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The map label for this gene is 17231281

Identifier: 17231281

GI number: 17231281

Start: 4579676

End: 4581976

Strand: Direct

Name: 17231281

Synonym: alr3789

Alternate gene names: NA

Gene position: 4579676-4581976 (Clockwise)

Preceding gene: 17231275

Following gene: 17231282

Centisome position: 71.4

GC content: 35.38

Gene sequence:

>2301_bases
ATGACCAGCCAAGGACTGAGAGCCTCGCCTGAAGGTATTAGAGCCGCGAAAACAGCCCTAACCGACAAAACCTTGACTCA
ACAAAAACTAGCAGCTGCGTTAGGGATTACACGCCAACCAGTCTCCAAGTTTTTCGCGGGAGAGCCGGTATCTCGCAGTT
GTTTTGTGCAAATTTGCCAACAACTAGGACTATCCTGGCAAAAAGTTGTTGGTTTAGCGGAAGAAGCAATATCAGAGACT
AAATTACAATCCCAAGGAATTGACCTTGATGCGTTGGTAAGGGAAGTACGCCAAAAGCGTCAGGAGAAAATTCAAGACCA
TTGCAGTACTCTGCAAATGTTAGATATTGCTCAGGCAATTCCCTTAAGTGAAATTTACACTCCTGTGAGTATTTTGGAGG
AGATAACCAGTCAGCAATGGCGGGAAATTTCTGACCTGATGAATGATTGGTGTATTGAATCTAACTTTCAGGGGTTTGGG
CAAGGAAAACATCAAAGAGCATTACCAGGGTTAGATGCTATATCGCGCTATTCAAAATTGATGCTTTTGGGTAAACCTGG
GTCTGGGAAGACAACATTTTTACAGTATCTAGCAATGGAATGTAATTATGGTAAATTACGACCCAATCAAGTACCTATCT
TTATTAGGTTAAAGGAATTTGCTGAAGATACTCAACGTGAGAGTGAGTTAAATCTTTTACAGTACTTAGTTCAAGAATTT
CGTTGCAATGGAGTTGAAGAAGAATCAACTTTAGCGGTGCTTACGGGAGGTAAAGCACTAATTTTACTTGATGCTTTAGA
TGAAGTGCCATTGAGTCATGTAGATAAAGTTATTAGAGAAATCCGCAAGTTTATTCAGACATTTTATAAAAATCAATTTG
TAATTACTTGCCGAGTTTCTGCCCAAAAATATAGGTTTCAAGGTTTCACTGAGGTGGAAATTGCAGATTTTCAAGAACAA
CAAAGAGATGTTTTTGTCAAGCAATGGTTTATGGCAGTGGCTCATCTGTCAAGCAAAGAAGGTGAATCAACTTGCAATAT
ATTTACCCAGCAACTGAACTTACCGGAAAATCAGCGCATCCGAGAATTAGCGAATACACCAATTTTATTGCATCTATTGT
GTTTAATATTTAAAGTTAAGATGCAATTTCCCTGTAAATCGGCAAATTTATACGAACAGGCACTGAATATTTTCCTGGCT
AGATGGGATGAAACTAGAGGTATTAAAAGAGATGATTTTTATGCACATTTAAATTTAGCAGATAAAAAGAAGCTACTTTG
CTATCTTGCCGTCAATACTTTTGTGAAAGGAGATTATTTCTTTACTTCAGATAAAATTCAAGACTTAATATGTGATTATT
TATCTAACCAATCAAATACCATTGATTTACAGCAACATAGTATAGATATTCTGCAAGGAATTGAAGCACAAGATGGTTTA
TTAGTAGAACGAGCTAGGGGGATTGATTCTTTTTCCCATTTGGCATTTCAAGAATATCTCACTGCAAAATATATTGTTGA
TGATGCTCAAAATTATAATTGGCAGTTGTTAATTAACCACATAGGCGAAGAGCGTTGGCATAACTTGTTCTTGTTAATCG
TCAGTATGTTAGATAAACCTGACAACATACTCCAATTAATGAAAGATAAAGTTGATGAGCTTGTAGCTGCTGATGAAAAG
ATTCAAAGTTATTTAGTTTGGCTGCATCAAAAAACTAATGAAGTTGTTAATTCAGGGCAAGTATTTGCTACTCGTGCCTT
TTACATGATTTGTAGTTACTTTTTTGCCGATAGTGACAACAATGTGTTAGCAGGAGATTTATTTAACGATATATCTTTTA
ATGCTGAATTAGCTCTGGATCAGTTGCTTTTTAGTACTCTGAACTGTGTGAGTGAGCTAGAAATTTGTTTTGAACAAAAT
CTTCATCACGCTCATGCTTTTAATTATATCTACGCTCTCAACATTAATTTCGATGAAGCTATTAATATAGTTAGTGATGC
CGAATTTAGAGAAGAATTACAAAAGCTCAAGAAAGGATTACCCAGTGCAGAAAGTAATTTTGAAAAATTAGTATCTTGGT
GGGATGAAAATGGTAAGTCATGGAACCAACAATTGAGTATTAAGATAATTAAATATCGTAACATTGGTCACAATTGGCAA
TTTGAGAAGCAACAAGTTAGGTTATTACAACAATATTTTAAAGCTAATAAATTACTAATGGATTGTCTAAGATATGCTTT
GAATGATGGATTAAAACAAAAAATTGAGGATGAATTATTTCTAATCTACCAAAAGAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGAAAAACTACCTACGGGGAGATATGAGTATTTGTCCGGAGTGTGTCTACGTGCAGCTACCAAAAAAATCGTATTTAAT
AACACATTTTAGCTGAGAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAGACAATATTCATACCACAGCCAGAGAAAATAAACGGATAAACTTAGCTAAATTGCTATTAATTCCATTAGCAGTTAA
TAGTTAGGTTATGACTAATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Signal Transduction Protein; NACHT Domain Family; Signal Transduction Protein With Nacht Domain Protein; NTPase-Like Protein; PBS Lyase HEAT-Like Repeat Domain Protein; SLEI Family; XRE Family Transcriptional Regulator; GUN4-Like Family; HEAT Repeat Protein; NTPase-Like Protein Probably Invoved In Signal Transduction; P-Loop Containing NTPase; GUN4 Domain Protein

Number of amino acids: Translated: 766; Mature: 765

Protein sequence:

>766_residues
MTSQGLRASPEGIRAAKTALTDKTLTQQKLAAALGITRQPVSKFFAGEPVSRSCFVQICQQLGLSWQKVVGLAEEAISET
KLQSQGIDLDALVREVRQKRQEKIQDHCSTLQMLDIAQAIPLSEIYTPVSILEEITSQQWREISDLMNDWCIESNFQGFG
QGKHQRALPGLDAISRYSKLMLLGKPGSGKTTFLQYLAMECNYGKLRPNQVPIFIRLKEFAEDTQRESELNLLQYLVQEF
RCNGVEEESTLAVLTGGKALILLDALDEVPLSHVDKVIREIRKFIQTFYKNQFVITCRVSAQKYRFQGFTEVEIADFQEQ
QRDVFVKQWFMAVAHLSSKEGESTCNIFTQQLNLPENQRIRELANTPILLHLLCLIFKVKMQFPCKSANLYEQALNIFLA
RWDETRGIKRDDFYAHLNLADKKKLLCYLAVNTFVKGDYFFTSDKIQDLICDYLSNQSNTIDLQQHSIDILQGIEAQDGL
LVERARGIDSFSHLAFQEYLTAKYIVDDAQNYNWQLLINHIGEERWHNLFLLIVSMLDKPDNILQLMKDKVDELVAADEK
IQSYLVWLHQKTNEVVNSGQVFATRAFYMICSYFFADSDNNVLAGDLFNDISFNAELALDQLLFSTLNCVSELEICFEQN
LHHAHAFNYIYALNINFDEAINIVSDAEFREELQKLKKGLPSAESNFEKLVSWWDENGKSWNQQLSIKIIKYRNIGHNWQ
FEKQQVRLLQQYFKANKLLMDCLRYALNDGLKQKIEDELFLIYQKR

Sequences:

>Translated_766_residues
MTSQGLRASPEGIRAAKTALTDKTLTQQKLAAALGITRQPVSKFFAGEPVSRSCFVQICQQLGLSWQKVVGLAEEAISET
KLQSQGIDLDALVREVRQKRQEKIQDHCSTLQMLDIAQAIPLSEIYTPVSILEEITSQQWREISDLMNDWCIESNFQGFG
QGKHQRALPGLDAISRYSKLMLLGKPGSGKTTFLQYLAMECNYGKLRPNQVPIFIRLKEFAEDTQRESELNLLQYLVQEF
RCNGVEEESTLAVLTGGKALILLDALDEVPLSHVDKVIREIRKFIQTFYKNQFVITCRVSAQKYRFQGFTEVEIADFQEQ
QRDVFVKQWFMAVAHLSSKEGESTCNIFTQQLNLPENQRIRELANTPILLHLLCLIFKVKMQFPCKSANLYEQALNIFLA
RWDETRGIKRDDFYAHLNLADKKKLLCYLAVNTFVKGDYFFTSDKIQDLICDYLSNQSNTIDLQQHSIDILQGIEAQDGL
LVERARGIDSFSHLAFQEYLTAKYIVDDAQNYNWQLLINHIGEERWHNLFLLIVSMLDKPDNILQLMKDKVDELVAADEK
IQSYLVWLHQKTNEVVNSGQVFATRAFYMICSYFFADSDNNVLAGDLFNDISFNAELALDQLLFSTLNCVSELEICFEQN
LHHAHAFNYIYALNINFDEAINIVSDAEFREELQKLKKGLPSAESNFEKLVSWWDENGKSWNQQLSIKIIKYRNIGHNWQ
FEKQQVRLLQQYFKANKLLMDCLRYALNDGLKQKIEDELFLIYQKR
>Mature_765_residues
TSQGLRASPEGIRAAKTALTDKTLTQQKLAAALGITRQPVSKFFAGEPVSRSCFVQICQQLGLSWQKVVGLAEEAISETK
LQSQGIDLDALVREVRQKRQEKIQDHCSTLQMLDIAQAIPLSEIYTPVSILEEITSQQWREISDLMNDWCIESNFQGFGQ
GKHQRALPGLDAISRYSKLMLLGKPGSGKTTFLQYLAMECNYGKLRPNQVPIFIRLKEFAEDTQRESELNLLQYLVQEFR
CNGVEEESTLAVLTGGKALILLDALDEVPLSHVDKVIREIRKFIQTFYKNQFVITCRVSAQKYRFQGFTEVEIADFQEQQ
RDVFVKQWFMAVAHLSSKEGESTCNIFTQQLNLPENQRIRELANTPILLHLLCLIFKVKMQFPCKSANLYEQALNIFLAR
WDETRGIKRDDFYAHLNLADKKKLLCYLAVNTFVKGDYFFTSDKIQDLICDYLSNQSNTIDLQQHSIDILQGIEAQDGLL
VERARGIDSFSHLAFQEYLTAKYIVDDAQNYNWQLLINHIGEERWHNLFLLIVSMLDKPDNILQLMKDKVDELVAADEKI
QSYLVWLHQKTNEVVNSGQVFATRAFYMICSYFFADSDNNVLAGDLFNDISFNAELALDQLLFSTLNCVSELEICFEQNL
HHAHAFNYIYALNINFDEAINIVSDAEFREELQKLKKGLPSAESNFEKLVSWWDENGKSWNQQLSIKIIKYRNIGHNWQF
EKQQVRLLQQYFKANKLLMDCLRYALNDGLKQKIEDELFLIYQKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88440; Mature: 88309

Theoretical pI: Translated: 5.58; Mature: 5.58

Prosite motif: PS50837 NACHT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.1 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
2.1 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTSQGLRASPEGIRAAKTALTDKTLTQQKLAAALGITRQPVSKFFAGEPVSRSCFVQICQ
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
QLGLSWQKVVGLAEEAISETKLQSQGIDLDALVREVRQKRQEKIQDHCSTLQMLDIAQAI
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PLSEIYTPVSILEEITSQQWREISDLMNDWCIESNFQGFGQGKHQRALPGLDAISRYSKL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHE
MLLGKPGSGKTTFLQYLAMECNYGKLRPNQVPIFIRLKEFAEDTQRESELNLLQYLVQEF
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RCNGVEEESTLAVLTGGKALILLDALDEVPLSHVDKVIREIRKFIQTFYKNQFVITCRVS
CCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC
AQKYRFQGFTEVEIADFQEQQRDVFVKQWFMAVAHLSSKEGESTCNIFTQQLNLPENQRI
CHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHH
RELANTPILLHLLCLIFKVKMQFPCKSANLYEQALNIFLARWDETRGIKRDDFYAHLNLA
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECC
DKKKLLCYLAVNTFVKGDYFFTSDKIQDLICDYLSNQSNTIDLQQHSIDILQGIEAQDGL
CCHHHHHHEEHHHHHCCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCH
LVERARGIDSFSHLAFQEYLTAKYIVDDAQNYNWQLLINHIGEERWHNLFLLIVSMLDKP
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
DNILQLMKDKVDELVAADEKIQSYLVWLHQKTNEVVNSGQVFATRAFYMICSYFFADSDN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NVLAGDLFNDISFNAELALDQLLFSTLNCVSELEICFEQNLHHAHAFNYIYALNINFDEA
CEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEEEEECCHHHH
INIVSDAEFREELQKLKKGLPSAESNFEKLVSWWDENGKSWNQQLSIKIIKYRNIGHNWQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCC
FEKQQVRLLQQYFKANKLLMDCLRYALNDGLKQKIEDELFLIYQKR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECC
>Mature Secondary Structure 
TSQGLRASPEGIRAAKTALTDKTLTQQKLAAALGITRQPVSKFFAGEPVSRSCFVQICQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
QLGLSWQKVVGLAEEAISETKLQSQGIDLDALVREVRQKRQEKIQDHCSTLQMLDIAQAI
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PLSEIYTPVSILEEITSQQWREISDLMNDWCIESNFQGFGQGKHQRALPGLDAISRYSKL
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MLLGKPGSGKTTFLQYLAMECNYGKLRPNQVPIFIRLKEFAEDTQRESELNLLQYLVQEF
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RCNGVEEESTLAVLTGGKALILLDALDEVPLSHVDKVIREIRKFIQTFYKNQFVITCRVS
CCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEC
AQKYRFQGFTEVEIADFQEQQRDVFVKQWFMAVAHLSSKEGESTCNIFTQQLNLPENQRI
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RELANTPILLHLLCLIFKVKMQFPCKSANLYEQALNIFLARWDETRGIKRDDFYAHLNLA
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NVLAGDLFNDISFNAELALDQLLFSTLNCVSELEICFEQNLHHAHAFNYIYALNINFDEA
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INIVSDAEFREELQKLKKGLPSAESNFEKLVSWWDENGKSWNQQLSIKIIKYRNIGHNWQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCC
FEKQQVRLLQQYFKANKLLMDCLRYALNDGLKQKIEDELFLIYQKR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA