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The map label for this gene is 17229830

Identifier: 17229830

GI number: 17229830

Start: 2818434

End: 2820689

Strand: Direct

Name: 17229830

Synonym: alr2338

Alternate gene names: NA

Gene position: 2818434-2820689 (Clockwise)

Preceding gene: 17229828

Following gene: 17229831

Centisome position: 43.94

GC content: 44.41

Gene sequence:

>2256_bases
ATGGGGCGATTTGAGAAGCGACCAGACAACGACCCGCGAGTCCGAGGCGAGTTATCCAGGGCAGCAGAAACAGCTCTATG
GGCTGTTGTGGAAGATTTAGAAAGTCTACAGCAGAATGTCCTCAGATCATTTCAGGAAGAAATCAAAAAACTACAGACAG
AAAAAGACCGTTTAACAGATGAAGTTCAGCAGCTAATTGAAGAAAAAGAACATTTACAAGAGGTACGGCGGATTACAGAG
CAGCAAGTATTAATCCGTCAATTGTCAGAAGCTTTAGCCAAGCACATCTGTTCTCAATTGCAATCATCACTAGCGAAAAT
AGCCAACCAAACAGAGAGCCAAATAGCTGCTCTCAAGTCAGCCCAAAGCATCGGCCCTGCTATCGAGAACAATGAGCAGG
TAGAAAAAATGCTGGGTAGTCTAGACGATAACCTGACGATCGCCTTTAATTCTCTCCAACAAGAACTCAAAAACTACCAA
AGTAATCTCTCCCAGCAGTTGTCTCGAATGTATAACCAACAGCAGCAAGGAGAAACAATTGTCGAAGAGTTAATTGATCG
TCTACGTGGGGAATTGACAAGAGCTATCCAAGAAACATCAACAGCGAAAGCTCAGTTATCCCCGCCAACGGTGTTGCAGC
CTCCAGAACTACAACCCCCAAGCTCTCCGGTGGTAGTGAATTTATCACCACCTACGGTATTGCAATTTCCTGATCAACAA
TCGCCCAATCCTTTACAAGCATCTACACCATTAGAGGAGACTAGCACTACCAAGCCATCGGTTAGTATTACTCCTCCTGA
GAAATCAACACCAGTAACAATAGTTCCACCACCCCAGGAAACACGACCAGAAACAAAGTCTGTCATCCCCAAGGTGTCAC
CAGACAGCGAGACGAAATTACAATCATCTCAGGAAAAAGCTGCTGAACCAAGTTCTGTAATTAACAGAGAATTATCTGCG
GGTGCGGCTAAATCTCCACTAACTCCAGAAAAACCTCCTGAGCCAATTTCTACAAGTAAAACGAAGTTCTCACCCTCCTC
AGAAAAACCTCCTGAGCCGATTTCTACAAGTAAAACTAAGTTCTCACCCTCCTCAGAAAAACCTCCTGAGCCAGTTTCTG
TACTCAGTCGAGATTCATCGGCAAGTAAAGCTTCAACTCCTCCGCCTGCACCAGTAGTCAGACGGGGATCAACACCTTCC
TCATCAAGATCACGTAAATCATCTAACTTGTCACCAGTCCAAGTGGGTTTTTTGTTGGTAGTGTTGTCCACGGTGATGAC
AGCGTTATACAACGTAGTCCTGAAGGGGATGTTCTATAAAACTTCTCAACTCTCCGCAATGCTGGAAGTGGCGGGGTTAA
TCTCGCCGACCTTGGGAAATATTATGTTAATTCTGACTTTGCGGTTAATGGTGGTTGTACCACTAATGATACTTTTAGCA
CCCATGATGTATCCGCAAGTGTGGCAGGATTTGCAAAACCTGAAGCAATCATTAGGCAATAATCAGTCTGGAAGTCGTTC
TCAGCCACAGAGATTTGTCCAGTTAATGTTTGCTAGTGGCTGCTTTTTGTTTTTATCGCAAGTTCTGATTTATCTGGCCA
TTGGTCAAGTCCCCACCGGAGTGGCGATCGCCCTTTTCTTTGTCTATCCACTGATCAACGGGGTGTTATCCTGGCTTCTG
TTCCGCGATCGCCCCGGTGTATTTCGCGCTAGTGCGATCGGCGCTATTTTCTGTGGTGAGGTGCTAGTTTTTGCGGGAGC
AACCAGCACTGGTATAGGAACTACTCCCCTTGGTAGCATCACCGCAATTCTTGCTGGTGCAGCCTTTGCTTGTTACCTCA
TCCTGACCCGCGTATGTGCGGCTAAAGTCCATCCAGTATCTTTGTCTTTGATTAACTTCGTCACCATGTTGGGGTTGAGT
TTTATCTTCTTGATGATACCGTTACCGGAAAACTGGAGCTTAGTTGTTGACCCTTCTAAGTTACTGGAAATTGTGTTAAG
TGCTTTTATTTTGGGTGCTTTAACTCTATTGAGCTATGTATTTAGCCATATTGGGATCAATAAATTAGGTGGGTTGCGGT
CAGCTATTATTAGTGCAAGTGTACCTATTTTGACAGTAATTCTTGCTGGTTTGGTACTTCAAGAAACTTTAAACATTGCC
CAAATATTCGGAGTTTTATTCGTCACTTTTGGGGCAATTGCTTTTGGTATTGGCAAAATACAAAATCCCAACAAACCTGC
CAATGCAGAAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGCTTGAGTTTATCTGAAAAAATACAGGAAATTAGAGTGAGCGCCACGCAAATTTACAGGCGGCAGCTGTATCGTCAAGG
TGTATAGAGGTTAGAAGCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCCTTATGACAAAGGACTTATAATCAAAACAAATGTTTGGTCACTTAGGTAGCAGGAAGAGAATAATTAATAACTCTGG
ACTTCTGGCTCAGTAGTCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 751; Mature: 750

Protein sequence:

>751_residues
MGRFEKRPDNDPRVRGELSRAAETALWAVVEDLESLQQNVLRSFQEEIKKLQTEKDRLTDEVQQLIEEKEHLQEVRRITE
QQVLIRQLSEALAKHICSQLQSSLAKIANQTESQIAALKSAQSIGPAIENNEQVEKMLGSLDDNLTIAFNSLQQELKNYQ
SNLSQQLSRMYNQQQQGETIVEELIDRLRGELTRAIQETSTAKAQLSPPTVLQPPELQPPSSPVVVNLSPPTVLQFPDQQ
SPNPLQASTPLEETSTTKPSVSITPPEKSTPVTIVPPPQETRPETKSVIPKVSPDSETKLQSSQEKAAEPSSVINRELSA
GAAKSPLTPEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPVSVLSRDSSASKASTPPPAPVVRRGSTPS
SSRSRKSSNLSPVQVGFLLVVLSTVMTALYNVVLKGMFYKTSQLSAMLEVAGLISPTLGNIMLILTLRLMVVVPLMILLA
PMMYPQVWQDLQNLKQSLGNNQSGSRSQPQRFVQLMFASGCFLFLSQVLIYLAIGQVPTGVAIALFFVYPLINGVLSWLL
FRDRPGVFRASAIGAIFCGEVLVFAGATSTGIGTTPLGSITAILAGAAFACYLILTRVCAAKVHPVSLSLINFVTMLGLS
FIFLMIPLPENWSLVVDPSKLLEIVLSAFILGALTLLSYVFSHIGINKLGGLRSAIISASVPILTVILAGLVLQETLNIA
QIFGVLFVTFGAIAFGIGKIQNPNKPANAEG

Sequences:

>Translated_751_residues
MGRFEKRPDNDPRVRGELSRAAETALWAVVEDLESLQQNVLRSFQEEIKKLQTEKDRLTDEVQQLIEEKEHLQEVRRITE
QQVLIRQLSEALAKHICSQLQSSLAKIANQTESQIAALKSAQSIGPAIENNEQVEKMLGSLDDNLTIAFNSLQQELKNYQ
SNLSQQLSRMYNQQQQGETIVEELIDRLRGELTRAIQETSTAKAQLSPPTVLQPPELQPPSSPVVVNLSPPTVLQFPDQQ
SPNPLQASTPLEETSTTKPSVSITPPEKSTPVTIVPPPQETRPETKSVIPKVSPDSETKLQSSQEKAAEPSSVINRELSA
GAAKSPLTPEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPVSVLSRDSSASKASTPPPAPVVRRGSTPS
SSRSRKSSNLSPVQVGFLLVVLSTVMTALYNVVLKGMFYKTSQLSAMLEVAGLISPTLGNIMLILTLRLMVVVPLMILLA
PMMYPQVWQDLQNLKQSLGNNQSGSRSQPQRFVQLMFASGCFLFLSQVLIYLAIGQVPTGVAIALFFVYPLINGVLSWLL
FRDRPGVFRASAIGAIFCGEVLVFAGATSTGIGTTPLGSITAILAGAAFACYLILTRVCAAKVHPVSLSLINFVTMLGLS
FIFLMIPLPENWSLVVDPSKLLEIVLSAFILGALTLLSYVFSHIGINKLGGLRSAIISASVPILTVILAGLVLQETLNIA
QIFGVLFVTFGAIAFGIGKIQNPNKPANAEG
>Mature_750_residues
GRFEKRPDNDPRVRGELSRAAETALWAVVEDLESLQQNVLRSFQEEIKKLQTEKDRLTDEVQQLIEEKEHLQEVRRITEQ
QVLIRQLSEALAKHICSQLQSSLAKIANQTESQIAALKSAQSIGPAIENNEQVEKMLGSLDDNLTIAFNSLQQELKNYQS
NLSQQLSRMYNQQQQGETIVEELIDRLRGELTRAIQETSTAKAQLSPPTVLQPPELQPPSSPVVVNLSPPTVLQFPDQQS
PNPLQASTPLEETSTTKPSVSITPPEKSTPVTIVPPPQETRPETKSVIPKVSPDSETKLQSSQEKAAEPSSVINRELSAG
AAKSPLTPEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPVSVLSRDSSASKASTPPPAPVVRRGSTPSS
SRSRKSSNLSPVQVGFLLVVLSTVMTALYNVVLKGMFYKTSQLSAMLEVAGLISPTLGNIMLILTLRLMVVVPLMILLAP
MMYPQVWQDLQNLKQSLGNNQSGSRSQPQRFVQLMFASGCFLFLSQVLIYLAIGQVPTGVAIALFFVYPLINGVLSWLLF
RDRPGVFRASAIGAIFCGEVLVFAGATSTGIGTTPLGSITAILAGAAFACYLILTRVCAAKVHPVSLSLINFVTMLGLSF
IFLMIPLPENWSLVVDPSKLLEIVLSAFILGALTLLSYVFSHIGINKLGGLRSAIISASVPILTVILAGLVLQETLNIAQ
IFGVLFVTFGAIAFGIGKIQNPNKPANAEG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 DUF6 domains [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000620 [H]

Pfam domain/function: PF00892 DUF6 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81390; Mature: 81259

Theoretical pI: Translated: 8.43; Mature: 8.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGRFEKRPDNDPRVRGELSRAAETALWAVVEDLESLQQNVLRSFQEEIKKLQTEKDRLTD
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVQQLIEEKEHLQEVRRITEQQVLIRQLSEALAKHICSQLQSSLAKIANQTESQIAALKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQSIGPAIENNEQVEKMLGSLDDNLTIAFNSLQQELKNYQSNLSQQLSRMYNQQQQGETI
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEELIDRLRGELTRAIQETSTAKAQLSPPTVLQPPELQPPSSPVVVNLSPPTVLQFPDQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEECCCCC
SPNPLQASTPLEETSTTKPSVSITPPEKSTPVTIVPPPQETRPETKSVIPKVSPDSETKL
CCCCCCCCCCCHHCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHH
QSSQEKAAEPSSVINRELSAGAAKSPLTPEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPISTSKTK
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
FSPSSEKPPEPVSVLSRDSSASKASTPPPAPVVRRGSTPSSSRSRKSSNLSPVQVGFLLV
CCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
VLSTVMTALYNVVLKGMFYKTSQLSAMLEVAGLISPTLGNIMLILTLRLMVVVPLMILLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PMMYPQVWQDLQNLKQSLGNNQSGSRSQPQRFVQLMFASGCFLFLSQVLIYLAIGQVPTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
VAIALFFVYPLINGVLSWLLFRDRPGVFRASAIGAIFCGEVLVFAGATSTGIGTTPLGSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH
TAILAGAAFACYLILTRVCAAKVHPVSLSLINFVTMLGLSFIFLMIPLPENWSLVVDPSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHH
LLEIVLSAFILGALTLLSYVFSHIGINKLGGLRSAIISASVPILTVILAGLVLQETLNIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QIFGVLFVTFGAIAFGIGKIQNPNKPANAEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GRFEKRPDNDPRVRGELSRAAETALWAVVEDLESLQQNVLRSFQEEIKKLQTEKDRLTD
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EVQQLIEEKEHLQEVRRITEQQVLIRQLSEALAKHICSQLQSSLAKIANQTESQIAALKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQSIGPAIENNEQVEKMLGSLDDNLTIAFNSLQQELKNYQSNLSQQLSRMYNQQQQGETI
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VEELIDRLRGELTRAIQETSTAKAQLSPPTVLQPPELQPPSSPVVVNLSPPTVLQFPDQQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEECCCCC
SPNPLQASTPLEETSTTKPSVSITPPEKSTPVTIVPPPQETRPETKSVIPKVSPDSETKL
CCCCCCCCCCCHHCCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHH
QSSQEKAAEPSSVINRELSAGAAKSPLTPEKPPEPISTSKTKFSPSSEKPPEPISTSKTK
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
FSPSSEKPPEPVSVLSRDSSASKASTPPPAPVVRRGSTPSSSRSRKSSNLSPVQVGFLLV
CCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
VLSTVMTALYNVVLKGMFYKTSQLSAMLEVAGLISPTLGNIMLILTLRLMVVVPLMILLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PMMYPQVWQDLQNLKQSLGNNQSGSRSQPQRFVQLMFASGCFLFLSQVLIYLAIGQVPTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
VAIALFFVYPLINGVLSWLLFRDRPGVFRASAIGAIFCGEVLVFAGATSTGIGTTPLGSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH
TAILAGAAFACYLILTRVCAAKVHPVSLSLINFVTMLGLSFIFLMIPLPENWSLVVDPSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHH
LLEIVLSAFILGALTLLSYVFSHIGINKLGGLRSAIISASVPILTVILAGLVLQETLNIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QIFGVLFVTFGAIAFGIGKIQNPNKPANAEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]