| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15922165
Identifier: 15922165
GI number: 15922165
Start: 1861670
End: 1862917
Strand: Direct
Name: 15922165
Synonym: ST1852
Alternate gene names: NA
Gene position: 1861670-1862917 (Clockwise)
Preceding gene: 15922161
Following gene: 15922167
Centisome position: 69.08
GC content: 31.57
Gene sequence:
>1248_bases ATGTTTTTATTAGAAAAATTGACGATAACTAAACTTAAATATAGCGAGATAAATTACACCTTTATGCAAAAAAAGGATAT AACATTTCTTCATGCATTATTAATTATTATTCCTTTGACTATTGCAATAAGAGCATCTAATAATATGTTAATGACAACAA TTCCCCTTGTAACCAAATACATATTTAATTTTAGCGAAAGCGAAATCGGAATTATTTCAGCCCTAACTTCACTGTTTACG TTTATTGGAAGCGGTGTAATCAATTCTAGATTGAAACGCGATATGAGGAAAAAAGTTTTTAGAGCATCTGGCATAGTTTA CGCTATACTTTTACCTATCTTTTATTTTGCTTCTCCAATTACTATTTGGGTTTTATCAGCGTTAGCTGGGATTGTTCTTG GTATACTTATGCCAAATATTATTACTTATGCCGGATTACTAAAAGATAGAAGGCAAAGGGAAAGAGTACTCTCAATTTAT ACCTTAGCATTATCAGCAAGTTTAGTAATCGGACCAGCAATTGAGTCATGGATATTAAATTACTTTTCACTCCTAGAAGT TTTCCTATTCTTTGCCCCATTCTCAATTCTTTCTGGGATAATGTCATTCTTTGTAGATTTCCCAGAAGAGAGAAATGATG GTAAAAAGACAAAAGTCTTCGAAAATCCAGGGTTTATAACGGCAGTTATTAATATCTTAACATATAATATAGTTTTCTCA ATACTTCTTGCTTTTGCAGGAATATATGCAAAATCTACTTTTAATATCTCTTACTCTTCTGTTACCCTAATCTTCTCAGC TTTCTTTTTAACCTCATTCCTTTCTAGGCTTTACCTTTCTATTAGACCCGCAGAAAGGCTATGGTATTATATGTCTTTTG CAATATCAATAACAACACTTGGTTTAGTATTTATTTCAGTTTTACCATCAAACTTAGTTCTCTTTACGGTAGCTCTATTG CTTCTAGGAATTCCTCATGGAATAACATATCCCTTATCCATCATTTCTATAAGCAGGACTTTCTTACCAGAAGAAAGAAA TGAGGCAAATAGTATATTCTTTGCTATTATGATGCTAATAGGTATAGTAACTCCAACAATATCGGGCTTTGTAATTGAGA TAATTGGATTTAGAACCACTCTAACTTTCATAATTCCTATAATCCTCTCGCTTCTTGTCTTGTTGAGACGTTATGTTAAA TATGTTGATACTCAGATTGATAAAACCTATAAGAGTATAGCTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGATATGCTATTAAAGGATAGGATACTGGGCCTGGAGCGGCTAATATTCTAATTTTACTCTGGGAATTCATGAGTTTC TATGAAACTACTTTTCTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTAGAAAATATAACGAAGTAGTTCTATAATAATCTTGTTTCATAAACTATGGCCTTAATGTTTTCTGTTTGTTTAATA AAGAGAGGAGAATAAAACCT
Product: multidrug resistance protein
Products: NA
Alternate protein names: Multidrug Efflux Permease; Facilitator Superfamily Protein; Multidrug Resistance Protein
Number of amino acids: Translated: 415; Mature: 415
Protein sequence:
>415_residues MFLLEKLTITKLKYSEINYTFMQKKDITFLHALLIIIPLTIAIRASNNMLMTTIPLVTKYIFNFSESEIGIISALTSLFT FIGSGVINSRLKRDMRKKVFRASGIVYAILLPIFYFASPITIWVLSALAGIVLGILMPNIITYAGLLKDRRQRERVLSIY TLALSASLVIGPAIESWILNYFSLLEVFLFFAPFSILSGIMSFFVDFPEERNDGKKTKVFENPGFITAVINILTYNIVFS ILLAFAGIYAKSTFNISYSSVTLIFSAFFLTSFLSRLYLSIRPAERLWYYMSFAISITTLGLVFISVLPSNLVLFTVALL LLGIPHGITYPLSIISISRTFLPEERNEANSIFFAIMMLIGIVTPTISGFVIEIIGFRTTLTFIIPIILSLLVLLRRYVK YVDTQIDKTYKSIAK
Sequences:
>Translated_415_residues MFLLEKLTITKLKYSEINYTFMQKKDITFLHALLIIIPLTIAIRASNNMLMTTIPLVTKYIFNFSESEIGIISALTSLFT FIGSGVINSRLKRDMRKKVFRASGIVYAILLPIFYFASPITIWVLSALAGIVLGILMPNIITYAGLLKDRRQRERVLSIY TLALSASLVIGPAIESWILNYFSLLEVFLFFAPFSILSGIMSFFVDFPEERNDGKKTKVFENPGFITAVINILTYNIVFS ILLAFAGIYAKSTFNISYSSVTLIFSAFFLTSFLSRLYLSIRPAERLWYYMSFAISITTLGLVFISVLPSNLVLFTVALL LLGIPHGITYPLSIISISRTFLPEERNEANSIFFAIMMLIGIVTPTISGFVIEIIGFRTTLTFIIPIILSLLVLLRRYVK YVDTQIDKTYKSIAK >Mature_415_residues MFLLEKLTITKLKYSEINYTFMQKKDITFLHALLIIIPLTIAIRASNNMLMTTIPLVTKYIFNFSESEIGIISALTSLFT FIGSGVINSRLKRDMRKKVFRASGIVYAILLPIFYFASPITIWVLSALAGIVLGILMPNIITYAGLLKDRRQRERVLSIY TLALSASLVIGPAIESWILNYFSLLEVFLFFAPFSILSGIMSFFVDFPEERNDGKKTKVFENPGFITAVINILTYNIVFS ILLAFAGIYAKSTFNISYSSVTLIFSAFFLTSFLSRLYLSIRPAERLWYYMSFAISITTLGLVFISVLPSNLVLFTVALL LLGIPHGITYPLSIISISRTFLPEERNEANSIFFAIMMLIGIVTPTISGFVIEIIGFRTTLTFIIPIILSLLVLLRRYVK YVDTQIDKTYKSIAK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46877; Mature: 46877
Theoretical pI: Translated: 10.16; Mature: 10.16
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFLLEKLTITKLKYSEINYTFMQKKDITFLHALLIIIPLTIAIRASNNMLMTTIPLVTKY CCCHHHHHHHHEEHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHH IFNFSESEIGIISALTSLFTFIGSGVINSRLKRDMRKKVFRASGIVYAILLPIFYFASPI HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH TIWVLSALAGIVLGILMPNIITYAGLLKDRRQRERVLSIYTLALSASLVIGPAIESWILN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFSLLEVFLFFAPFSILSGIMSFFVDFPEERNDGKKTKVFENPGFITAVINILTYNIVFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ILLAFAGIYAKSTFNISYSSVTLIFSAFFLTSFLSRLYLSIRPAERLWYYMSFAISITTL HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLVFISVLPSNLVLFTVALLLLGIPHGITYPLSIISISRTFLPEERNEANSIFFAIMMLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GIVTPTISGFVIEIIGFRTTLTFIIPIILSLLVLLRRYVKYVDTQIDKTYKSIAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MFLLEKLTITKLKYSEINYTFMQKKDITFLHALLIIIPLTIAIRASNNMLMTTIPLVTKY CCCHHHHHHHHEEHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEHHHHHHHHH IFNFSESEIGIISALTSLFTFIGSGVINSRLKRDMRKKVFRASGIVYAILLPIFYFASPI HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH TIWVLSALAGIVLGILMPNIITYAGLLKDRRQRERVLSIYTLALSASLVIGPAIESWILN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFSLLEVFLFFAPFSILSGIMSFFVDFPEERNDGKKTKVFENPGFITAVINILTYNIVFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ILLAFAGIYAKSTFNISYSSVTLIFSAFFLTSFLSRLYLSIRPAERLWYYMSFAISITTL HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLVFISVLPSNLVLFTVALLLLGIPHGITYPLSIISISRTFLPEERNEANSIFFAIMMLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GIVTPTISGFVIEIIGFRTTLTFIIPIILSLLVLLRRYVKYVDTQIDKTYKSIAK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA