Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ygfS [C]

Identifier: 15922172

GI number: 15922172

Start: 1869578

End: 1871440

Strand: Direct

Name: ygfS [C]

Synonym: ST1859

Alternate gene names: 15922172

Gene position: 1869578-1871440 (Clockwise)

Preceding gene: 15922171

Following gene: 15922173

Centisome position: 69.38

GC content: 32.37

Gene sequence:

>1863_bases
ATGAATTTACTGATTTTATTTTCAATTGCAATTTCCATGTTATTAGTTATGTTCTATGTTATCTATGAAGTAAAGAATTG
GAGGAGTGATAGGAGAGTTTTAGTTGCTATCTATGTAGAAGGAATGATGCTAGTAATGAATTTAGGTGCTTATCTTTATC
TTTTGCTTCACGATCTCTTTCTATTTCTTGTAATAAATGGAGCTTATATGATATTTGGCCTCTATGCTATCCTTAATATC
AAATCTATATCAAGAAGTATAGCATATGTTCTGTTTTCCTCATTTATGATTATTTCTGAAGTATTTATGGGTTCGCTTTT
TTACATTCTTCAAACTGGTTTACCAGCTAATCTTGATTCCTCTGTAGAAAATCCATGGTTTGTCACAGTTATGGTTGCTG
AAATGATCTTTACATTAATGGTATCTTTTAAGAGACTTGATAAGACGTTAAGAAATTATCTTATAAGCTTACTTTTATTA
ATGCCTTGGTTTCCTGTGATTTTCTCTAACTATGCCTTCTTATTCTCTTCAATAATAATGATAGGTGCTACTATATTAGT
TTACGAGACTCTGTATAATCAGAGATTAAGAGCTACTCAAGAGACCTTTACTACAATAGAATTAATGAGTATATTTACTC
TTATGATGATAGGAGGATTTATCTATTTTCTAACATTTTCCCTTACTGTCTACGATGTTTCAATGCTAATTGCAATGGTT
TGGTTTATTTATAGGACTGTTATAGGACCCAATCCGAGAAAAGGAAATTATCTGAGAGATACAAAGATTGCATTCTCGAT
AATTTTTCTGACATTTATCATGGAATTCTTCATGGGGGGTGTTTTAGATTTCGTTATGGGATTATTTTCCCCAGGCATTA
AAGGCTTTATTTCCTCACTTAGTCTACCATGGACAGGAAATATAATTTGGGATGGTATTGATGTAGTAGGCAGTATACTA
GGGAGTACTTGGTTCTTAATAATGATGGGAATAGAAATGGGATTCTTAGCTTTTAAGAAAATGCTAGAGATCAGAGTAAG
AGAAGTTAAAATAAGAATGGCTTTAATGATATTAGCATATGCAATTTATTCAATATACATACCTAGCTTCTCTCCCTTAT
CATCCTCATTACCATATATACCATATATGTGGAGCATGGGTATTGGAACCTTAGCACCAGTCAGTAATTCTGTCTTATTA
GGTTTAATAGGAACTTATATTATTTACGCAATTCTCTCATTCCTATTTGGCTCAAGAAATTTGTGCGCTGTGACGTGTAC
AGCCCCAATGATGTATCAAGGGAACTTTTATGACTCTTTAAAGGTTTATAATAGGACATCTAAAATCGGTAAGAAATTAT
TAACTAGTAAGAGTAAATATTATAGACCCATAGCCTTATCTGTTTCTGTTCTTGTTCTAATTGCAGCAGTGATATCTTAC
TTAAATAGTCTAGGAATAATCTCCTTCACAATTTTTAACACTGATATTACTGTTCTAATTTATTTCATTTGGTTCGATAT
TATGTGGTATCTAATATTCATCTCAATACCCTTCTTAGGTACTTTTGCATGTGTAACTACTGGCTATTGTTATTGGGGAG
TTTTCAACCAAGCAATAAGCAGAATAGGGCTCTTTAGACTTAAAGTTAAGAACCCACAGCAATGTATAGAATGCAAGACT
GTAGATTGTGCAAATGCTTGCCCAGTAGGTTTGACTGATATGAGAGGCGAGTTTATTAGAAAAGGTGAGTTTAGGTCAAT
AAAGTGTGTTGGAATTGGAGAGTGTATTGATGCGTGTCCATATAATAACATATTTATTTATGATGTGAGAAATTGGATAA
AAGAAAGATTTAGAGGGAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATCTATTAAATAGAAGAAACGGAATAGACCTTAACTTACTATTTAATGAAGTTCCACCAGAATAAATTTTTTATATTT
ATATTTCATTTTTTTAATAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTTTTCCTCTAATATTCACTCTCTCTCTAATAGCTAGTGTGATGGTTGCTATAATAGTTTATACTCTTTATTCCGTTT
CCTATAAAATAAAAACTTGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620

Protein sequence:

>620_residues
MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLFLFLVINGAYMIFGLYAILNI
KSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDSSVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLL
MPWFPVIFSNYAFLFSSIIMIGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV
WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSLSLPWTGNIIWDGIDVVGSIL
GSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAYAIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLL
GLIGTYIIYAILSFLFGSRNLCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY
LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAISRIGLFRLKVKNPQQCIECKT
VDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACPYNNIFIYDVRNWIKERFRGK

Sequences:

>Translated_620_residues
MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLFLFLVINGAYMIFGLYAILNI
KSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDSSVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLL
MPWFPVIFSNYAFLFSSIIMIGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV
WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSLSLPWTGNIIWDGIDVVGSIL
GSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAYAIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLL
GLIGTYIIYAILSFLFGSRNLCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY
LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAISRIGLFRLKVKNPQQCIECKT
VDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACPYNNIFIYDVRNWIKERFRGK
>Mature_620_residues
MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLFLFLVINGAYMIFGLYAILNI
KSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDSSVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLL
MPWFPVIFSNYAFLFSSIIMIGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV
WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSLSLPWTGNIIWDGIDVVGSIL
GSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAYAIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLL
GLIGTYIIYAILSFLFGSRNLCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY
LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAISRIGLFRLKVKNPQQCIECKT
VDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACPYNNIFIYDVRNWIKERFRGK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70872; Mature: 70872

Theoretical pI: Translated: 9.23; Mature: 9.23

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
5.5 %Met     (Translated Protein)
7.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
5.5 %Met     (Mature Protein)
7.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLF
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFLVINGAYMIFGLYAILNIKSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
SVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLLMPWFPVIFSNYAFLFSSIIM
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSL
HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC
SLPWTGNIIWDGIDVVGSILGSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAY
CCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLLGLIGTYIIYAILSFLFGSRN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY
EEEEEECCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAIS
HHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
RIGLFRLKVKNPQQCIECKTVDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACP
HHCEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCC
YNNIFIYDVRNWIKERFRGK
CCCEEEEEHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNLLILFSIAISMLLVMFYVIYEVKNWRSDRRVLVAIYVEGMMLVMNLGAYLYLLLHDLF
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFLVINGAYMIFGLYAILNIKSISRSIAYVLFSSFMIISEVFMGSLFYILQTGLPANLDS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
SVENPWFVTVMVAEMIFTLMVSFKRLDKTLRNYLISLLLLMPWFPVIFSNYAFLFSSIIM
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGATILVYETLYNQRLRATQETFTTIELMSIFTLMMIGGFIYFLTFSLTVYDVSMLIAMV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WFIYRTVIGPNPRKGNYLRDTKIAFSIIFLTFIMEFFMGGVLDFVMGLFSPGIKGFISSL
HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC
SLPWTGNIIWDGIDVVGSILGSTWFLIMMGIEMGFLAFKKMLEIRVREVKIRMALMILAY
CCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIYSIYIPSFSPLSSSLPYIPYMWSMGIGTLAPVSNSVLLGLIGTYIIYAILSFLFGSRN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
LCAVTCTAPMMYQGNFYDSLKVYNRTSKIGKKLLTSKSKYYRPIALSVSVLVLIAAVISY
EEEEEECCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNSLGIISFTIFNTDITVLIYFIWFDIMWYLIFISIPFLGTFACVTTGYCYWGVFNQAIS
HHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
RIGLFRLKVKNPQQCIECKTVDCANACPVGLTDMRGEFIRKGEFRSIKCVGIGECIDACP
HHCEEEEECCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCC
YNNIFIYDVRNWIKERFRGK
CCCEEEEEHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: Fe [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA