The gene/protein map for NC_003106 is currently unavailable.
Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15922680

Identifier: 15922680

GI number: 15922680

Start: 2349283

End: 2350764

Strand: Direct

Name: 15922680

Synonym: ST2349

Alternate gene names: NA

Gene position: 2349283-2350764 (Clockwise)

Preceding gene: 15922679

Following gene: 15922681

Centisome position: 87.18

GC content: 31.31

Gene sequence:

>1482_bases
ATGACAGAAAAACAGCAAGAGGTTAGACTAGTTTATACTGGCGTAAGAAATTTATTCTTACGTATTATAACTTCACCCCT
TTCATTTATCTTTACTTATTTAGTAGCAAAGTATCTCAGTTCTTTGCCTAATGGTGAAGTGGTTTTTGCCTCTTGGCAAT
CATTATACGTTTTAGTTTTGGGATATTTTACAATACCTGCTGATATTTTCTCCACATTAACCTCAAGGTATGCAAGTGAA
AATAAACCGGTAGGAGGAATACTTTTCTTTAATTTCTTATTTGGTGCAATAAGTGCTACAATTTACATTTTTCTAGTTCC
TTATTTAGTATCAGCTGTAAATTACCCAGATTATTTTGCTTTTTATATGGCTTCTCTCTTGATAGTCTCATTTTATGTTT
ATCGAATAGTTTATGCCATAGCCAGGGGTAAAACCCCTTTAGTAATAGGGACAATTACTATTGCCTTCCAGGTAGTTAGA
GTTATAATAGTTTTAGTAGCTTTCTATGCATTTCACCTATCTATACTAGGAGTAATTTACGCATATCTTGCAGGATATAT
TACTCAAGCACTCTTAAGTAGTTTTAGAATAAAAGCTAACTTAAAATTTGACATAAAGACAGCTATCATAACTGTTAAAA
AATCTATAGTTACAATAATTTATTATTTACAGCTCATTTTAGAGGCAACAATCGTATGGTTGACAATTGTTATACTTCAT
AACGATATTCCAATCGCATATTTTGAGTCAGCCTTAATAATTGCTAATGTAGTTTCGTGGTCTTATGCTCTTTATGACGG
GTTAATTGCAAAGCTTGGAGAAACTAAGGACCCTAGCATTATAACTACTTCTTTGAGACTATACTTTTTAATATCAACTT
TATGGCTTGTTGTAGTAGTAAGTGAAGGTCATGCATTACTTTTCCATATAAGGAGAGATTACCTCACAGCCATATACGCT
TTGATTGTCTTGTCCCTTTCTAATTATATGAGAGGAATATATTCAATATTCTATTACTCTATAGTAATGAAAGATAAAGC
ATTAGGCTTAGAAGAGTCAGAAAACCCGTTTAAAGGTATTACTGCAAAATTAAACGTTACTAATATCACATTTAGTATTA
TTGGTGTAGTAGTATCTATGATATCTGTTTTTATTCTGAGAAGCTTCCCACCATACATTATAGCTATTGGAATGTCATTG
GGAGTCCTCATAAACTCTGTTTGGTTACTTCTTACTTCCTACTCTATCTCTAAAAAGGAATACAACTTCAAAATCCCCAA
ACGAGATATTATCGTATCTATACTCTCTGGTGGTTTAATCTCATTTATTTTCCTACAGCTAAACTTTGTTTCCTATATTA
ATATGATAGAATATGGATTATTAGCTTCTATCCTATATATTAGTATAAACTATTTGTTTAGCTCTTATGCAAGAAATTTC
ATAAGATCTGCAATAAAGGAGCTAAGAAAAATTCTTATGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TACCATATGTGGAACCAACAAAATATAAAAACATTAATGTAGAGTGTGGGTGTAAAGATTTGATAAAACATTTAAAGTAC
TACTTATTCTGTTTGCATGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAATGTAAGTTATACATTGATGGTTGGTTTAGAAATAAGAATGAGGAGGCTTTTTGAACACGGAAAGGCATTTGTAGTTG
CTTTAGATCACGGACTTGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 493; Mature: 492

Protein sequence:

>493_residues
MTEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVLGYFTIPADIFSTLTSRYASE
NKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFAFYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVR
VIIVLVAFYAFHLSILGVIYAYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH
NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVVSEGHALLFHIRRDYLTAIYA
LIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGITAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSL
GVLINSVWLLLTSYSISKKEYNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF
IRSAIKELRKILM

Sequences:

>Translated_493_residues
MTEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVLGYFTIPADIFSTLTSRYASE
NKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFAFYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVR
VIIVLVAFYAFHLSILGVIYAYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH
NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVVSEGHALLFHIRRDYLTAIYA
LIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGITAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSL
GVLINSVWLLLTSYSISKKEYNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF
IRSAIKELRKILM
>Mature_492_residues
TEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVLGYFTIPADIFSTLTSRYASEN
KPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFAFYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVRV
IIVLVAFYAFHLSILGVIYAYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILHN
DIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVVSEGHALLFHIRRDYLTAIYAL
IVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGITAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSLG
VLINSVWLLLTSYSISKKEYNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNFI
RSAIKELRKILM

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55828; Mature: 55697

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH
GYFTIPADIFSTLTSRYASENKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
FYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVRVIIVLVAFYAFHLSILGVIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SEGHALLFHIRRDYLTAIYALIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGI
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
TAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSLGVLINSVWLLLTSYSISKKE
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
YNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRSAIKELRKILM
HHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure 
TEKQQEVRLVYTGVRNLFLRIITSPLSFIFTYLVAKYLSSLPNGEVVFASWQSLYVLVL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHH
GYFTIPADIFSTLTSRYASENKPVGGILFFNFLFGAISATIYIFLVPYLVSAVNYPDYFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
FYMASLLIVSFYVYRIVYAIARGKTPLVIGTITIAFQVVRVIIVLVAFYAFHLSILGVIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AYLAGYITQALLSSFRIKANLKFDIKTAIITVKKSIVTIIYYLQLILEATIVWLTIVILH
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
NDIPIAYFESALIIANVVSWSYALYDGLIAKLGETKDPSIITTSLRLYFLISTLWLVVVV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SEGHALLFHIRRDYLTAIYALIVLSLSNYMRGIYSIFYYSIVMKDKALGLEESENPFKGI
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
TAKLNVTNITFSIIGVVVSMISVFILRSFPPYIIAIGMSLGVLINSVWLLLTSYSISKKE
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
YNFKIPKRDIIVSILSGGLISFIFLQLNFVSYINMIEYGLLASILYISINYLFSSYARNF
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IRSAIKELRKILM
HHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA