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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 18310258

GI number: 18310258

Start: 1496203

End: 1497573

Strand: Reverse

Name: mepA [H]

Synonym: CPE1276

Alternate gene names: 18310258

Gene position: 1497573-1496203 (Counterclockwise)

Preceding gene: 18310259

Following gene: 18310257

Centisome position: 49.4

GC content: 29.98

Gene sequence:

>1371_bases
ATGAAAAATCAATATGAACTAAAGAATGAAAAAATTGGGAGGTTGCTTTTAAAATATTCCCTACCAGCTATACTATCTAT
GATGGTAACTTCCTTATATAACACTGTAGATAGAGCTTTTATAGGATCTATTAAGGATATAGGAGCCCTTGCCATATCTG
GCTTAGGAGTAACTATGCCCTTGTTCACAATATTAGGTGCTTTTTGCGTAGCCATATCTGTAGGGGGAAGCACTAATATA
TCAATAAAGCTAGGGGAAGAAAAGAGGGAAGAAGCTGAAAGAATATTAGGAAATACTTTTATATTATCCATAGTTGTTGC
TTTAATTATTATGATCTTTGGACTCTCCTTTTTAGAAAAAATACTATATTTTTTTGAAGCAAGTAAGGAAACTATTATAT
ATGCAAAGGATTATATGAGGGTAATACTTATAGGGGCATGGTTTAACTTTCCTGGATTTGCTCTTAATAATGCAATAAGA
GCTGAGGGAAATCCAAAGTTAGCTGGTAAAATCATGATAATAAGTTGTGTTTTAAACATAATTTTAGATCCAATATTTAT
ATTCTTATTTCATATGGGAATTAAGGGAGCTGCCTTAGGAACTATAATTTGTCAATTCATAGTTTTTCTATGGACAATGT
ATTATTTTACCTTAGGAAAGTCAAACTTAAAGTTAAGGATTAAAGGAAAGATATTAAATAAGAATATTTTAAGGGCAATA
ATCTTAATTGCTTTAACTCCGTTTTTTATGGAGCTTGCAGCAGGATTTATACATTTAATAACAAATAGAGTGCTTAAGGA
TTATGGTGGAGATTTAGCTATAGGTGCAATGACTTCAATAACATCTATATATCTTTTGTTTTTGATGCCAGTCTTTGGAC
TGAGCCAAGGAATGCAAACCATAGTTGCATATAATTATGGAGCGAAGGAGTATAAACGTGCTAAAAAAACTCTATTAATG
ACTATAATAATTGCAACTTTAATTTTAACTCTAGGCCTTGTACTTATTAGAATTTATCCAAGGGAGTTTATTAATATATT
TACAAAGGATAAGGAGTTAATAAATATAGCACTTAATGGGTTAAAAATATATACAATTGCCCTACCCACCTTAGGGGTTT
CAATCTTAGGGGCAGTATATTTTCAGTCTATAGGAAATGTTAAAAAGTCAATTTTTTTAAGTTTATTAAGACAAGTTATA
CTATTTATACCTATTGTATTTATAATACCTAGAGTATATGGACTAAATGGAGTGTGGATTTCACAACCCTTAGCTGATAT
TTTAGCTACCCTGATAATACTTATATTTTTAATAAAAGAATTTTACATAAGAGATAAGAGTTATGCAATTTCCATAGAAG
AAAGTGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAATGCTATAATGAACAGGAATTGATAATAATTATTAATAACAGATAGAATAATTATTAATCATAAGAAATATAGGACA
TTAGGAATAGGGACATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAATTAAAGAAATTTACATAAAAATACTTTAATTACTAAGTGGATAAGAAGAAAAAAGCCTGTTATAATATTTTCTAGA
ATCTTTAAAAAAAGGAGAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456

Protein sequence:

>456_residues
MKNQYELKNEKIGRLLLKYSLPAILSMMVTSLYNTVDRAFIGSIKDIGALAISGLGVTMPLFTILGAFCVAISVGGSTNI
SIKLGEEKREEAERILGNTFILSIVVALIIMIFGLSFLEKILYFFEASKETIIYAKDYMRVILIGAWFNFPGFALNNAIR
AEGNPKLAGKIMIISCVLNIILDPIFIFLFHMGIKGAALGTIICQFIVFLWTMYYFTLGKSNLKLRIKGKILNKNILRAI
ILIALTPFFMELAAGFIHLITNRVLKDYGGDLAIGAMTSITSIYLLFLMPVFGLSQGMQTIVAYNYGAKEYKRAKKTLLM
TIIIATLILTLGLVLIRIYPREFINIFTKDKELINIALNGLKIYTIALPTLGVSILGAVYFQSIGNVKKSIFLSLLRQVI
LFIPIVFIIPRVYGLNGVWISQPLADILATLIILIFLIKEFYIRDKSYAISIEESE

Sequences:

>Translated_456_residues
MKNQYELKNEKIGRLLLKYSLPAILSMMVTSLYNTVDRAFIGSIKDIGALAISGLGVTMPLFTILGAFCVAISVGGSTNI
SIKLGEEKREEAERILGNTFILSIVVALIIMIFGLSFLEKILYFFEASKETIIYAKDYMRVILIGAWFNFPGFALNNAIR
AEGNPKLAGKIMIISCVLNIILDPIFIFLFHMGIKGAALGTIICQFIVFLWTMYYFTLGKSNLKLRIKGKILNKNILRAI
ILIALTPFFMELAAGFIHLITNRVLKDYGGDLAIGAMTSITSIYLLFLMPVFGLSQGMQTIVAYNYGAKEYKRAKKTLLM
TIIIATLILTLGLVLIRIYPREFINIFTKDKELINIALNGLKIYTIALPTLGVSILGAVYFQSIGNVKKSIFLSLLRQVI
LFIPIVFIIPRVYGLNGVWISQPLADILATLIILIFLIKEFYIRDKSYAISIEESE
>Mature_456_residues
MKNQYELKNEKIGRLLLKYSLPAILSMMVTSLYNTVDRAFIGSIKDIGALAISGLGVTMPLFTILGAFCVAISVGGSTNI
SIKLGEEKREEAERILGNTFILSIVVALIIMIFGLSFLEKILYFFEASKETIIYAKDYMRVILIGAWFNFPGFALNNAIR
AEGNPKLAGKIMIISCVLNIILDPIFIFLFHMGIKGAALGTIICQFIVFLWTMYYFTLGKSNLKLRIKGKILNKNILRAI
ILIALTPFFMELAAGFIHLITNRVLKDYGGDLAIGAMTSITSIYLLFLMPVFGLSQGMQTIVAYNYGAKEYKRAKKTLLM
TIIIATLILTLGLVLIRIYPREFINIFTKDKELINIALNGLKIYTIALPTLGVSILGAVYFQSIGNVKKSIFLSLLRQVI
LFIPIVFIIPRVYGLNGVWISQPLADILATLIILIFLIKEFYIRDKSYAISIEESE

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50933; Mature: 50933

Theoretical pI: Translated: 10.03; Mature: 10.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNQYELKNEKIGRLLLKYSLPAILSMMVTSLYNTVDRAFIGSIKDIGALAISGLGVTMP
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHH
LFTILGAFCVAISVGGSTNISIKLGEEKREEAERILGNTFILSIVVALIIMIFGLSFLEK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILYFFEASKETIIYAKDYMRVILIGAWFNFPGFALNNAIRAEGNPKLAGKIMIISCVLNI
HHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ILDPIFIFLFHMGIKGAALGTIICQFIVFLWTMYYFTLGKSNLKLRIKGKILNKNILRAI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHH
ILIALTPFFMELAAGFIHLITNRVLKDYGGDLAIGAMTSITSIYLLFLMPVFGLSQGMQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVAYNYGAKEYKRAKKTLLMTIIIATLILTLGLVLIRIYPREFINIFTKDKELINIALNG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC
LKIYTIALPTLGVSILGAVYFQSIGNVKKSIFLSLLRQVILFIPIVFIIPRVYGLNGVWI
EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
SQPLADILATLIILIFLIKEFYIRDKSYAISIEESE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MKNQYELKNEKIGRLLLKYSLPAILSMMVTSLYNTVDRAFIGSIKDIGALAISGLGVTMP
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHH
LFTILGAFCVAISVGGSTNISIKLGEEKREEAERILGNTFILSIVVALIIMIFGLSFLEK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILYFFEASKETIIYAKDYMRVILIGAWFNFPGFALNNAIRAEGNPKLAGKIMIISCVLNI
HHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ILDPIFIFLFHMGIKGAALGTIICQFIVFLWTMYYFTLGKSNLKLRIKGKILNKNILRAI
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHH
ILIALTPFFMELAAGFIHLITNRVLKDYGGDLAIGAMTSITSIYLLFLMPVFGLSQGMQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVAYNYGAKEYKRAKKTLLMTIIIATLILTLGLVLIRIYPREFINIFTKDKELINIALNG
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCC
LKIYTIALPTLGVSILGAVYFQSIGNVKKSIFLSLLRQVILFIPIVFIIPRVYGLNGVWI
EEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
SQPLADILATLIILIFLIKEFYIRDKSYAISIEESE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA