Definition Nostoc sp. PCC 7120, complete genome.
Accession NC_003272
Length 6,413,771

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The map label for this gene is lcnDR2 [H]

Identifier: 17229517

GI number: 17229517

Start: 2423195

End: 2426482

Strand: Reverse

Name: lcnDR2 [H]

Synonym: all2025

Alternate gene names: 17229517

Gene position: 2426482-2423195 (Counterclockwise)

Preceding gene: 17229518

Following gene: 17229516

Centisome position: 37.83

GC content: 37.1

Gene sequence:

>3288_bases
ATGAACGTTTCTAAGCAATCTTTAATTAAAATAATAGAGCGTTCTAGTAATATTTCTGAACGTCTTAGTAGTAGTTTTAT
TTTCAATGACCGTCAAATAAATGCAAATCAAAATAATGCTAAATTAGAAAAATGGTATCAATTTATCGCTAAAGGAAATC
AACATAATTTTGAAAAGCGTTTATTGTGGGATGGCTTAGATACTAATACTATTAGCTGTGTTTTAGGTAATGTTAATCTA
GCTGATGAAAAATATCTACCCAACTGGGTGGAAACTTTAAAAGCAGGAATGCAAGTTGCTACTTTTGTTATTCCAGAAAA
TTCAAACAACAAATTCTTACAGCAGCATCGGTATTTAGATCCTGAACGTCCGTTTCCGTTTGAAGAAATTCTGGTACCAT
TTGTTGATGTTGCTAAAAAAAAATTAATTGAGTCTGCTGGATCTAGCTATTATTTATTATCACAAAATGCTCATATTCAA
ATGGAACGAAGTCTCCTGGAGCATTTGACTGGTATTTGCATCTCTCCTTTGGAACTGGAGTTCTCAATTTTTCGCTCTTT
AAAAAGTTCTCCCTTAGTTCGTTTTATTAATCAGTTGCAAAGTAATTGTTCTAAGCAGCAGTACACAGATTTTGTTAACA
AATTACTTAAAGACGGACTACTGTCTTTCTTCCAAGAGTACAGTGTATTAGCTAGATTGATAGCAACATCTGTAGACTTC
TGGGTAGAAGCGACTGGAGAATTTCTCTCAAGATTGGCATCAGACTCGGATAAAATTCAGTTGACTTTTCAGCCAGAGCA
AAAATTAGGGCAAGTTGTTAGTGTTCAATTAGCAATGTCTGATTTTCATAATCGTGGCCGTGCTGTAATTGTGATTAAGT
TTGCTTCAGGTTTCAAGCTAGTTTACAAACCTAAAAGCTTAGGCTTAGAAAAGGCTTATTTTGATTTTTTAGATTGGATT
AATCAACAAAAAATTAACTTGCCCCTGAAGCTGCTGAAGATAATTAATTGCTCTAACTACGGTTGGATGGAGTTCGCTGA
AGCTTTGCCATGTCAAGATCAAGACGCAGTGAAACACTATTATCAGCGTGCCGGTATGGTGCTGTGTATTGTGTACCTCT
TAAAAGGGAACGACTGTCATTGTGAAAACTTAATTGCTTGTGGAGATCAGCCAGTTCTTGTAGATTTAGAGACACTTTTA
CATCACCGTACTTGGTTAAGTAAAGATGATGCTGATGCTAAATCTATAGCAAATGAATGTTTACAAGATTCTGTTGTTGG
TACTGGTTTCTTACCAGGATGGCAAATTTTGCCTTATGAGCAAACTGAGATACTGAAGTTAGACTTCAGTGGATTGGGAG
GTTTTGGTGAACAAGAGATGCCTTACCGAGCAATGAAATGGAAGCACATTAATACAGATAGCATGGTTATTGTACGCGAG
TACACTAAATTACTACCAAAAAAAAATCGACCTTTTGGTGAGAATATTGATACCTCGCTGAATAACCACAGCAAAGAACT
CATAGATGGATTTCGGCAGATGTACCAGTTCTTGCAACAAAGAAAAGAAGAACTGTTAGCAAGTGATAGTCCAATAACGG
CATTTAGCAACCAGAAAGTACGGCTTGTAATTCGCAATACTACTGTTTACGCTTCTATTTTGCAGAACTCTTTAAATCAT
AAATGCTTGCGAACTGGAGTAGAACATAGTATTCAGTTAGACTTACTAAGCAGAGCATTTCTCTCTTCAGAAGATAAACA
TCCTTTATGGCCATTATTAGCAGCAGAAAAGCAAGCTTTAGAACAGTTAGATATTCCTTATTTCACGGCATATTCAGATA
GTAATGTAATAGATATTAGTTCAGAGCAAACTATCAATAAATTTTTGAGTAGTTCTAGTTATGACGATGTTATTGCCCAT
CTGCGACAGATGGATGATGCAGATTTAGCGAAGCAGATTAGCCTGATTAGAGGTTCACTTTACTCATGTCTGACTAATGA
ACAACTAAATTCTTTACCATTAGAGAATCCTAACCTGTACATGGACATAGTTGCCCCCATAGAAAGACGAGGTATGTTAC
AGCAGGCGATCGCCATCGCTCAACAACTAGAGCAGCAAGCTATTCGCGGAAAGGACAATAGTGTTACCTGGATTGGGATG
GGATACTTGTTTGAGGCGCAAAGGTTTCAATTACAGCCAGTAGGCAATAGTTTATATGATGGTTGTTGTGGCATATCTTT
ATTTTTAGCAGCACTAGCGTCTGTTACGAATCGAGCAGAATTTGGTGAATTATCCTTAGCATCTTTACAGTCCCTACGCA
AAACTTTACAAGATCCACATATTGACCTTCAGCAAAAGCTAATTGGACAAATGGGTATTGGTGGTGCTACAGGATTAGCT
TCTATTGTTTATGCCCTAGTTCGTATTAGTGAGTTTCTCGGCGAAGTAGAGCTGATTCAGGATGCTCAACAACTAGCTTC
TTTGATGGTAATAAATGAAGCGACCGTTAATCAAGCACCTGGAGTAATGACTGGTGTTGCTGGTACAATTCTTAGCTTAT
TAGCTTTGTACAAAGCTACAAAAGAACCTGCTACTTTACAGCAGGCTATTAGCTGGGGCAATTATTTACTAGATACTCGT
GTAACCGTAGATGAAGTCTATCAAGCCTGGACTAATGCTGAAGGCAAGGTACTACTAGGATTTTCTCATGGTGCTGCGGG
TATTGCCTATGCACTGCTTCAATTATATGCAGCTACTGATGAGCCAATCTTTGCATCAGCAGCTCGAGAAGCTATTACTT
TAGAACAACGTTTATTCTCGTTAAGCAGCAATTGCCAAGACTTGGATTTAGTTAGCATTGACAATAGCTTACTCTCATCT
ACAACTGAATGGTGTTCTGGGCTAATTGGTATTTCTGTGGCTCGGTTAGGAACTTTAAACATCCTCGATACAGATGAAAT
TCGTCAAGAATTAGATATAAATTTACATACAATACATCACTCAAGTTTACAGGTTTTAGATAACATCTGCTGTGGCAATT
TTAGTCATATAGAAATGTTATTAGTTGCATCTAAGCAACTTTCACACCCAGAATTACTAGAAACAGCAAATAATCGAGCA
ACTCAAGTTTTGTCTAGAGCAAACCAGATTGGTTATTTTCAACTTCTTCCTCATTTACCAGCCGACGTATATAGTTTTGG
TTTTTGTCAAGGAATAGCTGGTATTGGCTATGAGCTATTGAGATTATCATGTCCAGACTTACTACCTTCAATATTGTTAT
GGCAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTCCAAGTCCTAAATAATACAAATCATTAAAACATTTACAATGAAACCGGAGAGGTTTTTCATAAAAAGTAATAAA
TTAATTATTTTAAATTGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTGAGTGAGACTTCCGTTAAAATTTGTTAACAAAATAAAACTTCTTACACCATTTTAAATTTTGGATTGGAAATCGCTTG
GTGTATATGAGTTTTATATG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1095; Mature: 1095

Protein sequence:

>1095_residues
MNVSKQSLIKIIERSSNISERLSSSFIFNDRQINANQNNAKLEKWYQFIAKGNQHNFEKRLLWDGLDTNTISCVLGNVNL
ADEKYLPNWVETLKAGMQVATFVIPENSNNKFLQQHRYLDPERPFPFEEILVPFVDVAKKKLIESAGSSYYLLSQNAHIQ
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WVEATGEFLSRLASDSDKIQLTFQPEQKLGQVVSVQLAMSDFHNRGRAVIVIKFASGFKLVYKPKSLGLEKAYFDFLDWI
NQQKINLPLKLLKIINCSNYGWMEFAEALPCQDQDAVKHYYQRAGMVLCIVYLLKGNDCHCENLIACGDQPVLVDLETLL
HHRTWLSKDDADAKSIANECLQDSVVGTGFLPGWQILPYEQTEILKLDFSGLGGFGEQEMPYRAMKWKHINTDSMVIVRE
YTKLLPKKNRPFGENIDTSLNNHSKELIDGFRQMYQFLQQRKEELLASDSPITAFSNQKVRLVIRNTTVYASILQNSLNH
KCLRTGVEHSIQLDLLSRAFLSSEDKHPLWPLLAAEKQALEQLDIPYFTAYSDSNVIDISSEQTINKFLSSSSYDDVIAH
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SIVYALVRISEFLGEVELIQDAQQLASLMVINEATVNQAPGVMTGVAGTILSLLALYKATKEPATLQQAISWGNYLLDTR
VTVDEVYQAWTNAEGKVLLGFSHGAAGIAYALLQLYAATDEPIFASAAREAITLEQRLFSLSSNCQDLDLVSIDNSLLSS
TTEWCSGLIGISVARLGTLNILDTDEIRQELDINLHTIHHSSLQVLDNICCGNFSHIEMLLVASKQLSHPELLETANNRA
TQVLSRANQIGYFQLLPHLPADVYSFGFCQGIAGIGYELLRLSCPDLLPSILLWQ

Sequences:

>Translated_1095_residues
MNVSKQSLIKIIERSSNISERLSSSFIFNDRQINANQNNAKLEKWYQFIAKGNQHNFEKRLLWDGLDTNTISCVLGNVNL
ADEKYLPNWVETLKAGMQVATFVIPENSNNKFLQQHRYLDPERPFPFEEILVPFVDVAKKKLIESAGSSYYLLSQNAHIQ
MERSLLEHLTGICISPLELEFSIFRSLKSSPLVRFINQLQSNCSKQQYTDFVNKLLKDGLLSFFQEYSVLARLIATSVDF
WVEATGEFLSRLASDSDKIQLTFQPEQKLGQVVSVQLAMSDFHNRGRAVIVIKFASGFKLVYKPKSLGLEKAYFDFLDWI
NQQKINLPLKLLKIINCSNYGWMEFAEALPCQDQDAVKHYYQRAGMVLCIVYLLKGNDCHCENLIACGDQPVLVDLETLL
HHRTWLSKDDADAKSIANECLQDSVVGTGFLPGWQILPYEQTEILKLDFSGLGGFGEQEMPYRAMKWKHINTDSMVIVRE
YTKLLPKKNRPFGENIDTSLNNHSKELIDGFRQMYQFLQQRKEELLASDSPITAFSNQKVRLVIRNTTVYASILQNSLNH
KCLRTGVEHSIQLDLLSRAFLSSEDKHPLWPLLAAEKQALEQLDIPYFTAYSDSNVIDISSEQTINKFLSSSSYDDVIAH
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VTVDEVYQAWTNAEGKVLLGFSHGAAGIAYALLQLYAATDEPIFASAAREAITLEQRLFSLSSNCQDLDLVSIDNSLLSS
TTEWCSGLIGISVARLGTLNILDTDEIRQELDINLHTIHHSSLQVLDNICCGNFSHIEMLLVASKQLSHPELLETANNRA
TQVLSRANQIGYFQLLPHLPADVYSFGFCQGIAGIGYELLRLSCPDLLPSILLWQ
>Mature_1095_residues
MNVSKQSLIKIIERSSNISERLSSSFIFNDRQINANQNNAKLEKWYQFIAKGNQHNFEKRLLWDGLDTNTISCVLGNVNL
ADEKYLPNWVETLKAGMQVATFVIPENSNNKFLQQHRYLDPERPFPFEEILVPFVDVAKKKLIESAGSSYYLLSQNAHIQ
MERSLLEHLTGICISPLELEFSIFRSLKSSPLVRFINQLQSNCSKQQYTDFVNKLLKDGLLSFFQEYSVLARLIATSVDF
WVEATGEFLSRLASDSDKIQLTFQPEQKLGQVVSVQLAMSDFHNRGRAVIVIKFASGFKLVYKPKSLGLEKAYFDFLDWI
NQQKINLPLKLLKIINCSNYGWMEFAEALPCQDQDAVKHYYQRAGMVLCIVYLLKGNDCHCENLIACGDQPVLVDLETLL
HHRTWLSKDDADAKSIANECLQDSVVGTGFLPGWQILPYEQTEILKLDFSGLGGFGEQEMPYRAMKWKHINTDSMVIVRE
YTKLLPKKNRPFGENIDTSLNNHSKELIDGFRQMYQFLQQRKEELLASDSPITAFSNQKVRLVIRNTTVYASILQNSLNH
KCLRTGVEHSIQLDLLSRAFLSSEDKHPLWPLLAAEKQALEQLDIPYFTAYSDSNVIDISSEQTINKFLSSSSYDDVIAH
LRQMDDADLAKQISLIRGSLYSCLTNEQLNSLPLENPNLYMDIVAPIERRGMLQQAIAIAQQLEQQAIRGKDNSVTWIGM
GYLFEAQRFQLQPVGNSLYDGCCGISLFLAALASVTNRAEFGELSLASLQSLRKTLQDPHIDLQQKLIGQMGIGGATGLA
SIVYALVRISEFLGEVELIQDAQQLASLMVINEATVNQAPGVMTGVAGTILSLLALYKATKEPATLQQAISWGNYLLDTR
VTVDEVYQAWTNAEGKVLLGFSHGAAGIAYALLQLYAATDEPIFASAAREAITLEQRLFSLSSNCQDLDLVSIDNSLLSS
TTEWCSGLIGISVARLGTLNILDTDEIRQELDINLHTIHHSSLQVLDNICCGNFSHIEMLLVASKQLSHPELLETANNRA
TQVLSRANQIGYFQLLPHLPADVYSFGFCQGIAGIGYELLRLSCPDLLPSILLWQ

Specific function: Could be implicated in the processing or the export process of the lantibiotic lacticin 481/lactococcin DR [H]

COG id: COG4403

COG function: function code V; Lantibiotic modifying enzyme

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007822
- InterPro:   IPR017146 [H]

Pfam domain/function: PF05147 LANC_like [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 122906; Mature: 122906

Theoretical pI: Translated: 5.33; Mature: 5.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNVSKQSLIKIIERSSNISERLSSSFIFNDRQINANQNNAKLEKWYQFIAKGNQHNFEKR
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
LLWDGLDTNTISCVLGNVNLADEKYLPNWVETLKAGMQVATFVIPENSNNKFLQQHRYLD
HHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCC
PERPFPFEEILVPFVDVAKKKLIESAGSSYYLLSQNAHIQMERSLLEHLTGICISPLELE
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
FSIFRSLKSSPLVRFINQLQSNCSKQQYTDFVNKLLKDGLLSFFQEYSVLARLIATSVDF
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WVEATGEFLSRLASDSDKIQLTFQPEQKLGQVVSVQLAMSDFHNRGRAVIVIKFASGFKL
HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCEE
VYKPKSLGLEKAYFDFLDWINQQKINLPLKLLKIINCSNYGWMEFAEALPCQDQDAVKHY
EECCHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
YQRAGMVLCIVYLLKGNDCHCENLIACGDQPVLVDLETLLHHRTWLSKDDADAKSIANEC
HHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
LQDSVVGTGFLPGWQILPYEQTEILKLDFSGLGGFGEQEMPYRAMKWKHINTDSMVIVRE
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YTKLLPKKNRPFGENIDTSLNNHSKELIDGFRQMYQFLQQRKEELLASDSPITAFSNQKV
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEE
RLVIRNTTVYASILQNSLNHKCLRTGVEHSIQLDLLSRAFLSSEDKHPLWPLLAAEKQAL
EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
EQLDIPYFTAYSDSNVIDISSEQTINKFLSSSSYDDVIAHLRQMDDADLAKQISLIRGSL
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HHHHHHCHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEE
GYLFEAQRFQLQPVGNSLYDGCCGISLFLAALASVTNRAEFGELSLASLQSLRKTLQDPH
HHHHHCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
IDLQQKLIGQMGIGGATGLASIVYALVRISEFLGEVELIQDAQQLASLMVINEATVNQAP
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ECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHH
TTEWCSGLIGISVARLGTLNILDTDEIRQELDINLHTIHHSSLQVLDNICCGNFSHIEML
HHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
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HHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLSCPDLLPSILLWQ
HHCCHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNVSKQSLIKIIERSSNISERLSSSFIFNDRQINANQNNAKLEKWYQFIAKGNQHNFEKR
CCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
LLWDGLDTNTISCVLGNVNLADEKYLPNWVETLKAGMQVATFVIPENSNNKFLQQHRYLD
HHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCC
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CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
FSIFRSLKSSPLVRFINQLQSNCSKQQYTDFVNKLLKDGLLSFFQEYSVLARLIATSVDF
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCEE
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EECCHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
YQRAGMVLCIVYLLKGNDCHCENLIACGDQPVLVDLETLLHHRTWLSKDDADAKSIANEC
HHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH
LQDSVVGTGFLPGWQILPYEQTEILKLDFSGLGGFGEQEMPYRAMKWKHINTDSMVIVRE
HHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHCEEECCCCCEEHHHH
YTKLLPKKNRPFGENIDTSLNNHSKELIDGFRQMYQFLQQRKEELLASDSPITAFSNQKV
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCEE
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EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
EQLDIPYFTAYSDSNVIDISSEQTINKFLSSSSYDDVIAHLRQMDDADLAKQISLIRGSL
HHCCCCEEEEECCCCEEECCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
YSCLTNEQLNSLPLENPNLYMDIVAPIERRGMLQQAIAIAQQLEQQAIRGKDNSVTWIGM
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HHHHHCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
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CCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
GVMTGVAGTILSLLALYKATKEPATLQQAISWGNYLLDTRVTVDEVYQAWTNAEGKVLLG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEE
FSHGAAGIAYALLQLYAATDEPIFASAAREAITLEQRLFSLSSNCQDLDLVSIDNSLLSS
ECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHH
TTEWCSGLIGISVARLGTLNILDTDEIRQELDINLHTIHHSSLQVLDNICCGNFSHIEML
HHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LVASKQLSHPELLETANNRATQVLSRANQIGYFQLLPHLPADVYSFGFCQGIAGIGYELL
HHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLSCPDLLPSILLWQ
HHCCHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8017945 [H]