Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is 18309867

Identifier: 18309867

GI number: 18309867

Start: 1087988

End: 1089637

Strand: Direct

Name: 18309867

Synonym: CPE0885

Alternate gene names: NA

Gene position: 1087988-1089637 (Clockwise)

Preceding gene: 18309866

Following gene: 18309870

Centisome position: 35.89

GC content: 25.94

Gene sequence:

>1650_bases
ATGAAAAAGGATAAATCTTTAGCTGTAGTTCATAGACTAAGAGGGGTTTATGAAAAGCTTGGTGTTGATTATGAAATGAT
GAGATTAATATTAGAGACTAAGCTTACAATGGATAGAAGAAGAGAGCATACAATAAACATGAATAATAAAAGTAGTGATG
AGAAAGATAATAGTTTTGGCAAGGCATTAATTCTTTATGGAGTAATGGGAGCTTTTATGTCTATGCTTATAATTATTAAG
CAGAATATAATGCTTCAGATGGCTGTTTATTTTGGATTTTTTATGTTTGTAATAGGTAGTAGTTTTATAGCTGATTTTGC
TTATGTTCTTTTAGATGTTAGGGATAAAAATCTACTTGGAATTACTGGTGTAAGTTCTAAAACTATAAATGCAGCTAAGA
TTACTAATATTTTGATTTATATGACAAAGCTAAGCTTAGCTTATGGGGGAGTAGGAATACTTGTTTCTTTAAGGTATGGT
ATATTATTTACTATTGTTTTTATACTTGAGATTATACTTATTAATTTATTCATGATACTTATAACAGCATTTATTTATTA
TTTAGTTCTTAAGTTTTTTAATGGAGAAAAGCTTAAAGACATAATAAATGTAGTTCAAATAGTTCTTACTGTTGGAATAA
TGATTATGTATCAACTTGTAGGAAGACTTTTTGATATTTTAGATGTAGGTAGTAGATTTGCTATAACGAGTTGGTGGCAA
GGATTCATAGCGCCTTTATGGTTTGCTGCTCCTCTTGAAATAATAGAAAGTGGAGTAATAGATAGAACATTAATAATATT
TACAGGGTTAGCAGTTTTAGCACCAATATTATCAATACTTATTTATTTTAAAATAGCTAAAAAGTTTGAAGATTATATTC
AAAAGTTAAATGATAATACTTATAAAGGTAAAGATAGAATTCCATTTTCCTTTAAGATTGGAAATTTGGTGTGTAGAAGT
AATACTGAGAAAAGTTTCTTTAATTTTACTGTAAATATAATAAAAAGTGAGAGAAACTTTAAGTTAAAAACATATCCCAA
TATAGCAATGTCTTTAGTTTTTCCTTTCATATTCTTATTTAATTTTATTAGAAGTTATGAAAGTTTTGCAGATTGGAAAA
ATCATATGGCTAGTTCAAATGAGTTTTTCACATTGTATATATGTATATTTATGTTGACTCCTGTAATCCTTATGGTTAAA
TATTCAGATCAGTTTAAAGCATCTTGGATTTATAAAGCTGTTCCTATAGATGATATGGCTTCAATATTTAAAGGGGTATA
TAAAGGTGTGTTTTATAAAATGATTCTACCTGTATATATAGTATTGGCTTTAGTATATTTATGGGTATTTGGATTAAGAA
TTATTCCTCAAATTATAGCTATATTATTTGTAATAATTATTCTAAACCTAATAACAGTTAAGTTGATGGATAAACATCTT
CCATTTTCAGTTAGTTTTAAAGATGGTGAAAAGATGGATGATTTAGGAATAACCTTATTTATTTTTATGCTAAGTGCAAT
ATTTGGAGTGGTTCATTATATAATTAATAGACTTAATTATGGAGTATATATCTTTATCTTTATAGAGTTAATATTAATAG
GAATTTTATGGACAATAATAAGTAAAAGCAAATATCATAAAATTAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAGAATCCTTAGAAGAAATATTCAATGACTTAACTGGTTTTAATGATCATAAAAGATTAGCAGAGGAATTTACTGCA
CTTATAAAGGGGTGTAGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAACAAATTAGAGTTTAATAGTTATAGAATATATAAAATAGAGTTAAATAAACTTAATTTTATATATAAAATTAAA
TTTAAAAATCTTAACCTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 549; Mature: 549

Protein sequence:

>549_residues
MKKDKSLAVVHRLRGVYEKLGVDYEMMRLILETKLTMDRRREHTINMNNKSSDEKDNSFGKALILYGVMGAFMSMLIIIK
QNIMLQMAVYFGFFMFVIGSSFIADFAYVLLDVRDKNLLGITGVSSKTINAAKITNILIYMTKLSLAYGGVGILVSLRYG
ILFTIVFILEIILINLFMILITAFIYYLVLKFFNGEKLKDIINVVQIVLTVGIMIMYQLVGRLFDILDVGSRFAITSWWQ
GFIAPLWFAAPLEIIESGVIDRTLIIFTGLAVLAPILSILIYFKIAKKFEDYIQKLNDNTYKGKDRIPFSFKIGNLVCRS
NTEKSFFNFTVNIIKSERNFKLKTYPNIAMSLVFPFIFLFNFIRSYESFADWKNHMASSNEFFTLYICIFMLTPVILMVK
YSDQFKASWIYKAVPIDDMASIFKGVYKGVFYKMILPVYIVLALVYLWVFGLRIIPQIIAILFVIIILNLITVKLMDKHL
PFSVSFKDGEKMDDLGITLFIFMLSAIFGVVHYIINRLNYGVYIFIFIELILIGILWTIISKSKYHKIN

Sequences:

>Translated_549_residues
MKKDKSLAVVHRLRGVYEKLGVDYEMMRLILETKLTMDRRREHTINMNNKSSDEKDNSFGKALILYGVMGAFMSMLIIIK
QNIMLQMAVYFGFFMFVIGSSFIADFAYVLLDVRDKNLLGITGVSSKTINAAKITNILIYMTKLSLAYGGVGILVSLRYG
ILFTIVFILEIILINLFMILITAFIYYLVLKFFNGEKLKDIINVVQIVLTVGIMIMYQLVGRLFDILDVGSRFAITSWWQ
GFIAPLWFAAPLEIIESGVIDRTLIIFTGLAVLAPILSILIYFKIAKKFEDYIQKLNDNTYKGKDRIPFSFKIGNLVCRS
NTEKSFFNFTVNIIKSERNFKLKTYPNIAMSLVFPFIFLFNFIRSYESFADWKNHMASSNEFFTLYICIFMLTPVILMVK
YSDQFKASWIYKAVPIDDMASIFKGVYKGVFYKMILPVYIVLALVYLWVFGLRIIPQIIAILFVIIILNLITVKLMDKHL
PFSVSFKDGEKMDDLGITLFIFMLSAIFGVVHYIINRLNYGVYIFIFIELILIGILWTIISKSKYHKIN
>Mature_549_residues
MKKDKSLAVVHRLRGVYEKLGVDYEMMRLILETKLTMDRRREHTINMNNKSSDEKDNSFGKALILYGVMGAFMSMLIIIK
QNIMLQMAVYFGFFMFVIGSSFIADFAYVLLDVRDKNLLGITGVSSKTINAAKITNILIYMTKLSLAYGGVGILVSLRYG
ILFTIVFILEIILINLFMILITAFIYYLVLKFFNGEKLKDIINVVQIVLTVGIMIMYQLVGRLFDILDVGSRFAITSWWQ
GFIAPLWFAAPLEIIESGVIDRTLIIFTGLAVLAPILSILIYFKIAKKFEDYIQKLNDNTYKGKDRIPFSFKIGNLVCRS
NTEKSFFNFTVNIIKSERNFKLKTYPNIAMSLVFPFIFLFNFIRSYESFADWKNHMASSNEFFTLYICIFMLTPVILMVK
YSDQFKASWIYKAVPIDDMASIFKGVYKGVFYKMILPVYIVLALVYLWVFGLRIIPQIIAILFVIIILNLITVKLMDKHL
PFSVSFKDGEKMDDLGITLFIFMLSAIFGVVHYIINRLNYGVYIFIFIELILIGILWTIISKSKYHKIN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63371; Mature: 63371

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.4 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKKDKSLAVVHRLRGVYEKLGVDYEMMRLILETKLTMDRRREHTINMNNKSSDEKDNSFG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHH
KALILYGVMGAFMSMLIIIKQNIMLQMAVYFGFFMFVIGSSFIADFAYVLLDVRDKNLLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
ITGVSSKTINAAKITNILIYMTKLSLAYGGVGILVSLRYGILFTIVFILEIILINLFMIL
EECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
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CCCCCCCCEEEECCCEEECCCCCHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
NFIRSYESFADWKNHMASSNEFFTLYICIFMLTPVILMVKYSDQFKASWIYKAVPIDDMA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHEEEECCHHHHH
SIFKGVYKGVFYKMILPVYIVLALVYLWVFGLRIIPQIIAILFVIIILNLITVKLMDKHL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PFSVSFKDGEKMDDLGITLFIFMLSAIFGVVHYIINRLNYGVYIFIFIELILIGILWTII
CEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKSKYHKIN
CCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA