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The map label for this gene is mmpL10 [H]

Identifier: 15922229

GI number: 15922229

Start: 1918971

End: 1921484

Strand: Reverse

Name: mmpL10 [H]

Synonym: ST1914

Alternate gene names: 15922229

Gene position: 1921484-1918971 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15922234

Following gene: 15922228

Centisome position: 71.3

GC content: 31.62

Gene sequence:

>2514_bases
ATGATTAACATTTTTAATTCTTATGGAGAATTTAGCGTTATGAAAGCTTACTTAATTTTATGGTTAGTTCTTCTAGTCAT
TTTAGCTCCTTTCGCTTTAAATATACAGCATCTATTCGTTTATTCTGACTCACCTTTTCTAAATTCACAATTTGCTAGCG
TAAAAGTGAAAGATATTCTCGTGAAATATTTTAATTTTTCGACAAATGATGATATATATGTAATAACTAAAGGAAATTAT
AGTACATCTCTGAAAATTGTAAATGACACGGCGAGTAAGTATCTTCAGAACTATAAACTTCTGACACCTTACTATATACT
TAATGAAAGTAACAGCTCATATTTCTCCGTTATATTCCCAGTAGTTGAGAAGGTATACAAAGAAATTTTGCCCCTTCACG
AACTTTATAAAAATCTAACAACACTACGACTTCTGCTATTAAATAACATAACATCCTTTTATTTTCAACTTAACGTAACC
TACGGATTACCCTTAGGAAAGTTCAAAAGTAATTCTAGTCTAGCATTAAAGTTTTTGGCAGTTTATAGTGCTTTAAAAAA
TGGTACTGATGTTGAAAAAGCTAGGAATGCGAGTTATATAGTGTTTAAGGATCCGTATGTTTTTCTTTTCTCTTTTAATA
ACTACAGTAATGTTAATCTAGTTACCAATACCTTAGAGGATTTTAAGGATTATGCATATTTGATCAGAATTATAACCGGA
AAGAACGTATCTACAGCAGAGATTGAGGATCCGTTAAATTATTCTTTAAATCTGGTTGAAAAGGAATTTCCTCCTCCACC
TTTAAGTATTAACCAGTTTCATAAAGGAGATGAGTGGCTTTTCATAGTTCAAGTACCTTCTAACGAAAGTTTGATCGATG
TTGAGATGTTCATGAAGGCTTTATCAAATGCTATAATAACTGGGCATTTACCAATATATGCCGAGTCAGCTGTAGTTACT
GAGCAAGATCTAAGAATTATTGACATTTTTACGATATTAATTCTAACTATACTTTTAATTGTGCTTGTGAGATCATTAGT
TCCTATCATAATATTAATTGTAAGTGCAGTAATAGGGTTAGTAATAGCATATTCTTTACTGTATCTTCTTACTTTCTTCG
GTTATTCTATTTATTATATCTCTGGATTGGTTATTCCTCCGATAGTTTTTGGTATAACAGTTGACTACTCGATTCTATTT
CTATATAGGTATTTTGAAGAAGTTAGAAAAGGCGAGAAAGAACCTTTGAAGGTTGCATTTAGAACTGCGGGAAGAGCAGT
TCTATTTAGTGGGTTAAGTATAACCTTAGGTTTTTCATCATTTCTTTTTTCTTCTTCGCCTTTGTTAAGAAACATTGGAA
TAGCCTTAGTAATATCTTCAATCTCGTCATTAGTTCCAGCTATACTCTTTATAAGAACAGCATTGGCTTCAATCCAGGTA
AGATGGCTAAGTTTTCCAAGAAAAGAAATTCCAAATCCTCAAGATGTTAGGCAAAGATATTTAGAAAAAATATCTAAAGT
ATCAATCAATCATAAGTATTGGGTTCTTCTTTTTATGATAGTGTTAGCTGTAGCTTCGTACTCGGTATTCATAACACATC
ATACAAATGTGGCTATTGATGAGATAGTTCCCTCTTCTTCAGAAGTGGTTAGGGGAGAACAACTGTTAGGTCAATTATAT
AATTATAGTGTAGATTATGTTATAATTAAGGGAAATCCAAATACCACGTATTCGGAAATATACAATCTAAGTAAAGAATT
AATAAATAAAGGCGCATTAGTGTATGGTCCAGCATCAATAGGTAAGGCACTTTTTGTTAATAAGACTTATGTCACAAATC
TTTATTATTCTCATAATTACTCATTACTGGAAGTTTACATTCCATATCCGGTATTCAGTCACGGTGCAATAAACTTAACC
AAGCAGCTTATTAATGAGGGTTATCTTGTTGGTGGAAGTAATGCTGAAAGAATAGATATTGTAGATAATACTGTAAATTT
ATATTATACAGAAGTTTTACCGCTAACAATAGTTATAATTACAGTGTACTTAGTAATTAGTTTGGGTTCTGTCCTAGTAC
CTATAAGGCTAAGTCTTACTCTTTTATTAAGTTCTTTGTTTGGCGTCTCAATCCTTTATCTAGTATATGGTTCTCTATAC
TGGCTTACACCTCTAATAGTTTTCGCAATTATGTATAGTCTTGGGATCGATTATGATATGTTTATTATTATCAGAATTTT
AGAGGAAAAAGGAAATGATGAGGAAAGAATTGTAAATGCTGTTAAAAAAACTGGATTGGTAGTTACAGCTGCTGGTTTAA
TATTAGCTGGTGCGTTTCTTTCCCTAATGTCTTCAGATATGAGGTTTTTACAAGAAATAGGATTTGGAGTTGGTATTACT
ATTTTGTTCGATACATTTGTAGTAAGACCTATATTTGTTCCTGCAATATTAGCAATATTGAAGAAGTATAATTGGTGGCC
TAGAATGATGAGCCTTACAAGGGATGATAGGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTTTGCTTTCCCTAGTACGAACTCAAGGTTTTTAGGGCATTATATGTCTTGTCTAAAAACTCTGAGAAAATACAATAA
ATGGTAATGTTATAATTCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAATGGATCCTTGCTGAGATAGCTTTATTAATTTCGATATATCTATTTCCCATATGAAATTTATGGCAATGAATAAAA
AGACCCTAGGGCTCCTCTTT

Product: antibiotic transport-associated protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 837

Protein sequence:

>837_residues
MINIFNSYGEFSVMKAYLILWLVLLVILAPFALNIQHLFVYSDSPFLNSQFASVKVKDILVKYFNFSTNDDIYVITKGNY
STSLKIVNDTASKYLQNYKLLTPYYILNESNSSYFSVIFPVVEKVYKEILPLHELYKNLTTLRLLLLNNITSFYFQLNVT
YGLPLGKFKSNSSLALKFLAVYSALKNGTDVEKARNASYIVFKDPYVFLFSFNNYSNVNLVTNTLEDFKDYAYLIRIITG
KNVSTAEIEDPLNYSLNLVEKEFPPPPLSINQFHKGDEWLFIVQVPSNESLIDVEMFMKALSNAIITGHLPIYAESAVVT
EQDLRIIDIFTILILTILLIVLVRSLVPIIILIVSAVIGLVIAYSLLYLLTFFGYSIYYISGLVIPPIVFGITVDYSILF
LYRYFEEVRKGEKEPLKVAFRTAGRAVLFSGLSITLGFSSFLFSSSPLLRNIGIALVISSISSLVPAILFIRTALASIQV
RWLSFPRKEIPNPQDVRQRYLEKISKVSINHKYWVLLFMIVLAVASYSVFITHHTNVAIDEIVPSSSEVVRGEQLLGQLY
NYSVDYVIIKGNPNTTYSEIYNLSKELINKGALVYGPASIGKALFVNKTYVTNLYYSHNYSLLEVYIPYPVFSHGAINLT
KQLINEGYLVGGSNAERIDIVDNTVNLYYTEVLPLTIVIITVYLVISLGSVLVPIRLSLTLLLSSLFGVSILYLVYGSLY
WLTPLIVFAIMYSLGIDYDMFIIIRILEEKGNDEERIVNAVKKTGLVVTAAGLILAGAFLSLMSSDMRFLQEIGFGVGIT
ILFDTFVVRPIFVPAILAILKKYNWWPRMMSLTRDDR

Sequences:

>Translated_837_residues
MINIFNSYGEFSVMKAYLILWLVLLVILAPFALNIQHLFVYSDSPFLNSQFASVKVKDILVKYFNFSTNDDIYVITKGNY
STSLKIVNDTASKYLQNYKLLTPYYILNESNSSYFSVIFPVVEKVYKEILPLHELYKNLTTLRLLLLNNITSFYFQLNVT
YGLPLGKFKSNSSLALKFLAVYSALKNGTDVEKARNASYIVFKDPYVFLFSFNNYSNVNLVTNTLEDFKDYAYLIRIITG
KNVSTAEIEDPLNYSLNLVEKEFPPPPLSINQFHKGDEWLFIVQVPSNESLIDVEMFMKALSNAIITGHLPIYAESAVVT
EQDLRIIDIFTILILTILLIVLVRSLVPIIILIVSAVIGLVIAYSLLYLLTFFGYSIYYISGLVIPPIVFGITVDYSILF
LYRYFEEVRKGEKEPLKVAFRTAGRAVLFSGLSITLGFSSFLFSSSPLLRNIGIALVISSISSLVPAILFIRTALASIQV
RWLSFPRKEIPNPQDVRQRYLEKISKVSINHKYWVLLFMIVLAVASYSVFITHHTNVAIDEIVPSSSEVVRGEQLLGQLY
NYSVDYVIIKGNPNTTYSEIYNLSKELINKGALVYGPASIGKALFVNKTYVTNLYYSHNYSLLEVYIPYPVFSHGAINLT
KQLINEGYLVGGSNAERIDIVDNTVNLYYTEVLPLTIVIITVYLVISLGSVLVPIRLSLTLLLSSLFGVSILYLVYGSLY
WLTPLIVFAIMYSLGIDYDMFIIIRILEEKGNDEERIVNAVKKTGLVVTAAGLILAGAFLSLMSSDMRFLQEIGFGVGIT
ILFDTFVVRPIFVPAILAILKKYNWWPRMMSLTRDDR
>Mature_837_residues
MINIFNSYGEFSVMKAYLILWLVLLVILAPFALNIQHLFVYSDSPFLNSQFASVKVKDILVKYFNFSTNDDIYVITKGNY
STSLKIVNDTASKYLQNYKLLTPYYILNESNSSYFSVIFPVVEKVYKEILPLHELYKNLTTLRLLLLNNITSFYFQLNVT
YGLPLGKFKSNSSLALKFLAVYSALKNGTDVEKARNASYIVFKDPYVFLFSFNNYSNVNLVTNTLEDFKDYAYLIRIITG
KNVSTAEIEDPLNYSLNLVEKEFPPPPLSINQFHKGDEWLFIVQVPSNESLIDVEMFMKALSNAIITGHLPIYAESAVVT
EQDLRIIDIFTILILTILLIVLVRSLVPIIILIVSAVIGLVIAYSLLYLLTFFGYSIYYISGLVIPPIVFGITVDYSILF
LYRYFEEVRKGEKEPLKVAFRTAGRAVLFSGLSITLGFSSFLFSSSPLLRNIGIALVISSISSLVPAILFIRTALASIQV
RWLSFPRKEIPNPQDVRQRYLEKISKVSINHKYWVLLFMIVLAVASYSVFITHHTNVAIDEIVPSSSEVVRGEQLLGQLY
NYSVDYVIIKGNPNTTYSEIYNLSKELINKGALVYGPASIGKALFVNKTYVTNLYYSHNYSLLEVYIPYPVFSHGAINLT
KQLINEGYLVGGSNAERIDIVDNTVNLYYTEVLPLTIVIITVYLVISLGSVLVPIRLSLTLLLSSLFGVSILYLVYGSLY
WLTPLIVFAIMYSLGIDYDMFIIIRILEEKGNDEERIVNAVKKTGLVVTAAGLILAGAFLSLMSSDMRFLQEIGFGVGIT
ILFDTFVVRPIFVPAILAILKKYNWWPRMMSLTRDDR

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004707
- InterPro:   IPR004869 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94724; Mature: 94724

Theoretical pI: Translated: 8.52; Mature: 8.52

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINIFNSYGEFSVMKAYLILWLVLLVILAPFALNIQHLFVYSDSPFLNSQFASVKVKDIL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHH
VKYFNFSTNDDIYVITKGNYSTSLKIVNDTASKYLQNYKLLTPYYILNESNSSYFSVIFP
HHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCEEECCEEEEECCCCCHHHHHHH
VVEKVYKEILPLHELYKNLTTLRLLLLNNITSFYFQLNVTYGLPLGKFKSNSSLALKFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VYSALKNGTDVEKARNASYIVFKDPYVFLFSFNNYSNVNLVTNTLEDFKDYAYLIRIITG
HHHHHCCCCCHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
KNVSTAEIEDPLNYSLNLVEKEFPPPPLSINQFHKGDEWLFIVQVPSNESLIDVEMFMKA
CCCCCCCCCCCCCCCEEEHECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHH
LSNAIITGHLPIYAESAVVTEQDLRIIDIFTILILTILLIVLVRSLVPIIILIVSAVIGL
HCCCEEECCCCEEECCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIAYSLLYLLTFFGYSIYYISGLVIPPIVFGITVDYSILFLYRYFEEVRKGEKEPLKVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
RTAGRAVLFSGLSITLGFSSFLFSSSPLLRNIGIALVISSISSLVPAILFIRTALASIQV
HHCCCEEEEECCEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RWLSFPRKEIPNPQDVRQRYLEKISKVSINHKYWVLLFMIVLAVASYSVFITHHTNVAID
HHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEHH
EIVPSSSEVVRGEQLLGQLYNYSVDYVIIKGNPNTTYSEIYNLSKELINKGALVYGPASI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHH
GKALFVNKTYVTNLYYSHNYSLLEVYIPYPVFSHGAINLTKQLINEGYLVGGSNAERIDI
CCCCEEECEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEE
VDNTVNLYYTEVLPLTIVIITVYLVISLGSVLVPIRLSLTLLLSSLFGVSILYLVYGSLY
EECCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLTPLIVFAIMYSLGIDYDMFIIIRILEEKGNDEERIVNAVKKTGLVVTAAGLILAGAFL
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHHHHHH
SLMSSDMRFLQEIGFGVGITILFDTFVVRPIFVPAILAILKKYNWWPRMMSLTRDDR
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MINIFNSYGEFSVMKAYLILWLVLLVILAPFALNIQHLFVYSDSPFLNSQFASVKVKDIL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHH
VKYFNFSTNDDIYVITKGNYSTSLKIVNDTASKYLQNYKLLTPYYILNESNSSYFSVIFP
HHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECHHHHHHHHCCEEECCEEEEECCCCCHHHHHHH
VVEKVYKEILPLHELYKNLTTLRLLLLNNITSFYFQLNVTYGLPLGKFKSNSSLALKFLA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VYSALKNGTDVEKARNASYIVFKDPYVFLFSFNNYSNVNLVTNTLEDFKDYAYLIRIITG
HHHHHCCCCCHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEC
KNVSTAEIEDPLNYSLNLVEKEFPPPPLSINQFHKGDEWLFIVQVPSNESLIDVEMFMKA
CCCCCCCCCCCCCCCEEEHECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHH
LSNAIITGHLPIYAESAVVTEQDLRIIDIFTILILTILLIVLVRSLVPIIILIVSAVIGL
HCCCEEECCCCEEECCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIAYSLLYLLTFFGYSIYYISGLVIPPIVFGITVDYSILFLYRYFEEVRKGEKEPLKVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
RTAGRAVLFSGLSITLGFSSFLFSSSPLLRNIGIALVISSISSLVPAILFIRTALASIQV
HHCCCEEEEECCEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RWLSFPRKEIPNPQDVRQRYLEKISKVSINHKYWVLLFMIVLAVASYSVFITHHTNVAID
HHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEHH
EIVPSSSEVVRGEQLLGQLYNYSVDYVIIKGNPNTTYSEIYNLSKELINKGALVYGPASI
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHH
GKALFVNKTYVTNLYYSHNYSLLEVYIPYPVFSHGAINLTKQLINEGYLVGGSNAERIDI
CCCCEEECEEEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEE
VDNTVNLYYTEVLPLTIVIITVYLVISLGSVLVPIRLSLTLLLSSLFGVSILYLVYGSLY
EECCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLTPLIVFAIMYSLGIDYDMFIIIRILEEKGNDEERIVNAVKKTGLVVTAAGLILAGAFL
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHHHHHH
SLMSSDMRFLQEIGFGVGITILFDTFVVRPIFVPAILAILKKYNWWPRMMSLTRDDR
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11234002 [H]