Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is perM [C]

Identifier: 17229969

GI number: 17229969

Start: 2974530

End: 2975693

Strand: Reverse

Name: perM [C]

Synonym: all2477

Alternate gene names: 17229969

Gene position: 2975693-2974530 (Counterclockwise)

Preceding gene: 17229972

Following gene: 17229965

Centisome position: 46.4

GC content: 43.9

Gene sequence:

>1164_bases
ATGCAGACACTCAAGCTACTCAACTGGTGGCAAACACTAACACCAATAGCGAGAATTGGGGCGATCGCTCTGTTCGCTCC
TTTATTAGTTCTCAATGGTTGGGCAATTTCCGCAATTTTTGATTACTTCCATTCCTTAATAGTCATTTTAGTCGGAGCTT
CAGTTTTAGCATTTCTGCTCAACTACCCTGTTAGTTGGATGGCGCATCGCGGCGCGAGGCGAGAGCAAGTTGCTATTTTA
GTGTTTTTATTGGCTCTATCAATTTTGTTAGCTCTGGGTGTGACTTTATTTCCTCTGGCGCTTACCCAAGCTCAACAACT
GGTAGCACGTATCCCAGAGTTAATTGATTCTGGGCGATCGCAGCTCATGATGTTAAACGAGAAAGCAGAGACTGTAGGTT
TACCGATTAACCTGGATGCTTTGGTAGTACAGATTAATGATCGCGTCAAAGGACAACTCCAGGCGATCGCCGGACAAGTC
CTCAATCTGGCCGTTGTCACCTTCACCAGTTTGCTAGATTTTCTGTTGACAATGGTGTTAACTTTCTATCTTCTCCAGCA
TGGCGGTGAACTTTGGCAAAGCTTAGTAGAATGGCTCCCTAGCAAGTTCCGCGCTCCATTCTCCCAAACAGTACGCTTGA
GCTTTCAAAATTTCTTTATTACCCAGTTAATTTTATCTACTTGTATGGCATCAGCCCTCATTCCTGCCTTCTTATGGCTG
AAGGTGCCATTTGGGCTATTATTTGGGCTGACCATTGGCATTATGGCGCTTGTGCCATTTGGTGGTTCTGTGGGTATTGC
ACTTACTACCTCACTAGTCGCATTGCAAGATTTCTCGATGGGAGTCAGAGTTTTGATTGCGGCTGTAATTGTCCAGCAAA
TTCTGGAAAACTTAATCGCTCCCCGTATCTTGGGCAATTTTACTGGCTTGAATCCAGTCTGGATATTAATATCTGTTTTG
ACAGGAGCTAGAGTTGGTGGACTTTTAGGGGTAATTGTTGCCGTTCCCACTGCTGTAATAATTAAGACTGCTTTGACTGC
CTTACGTCCCTCTAGTGTAAATAATGCAATAGAAGTAACAGATACCACAGAAATAGCTGCATCCGTAGTACAAAAAGAGA
ATCCCAAAAATACCCTAAGTATTTCCGAACCAACTACGCCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGTCAAATCCTAAACTAGAGGGATGAATGACAATGATGTAGTTAGAGATAATAAGCTATAGATACAGAATTTTTTAGTTC
TATCCCGCAATCGGCTCAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTGGGCATTTATGGGAAACGGGTCATAGGGAATATGCTTTTCTCTAGAGGTGAACAAAATTAACGATTTGGATAAACAT
GGCGCATTTCAAAGCGGCTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 387; Mature: 387

Protein sequence:

>387_residues
MQTLKLLNWWQTLTPIARIGAIALFAPLLVLNGWAISAIFDYFHSLIVILVGASVLAFLLNYPVSWMAHRGARREQVAIL
VFLLALSILLALGVTLFPLALTQAQQLVARIPELIDSGRSQLMMLNEKAETVGLPINLDALVVQINDRVKGQLQAIAGQV
LNLAVVTFTSLLDFLLTMVLTFYLLQHGGELWQSLVEWLPSKFRAPFSQTVRLSFQNFFITQLILSTCMASALIPAFLWL
KVPFGLLFGLTIGIMALVPFGGSVGIALTTSLVALQDFSMGVRVLIAAVIVQQILENLIAPRILGNFTGLNPVWILISVL
TGARVGGLLGVIVAVPTAVIIKTALTALRPSSVNNAIEVTDTTEIAASVVQKENPKNTLSISEPTTP

Sequences:

>Translated_387_residues
MQTLKLLNWWQTLTPIARIGAIALFAPLLVLNGWAISAIFDYFHSLIVILVGASVLAFLLNYPVSWMAHRGARREQVAIL
VFLLALSILLALGVTLFPLALTQAQQLVARIPELIDSGRSQLMMLNEKAETVGLPINLDALVVQINDRVKGQLQAIAGQV
LNLAVVTFTSLLDFLLTMVLTFYLLQHGGELWQSLVEWLPSKFRAPFSQTVRLSFQNFFITQLILSTCMASALIPAFLWL
KVPFGLLFGLTIGIMALVPFGGSVGIALTTSLVALQDFSMGVRVLIAAVIVQQILENLIAPRILGNFTGLNPVWILISVL
TGARVGGLLGVIVAVPTAVIIKTALTALRPSSVNNAIEVTDTTEIAASVVQKENPKNTLSISEPTTP
>Mature_387_residues
MQTLKLLNWWQTLTPIARIGAIALFAPLLVLNGWAISAIFDYFHSLIVILVGASVLAFLLNYPVSWMAHRGARREQVAIL
VFLLALSILLALGVTLFPLALTQAQQLVARIPELIDSGRSQLMMLNEKAETVGLPINLDALVVQINDRVKGQLQAIAGQV
LNLAVVTFTSLLDFLLTMVLTFYLLQHGGELWQSLVEWLPSKFRAPFSQTVRLSFQNFFITQLILSTCMASALIPAFLWL
KVPFGLLFGLTIGIMALVPFGGSVGIALTTSLVALQDFSMGVRVLIAAVIVQQILENLIAPRILGNFTGLNPVWILISVL
TGARVGGLLGVIVAVPTAVIIKTALTALRPSSVNNAIEVTDTTEIAASVVQKENPKNTLSISEPTTP

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=323, Percent_Identity=23.2198142414861, Blast_Score=68, Evalue=1e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003544
- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41880; Mature: 41880

Theoretical pI: Translated: 9.58; Mature: 9.58

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQTLKLLNWWQTLTPIARIGAIALFAPLLVLNGWAISAIFDYFHSLIVILVGASVLAFLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYPVSWMAHRGARREQVAILVFLLALSILLALGVTLFPLALTQAQQLVARIPELIDSGRS
HCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QLMMLNEKAETVGLPINLDALVVQINDRVKGQLQAIAGQVLNLAVVTFTSLLDFLLTMVL
HEEEEECCHHHCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFYLLQHGGELWQSLVEWLPSKFRAPFSQTVRLSFQNFFITQLILSTCMASALIPAFLWL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVPFGLLFGLTIGIMALVPFGGSVGIALTTSLVALQDFSMGVRVLIAAVIVQQILENLIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PRILGNFTGLNPVWILISVLTGARVGGLLGVIVAVPTAVIIKTALTALRPSSVNNAIEVT
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEC
DTTEIAASVVQKENPKNTLSISEPTTP
CHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MQTLKLLNWWQTLTPIARIGAIALFAPLLVLNGWAISAIFDYFHSLIVILVGASVLAFLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NYPVSWMAHRGARREQVAILVFLLALSILLALGVTLFPLALTQAQQLVARIPELIDSGRS
HCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QLMMLNEKAETVGLPINLDALVVQINDRVKGQLQAIAGQVLNLAVVTFTSLLDFLLTMVL
HEEEEECCHHHCCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFYLLQHGGELWQSLVEWLPSKFRAPFSQTVRLSFQNFFITQLILSTCMASALIPAFLWL
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KVPFGLLFGLTIGIMALVPFGGSVGIALTTSLVALQDFSMGVRVLIAAVIVQQILENLIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PRILGNFTGLNPVWILISVLTGARVGGLLGVIVAVPTAVIIKTALTALRPSSVNNAIEVT
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEC
DTTEIAASVVQKENPKNTLSISEPTTP
CHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8590279; 8905231 [H]