Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15921961

Identifier: 15921961

GI number: 15921961

Start: 1652957

End: 1655629

Strand: Reverse

Name: 15921961

Synonym: ST1658

Alternate gene names: NA

Gene position: 1655629-1652957 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15921964

Following gene: 15921956

Centisome position: 61.44

GC content: 30.19

Gene sequence:

>2673_bases
GTGAAAATGTTATTCTCGTATTATAGCTTTTTAAATCTTGTTTTTTATTCTTATACAATGAAATCCTATTTACTTATTCC
TCTTTTCCTAGTCCTTCTCTCAATCATCCCTTCATCTATGTTTATTATTCATACAGTCTCACAAGAATCAAGTGTTACTG
CAGTACAACCATTAGGTATAACTACAGGTGGTAATTACTTATATGTTACTACGCTTAATGGTATCGTTACCTTAACTCCT
AATTTATCAGTAGAGGATTTTATACCGCTTTATGGTTCTACAATACCTTTAATAGTAAATAACACTTTGTATGCGACTAA
CTATTTTAATAATATATTAAGTATAATTAAAGATAATGAAATTGTTGGAAATATTTCTTTAGGAGGAAACTTTAAACTCA
TAGGTAAAGCTCCTTCATTACCAAGAATGTTTTATGGATATGGTATGGCTTTCGATCCTCAAAAAAATATACTTTACGTT
GCAGATAGTAACTTAGATTATGTAGTTGCTATTAACATTACTAATGATAATAAGACTTTCATTTACGGTTTAGAAGAGCC
AACAGATATCATTTATTACAACGGGCTAACTTATGTATTATGTTATTATAGTGATCATATTGTAGTCCTAGATGGAACTC
AAGAAATAGAGACTATAAATGTAGCTTTACCCCCCTCGATGGGAATTATAGTAAACAATCTAATGTATATATCATCCTTT
GATTATAGTTACGTTATAGTATTAAACTTAACAAGTGGTAAACAAACTCTTATCCCTACTGGTAACAATCCCTATTTCTT
TGCTTATGATCCAAATAATGGAAATGTGTATTTAACTGAATTTGGTGCAGGGAAAATTGCTGTTATCCACGATACCAGAG
TTGTAGGAAATTACTCTATAGGTTCTCAACCAGCCGATATTATATACTTTAATGGTCTTTTATACGTGGTTCTATATGGA
AATAACGAGATAGTAGCACTAAATCCTAATAATATGAGTGTAGTCTATTCCATTACTTTAACAGCTACTTATACTGATGC
GATTGCTTATGGCTCATCAGTTTACGTTACAGAATATTATAATAATAGAATAGTTCAAATAAATTCTTCTGGGGAATTTG
AGATAAATCTAGATTCAAATCCTTATAGTATAACTGAAGGTAACGGAATCATTTATGTTACTTGCCCTAATTCGAATAGA
GTAATCGAATTATCGCCAACATTAAAAATACTAGGCTACATAAAAATCGACGATCCTACGTGGATAATTTACTATAATGG
ATATTTATATGTCACAAGTTACAATAAGAACCTTCTATATGTCATACCCCCTTACGGGGGGAATATTACTATTAGTACTG
GTAAAGGACCAAATTATATAACCGTCTATAATGGAGAAATAATAGTTACTGATCAATTATCTAACCAGCTTACAATTTAC
CAAAATGGCATAACAAAAAATATAAACTTGAGTTTTCGCCCTCTGAGTGTTATAGGTTATGACGACTACATTTACGTAAT
AGGGAACGATAGAATAGCTATATATAATGATAACTTCACGCTGTTAAACGTTATTTATTTTACACCCGTTAGCTTACCTA
TTCCAATTCTACCATTTGAAGAAGCATTAGTCTATAACAACTCAGTTGTTATCGCTTATGGAAATAATTTAGGAATATTT
AAAGGAGTGAACGAGATATCCTCTTATCACTTTAATACTACGATTATGAGCGTAACAACGCTTAATGGAAATATTTATGT
ATTTTCACCAGAATCAGAAGTAGTTATATTACAAAAACCTCCCGTATATTCACTAGTAATTCATGAGGAAGGCTTACCTA
AAGGGACTGAATGGGGGATCGAAATAAATGGAAGTGTGATTAAAACCATTAGCTCGACATTAATATTAAACTTAACTGAG
GGAGTTTACAATTTAACAATTCTAATACCGAAATATTACTATTCTAATATTACATACGAAATTGTAAACTTAACATCAAA
TCTTACAATTTCTGTTCACTTTTCAGCAATATTATTCAAAGTCTTATTTGAAGAAAAAGGTTTACCTAATGGAAGTCAAT
GGGGAGTAATAATAAACGGAACTAAAATATTATCATCCAATATTTCAATAGTCTTAACTTTACCAGAAGGTATTTATAAC
GTGAGTATTATTAGTCCAGTCTTCTATAAAACTAATCAGAGCGTTATGATTATTAATATATCGGGTAATCAAACCTTTAA
ACTACTATTTACACCAATTCTTTTCAACGTGATATTTAATGGGTCTGGATTACGTAATGGCATGGAATGGGAGGTAATAA
TAAACGGATCTACTTATTCGACGAATTCCTCCACACTAATTATTAAACTACCACATGGAATATATTCATATACCGTTATA
GCCCCTAAAGGATATAATTCCTCAATTGTTAGAGGAGAATTTACTTTAAGTAATAACTTAACAATTACTATATCATTTCA
AAAAATTGTTATAAACACTTCAACTAGTACAACAACTAAAGCAACAACTACAAAAACAACAGCAGTAACTACTTCATCCT
CTTTTACCTTTGTTCATTCAAATAATTCTACTAATGTTAAAGTGTATATTGGAGTCTTATTAATCATTATAATTGGGGTT
ATCCTTTCGGTATTTATAATGAGAAAACGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTCTCACCCATTGAGTTGTTTTCTTAATTATCATTATTTCAAAATATTATAAATTTCTCGAGAATGGAAGAGGAAAGAA
GTTTTTACTTTGCATATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAGTTTCGTATTTTATTTTTATTACCTGATCTGGGTAATATATATTATAGGTTCTTAAAGTAAGGTAAAGTTTATACTC
TTTTCCTTTTAATAACCCTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 890; Mature: 890

Protein sequence:

>890_residues
MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGITTGGNYLYVTTLNGIVTLTP
NLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNEIVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYV
ADSNLDYVVAINITNDNKTFIYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF
DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSIGSQPADIIYFNGLLYVVLYG
NNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYYNNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNR
VIELSPTLKILGYIKIDDPTWIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY
QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFEEALVYNNSVVIAYGNNLGIF
KGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKPPVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTE
GVYNLTILIPKYYYSNITYEIVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN
VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYSTNSSTLIIKLPHGIYSYTVI
APKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTKATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGV
ILSVFIMRKR

Sequences:

>Translated_890_residues
MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGITTGGNYLYVTTLNGIVTLTP
NLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNEIVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYV
ADSNLDYVVAINITNDNKTFIYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF
DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSIGSQPADIIYFNGLLYVVLYG
NNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYYNNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNR
VIELSPTLKILGYIKIDDPTWIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY
QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFEEALVYNNSVVIAYGNNLGIF
KGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKPPVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTE
GVYNLTILIPKYYYSNITYEIVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN
VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYSTNSSTLIIKLPHGIYSYTVI
APKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTKATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGV
ILSVFIMRKR
>Mature_890_residues
MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGITTGGNYLYVTTLNGIVTLTP
NLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNEIVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYV
ADSNLDYVVAINITNDNKTFIYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF
DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSIGSQPADIIYFNGLLYVVLYG
NNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYYNNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNR
VIELSPTLKILGYIKIDDPTWIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY
QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFEEALVYNNSVVIAYGNNLGIF
KGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKPPVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTE
GVYNLTILIPKYYYSNITYEIVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN
VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYSTNSSTLIIKLPHGIYSYTVI
APKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTKATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGV
ILSVFIMRKR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98874; Mature: 98874

Theoretical pI: Translated: 5.00; Mature: 5.00

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEEE
TTGGNYLYVTTLNGIVTLTPNLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNE
EECCCEEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEEEHHHHHHHHHHCCCE
IVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYVADSNLDYVVAINITNDNKTF
EEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEHHCCCEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEE
IYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF
EEECCCCCEEEEECCEEEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEC
DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSI
CCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCC
GSQPADIIYFNGLLYVVLYGNNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYY
CCCCCEEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEHHHHCCCEEEEEEEC
NNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNRVIELSPTLKILGYIKIDDPT
CCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCE
WIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY
EEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCEEEEE
QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFE
ECCCEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCEEECCCC
EALVYNNSVVIAYGNNLGIFKGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKP
HHEEECCEEEEEECCCEEEECCCHHHHCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEECC
PVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTEGVYNLTILIPKYYYSNITYE
CEEEEEEECCCCCCCCEECEEECCCEEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEHHHCCEEEE
IVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN
EEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCEEEECCCEEEEECCCCCEE
VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYS
EEEECEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEEHEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCEEC
TNSSTLIIKLPHGIYSYTVIAPKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTK
CCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEE
ATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGVILSVFIMRKR
EEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC
>Mature Secondary Structure
MKMLFSYYSFLNLVFYSYTMKSYLLIPLFLVLLSIIPSSMFIIHTVSQESSVTAVQPLGI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEEE
TTGGNYLYVTTLNGIVTLTPNLSVEDFIPLYGSTIPLIVNNTLYATNYFNNILSIIKDNE
EECCCEEEEEEECCEEEECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEECEEEEEHHHHHHHHHHCCCE
IVGNISLGGNFKLIGKAPSLPRMFYGYGMAFDPQKNILYVADSNLDYVVAINITNDNKTF
EEEEEEECCCEEEEECCCCCCEEHHCCCEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEE
IYGLEEPTDIIYYNGLTYVLCYYSDHIVVLDGTQEIETINVALPPSMGIIVNNLMYISSF
EEECCCCCEEEEECCEEEEEEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEEEC
DYSYVIVLNLTSGKQTLIPTGNNPYFFAYDPNNGNVYLTEFGAGKIAVIHDTRVVGNYSI
CCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCC
GSQPADIIYFNGLLYVVLYGNNEIVALNPNNMSVVYSITLTATYTDAIAYGSSVYVTEYY
CCCCCEEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEEEEEHHHHCCCEEEEEEEC
NNRIVQINSSGEFEINLDSNPYSITEGNGIIYVTCPNSNRVIELSPTLKILGYIKIDDPT
CCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEECCCEEEEEEEEECCCE
WIIYYNGYLYVTSYNKNLLYVIPPYGGNITISTGKGPNYITVYNGEIIVTDQLSNQLTIY
EEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCEEEEEECCCCEEEEE
QNGITKNINLSFRPLSVIGYDDYIYVIGNDRIAIYNDNFTLLNVIYFTPVSLPIPILPFE
ECCCEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCEEECCCC
EALVYNNSVVIAYGNNLGIFKGVNEISSYHFNTTIMSVTTLNGNIYVFSPESEVVILQKP
HHEEECCEEEEEECCCEEEECCCHHHHCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEECC
PVYSLVIHEEGLPKGTEWGIEINGSVIKTISSTLILNLTEGVYNLTILIPKYYYSNITYE
CEEEEEEECCCCCCCCEECEEECCCEEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEHHHCCEEEE
IVNLTSNLTISVHFSAILFKVLFEEKGLPNGSQWGVIINGTKILSSNISIVLTLPEGIYN
EEEECCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCEEEECCCEEEEECCCCCEE
VSIISPVFYKTNQSVMIINISGNQTFKLLFTPILFNVIFNGSGLRNGMEWEVIINGSTYS
EEEECEEEEECCCEEEEEEECCCCEEEEEEHEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCEEC
TNSSTLIIKLPHGIYSYTVIAPKGYNSSIVRGEFTLSNNLTITISFQKIVINTSTSTTTK
CCCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEE
ATTTKTTAVTTSSSFTFVHSNNSTNVKVYIGVLLIIIIGVILSVFIMRKR
EEEEEEEEEEECCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA