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The map label for this gene is ykfA [C]

Identifier: 17232312

GI number: 17232312

Start: 5737373

End: 5739259

Strand: Reverse

Name: ykfA [C]

Synonym: all4820

Alternate gene names: 17232312

Gene position: 5739259-5737373 (Counterclockwise)

Preceding gene: 17232314

Following gene: 17232309

Centisome position: 89.48

GC content: 45.2

Gene sequence:

>1887_bases
GTGATATTGGCAATGCCGATCGCCTCCATAATTATTTTCTTACTAGTATCCGCCGGGATGCAGATTCATGCTTGGGGACT
AAGTTGGATTTGGGCTGTGTTTACCTTGGCATTTGTAGCTTGGCGTTGGTTGTTGGTGAAATGGACACAACCAGCCATCC
GGCAAATAGAAGCTGCATTAGCCGAAGTTAAAGAAGAACTCAAATCTGCGGTGGAGGATACAACACCAATTGTTAGTAGT
GATAGGACACAACAAGCAGAAGCAGCTTTGCAAGAAATTCTCACAATCGCCCAAAACGATCGCCCAATTTGGGAAGATTG
GACAACATTTTGGCAAAGATGTCAAGATTTAGTGAGAGCGATCGCCCTGATTTATTATCCCCAGGTGCAGTATCCCTTAC
TAAATATCTACGTACCCCAAGCTTACGGATTGATTCGGGGAACAGTCGATGACTTAGATCAATGGATGCAGAAGTTATCA
CCAGCACTCAATCAGGTAACAATTGGGCAAGCATACCAAGCATACGAAGTGTATCGCAAACTAGAACCATCAGCGCGGAA
GGTCTGGCGTGCATGGAACTGGGCGCAGTGGTTGTTAAATCCTGTGGCTGCGGCGGCTAACCGGGCAACTAAGGGAACAA
CTAATCAAGCAAATCAGCAATTATTGGTGAATTTGGGGCAATTACTGCGGGAAGCCGCTTTAAAAAACTTGTGTCGCCAG
GCGATCGCCCTCTACAGTGGAACTACAGTAAATATCTCCACAGCTACCGTTTCTACCCCAACCTTACCAAAAACCAAAAC
TCAAACACTAGAAAACATTCTCGCACAAGCCCAGCCAGTCGAGAAAGTTACCCAGAAACCTGTAAATATTTTACTGGCAG
GAAGAACGGGAGCAGGCAAAAGCAGTTTAATTAATACAATCTTCCAAAGTAATTTGGCAGAAGTTGATGTGTTACCCAGC
ACCGCCGAAATTCAAAATTACCACTGGCAAACCCAAGATGGGGAAACCTTGAATCTCTTAGACACACCAGGATACGAACA
AGTTAAACGGGGCGATTTACGGGATTCCGTATTAGAATATGCCACCAAAGCCGACTTATTACTGTTAGTCACTCCTGTAC
TTGACCCCGCTTTACAAATGGATGTGGACTTTTTGCAAGAAATCAAAGCCACAGTTGCAGACATCCCCGCGATCGCTGTA
GTTACTCAAGTAGATCGTCTGCGTCCCATCCGTGAATGGCAACCGCCTTATGATTGGGAATTGGGTAACAGACCCAAGGA
AATTGCCATCCGCGAAGCTACAGAGTACCGTGCTAACTTGTTAGGAGACTTTTGTAATCTAGTCCTACCCATTGTCACAG
GTGATACACAAACAGGTAGACTTGCTTGGGGAATAGAGGCTTTATCCTTGGGATTAATCCAGGCGATCGCCCCAGCCAAA
CAACTCAGACTCGCCCGCTTTTTGCGTAACCTAGAAGCCCGTACTGTAGCTGCTGCCAAAATCATCGACCACTACACATT
ACAAATGGCAACCACCCAAGGATTGACAGCATTACTCAAAAGTCCAGTGCTTCAGTTCATTTCTACCATTTCCACTGGTT
CCCCAACCTTGGCTTACCTACTAGCAGAACAAATTCCCGTAGAACAGTTACCCATTGTCATTGGTAAACTGCAAATGGCT
TATGATTTATTCTCACTATTAAAAACAGAAGAATCCAGCACCCTCAACTTTGACTTATTATCTCTGTGGCCGCTACTTTT
AGAAAACCCCACCACACCAGACCGCAACGCCTGGGCTTTTGGTCATGCGCTAGTTGAATACTGGACTCAAAATCTCACAG
TTGAACAATTACGACAGCGTTTCGACTATTATTTACAGCAGATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGCTTTATTTTCTAACAGTCTTGGGATGAATGATAGCAGTACAGTAACTTTAATTCAGGTAGGTATGGGGAAATGGTGC
GTTTAAAACCGTGGCAGTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTAACTAAAGAATTGTTTCAGCTTGAATTTCTCGAATAATTGTGAGAACTTCATCTTCTGATTGGATATGCCGTGCTA
ACACTTGAGCAGTTGATTCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628

Protein sequence:

>628_residues
MILAMPIASIIIFLLVSAGMQIHAWGLSWIWAVFTLAFVAWRWLLVKWTQPAIRQIEAALAEVKEELKSAVEDTTPIVSS
DRTQQAEAALQEILTIAQNDRPIWEDWTTFWQRCQDLVRAIALIYYPQVQYPLLNIYVPQAYGLIRGTVDDLDQWMQKLS
PALNQVTIGQAYQAYEVYRKLEPSARKVWRAWNWAQWLLNPVAAAANRATKGTTNQANQQLLVNLGQLLREAALKNLCRQ
AIALYSGTTVNISTATVSTPTLPKTKTQTLENILAQAQPVEKVTQKPVNILLAGRTGAGKSSLINTIFQSNLAEVDVLPS
TAEIQNYHWQTQDGETLNLLDTPGYEQVKRGDLRDSVLEYATKADLLLLVTPVLDPALQMDVDFLQEIKATVADIPAIAV
VTQVDRLRPIREWQPPYDWELGNRPKEIAIREATEYRANLLGDFCNLVLPIVTGDTQTGRLAWGIEALSLGLIQAIAPAK
QLRLARFLRNLEARTVAAAKIIDHYTLQMATTQGLTALLKSPVLQFISTISTGSPTLAYLLAEQIPVEQLPIVIGKLQMA
YDLFSLLKTEESSTLNFDLLSLWPLLLENPTTPDRNAWAFGHALVEYWTQNLTVEQLRQRFDYYLQQI

Sequences:

>Translated_628_residues
MILAMPIASIIIFLLVSAGMQIHAWGLSWIWAVFTLAFVAWRWLLVKWTQPAIRQIEAALAEVKEELKSAVEDTTPIVSS
DRTQQAEAALQEILTIAQNDRPIWEDWTTFWQRCQDLVRAIALIYYPQVQYPLLNIYVPQAYGLIRGTVDDLDQWMQKLS
PALNQVTIGQAYQAYEVYRKLEPSARKVWRAWNWAQWLLNPVAAAANRATKGTTNQANQQLLVNLGQLLREAALKNLCRQ
AIALYSGTTVNISTATVSTPTLPKTKTQTLENILAQAQPVEKVTQKPVNILLAGRTGAGKSSLINTIFQSNLAEVDVLPS
TAEIQNYHWQTQDGETLNLLDTPGYEQVKRGDLRDSVLEYATKADLLLLVTPVLDPALQMDVDFLQEIKATVADIPAIAV
VTQVDRLRPIREWQPPYDWELGNRPKEIAIREATEYRANLLGDFCNLVLPIVTGDTQTGRLAWGIEALSLGLIQAIAPAK
QLRLARFLRNLEARTVAAAKIIDHYTLQMATTQGLTALLKSPVLQFISTISTGSPTLAYLLAEQIPVEQLPIVIGKLQMA
YDLFSLLKTEESSTLNFDLLSLWPLLLENPTTPDRNAWAFGHALVEYWTQNLTVEQLRQRFDYYLQQI
>Mature_628_residues
MILAMPIASIIIFLLVSAGMQIHAWGLSWIWAVFTLAFVAWRWLLVKWTQPAIRQIEAALAEVKEELKSAVEDTTPIVSS
DRTQQAEAALQEILTIAQNDRPIWEDWTTFWQRCQDLVRAIALIYYPQVQYPLLNIYVPQAYGLIRGTVDDLDQWMQKLS
PALNQVTIGQAYQAYEVYRKLEPSARKVWRAWNWAQWLLNPVAAAANRATKGTTNQANQQLLVNLGQLLREAALKNLCRQ
AIALYSGTTVNISTATVSTPTLPKTKTQTLENILAQAQPVEKVTQKPVNILLAGRTGAGKSSLINTIFQSNLAEVDVLPS
TAEIQNYHWQTQDGETLNLLDTPGYEQVKRGDLRDSVLEYATKADLLLLVTPVLDPALQMDVDFLQEIKATVADIPAIAV
VTQVDRLRPIREWQPPYDWELGNRPKEIAIREATEYRANLLGDFCNLVLPIVTGDTQTGRLAWGIEALSLGLIQAIAPAK
QLRLARFLRNLEARTVAAAKIIDHYTLQMATTQGLTALLKSPVLQFISTISTGSPTLAYLLAEQIPVEQLPIVIGKLQMA
YDLFSLLKTEESSTLNFDLLSLWPLLLENPTTPDRNAWAFGHALVEYWTQNLTVEQLRQRFDYYLQQI

Specific function: Unknown

COG id: COG3596

COG function: function code R; Predicted GTPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70590; Mature: 70590

Theoretical pI: Translated: 5.15; Mature: 5.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILAMPIASIIIFLLVSAGMQIHAWGLSWIWAVFTLAFVAWRWLLVKWTQPAIRQIEAAL
CEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
AEVKEELKSAVEDTTPIVSSDRTQQAEAALQEILTIAQNDRPIWEDWTTFWQRCQDLVRA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IALIYYPQVQYPLLNIYVPQAYGLIRGTVDDLDQWMQKLSPALNQVTIGQAYQAYEVYRK
HHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEPSARKVWRAWNWAQWLLNPVAAAANRATKGTTNQANQQLLVNLGQLLREAALKNLCRQ
CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIALYSGTTVNISTATVSTPTLPKTKTQTLENILAQAQPVEKVTQKPVNILLAGRTGAGK
HHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCH
SSLINTIFQSNLAEVDVLPSTAEIQNYHWQTQDGETLNLLDTPGYEQVKRGDLRDSVLEY
HHHHHHHHHCCCCCEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHH
ATKADLLLLVTPVLDPALQMDVDFLQEIKATVADIPAIAVVTQVDRLRPIREWQPPYDWE
HHHCCHHEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCC
LGNRPKEIAIREATEYRANLLGDFCNLVLPIVTGDTQTGRLAWGIEALSLGLIQAIAPAK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLRLARFLRNLEARTVAAAKIIDHYTLQMATTQGLTALLKSPVLQFISTISTGSPTLAYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
LAEQIPVEQLPIVIGKLQMAYDLFSLLKTEESSTLNFDLLSLWPLLLENPTTPDRNAWAF
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
GHALVEYWTQNLTVEQLRQRFDYYLQQI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MILAMPIASIIIFLLVSAGMQIHAWGLSWIWAVFTLAFVAWRWLLVKWTQPAIRQIEAAL
CEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
AEVKEELKSAVEDTTPIVSSDRTQQAEAALQEILTIAQNDRPIWEDWTTFWQRCQDLVRA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IALIYYPQVQYPLLNIYVPQAYGLIRGTVDDLDQWMQKLSPALNQVTIGQAYQAYEVYRK
HHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEPSARKVWRAWNWAQWLLNPVAAAANRATKGTTNQANQQLLVNLGQLLREAALKNLCRQ
CCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIALYSGTTVNISTATVSTPTLPKTKTQTLENILAQAQPVEKVTQKPVNILLAGRTGAGK
HHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCH
SSLINTIFQSNLAEVDVLPSTAEIQNYHWQTQDGETLNLLDTPGYEQVKRGDLRDSVLEY
HHHHHHHHHCCCCCEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHH
ATKADLLLLVTPVLDPALQMDVDFLQEIKATVADIPAIAVVTQVDRLRPIREWQPPYDWE
HHHCCHHEEEHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCC
LGNRPKEIAIREATEYRANLLGDFCNLVLPIVTGDTQTGRLAWGIEALSLGLIQAIAPAK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLRLARFLRNLEARTVAAAKIIDHYTLQMATTQGLTALLKSPVLQFISTISTGSPTLAYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
LAEQIPVEQLPIVIGKLQMAYDLFSLLKTEESSTLNFDLLSLWPLLLENPTTPDRNAWAF
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
GHALVEYWTQNLTVEQLRQRFDYYLQQI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA