| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is cbsB [H]
Identifier: 15921968
GI number: 15921968
Start: 1662184
End: 1663128
Strand: Direct
Name: cbsB [H]
Synonym: ST1665
Alternate gene names: 15921968
Gene position: 1662184-1663128 (Clockwise)
Preceding gene: 15921967
Following gene: 15921969
Centisome position: 61.68
GC content: 28.99
Gene sequence:
>945_bases ATGAGAATTTCATCCTTTTTAGAAAAAGATATAAAATATTTTTTTATAATTCTAGGCATTTCTGCATTTCTTCAATTTAT GTTTTCTGAAGCTTTCGTTTTTCCTTCAGCCTTACCTATTCACATCCCTGCTGAAATGATCCTCCTTAGAATAGGTGCAG TTTCTTTTTACATCTTTTTCATTTCTCTTATCCTAGTCTCACTTCTTTTATCTAACAAAGTAAAAGCTCTTCTACCTTTA TCAATAGTGCTTATAATATCCCCTATTTTAGCGTATTTAAACGTCAGTTATACATATTATTACGGTATTGAAATATTTAT AATAATAGTAGCTATTATGGCACTGATAGAAGCTACTGTTAAAAGTGACGTAAAAGTAGTACTTCTTATCCCATCTGGAA TACTAGTAGGATTAGGTTTAATAGCGTCATTTTTCATTACTTTCTATCATACTACTCTTTACATAAGTTATTTAGATTTT CTCATTTTTTCTGCAATTACATTTTTAGTCTATACTGTATTTTGGAGAAAGATAATTAGCAAAAGGAGTGTTATTGCCTA TATTGTGGGCTTAATAAGTATGTATCCGTTTGTTATGTTTGCTCATGAGATTATAACAAACAGATATATACAAATCCTAA TGGAAATGATACTTCCGTCAGCTCTCGGTATAACTATCTATAATCCTTCCCACTTACTCTATTTAGTTTACTTCTTAGGG ATAATTACATTTTCTATTATTTCTATCATTATTAAGGGTAATAGCGCAGCAGGGATTGGTTATTTTATGCTTATATCTAC TGTATTTTTCGGAATATACGGCTATCTATTACTAATGTATATGCTAGTTCCCACTATTGGTTATGTTCTCATGTGTTATA ACGAGATGAGAGAAGAAAATATTATTAAATATTTATCACAAAAATTGAAGATAAAAAATCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTACATCAGCAGCAATTCCATCAACCACAGTAGATGTGACTGTGGCTGGTGCAGTTATAGCTATTTTAGCTCTAGTAATA CTCTATGTGGTGTATAGAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATTAAACTCTTTTTTAATTTAATATCTTTAGTCCAACGGCAAAAAGTTATATGAGATACTGCATATTTTTATTGTGA TAAAAAATGATAAAAATAAG
Product: cytochrome b558/566 subunit B
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 314; Mature: 314
Protein sequence:
>314_residues MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFFISLILVSLLLSNKVKALLPL SIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATVKSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDF LIFSAITFLVYTVFWRKIISKRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREENIIKYLSQKLKIKNQ
Sequences:
>Translated_314_residues MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFFISLILVSLLLSNKVKALLPL SIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATVKSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDF LIFSAITFLVYTVFWRKIISKRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREENIIKYLSQKLKIKNQ >Mature_314_residues MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFFISLILVSLLLSNKVKALLPL SIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATVKSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDF LIFSAITFLVYTVFWRKIISKRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREENIIKYLSQKLKIKNQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR017573 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 35854; Mature: 35854
Theoretical pI: Translated: 9.37; Mature: 9.37
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 4.1 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 4.1 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLILVSLLLSNKVKALLPLSIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATV HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDFLIFSAITFLVYTVFWRKIIS HCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCEEEECHHHHHHHHHHHH IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREEN HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIKYLSQKLKIKNQ HHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MRISSFLEKDIKYFFIILGISAFLQFMFSEAFVFPSALPIHIPAEMILLRIGAVSFYIFF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH ISLILVSLLLSNKVKALLPLSIVLIISPILAYLNVSYTYYYGIEIFIIIVAIMALIEATV HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSDVKVVLLIPSGILVGLGLIASFFITFYHTTLYISYLDFLIFSAITFLVYTVFWRKIIS HCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRSVIAYIVGLISMYPFVMFAHEIITNRYIQILMEMILPSALGITIYNPSHLLYLVYFLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCEEEECHHHHHHHHHHHH IITFSIISIIIKGNSAAGIGYFMLISTVFFGIYGYLLLMYMLVPTIGYVLMCYNEMREEN HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIKYLSQKLKIKNQ HHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 7.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11427726 [H]