALKAGEWFNFFTYAGGPWG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCE
LQVRLFHPLGLWATPAYIYKLFSFLGISLYTAFRVTPVIFGVLTVVFFYLSLKKLYNRDV
EEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
AFIVGLFLGVNYGHIFRSMANYYRGDNYMLFWYSVALLGIALGLKTRSKYRYLFYLLPGI
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ATGFASAFWQAYYPIFVFVLAGGLLLGVYAYLKSPKLFLDSILIVLSTGLGVLIANILGD
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KVGYGMLGYTDWMGKKVAETFGLEFGFIKDAYLLIHVKYLLPLSLVFLGFLIITKKLNPK
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IKVGVLVGGSILAFIVMLVKFPALKDLSTGFGTFREVPISETLPPTLDDLWRAYNIAIFL
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CCCEEECCCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCE
KVFRFVHPNVVFRGNKFILTGNGTGLGLYGYLDNGTLVFKKWYSVKNMQEFELPNNLNGS
EEEEECCCCEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEHHCCCCCHHHCCCCCCCCC
VVVRYVYTQGKIVLDRGIVRVKN
EEEEEEEECCEEEEECCEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA