| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
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The map label for this gene is hupL
Identifier: 17228172
GI number: 17228172
Start: 784437
End: 785522
Strand: Direct
Name: hupL
Synonym: all0687
Alternate gene names: NA
Gene position: 784437-785522 (Clockwise)
Preceding gene: 17228170
Following gene: 17228173
Centisome position: 12.23
GC content: 48.8
Gene sequence:
>11031_bases ATGACAATCAAAACATTAGATATATCACCCGTCGGTAGAGTCGAGGGTGATTTAGATGTCCGTGTGGAAATAGAAGACGG AAGGGTAGTTAACGCCTGGACACACGCCGAACTATTTCGCGGCTTTGAAATCATTCTTCGTGGTAAAGACCCCCAAGCTG GATTAATTGTTACGCCTCGTATCTGCGGTATCTGCGGTGCTTCTCACTTAACCTCTGCATCATGGGCATTAGATACAGCA TGGAATACAACCGTTCCCCGCAACGCCATCTTAGCCAGAAACCTCGGTCAAATTGTCGAAACCATCCAAAGCATCCCCCG CTACTTTTATGGATTGTTCGCCATTGACCTAACAAATAAAAAATACCGTAGTAGCCGCTTCTACGATGAAGCCGTCCGCC GCTTTTCTGCCTACACAGGTAAATCTTATGAACTCGGCGTGACCATTTCCAGCAAACCCGTAGAAATTTACGCCCTGTTT GGCGGACAATGGCCGCACAGCAGTTATATGGAAATAAATTAGGAAATTGCTTATGTAGTCAGGATTTACCAGGATAGGTG CAATGATTCCCTGATTTTTCCTTAAATTAGGCAATAAAGCCACTCCAGAAATATCATCAATCCATTTATTTTTATCTACT AAAAGTTATTTGCTTTTCTCAGGCGTTACCTAACTTTTCCCTACATTGCCTCACTCCAACCCCAAAATCGTCTAAACTCA AAGTGTCCGCCAACTGCCAAAATCCCATGCCTCGCTGGTTCAATATTGCAGGTCCATGTGAAGACGATATCCACTATATG CTATCTCCAACAACACGATTACCAGATTTGGAGGAGCTAATCCAACAGCGTAGTTATTTTGTCCTTCATGCACCATGACA AACAGGGAAAACCACCACAATGTTAGCTTTAGCACAGCAACTTACTGATACAGGACGTTATGCAGCAGTAATGGTATCGG 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AGAAAAAGCGTGACCCCCAAGCTGAGGGGATTGAGCAGTTAGAATCCTATTTAGGGCGTTTGGGGTTGGATTTTGGTTGG TTATTTGTGTTTGATAGGCGGAAAAATGCTTTGCCAATGGAAGAACGTTTGTCAACTCAGGTTGTGGTGACAGAAAATCA GCGTAGGATTACTGTGATTCGGGCGTAAGTATTTTGTATGATTGATTTCTTTGTTTGAGCGATCGCACTCAAATATGTTT AACAGTAAATCTAACACTTCTAGACTGCGATCGCTTGATTAAATTCTATAATCCTGCTACATTCCCAGGAATTTATAGTC GCACTACGTCATAAAAATTCCTGAAAGAGGTTATCAAAAGGTTCTGTATTTTTCCAGCGATAGGTGTTGAAGTCTCGATA ATCAACCGATAAAATTTGACCATGACCTAATTCTTCTGCCAAAATAACGAGAGAGGCATCGGCTAAATCCATCGGTAAGT CTTTATATTTTTCCATCAGTTCTTCAATACGCTGGCAATGATGTTGTTTCAGATCAAAGATTTGTAGCTTTCCTGTAGAA ATTTTATGAATAAAGATTTTTGGAGCATCTACTCCTACTCTTTTTTGTAATAGATAGCACGTTTCCGTGACGACACACCA AGTCGTAATAAATTGCTGATTAGCTAAATCTTGAAATCGTTTTTTGGCGGATATATGAACTGTATCTTTTTTATTGGCAA GAGCTAACCAAAAGCCTGTATCAACTATGATCATATTTTTGGTTAAGTTCATGGTCTAAGTAGTTTTTATAGTTTTTTGA GAGGTCTGTTTCAGCTTCTATGCAACCGATAAAGTCTGACCAGTCTTGTAAGGAATTTGCTGAAGATTCGTGTTGATTCA GAAGGTAGCGTTTTTTCAGAACTTCTACGAGATCCACTATGATTTGTTGTGCATCGGGAGGAAGAGACTCAATATCTTGT TGAATTGTATCTAAGTTCATAATCTCATCTTGCTGTTTCCCTGATTATAATTTAGCGAAAAAGCGTATCGCAGAAATAAT AAGCATCCAAAAGGTGCATTACATTTCATTAATGCATCCTACAAGATCGGCGATCGCACTTTGTTTGGATATTGAGCGAT CGCAGTTACATAGTAGTTAAGGAAGCACAAGAAAATGAATATTGAGCGATCGCACTCAAATATGTTTAACAGTAAATCTA ACACTTCTAGACTGCGATCGCTTGATTAAAGTCCACAATCTTGGTACGTTAAGAGGAATTTATCGGCGGAGTAAGCACCC CACAAGATAGGCGATGGCTACGCCCGCCGCAGGCATCGCACTAAGCATATCAAAGTTAAGAGATGGGAATTTAAACCAGA ACTCTTGCCATCTGTTTAATTCGATTTGCCCAGGTTTGAGACAAAGTTGAAATTTCCAGACGACTAGAATCACTTGCCCA AGTTGACCACCAATGAATATGCCATCGAGACAATTGACGTTGCATTTGAGCCAGTTCAAAGGCACTGTCCACATCTAAAT CAATCGCTGTCAGTTCTAAAAATACTTTACTTTCTCTAACAATCCCAAGTACAGCTTCCCCATTAACCCCATCCAAACTG AGAGATGCCATTTGCAGAAAGTTCTGTGCTAATCGTTCAAGACGTACAGAAAGGCGATCGCACCGAAATGCAGTTTGTTC TAAAGTCCAGTTATTCATACGCCTCCTAATAACTTGTGGATGATTTGTTTGACCTCTTCCCGAATCGCTGGATCTAAAAT TTCCATCGCTCTATTTTGACGTGGTCGGAGATTTACCATTGATTCATAGAAAATTTCTTGAGAAATAGGATTCCAACTCG CGCCCCAAATATCCTGCTGTTGACTTCCATTCTCCAGTAAAATTGTTTCGCAGTCCGAGTGCATTTCACCTCCACCTGCC AAAATTTGATGACGTATATCTACGGCTGTTTTAATATAGAAACGATTAGCTTGAAGCATCTCGTTGATTTGGCTAGGTGT TGCAGGTTCTCGTAAAATATGAATTATCAAAGGTAAAATACGAGTTAATTTATTAAAACATTCTCTTCATATTACATTAA ACTATATTAACGTGATCCTATTTCAATCCCTTGATAATCTAAGCTAAGATTCTCTACTTGATAGGGATCGCAGTTAATAG TAGTTACGGAAGCACAAGATAATGGAAATTGAGCGATCGCACTCAAATATGTTTAACGGCAAATCTAACACCTCTAGACT GCGATCGCTTGCTTAAAGTCTACAATCTTGGTGTGTTCCCATGAATTTATCGGCGGAGTAAGCACCCGACAAGATAGGCA ATGGCTACGCCCGCCGCAGGCATCGCACTTAAAATCCAATGAACTTTTGTAAGTCAATAACTATTTCACTCACTTTATTC TGCCTGACCTCCCAATTACTCACTCTAAAAATATTCCATCCCTCTACTTGTAATTTTCGATCTTCCTCTAGGCGTTTTGA GTAGGTTTCCTCATCAGCTATCCACTGATTACCATGCTTTATCGCGTAATGGCTAATGTCGTCAATCAATATCGCATATC TATGATTATTCCAAAATGCGACAAAATCTACACGATACAGTTCTTTTGCTAGTGAACTTCCTGAAGCTTGCAAAACCTTT TTTGATGACGAATGCCATTGTATCCAGGCTTGTGGAATTAACATTGGTATATGATTATCCGCCATGCCGAAATGTTTGGC ATATGACTGAAAAAATATTTTTTCAGATTCAGTTTGATTCATGGCAAGAAGAGCTTTTTTTAGTGCTAGGTTTGTTTCCG AGTTAATTCCACAAGCAGTTTGAAAAGTTGGAAAATCAAAATTTGGATATACACCCCGCCAAATAATACCTATGCCAGAC 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CCCACTTTTCTAAACCATCTGGATATATCTCTCCGCATCCAATTAATATTTTGTACAGATGCAATTTTTGTCACCTTTTT TTCTAAAATCTTTAATGGTTTGGGATTTTTTAAATCAAATAATTCTATCCATTCAGGAACAAAAGGAATAACTTCTCGAT ATCCAGTTTTTGTATTTTTATTGACTTTCCAAGTATGGTCTAGATTTTGGGGAGACATCCACCAATTAATATCTGGTTGT ACAAATAGTTCCCTTGGTCTTAACCCAAATGTCGCCAACATTCCATATACCCAACGCCACATTTCCCAGGTGTCGATTTC ATCACTAATATTTGTATTTTTGCGATTGAGGGCGAATTTTTCAAAGAGGTCAAAAGAATATATTATTTTGTCATCTTCAG GTATTTCTCGATGAGCAGGGGTGACATTATCACGTTTAACATCGAGTTGAAATCCTAAATTAAAGGTTTTAATAAAAACA GAAGTTACGGCAATTAGTTCATTTTTTTTATTCCCCTGAACTGAATTAATAATTTCCTCAAAATTTTCTTTTGTGGCTAA ATGGGTGAGAGGAAAGTTTCTTTTAATTACAGATATATAGTTAGGAAAAGTATTTTGACTGGTTATAGTTTTCTGACGGG TTTGATAATATTTTTCCTCAAATTTATCTAATAATTCCCCAATAGTTTTTATTTCTTGCTTCTCTCTAGATTTAATTCCT AAATACTTCTCATTCCACTCGAAAGTATGACGAGCGATTAATTTACCCAACTCGTAACTTTCTTCAATTGCAGTTTTCAG TCCTTCTAAATTTGCTGGTATCCCTAGAGACAAATCATACTGTTTTTTTGTCTTACCTAAACTACCATCCCCTGGTTTTA AGGGTAGGGTAGCTCGTAATTGGAGAGAATTACCAGTCTGTTTAATGCTAACTCTTATTCTCTCCCTTTTTAAATTAGTA 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TACGACGGTTTTATCTTGGATGCTTTCCAAAAAATGGGTGGTGCTAGTATTCATTTGCGTCAACTTGCACGAGTTCACGA AATTGTCAAGTTATATCGCCAAGCAGAAAGATGTCTGCGTGAGTTTGTCTTAAATGATCCTTGGTATATCAAACCCAAAG AAAAAGACGGACGTGGTTGGGGTGCAACGGAAGCCTCACGGGGTTCTTTGTGTCACTGGATAGATATAGAAGGTGGCAAG ATTAAGAATTATCAGGTGATTGCTGCGACTACTTGGAACGTCGGCCCCCGTGATAGTGAAGGGGTACGCGGCCCTATTGA GGAAGCTTTAATCGGGACTCCTATTGAAGATTCTAGAGATCCTGTGGAAGTGGGACACGTTGCGCGATCGTTTGACTCTT GTCTGGTGTGTACTGTCCACGCCCATGATGCGAAGACAGGCGAGGAGTTGGCGCGTTTTCGGACTGCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATGGGCAGAAGAAGACTTTTTCACAGTTTAGTCAGTGGTCAGTAGTCAATGGTCAGTTGCTACTGACAACCGACAACCG ACAACCAACAACTAACAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTTTAAACGCAGAGGGGCGCGGAGGTCAGCGCGGAGGTACGCGGAGAGTGTGCTGTTAATTAATGAGTGGCTAATGGCTA GTTATGATTTAGTTAGTCAT
Product: [NiFe] uptake hydrogenase large subunit
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 362; Mature: 362
Protein sequence:
>531_residues MTIKTLDISPVGRVEGDLDVRVEIEDGRVVNAWTHAELFRGFEIILRGKDPQAGLIVTPRICGICGASHLTSASWALDTA WNTTVPRNAILARNLGQIVETIQSIPRYFYGLFAIDLTNKKYRSSRFYDEAVRRFSAYTGKSYELGVTISSKPVEIYALF GGQWPHSSYMVPGGVMCAPTLTDITRAWAILEYFRTNWLEPVWLGCSLERYEEIQTYDDFMDWLEADIKHRESDLGFYWR MGLDIGLDRYGAGVGKYVSWGYLPHEDKYQKPTIEGRNAAMIMKSGVYDSFENTHTLMDHTFARENTTHAWYDEGNADVH PFDRTTKPTQKNTKDFKNAYSWSTAVLHQDFGRLEVGPLARQLVAGGQHGESWQHYDGFILDAFQKMGGASIHLRQLARV HEIVKLYRQAERCLREFVLNDPWYIKPKEKDGRGWGATEASRGSLCHWIDIEGGKIKNYQVIAATTWNVGPRDSEGVRGP IEEALIGTPIEDSRDPVEVGHVARSFDSCLVCTVHAHDAKTGEELARFRTA
Sequences:
>Translated_362_residues LSSPKTRQLLACLRIMGVDSTHQTRVKRSRNVSHFHRISRIFNRSPD*SFLNRAAYPFTITGADVPSSRSNHLIILNLAT FYIYPVTQRTP*GFRCTPTTSVFFFGFDIPRII*DKLTQTSFCLAI*LDNFVNSCKLTQMNTSTTHFLESIQDKTVVMLP RFAMLTTCN*LAG*GADFQASEVLV*YGC*PRVGIFEVFSIFLGGFGGTVKGVNICVTFIIPGVGGILTGEGVIHQSVCI LEAVIHTTFHNHGGVASFDGGLLVFIFMG*VSPGDVFTHTSPVSIQTDI*THTPIETQV*LTMLDVCF*PVHEVIVSLNF FVAFQRTTQPHRF*PVGAEVFENCPSAGNVG*GGGAHHTTRH >Mature_362_residues LSSPKTRQLLACLRIMGVDSTHQTRVKRSRNVSHFHRISRIFNRSPD*SFLNRAAYPFTITGADVPSSRSNHLIILNLAT FYIYPVTQRTP*GFRCTPTTSVFFFGFDIPRII*DKLTQTSFCLAI*LDNFVNSCKLTQMNTSTTHFLESIQDKTVVMLP RFAMLTTCN*LAG*GADFQASEVLV*YGC*PRVGIFEVFSIFLGGFGGTVKGVNICVTFIIPGVGGILTGEGVIHQSVCI LEAVIHTTFHNHGGVASFDGGLLVFIFMG*VSPGDVFTHTSPVSIQTDI*THTPIETQV*LTMLDVCF*PVHEVIVSLNF FVAFQRTTQPHRF*PVGAEVFENCPSAGNVG*GGGAHHTTRH
Specific function: Unknown
COG id: COG0374
COG function: function code C; Ni,Fe-hydrogenase I large subunit
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 37808; Mature: 37808
Theoretical pI: Translated: 8.14; Mature: 8.14
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.8 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 4.4 %Cys+Met (Translated Protein) 2.8 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 4.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure LSSPKTRQLLACLRIMGVDSTHQTRVKRSRNVSHFHRISRIFNRSPDSFLNRAAYPFTIT CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEEE GADVPSSRSNHLIILNLATFYIYPVTQRTPGFRCTPTTSVFFFGFDIPRIIDKLTQTSFC CCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCCCEECCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH LAILDNFVNSCKLTQMNTSTTHFLESIQDKTVVMLPRFAMLTTCNLAGGADFQASEVLVY HHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHEECCCCCCCCCCCCEEEE GCPRVGIFEVFSIFLGGFGGTVKGVNICVTFIIPGVGGILTGEGVIHQSVCILEAVIHTT ECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEEEEEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH FHNHGGVASFDGGLLVFIFMGVSPGDVFTHTSPVSIQTDITHTPIETQVLTMLDVCFPVH HCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH EVIVSLNFFVAFQRTTQPHRFPVGAEVFENCPSAGNVGGGGAHHTTRH HHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA