| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15922680
Identifier: 15922680
GI number: 15922680
Start: 2349283
End: 2350764
Strand: Direct
Name: 15922680
Synonym: ST2349
Alternate gene names: NA
Gene position: 2349283-2350764 (Clockwise)
Preceding gene: 15922679
Following gene: 15922681
Centisome position: 87.18
GC content: 31.31
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TACCATATGTGGAACCAACAAAATATAAAAACATTAATGTAGAGTGTGGGTGTAAAGATTTGATAAAACATTTAAAGTAC TACTTATTCTGTTTGCATGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAATGTAAGTTATACATTGATGGTTGGTTTAGAAATAAGAATGAGGAGGCTTTTTGAACACGGAAAGGCATTTGTAGTTG CTTTAGATCACGGACTTGTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 493; Mature: 492
Protein sequence:
>493_residues MTEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVLGYFTIPADIFSTLTSRYASE NKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFAFYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVR VIIVLVAFYAFHLSILGVIYAYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVVSEGHALLFHIRRDYLTAIYA LIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGITAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSL GVLINSVWLLLTSYSISKKEYNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF IRSAIKELRKILM
Sequences:
>Translated_493_residues MTEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVLGYFTIPADIFSTLTSRYASE NKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFAFYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVR VIIVLVAFYAFHLSILGVIYAYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVVSEGHALLFHIRRDYLTAIYA LIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGITAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSL GVLINSVWLLLTSYSISKKEYNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF IRSAIKELRKILM >Mature_492_residues TEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVLGYFTIPADIFSTLTSRYASEN KPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFAFYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVRV IIVLVAFYAFHLSILGVIYAYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILHN DIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVVSEGHALLFHIRRDYLTAIYAL IVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGITAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSLG VLINSVWLLLTSYSISKKEYNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNFI RSAIKELRKILM
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55828; Mature: 55697
Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH GYFTIPADIFSTLTSRYASENKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH FYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVRVIIVLVAFYAFHLSILGVIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SEGHALLFHIRRDYLTAIYALIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGI CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC TAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSLGVLINSVWLLLTSYSISKKE EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC YNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRSAIKELRKILM HHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure TEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH GYFTIPADIFSTLTSRYASENKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH FYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVRVIIVLVAFYAFHLSILGVIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVV CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SEGHALLFHIRRDYLTAIYALIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGI CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC TAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSLGVLINSVWLLLTSYSISKKE EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC YNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IRSAIKELRKILM HHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA