Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is bps2 [H]

Identifier: 15922443

GI number: 15922443

Start: 2124642

End: 2126396

Strand: Direct

Name: bps2 [H]

Synonym: ST2117

Alternate gene names: 15922443

Gene position: 2124642-2126396 (Clockwise)

Preceding gene: 15922441

Following gene: 15922446

Centisome position: 78.84

GC content: 29.74

Gene sequence:

>1755_bases
ATGAAGGTTAGAGTATCAAATATAGGAGGAATAACTAGGGAACTTACTCTATCAGTAGAAAAAGGACTAACACTGTATAA
AGCGCCAAATGCGTATGGAAAAACATCTTTAACAAAGGCATTAGTTTCTCTCTTAACTTCTTCAATAACGGCTGCAGACC
TGTTAAATGTTTTTAGTGATGAAGGTTATGTAGAGGTAGAACTTGATAACAAACTATATTATAGAAGATTTCATAGAATA
AAGAACAAAATAGAAGAAGAAAAGAATTTAATAATGGATGATGATAGAGCACTACTACTTTCTTATTTCTCTCCAGAGAA
TCAGTTATTAGCTAGAATTATTACTGGAGATGAAAATGTTGAATGGTTTATTTCAAAAACATCTAAAGTACAAGAATTAA
AAGCAAAAAAAGAAGAATTAGAAAGAAAACTAACTGAACTTAAAACAAGACAAGAAGAATTAACAAAAAAATACCAAGAA
ATTAAAGATATCAGCAGAGAATTAGAAAGAATAAATGAGGAAATAGATAAACTAGAAAGAGAAAGAAAAAATTTACAGAA
AAATGCTGCACAGACCATAATTCTTACAAGACAAAATAGGTTAACTGAGTTAAAGAGTAGAGTAGAAACTAGGCAAAAAG
AGCTTAGAGATAACCAAGCTAGATTAGAAAAACTTGATAAGGAAATTGAGGAACTTAAGCAAAAAGCAGATCAAACTTTA
AAAGAAAAAATTAGAAGTGAATTAACTGAGTTAGATAAAAAACTACAAGAATTAAGTTCTAAAAAGAACAGTATAGATAT
AGAAATCGGAGTACTTAATAGAGTTCTTGATGAAATTAAAGAATCAGAAAAAGAGCATGCATCAGTATGCCATGTATGTG
GAAGCAAGGTAGACCCATCTATATGGAAAACAAGAATGGACATTATATCAAAGGAATTAGAAAATGCTAATAGAAGCAAA
AATGAGCTCTTAACCGAACTAAATTCTACTATAGCTAGGAAAAATGAACTAGAAGCAAAAATCAAAGAAATAGAAAAAGC
AGAAAAAATGTTAGCTGAGAAGCAAATTCAAAGAGAAAACTTAGCGATAAAAATAGAAACTATTAAACATCAAATAGCCG
AGTATGAGAGACAGATAAAGGAATTAGAGGAAAAAATAAATGAAATAAATGAAATTTATTCTATGGGAGAAGGAGAAAGC
GAGATTGATAAGAAGTTAGAAGAATTAAAGAAAAAGAGGGGAGACTTAGAATATCAGTTGCAAACTCTAGGAGTTTCAAG
CAAGATTCTTGAAGAAATTACTACTGTGCAGAACCAGATAGAAGAAATAACAAAACAAATAGATGATTTACAAAGAGAAT
ATATTAGAAGATTAACTGTAATTAGAGAGAGATTTACTGAGATGGCAACATCATTACTTAAAGAACTGGAATTTGATTTC
ACTGCTGAAATTGATAATAATTATAGACTTATAGTAAAAAGAATGGGGGCTCAACTAGAAATTAGAAAGCTTTCATCATC
TGAAAGAACAACATTAGCATTAATCTTAGTATTAGTTGCCCTAAAAGAATACTTCAAAACTCCATACTTCATCGTTGATG
AATCATTTATGACTTTCGATCAAAAAAGATTTGAAAAACTAGTAAAATATCTAAATGGAGTTGTAGATTATATAATCATA
ACGAAGAGCGATGAAATGGTACAGCTAACTAATGAGATAATTCCGGCGACCATGGCACATCAAGTTGTTTCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATTATTATAAATTTGCTAGAAAAATATGATAAATTTATATATAGTATATTAGAAATATGGCATAACATTTTTAAGGT
ATAAAAAGAAAAAGCACATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAATTTATTTAAATCAGTTTTTACGGCTTCTTCAACATCTGGTGGAATATTAGTTATTTCAGTAAACCAACCAACTAAG
GCAACCATTCCTAACTCTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 584; Mature: 584

Protein sequence:

>584_residues
MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSDEGYVEVELDNKLYYRRFHRI
KNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENVEWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQE
IKDISRELERINEEIDKLERERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL
KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPSIWKTRMDIISKELENANRSK
NELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQRENLAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGES
EIDKKLEELKKKRGDLEYQLQTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF
TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFDQKRFEKLVKYLNGVVDYIII
TKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS

Sequences:

>Translated_584_residues
MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSDEGYVEVELDNKLYYRRFHRI
KNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENVEWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQE
IKDISRELERINEEIDKLERERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL
KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPSIWKTRMDIISKELENANRSK
NELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQRENLAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGES
EIDKKLEELKKKRGDLEYQLQTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF
TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFDQKRFEKLVKYLNGVVDYIII
TKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS
>Mature_584_residues
MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSDEGYVEVELDNKLYYRRFHRI
KNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENVEWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQE
IKDISRELERINEEIDKLERERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL
KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPSIWKTRMDIISKELENANRSK
NELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQRENLAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGES
EIDKKLEELKKKRGDLEYQLQTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF
TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFDQKRFEKLVKYLNGVVDYIII
TKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 zinc-hook domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013134 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68361; Mature: 68361

Theoretical pI: Translated: 5.67; Mature: 5.67

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSD
CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EGYVEVELDNKLYYRRFHRIKNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENV
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCC
EWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQEIKDISRELERINEEIDKLER
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL
HHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
IWKTRMDIISKELENANRSKNELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQREN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGESEIDKKLEELKKKRGDLEYQL
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
QTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFD
EEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHH
QKRFEKLVKYLNGVVDYIIITKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKVRVSNIGGITRELTLSVEKGLTLYKAPNAYGKTSLTKALVSLLTSSITAADLLNVFSD
CEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EGYVEVELDNKLYYRRFHRIKNKIEEEKNLIMDDDRALLLSYFSPENQLLARIITGDENV
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCC
EWFISKTSKVQELKAKKEELERKLTELKTRQEELTKKYQEIKDISRELERINEEIDKLER
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERKNLQKNAAQTIILTRQNRLTELKSRVETRQKELRDNQARLEKLDKEIEELKQKADQTL
HHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEKIRSELTELDKKLQELSSKKNSIDIEIGVLNRVLDEIKESEKEHASVCHVCGSKVDPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
IWKTRMDIISKELENANRSKNELLTELNSTIARKNELEAKIKEIEKAEKMLAEKQIQREN
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LAIKIETIKHQIAEYERQIKELEEKINEINEIYSMGEGESEIDKKLEELKKKRGDLEYQL
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
QTLGVSSKILEEITTVQNQIEEITKQIDDLQREYIRRLTVIRERFTEMATSLLKELEFDF
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCE
TAEIDNNYRLIVKRMGAQLEIRKLSSSERTTLALILVLVALKEYFKTPYFIVDESFMTFD
EEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHH
QKRFEKLVKYLNGVVDYIIITKSDEMVQLTNEIIPATMAHQVVS
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA