| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15922005
Identifier: 15922005
GI number: 15922005
Start: 1701574
End: 1703514
Strand: Reverse
Name: 15922005
Synonym: ST1701
Alternate gene names: NA
Gene position: 1703514-1701574 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15922006
Following gene: 15922003
Centisome position: 63.22
GC content: 31.53
Gene sequence:
>1941_bases ATGATAAGTCTCCTTTCCATTGTAGTTCTAACGTATATAGTATTAATGATGGGAATAAACTTTGCAATTCTAGGTTATAT TTTGAGAAAAGAATACTTAAATAGAAGAGCAGTATTGTTTTTACTTTCAATCATTTTGTATATGGGTGTCGAAAGTATCT CTTTAGGTTATATTATTTTCTATCACGGAAGTCCTTTCATAGAGCCTGTTGTACTTCTGTTAGCTTCAGTTCCAATTATT ATGTCGGCTATAATAAAAAGTGAAGTAATCAGGGTAAGGAGTAATAAACTTTCAGCATTCTTACTCGCATTTTCCATAGT ATTTGATGAAATTGCTATGGGTTATCTCTATGCATCAGCTTTTGGTCCTCACATGTTTAATCCGTTTATTGACGCTGTAA GTAATATAGCCTTTGGAATAATGATGTTAGCTGACGGAGTTTTCTTCTTATTAATATCACGTGTGAAAAGTATAATTGAA TTTTCATTAACTACATTTGCAATATCAATGGCATTCTTACCGTCTATATTTATAGAAAGTGGTAAACTTACTGAACTTGT TGTCTCGTTTATATCTACGATAATAATGATCATAAATATTGTAACGCTTTATTTAATTGAAATTAGGAGAGTTACACTAC AAGGACAACTTTTTTCGATAACCTTAGCGTTTTTTGACTTTCTAATGATGTTAGGATTAACTACTTTTGCCTCATTTAAT GATATGTGGTTAATATCTTTGTCAATTGTTCTATCTATGATATGGTATTTTATTCTTATATTTTATGAAATTCCTTCTAG GAAAATTGAAATGAAGTTAAGATATCCCTTCATTTTTCTTGTTTTCGTAAATCTAGCAGAACTTACTATGGGATTTGGTG AAAGTGTCCTAGGATTTACTATAAGTAATTCACTATTTTCCAGTATGCAATCACATATGATGATGAAGCATGGAATGATT ATGATGAGAAGTCCATTTACAAATCCGCTATGGTGGTTATTTCCAATTAACCCTATAGGTATGGGTTTAATGTTTATTCA TACTAACATTAATATCATTCTGAAAGCAATATTTACTTCTTACATGTTTGTCATGGCAACTACAATGACGCCATTTTATG TTATAATGATGGGAGCTGAAATGAGCTATTTAGTTTATGAAAGATATAAGCATGCGAAAAACCTGGGAGTTAAGAGATGG GCTTTAGTTATACTTTTAGGAATCCCTATATTTGTAGTTTTAATACCATACTATACAAACTTTTACATTTTCGGAATGAG TGGTATGATATTTCCAGTAACACTCTTACCATTTATCATCTCTTTACTTGCAGTTGTGATAGCTTCAACATTGTTTGGTA GAAGGGCTTATTGTAATGCTGTTTGTATGTCAGCTCACATGTGGACTAACATATTTTATGATCAGTTTAAGCCAAAGAAG AGTAGTAAAGTATGGGAATATTTAAGATGGGTTTTCGTAATTCCTATAGTTATAGCTTTCTCTCTTTACATACTCATGGA AATTCATTTATGGACTCCACCTAAGATCGGGATGACAACTCTTGATCCCTTAAACTTTTACGGAATGTTCGTGTTGAATT ATATATGGTGGATATTTTACTTTTTAACCCCAGTATTTGGTGCCTATAGCTGTGCTAGACAAGGATGGTGTGGTTTCGGA ACATTTGCGGGAATATTTAACAAAGTATTTTTCAAAATAAAGGCAAATGAAGTTGAAACATGTAAGAGTTGTGAAGTAAA AGCTTGTGATTCTTCTTGTCCAGTAAAAATACCGATATCTCAAGATGTAATAACTAAGGGATATTCAAATAGGATAAGCT GTGTAGGTTGTGGAGACTGTGTTGAAGCTTGTCCATATAATAATTTAGAGATAATAGATATAACAAATTATTTGAGCAAA AAATCTCACATAGCTTCTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TACAGAGAATTTTTATTATGAAAATAAAGTTAAACAAATTTTTAACTTAATTGTTAATTATAATTACAAAGTTTAAAAAT TTCTCGTTGAATTATCTATC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAATTTGAAGAATTTGGTTTCCTTCTGTTTGAATGAAGGAGATTTGTGAAGGTATATTACCATTTTTTATATCTTGAAG AATCATTGCTGGAAGTTGAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 646; Mature: 646
Protein sequence:
>646_residues MISLLSIVVLTYIVLMMGINFAILGYILRKEYLNRRAVLFLLSIILYMGVESISLGYIIFYHGSPFIEPVVLLLASVPII MSAIIKSEVIRVRSNKLSAFLLAFSIVFDEIAMGYLYASAFGPHMFNPFIDAVSNIAFGIMMLADGVFFLLISRVKSIIE FSLTTFAISMAFLPSIFIESGKLTELVVSFISTIIMIINIVTLYLIEIRRVTLQGQLFSITLAFFDFLMMLGLTTFASFN DMWLISLSIVLSMIWYFILIFYEIPSRKIEMKLRYPFIFLVFVNLAELTMGFGESVLGFTISNSLFSSMQSHMMMKHGMI MMRSPFTNPLWWLFPINPIGMGLMFIHTNINIILKAIFTSYMFVMATTMTPFYVIMMGAEMSYLVYERYKHAKNLGVKRW ALVILLGIPIFVVLIPYYTNFYIFGMSGMIFPVTLLPFIISLLAVVIASTLFGRRAYCNAVCMSAHMWTNIFYDQFKPKK SSKVWEYLRWVFVIPIVIAFSLYILMEIHLWTPPKIGMTTLDPLNFYGMFVLNYIWWIFYFLTPVFGAYSCARQGWCGFG TFAGIFNKVFFKIKANEVETCKSCEVKACDSSCPVKIPISQDVITKGYSNRISCVGCGDCVEACPYNNLEIIDITNYLSK KSHIAS
Sequences:
>Translated_646_residues MISLLSIVVLTYIVLMMGINFAILGYILRKEYLNRRAVLFLLSIILYMGVESISLGYIIFYHGSPFIEPVVLLLASVPII MSAIIKSEVIRVRSNKLSAFLLAFSIVFDEIAMGYLYASAFGPHMFNPFIDAVSNIAFGIMMLADGVFFLLISRVKSIIE FSLTTFAISMAFLPSIFIESGKLTELVVSFISTIIMIINIVTLYLIEIRRVTLQGQLFSITLAFFDFLMMLGLTTFASFN DMWLISLSIVLSMIWYFILIFYEIPSRKIEMKLRYPFIFLVFVNLAELTMGFGESVLGFTISNSLFSSMQSHMMMKHGMI MMRSPFTNPLWWLFPINPIGMGLMFIHTNINIILKAIFTSYMFVMATTMTPFYVIMMGAEMSYLVYERYKHAKNLGVKRW ALVILLGIPIFVVLIPYYTNFYIFGMSGMIFPVTLLPFIISLLAVVIASTLFGRRAYCNAVCMSAHMWTNIFYDQFKPKK SSKVWEYLRWVFVIPIVIAFSLYILMEIHLWTPPKIGMTTLDPLNFYGMFVLNYIWWIFYFLTPVFGAYSCARQGWCGFG TFAGIFNKVFFKIKANEVETCKSCEVKACDSSCPVKIPISQDVITKGYSNRISCVGCGDCVEACPYNNLEIIDITNYLSK KSHIAS >Mature_646_residues MISLLSIVVLTYIVLMMGINFAILGYILRKEYLNRRAVLFLLSIILYMGVESISLGYIIFYHGSPFIEPVVLLLASVPII MSAIIKSEVIRVRSNKLSAFLLAFSIVFDEIAMGYLYASAFGPHMFNPFIDAVSNIAFGIMMLADGVFFLLISRVKSIIE FSLTTFAISMAFLPSIFIESGKLTELVVSFISTIIMIINIVTLYLIEIRRVTLQGQLFSITLAFFDFLMMLGLTTFASFN DMWLISLSIVLSMIWYFILIFYEIPSRKIEMKLRYPFIFLVFVNLAELTMGFGESVLGFTISNSLFSSMQSHMMMKHGMI MMRSPFTNPLWWLFPINPIGMGLMFIHTNINIILKAIFTSYMFVMATTMTPFYVIMMGAEMSYLVYERYKHAKNLGVKRW ALVILLGIPIFVVLIPYYTNFYIFGMSGMIFPVTLLPFIISLLAVVIASTLFGRRAYCNAVCMSAHMWTNIFYDQFKPKK SSKVWEYLRWVFVIPIVIAFSLYILMEIHLWTPPKIGMTTLDPLNFYGMFVLNYIWWIFYFLTPVFGAYSCARQGWCGFG TFAGIFNKVFFKIKANEVETCKSCEVKACDSSCPVKIPISQDVITKGYSNRISCVGCGDCVEACPYNNLEIIDITNYLSK KSHIAS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73757; Mature: 73757
Theoretical pI: Translated: 8.86; Mature: 8.86
Prosite motif: PS00198 4FE4S_FERREDOXIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.9 %Cys (Translated Protein) 6.0 %Met (Translated Protein) 7.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.9 %Cys (Mature Protein) 6.0 %Met (Mature Protein) 7.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MISLLSIVVLTYIVLMMGINFAILGYILRKEYLNRRAVLFLLSIILYMGVESISLGYIIF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEE YHGSPFIEPVVLLLASVPIIMSAIIKSEVIRVRSNKLSAFLLAFSIVFDEIAMGYLYASA ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGPHMFNPFIDAVSNIAFGIMMLADGVFFLLISRVKSIIEFSLTTFAISMAFLPSIFIES CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GKLTELVVSFISTIIMIINIVTLYLIEIRRVTLQGQLFSITLAFFDFLMMLGLTTFASFN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DMWLISLSIVLSMIWYFILIFYEIPSRKIEMKLRYPFIFLVFVNLAELTMGFGESVLGFT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH ISNSLFSSMQSHMMMKHGMIMMRSPFTNPLWWLFPINPIGMGLMFIHTNINIILKAIFTS HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH YMFVMATTMTPFYVIMMGAEMSYLVYERYKHAKNLGVKRWALVILLGIPIFVVLIPYYTN HHHHHHHHCCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC FYIFGMSGMIFPVTLLPFIISLLAVVIASTLFGRRAYCNAVCMSAHMWTNIFYDQFKPKK EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SSKVWEYLRWVFVIPIVIAFSLYILMEIHLWTPPKIGMTTLDPLNFYGMFVLNYIWWIFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLTPVFGAYSCARQGWCGFGTFAGIFNKVFFKIKANEVETCKSCEVKACDSSCPVKIPIS HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHCCCCEECCCCCCEEECCC QDVITKGYSNRISCVGCGDCVEACPYNNLEIIDITNYLSKKSHIAS HHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MISLLSIVVLTYIVLMMGINFAILGYILRKEYLNRRAVLFLLSIILYMGVESISLGYIIF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEE YHGSPFIEPVVLLLASVPIIMSAIIKSEVIRVRSNKLSAFLLAFSIVFDEIAMGYLYASA ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGPHMFNPFIDAVSNIAFGIMMLADGVFFLLISRVKSIIEFSLTTFAISMAFLPSIFIES CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GKLTELVVSFISTIIMIINIVTLYLIEIRRVTLQGQLFSITLAFFDFLMMLGLTTFASFN CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DMWLISLSIVLSMIWYFILIFYEIPSRKIEMKLRYPFIFLVFVNLAELTMGFGESVLGFT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH ISNSLFSSMQSHMMMKHGMIMMRSPFTNPLWWLFPINPIGMGLMFIHTNINIILKAIFTS HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCEEEEEECCHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHH YMFVMATTMTPFYVIMMGAEMSYLVYERYKHAKNLGVKRWALVILLGIPIFVVLIPYYTN HHHHHHHHCCHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC FYIFGMSGMIFPVTLLPFIISLLAVVIASTLFGRRAYCNAVCMSAHMWTNIFYDQFKPKK EEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC SSKVWEYLRWVFVIPIVIAFSLYILMEIHLWTPPKIGMTTLDPLNFYGMFVLNYIWWIFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLTPVFGAYSCARQGWCGFGTFAGIFNKVFFKIKANEVETCKSCEVKACDSSCPVKIPIS HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHCCCCEECCCCCCEEECCC QDVITKGYSNRISCVGCGDCVEACPYNNLEIIDITNYLSKKSHIAS HHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA