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The map label for this gene is 17230859

Identifier: 17230859

GI number: 17230859

Start: 4074663

End: 4077014

Strand: Reverse

Name: 17230859

Synonym: all3367

Alternate gene names: NA

Gene position: 4077014-4074663 (Counterclockwise)

Preceding gene: 17230863

Following gene: 17230852

Centisome position: 63.57

GC content: 38.52

Gene sequence:

>2352_bases
ATGGGTGCAGAAGAAGCTCTAGAGCTTTTGGATAGTTTGGTTTATAGAAAAACAGGGGAACGTTTAGGCACAACTCAAAG
AATAATTCTACGTAATTTATGGGAGGATAGAAAACAAACTTATCAGAATATTGCTGATATTTGTGGTTATACGGAAGCGC
ATTTAAAAGCAGTTGGCGCACAATTGTGGCAAACACTGACGAACGTTTTGGGGGAAAAAGTCTCGAAGTCAAACTTTTCT
TCAGTGGTGCAGAGATTTTGGCAATCTCATAGACTACAAAAGATGTCGCCTATTGTAAATCCAGTCCTCAATAATGGCAA
GCCACAAGAACTGGATTATAACTTTGTGGGGCGCGATCGCGAAATAGCCGAACTTGATAGCTATGTTGTCCGAGGCGCGA
AAATTATCCTCATCCAAGGTGAAGGTGGTGTTGGCAAAACTACCTTAGCTCGGCGGTATTTTAAGGCTCAAGGTTTTGAT
TTCCTAGAGTTGTGGATGGCTAAGGAAAGCCAACATATCGTTTCTGTGGAGAGTGTGGTTGAGGAATGGCTGAGGGTTGA
TTTTAATGAGGAACCGGGTAAAGAGTTTGGTATTAATCTAGATAGGCTACGGCGCAAGCTGCGGGATGAAACGCGCAAAA
TAGGGGTTTTAATTGATAATCTTGAGTCTGCTTTGGATAGAAATGGTCAGATTATTGCTTCTCGTCGTTCCTATGTAGAA
CTGTTGCGGGTATTAGCAGACCCTAGTATTAAATCTATCACTTTGATTACTAGTCGTGAGCGTCTGTATGAATCAGATGT
AGATGTGACTTTCTATCCCCTGGGGGGTTTAGATGAGTGTACTTGGCAAAAGTTTTTTACTAGTTGTCAAATTAAATCTA
ATTCACCTGCACTAAGTGAAATGTGTAAAGCTTTTGGTGGAAATGCCAAATCTATGCAAATTATTAGTGGTGCAATTACT
ACAGATTTTGAAGGCAATGCAGATATTTATTGGCGAGAAAATAAGCATGATTTATTAATTGAACCAGAATTAAAAAATTT
AGTTGCTAGTCAATTTGACCGTTTGGCACAAATGGATAGTGAAGCATATCGGCTGCTTTGTCGTTTGGGATGTTATCGCT
ATCAAGATGTTACTCATGTGAGTGTTCAGGGATTACAATGTTTACTTTGGGATGTGCCAGAACAACAAGCTAGGCGAGTA
ATTAGATATCTGACAGACCGTTTATTGATAGAGTTTCGTAAAGGAAAATATTGGTTACATCCGGTGATTTGTACAGAGGC
GATCGCCAGATTAAAACAAAGTGGTGAATGGCAAATTGCTAACCACAAAGCAGCAGAATTTTGGAATCAGAGTGTTACTC
AAGTGGAAAACCCTCAAGATGCTTTGATGGCGTTGGAAGCTTATCATCACTATATGGAAATTGGGGATTATGAAAAAGCT
GCTGATGTGATTATTCGTAGTAGACCCAAAAAGTGGGATCACAGTATATCTTTGGGGGTTTTATTTAATCGATTGGGTTT
GTTGGAAACCTTAATTTCTGTGATTAATCCCCTCATTCATAATTTACATTCCGACTATCATTTGAATATTCTGTATAATC
TATTGGGGCGAGCTTATCACCAAATAGGCAATATCAAATTAGCTCTGGAATGCCACTATAAATCTAATGAGATTGCTGAA
AAAAATAACTTTCTGCAAGAGAGAATTTCCAGTAGTTTCAATTTAGGTCTTTGTTACACAGATTTATGGGAAATTGAGCG
AGCAAGTGAGATTTTTTACTACGTCAAGAATCTAGGGGCAACAGACAGAAATTATTATCAATATGTTGTTTATTCTCTGT
GTTGTTTAGCTTATTTAGATTCCTCTGTGGGCAATAATGAAAACGTAGAGTTGATGTTACGAGAAGCGGAAGAGGGATTA
TCTCACGACAGATTAACTTCCTGGGGTATAGGCACTAGCTTACTATTTCTCAGCTTGACTTATAAAAATTTAGGTTTAAT
AGACAAGGCTTTCTCGATGTGCCATCAAGCTATTAACCATTGTCGTCAAAATCAGTTCAGTTTTTTGGAAGCGAGGGCTA
CATCTTGTTTAGCATCATTATATCGAGAACAGGGACAGTTTACAGTGGCGATAGATAAACATTTAGAAGCGATCGCCAAC
ATGAACAAGGTATCTGATAAATGCAATCTCGCCAAAGCCTACTACCAGTTAGGTTTAACATATCAAAGAATGGGTGAGGT
TAACCAGAGTAGAGAAACATTTCATCAGGCGATCGTTATTTTCAATGATATGCCTGCACCAAAGCAAGTGGAAAAAGTGC
AAATAACAATGACGCGTTTAGAAAATGGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCTACTGGGTAGGAAAAAGTAGTTTGTAGTATTGTGGCCAAAAGTGAAATCGTGAAAATATGGTTATAATTAAGCACAA
ATGATACAGTCAGGCGATAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGCAAAACAAGGTTGGGTGGAGGCTTTGCGTTAAGCGCTCAATTTATTTTTTTTCGTGATAAATCATATCAAAATATAG
CGATTTGCAATTGAGTTAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 783; Mature: 782

Protein sequence:

>783_residues
MGAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGAQLWQTLTNVLGEKVSKSNFS
SVVQRFWQSHRLQKMSPIVNPVLNNGKPQELDYNFVGRDREIAELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFD
FLELWMAKESQHIVSVESVVEEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
LLRVLADPSIKSITLITSRERLYESDVDVTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSPALSEMCKAFGGNAKSMQIISGAIT
TDFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLAQMDSEAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRV
IRYLTDRLLIEFRKGKYWLHPVICTEAIARLKQSGEWQIANHKAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEKA
ADVIIRSRPKKWDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIHNLHSDYHLNILYNLLGRAYHQIGNIKLALECHYKSNEIAE
KNNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIERASEIFYYVKNLGATDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVELMLREAEEGL
SHDRLTSWGIGTSLLFLSLTYKNLGLIDKAFSMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDMPAPKQVEKVQITMTRLENG

Sequences:

>Translated_783_residues
MGAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGAQLWQTLTNVLGEKVSKSNFS
SVVQRFWQSHRLQKMSPIVNPVLNNGKPQELDYNFVGRDREIAELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFD
FLELWMAKESQHIVSVESVVEEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
LLRVLADPSIKSITLITSRERLYESDVDVTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSPALSEMCKAFGGNAKSMQIISGAIT
TDFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLAQMDSEAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRV
IRYLTDRLLIEFRKGKYWLHPVICTEAIARLKQSGEWQIANHKAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEKA
ADVIIRSRPKKWDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIHNLHSDYHLNILYNLLGRAYHQIGNIKLALECHYKSNEIAE
KNNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIERASEIFYYVKNLGATDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVELMLREAEEGL
SHDRLTSWGIGTSLLFLSLTYKNLGLIDKAFSMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDMPAPKQVEKVQITMTRLENG
>Mature_782_residues
GAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGAQLWQTLTNVLGEKVSKSNFSS
VVQRFWQSHRLQKMSPIVNPVLNNGKPQELDYNFVGRDREIAELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFDF
LELWMAKESQHIVSVESVVEEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVEL
LRVLADPSIKSITLITSRERLYESDVDVTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSPALSEMCKAFGGNAKSMQIISGAITT
DFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLAQMDSEAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRVI
RYLTDRLLIEFRKGKYWLHPVICTEAIARLKQSGEWQIANHKAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEKAA
DVIIRSRPKKWDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIHNLHSDYHLNILYNLLGRAYHQIGNIKLALECHYKSNEIAEK
NNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIERASEIFYYVKNLGATDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVELMLREAEEGLS
HDRLTSWGIGTSLLFLSLTYKNLGLIDKAFSMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIANM
NKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDMPAPKQVEKVQITMTRLENG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 15 WD repeats [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR002182
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00931 NB-ARC; PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90055; Mature: 89924

Theoretical pI: Translated: 6.76; Mature: 6.76

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION L=RR

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
QLWQTLTNVLGEKVSKSNFSSVVQRFWQSHRLQKMSPIVNPVLNNGKPQELDYNFVGRDR
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
EIAELDSYVVRGAKIILIQGEGGVGKTTLARRYFKAQGFDFLELWMAKESQHIVSVESVV
HHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
EEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
HHHHHCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHH
LLRVLADPSIKSITLITSRERLYESDVDVTFYPLGGLDECTWQKFFTSCQIKSNSPALSE
HHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCEECCCCCHHHH
MCKAFGGNAKSMQIISGAITTDFEGNADIYWRENKHDLLIEPELKNLVASQFDRLAQMDS
HHHHHCCCCCCCHHEECCEEECCCCCCEEEEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRVIRYLTDRLLIEFRKGKYWLH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEH
PVICTEAIARLKQSGEWQIANHKAAEFWNQSVTQVENPQDALMALEAYHHYMEIGDYEKA
HHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
ADVIIRSRPKKWDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIHNLHSDYHLNILYNLLGRAYH
HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
QIGNIKLALECHYKSNEIAEKNNFLQERISSSFNLGLCYTDLWEIERASEIFYYVKNLGA
HHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
TDRNYYQYVVYSLCCLAYLDSSVGNNENVELMLREAEEGLSHDRLTSWGIGTSLLFLSLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YKNLGLIDKAFSMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHH
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDMPAPKQVEKVQITMTRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
ENG
CCC
>Mature Secondary Structure 
GAEEALELLDSLVYRKTGERLGTTQRIILRNLWEDRKQTYQNIADICGYTEAHLKAVGA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
QLWQTLTNVLGEKVSKSNFSSVVQRFWQSHRLQKMSPIVNPVLNNGKPQELDYNFVGRDR
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
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EEWLRVDFNEEPGKEFGINLDRLRRKLRDETRKIGVLIDNLESALDRNGQIIASRRSYVE
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EAYRLLCRLGCYRYQDVTHVSVQGLQCLLWDVPEQQARRVIRYLTDRLLIEFRKGKYWLH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEH
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ADVIIRSRPKKWDHSISLGVLFNRLGLLETLISVINPLIHNLHSDYHLNILYNLLGRAYH
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHH
YKNLGLIDKAFSMCHQAINHCRQNQFSFLEARATSCLASLYREQGQFTVAIDKHLEAIAN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHH
MNKVSDKCNLAKAYYQLGLTYQRMGEVNQSRETFHQAIVIFNDMPAPKQVEKVQITMTRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
ENG
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]