| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is ygfS [C]
Identifier: 15922172
GI number: 15922172
Start: 1869578
End: 1871440
Strand: Direct
Name: ygfS [C]
Synonym: ST1859
Alternate gene names: 15922172
Gene position: 1869578-1871440 (Clockwise)
Preceding gene: 15922171
Following gene: 15922173
Centisome position: 69.38
GC content: 32.37
Gene sequence:
>1863_bases ATGAATTTACTGATTTTATTTTCAATTGCAATTTCCATGTTATTAGTTATGTTCTATGTTATCTATGAAGTAAAGAATTG GAGGAGTGATAGGAGAGTTTTAGTTGCTATCTATGTAGAAGGAATGATGCTAGTAATGAATTTAGGTGCTTATCTTTATC TTTTGCTTCACGATCTCTTTCTATTTCTTGTAATAAATGGAGCTTATATGATATTTGGCCTCTATGCTATCCTTAATATC AAATCTATATCAAGAAGTATAGCATATGTTCTGTTTTCCTCATTTATGATTATTTCTGAAGTATTTATGGGTTCGCTTTT TTACATTCTTCAAACTGGTTTACCAGCTAATCTTGATTCCTCTGTAGAAAATCCATGGTTTGTCACAGTTATGGTTGCTG AAATGATCTTTACATTAATGGTATCTTTTAAGAGACTTGATAAGACGTTAAGAAATTATCTTATAAGCTTACTTTTATTA ATGCCTTGGTTTCCTGTGATTTTCTCTAACTATGCCTTCTTATTCTCTTCAATAATAATGATAGGTGCTACTATATTAGT TTACGAGACTCTGTATAATCAGAGATTAAGAGCTACTCAAGAGACCTTTACTACAATAGAATTAATGAGTATATTTACTC TTATGATGATAGGAGGATTTATCTATTTTCTAACATTTTCCCTTACTGTCTACGATGTTTCAATGCTAATTGCAATGGTT TGGTTTATTTATAGGACTGTTATAGGACCCAATCCGAGAAAAGGAAATTATCTGAGAGATACAAAGATTGCATTCTCGAT AATTTTTCTGACATTTATCATGGAATTCTTCATGGGGGGTGTTTTAGATTTCGTTATGGGATTATTTTCCCCAGGCATTA AAGGCTTTATTTCCTCACTTAGTCTACCATGGACAGGAAATATAATTTGGGATGGTATTGATGTAGTAGGCAGTATACTA GGGAGTACTTGGTTCTTAATAATGATGGGAATAGAAATGGGATTCTTAGCTTTTAAGAAAATGCTAGAGATCAGAGTAAG AGAAGTTAAAATAAGAATGGCTTTAATGATATTAGCATATGCAATTTATTCAATATACATACCTAGCTTCTCTCCCTTAT CATCCTCATTACCATATATACCATATATGTGGAGCATGGGTATTGGAACCTTAGCACCAGTCAGTAATTCTGTCTTATTA GGTTTAATAGGAACTTATATTATTTACGCAATTCTCTCATTCCTATTTGGCTCAAGAAATTTGTGCGCTGTGACGTGTAC AGCCCCAATGATGTATCAAGGGAACTTTTATGACTCTTTAAAGGTTTATAATAGGACATCTAAAATCGGTAAGAAATTAT TAACTAGTAAGAGTAAATATTATAGACCCATAGCCTTATCTGTTTCTGTTCTTGTTCTAATTGCAGCAGTGATATCTTAC TTAAATAGTCTAGGAATAATCTCCTTCACAATTTTTAACACTGATATTACTGTTCTAATTTATTTCATTTGGTTCGATAT TATGTGGTATCTAATATTCATCTCAATACCCTTCTTAGGTACTTTTGCATGTGTAACTACTGGCTATTGTTATTGGGGAG TTTTCAACCAAGCAATAAGCAGAATAGGGCTCTTTAGACTTAAAGTTAAGAACCCACAGCAATGTATAGAATGCAAGACT GTAGATTGTGCAAATGCTTGCCCAGTAGGTTTGACTGATATGAGAGGCGAGTTTATTAGAAAAGGTGAGTTTAGGTCAAT AAAGTGTGTTGGAATTGGAGAGTGTATTGATGCGTGTCCATATAATAACATATTTATTTATGATGTGAGAAATTGGATAA AAGAAAGATTTAGAGGGAAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATCTATTAAATAGAAGAAACGGAATAGACCTTAACTTACTATTTAATGAAGTTCCACCAGAATAAATTTTTTATATTT ATATTTCATTTTTTTAATAC
Downstream 100 bases:
>100_bases GATTTTTCCTCTAATATTCACTCTCTCTCTAATAGCTAGTGTGATGGTTGCTATAATAGTTTATACTCTTTATTCCGTTT CCTATAAAATAAAAACTTGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620
Protein sequence:
>620_residues MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLFLFLVINGAYMIFGLYAILNI KSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDSSVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLL MPWFPVIFSNYAFLFSSIIMIGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSLSLPWTGNIIWDGIDVVGSIL GSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAYAIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLL GLIGTYIIYAILSFLFGSRNLCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAISRIGLFRLKVKNPQQCIECKT VDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACPYNNIFIYDVRNWIKERFRGK
Sequences:
>Translated_620_residues MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLFLFLVINGAYMIFGLYAILNI KSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDSSVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLL MPWFPVIFSNYAFLFSSIIMIGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSLSLPWTGNIIWDGIDVVGSIL GSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAYAIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLL GLIGTYIIYAILSFLFGSRNLCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAISRIGLFRLKVKNPQQCIECKT VDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACPYNNIFIYDVRNWIKERFRGK >Mature_620_residues MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLFLFLVINGAYMIFGLYAILNI KSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDSSVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLL MPWFPVIFSNYAFLFSSIIMIGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSLSLPWTGNIIWDGIDVVGSIL GSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAYAIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLL GLIGTYIIYAILSFLFGSRNLCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAISRIGLFRLKVKNPQQCIECKT VDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACPYNNIFIYDVRNWIKERFRGK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70872; Mature: 70872
Theoretical pI: Translated: 9.23; Mature: 9.23
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 5.5 %Met (Translated Protein) 7.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 5.5 %Met (Mature Protein) 7.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLF CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLVINGAYMIFGLYAILNIKSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC SVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLLMPWFPVIFSNYAFLFSSIIM CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSL HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC SLPWTGNIIWDGIDVVGSILGSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAY CCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLLGLIGTYIIYAILSFLFGSRN HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY EEEEEECCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAIS HHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH RIGLFRLKVKNPQQCIECKTVDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACP HHCEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCC YNNIFIYDVRNWIKERFRGK CCCEEEEEHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLF CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFLVINGAYMIFGLYAILNIKSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC SVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLLMPWFPVIFSNYAFLFSSIIM CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSL HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC SLPWTGNIIWDGIDVVGSILGSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAY CCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLLGLIGTYIIYAILSFLFGSRN HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY EEEEEECCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAIS HHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH RIGLFRLKVKNPQQCIECKTVDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACP HHCEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCC YNNIFIYDVRNWIKERFRGK CCCEEEEEHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: Fe [C]
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA