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The map label for this gene is 17230929

Identifier: 17230929

GI number: 17230929

Start: 4143832

End: 4146207

Strand: Direct

Name: 17230929

Synonym: alr3437

Alternate gene names: NA

Gene position: 4143832-4146207 (Clockwise)

Preceding gene: 17230926

Following gene: 17230933

Centisome position: 64.61

GC content: 41.46

Gene sequence:

>2376_bases
ATGGACGCTGAAGCAGCATTAGCATGGTTAGACACCATAATTCCTGCTCAGACCGGGGAACGGTTGAGCGATTTGCAAAA
AGTTATTGTTGTGCAGGTTTGGTTGGGTAGGAAATATTTGGATATTGCCCGTGCTTATGGTTGTACGGAAGGACACGCTA
AGGATGCTGGCTCACATTTATGGAAACTGCTTTCTCAAGTACTGCGGGAGAGGATTACCAAGAGTAATTGTCGCGCTACG
TTGGAACGAGTGCTGAGAAAAACTACGGCTATATCTGGTCTAATTGATTACCAAAAATTGACCCAACAACCTACACCTAA
ATTAGAGGATAGCAATTTTTTAGGTAGGGAGGAAGCGATCGCTCACCTAAATACTCTAGTAAATCCAGGCTCGAAAGTGA
TTGTCGTCCAAGGTGAGGGGGGTTTAGGCAAAACTACTCTCGCCCAGCAATATCTCCAAACTCAGGGTTTTGACTTGGTT
TTAGAACTGTTAATGGCGAAGGAAACCCAAAACATTACCCCGGCGGAACGGGTGGTGGAAGAATGGCTCAAACAAGACTT
TGGGGAAGAACCAGGGGTAGAGTTTGGTGTGACGTTGGGACGACTCAAGCGCCAACTCCACAATCGGCGGATTGGGGTGT
TAATTGATAATCTGGAACCTGCATTAGATCAACAAGGTCGTTTGATTCCGCTTCACCGCAATTATGTAGAACTGTTGCGG
GTTTTGGCTGATGTTAGGGTGCAGTCGGTAACGTTGATTACTAGCCGCGATCGCCTGTGTGAACCTGGTTTAAATGTGCA
TCACTATCGGCTTCCAGGTTTGGATCAAAGCGCATGGCAAAAGTTTTTTAGTAACCGTGGGTTAACTATCAACTTGCCTA
TCTTGCAACAAATACATCATACTTACGGCGGTAATGCCAAAGCAATGGGGATTCTCTGCGGGGCGATGCAGGAAGATTTC
GGCGGGGATATGGCGCTTTATTGGCAAGAAAATCATGGTGATCCTTTAGCCGCAACAGATTTAAAGAATTTAGCGGTGAG
TCAAATTAATCGTTTGCAAGCCCTTGATCCCCAAGCCTATCGCCTACTGTGCCGTTTGGGATGTTATCGTTACCAAGATA
TACCCACCATTCCCTCATCAGGACTGTTTTCTTTACTTTGGGATGTTCCCGCGTCTGAACATCGTCAACTTATTGCTTCC
CTGAGAAATCGCTCTTTAGTGGAGTGTCATCAAGGGGAATATTGGCTACATCCGGTAATTCGCGCCGAGGCGATCGCTCG
TTTACGTACCAGTGATGAGTGGGAAATAACCAATCACAAGGCTGCCGATTTTTGGACAGCTAGTATTCCCAAAATTGCCA
CATTTCAAGATGCTTTACAAGCGCTAGAAGCATATTATCACTACATAGACATCAACGAATTTGAGTTAGCAGGTAAGGTA
ATTCTCAAGAGTCGCAATAATCAATGGCAGCAGTTTTTACCCTTGGGAAGTACCTTGTATCGGATGGGTTTGATTCAGCC
GATATTAACAGCAATTAATCAAGTTTTAAAAAATATTCAGCATGACCAAAACTTAAGTGAATTGTACAATATATTGGGTG
ATTTACATTGGATAACAGGGAATATTAGTCAAGCGATCGCCTGTCAGGAAAAAACCATCAATCTGACAACACAAGCCCTG
AAATCACTCGTACCGCAACCAGAGAATAAACATAAAGTCTACTATTTGAGAATGTTAGAAGTAGATTCTCTCTTAAGTAT
TGGTCTTTATAAGATAGATTTGTGGGAACTGGAAGACGCTGCCAAATTATTTCAACAAGTAATTTACCTAGCCCAAAATA
CAGACCATCATCGCTGGGCAGAAAAAGCTTCTGTATGTTTAGCCTTAGTCAATTCATACTTAGGTTTATGTGATGCTGCT
TATTTATTAGCAGATGTAGCTTACCGAAATATTAAAAAAGAAGCAATTATAGAGACAGGAAGATTCGCTTATTTCATTCA
AATATTAGGTCAAACCTATGTTAATTTAGGAGACTTTACCAAAGCAAAGGAAATGTTTCACCAAGCTTTGACCTTTGCGG
AAGAAAGCCATTATATGCAGGTTAAAGCAAAAACCCTGAATGGATTAGCAGAAATTCATCGCCAACAAGCAGATTATCCA
TTAGCCCTGGCTTATCATACAGAAGCAATCGAACTTTTAGATAAAATCGGCGCTAAATGTGACCTAGCTGAAACCTATTT
TCAATTAGGTTTAACTTATAAAAAAATGGCAAAGTCTGATGCCAGTCAAAAGTATTTTACTCAAGCAATAAATTTATTTA
CAGAAATTAAAGCCCCTAATCAAGTTGACAAAATTTCCATAACTGCCAGTTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAGTCGGATTCATCGAATCTTATCCGAAAGATGGGGCAGAAGAATTGTAGATTAACCTATAGTTCTCAAATTTAACT
ACCCTCGTCATTGCATAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCACCACTTCCCCTAAACCCACCTTTCAAGCTAAATTCCACGTCCTGGCTTACAATCTACGAAACCTAATGCTTCTGTG
TCCAGAAAACTGGCGATCGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 791; Mature: 791

Protein sequence:

>791_residues
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHLWKLLSQVLRERITKSNCRAT
LERVLRKTTAISGLIDYQKLTQQPTPKLEDSNFLGREEAIAHLNTLVNPGSKVIVVQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFDLV
LELLMAKETQNITPAERVVEEWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGRLIPLHRNYVELLR
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSNRGLTINLPILQQIHHTYGGNAKAMGILCGAMQEDF
GGDMALYWQENHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAYRLLCRLGCYRYQDIPTIPSSGLFSLLWDVPASEHRQLIAS
LRNRSLVECHQGEYWLHPVIRAEAIARLRTSDEWEITNHKAADFWTASIPKIATFQDALQALEAYYHYIDINEFELAGKV
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KSLVPQPENKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEDAAKLFQQVIYLAQNTDHHRWAEKASVCLALVNSYLGLCDAA
YLLADVAYRNIKKEAIIETGRFAYFIQILGQTYVNLGDFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
LALAYHTEAIELLDKIGAKCDLAETYFQLGLTYKKMAKSDASQKYFTQAINLFTEIKAPNQVDKISITASF

Sequences:

>Translated_791_residues
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHLWKLLSQVLRERITKSNCRAT
LERVLRKTTAISGLIDYQKLTQQPTPKLEDSNFLGREEAIAHLNTLVNPGSKVIVVQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFDLV
LELLMAKETQNITPAERVVEEWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGRLIPLHRNYVELLR
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSNRGLTINLPILQQIHHTYGGNAKAMGILCGAMQEDF
GGDMALYWQENHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAYRLLCRLGCYRYQDIPTIPSSGLFSLLWDVPASEHRQLIAS
LRNRSLVECHQGEYWLHPVIRAEAIARLRTSDEWEITNHKAADFWTASIPKIATFQDALQALEAYYHYIDINEFELAGKV
ILKSRNNQWQQFLPLGSTLYRMGLIQPILTAINQVLKNIQHDQNLSELYNILGDLHWITGNISQAIACQEKTINLTTQAL
KSLVPQPENKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEDAAKLFQQVIYLAQNTDHHRWAEKASVCLALVNSYLGLCDAA
YLLADVAYRNIKKEAIIETGRFAYFIQILGQTYVNLGDFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
LALAYHTEAIELLDKIGAKCDLAETYFQLGLTYKKMAKSDASQKYFTQAINLFTEIKAPNQVDKISITASF
>Mature_791_residues
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHLWKLLSQVLRERITKSNCRAT
LERVLRKTTAISGLIDYQKLTQQPTPKLEDSNFLGREEAIAHLNTLVNPGSKVIVVQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFDLV
LELLMAKETQNITPAERVVEEWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGRLIPLHRNYVELLR
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSNRGLTINLPILQQIHHTYGGNAKAMGILCGAMQEDF
GGDMALYWQENHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAYRLLCRLGCYRYQDIPTIPSSGLFSLLWDVPASEHRQLIAS
LRNRSLVECHQGEYWLHPVIRAEAIARLRTSDEWEITNHKAADFWTASIPKIATFQDALQALEAYYHYIDINEFELAGKV
ILKSRNNQWQQFLPLGSTLYRMGLIQPILTAINQVLKNIQHDQNLSELYNILGDLHWITGNISQAIACQEKTINLTTQAL
KSLVPQPENKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEDAAKLFQQVIYLAQNTDHHRWAEKASVCLALVNSYLGLCDAA
YLLADVAYRNIKKEAIIETGRFAYFIQILGQTYVNLGDFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
LALAYHTEAIELLDKIGAKCDLAETYFQLGLTYKKMAKSDASQKYFTQAINLFTEIKAPNQVDKISITASF

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 15 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR002182
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00931 NB-ARC; PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89634; Mature: 89634

Theoretical pI: Translated: 6.95; Mature: 6.95

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDAEAALAWLDTIIPAQTGERLSDLQKVIVVQVWLGRKYLDIARAYGCTEGHAKDAGSHL
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
WKLLSQVLRERITKSNCRATLERVLRKTTAISGLIDYQKLTQQPTPKLEDSNFLGREEAI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
AHLNTLVNPGSKVIVVQGEGGLGKTTLAQQYLQTQGFDLVLELLMAKETQNITPAERVVE
HHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
EWLKQDFGEEPGVEFGVTLGRLKRQLHNRRIGVLIDNLEPALDQQGRLIPLHRNYVELLR
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHCCCCCEEECHHHHHHHHH
VLADVRVQSVTLITSRDRLCEPGLNVHHYRLPGLDQSAWQKFFSNRGLTINLPILQQIHH
HHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHH
TYGGNAKAMGILCGAMQEDFGGDMALYWQENHGDPLAATDLKNLAVSQINRLQALDPQAY
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
RLLCRLGCYRYQDIPTIPSSGLFSLLWDVPASEHRQLIASLRNRSLVECHQGEYWLHPVI
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEEHHHH
RAEAIARLRTSDEWEITNHKAADFWTASIPKIATFQDALQALEAYYHYIDINEFELAGKV
HHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
ILKSRNNQWQQFLPLGSTLYRMGLIQPILTAINQVLKNIQHDQNLSELYNILGDLHWITG
HEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC
NISQAIACQEKTINLTTQALKSLVPQPENKHKVYYLRMLEVDSLLSIGLYKIDLWELEDA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECHHHHHHCCCEEEEHHHHHHH
AKLFQQVIYLAQNTDHHRWAEKASVCLALVNSYLGLCDAAYLLADVAYRNIKKEAIIETG
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RFAYFIQILGQTYVNLGDFTKAKEMFHQALTFAEESHYMQVKAKTLNGLAEIHRQQADYP
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LALAYHTEAIELLDKIGAKCDLAETYFQLGLTYKKMAKSDASQKYFTQAINLFTEIKAPN
EEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
QVDKISITASF
CCCEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
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WKLLSQVLRERITKSNCRATLERVLRKTTAISGLIDYQKLTQQPTPKLEDSNFLGREEAI
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LALAYHTEAIELLDKIGAKCDLAETYFQLGLTYKKMAKSDASQKYFTQAINLFTEIKAPN
EEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
QVDKISITASF
CCCEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]