Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

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The map label for this gene is 15921279

Identifier: 15921279

GI number: 15921279

Start: 1016972

End: 1018600

Strand: Direct

Name: 15921279

Synonym: ST1032

Alternate gene names: NA

Gene position: 1016972-1018600 (Clockwise)

Preceding gene: 15921277

Following gene: 15921288

Centisome position: 37.74

GC content: 34.07

Gene sequence:

>1629_bases
GTGAAAAATCAATTTATATTTATAAGAGATTTAAACCTCTATTTACCTATGGCCGTAGATAAAAAAAGTGATAAAAAAGA
AGTAAAAAGTTTACTTTTTGCAAGAGAATCCTCTGGTTTAGTAAGAGAAATAAATTGGTTAACGGCTATGTTTATCAGTA
TGGGTTTTATAGCTTTTTATGTCTTACCAATATCTTATTTAACTGGTCTTTCTGTATCTCCTAATGGTTTAATAGTTTTA
GGGGCATTATTGAGCTGGATCGTATTACTACCACATTCTTATCTATGGACTAAAATTTCTGAAAAATATCAAAGATCTGC
AGCTGACTATGTTTTCGCCAGTAGAGTTTTACCACCAGCCATAGGTGTAGGTGTAGGTTTAGTGTTTGGAATATCTCAAA
TGATTTTTGATGCCGCTATAGTTTATGATGATGTTGGTCAGTTGCAAACTGGATTTTCTGCACTGGCAGTTAATTTTGGT
AATCCTTACGCATCTATTGCTTCTACTTTATCTAATCCTTATGTAATATTACTAGTTGGTGCGTTAACATTTAGCACTGT
AATTGCTATAAACATATTCTTACCTAAATATACGAATCATATAATGGGAGGGGTTACTATAATTGCACTGATAACTTTTG
TTTTAGCTGGAGCTTTAATGCATTTTGTAGCCCCTTCCGCAATAAATTCCGCTGGTTTTGATTACTCCTCTATAGTATCT
TCTGCATCTAAAGCTGTACCGCTATTTACAAACCCAATTCTTGCAACATTAGGTTTAATGGTATTTACGGCGTCTTTCTT
GCCATTTGTAAATGGTGCGACTTCTGTAGCAGGTGAGGTAAGGGGAGGTAGTAGATCCTTTAAGATAGGAGTTTTTGGAG
CTTTAGTAGTATCCGGTCTGTTAATAACTTACTTTATTGCTTCCTCTGTTAGCTCTTTACAACCAGCGTTCTTTATAGGT
GCTGGAGTGTTATCCTCTACATCTTCTTCTTACTCAGCATTATTAAATCCGATATTTGATACGGTTGTAGCATTTAAGAG
TTTACCATTAGATCTATTTCTAGTAATAGGTTCTTACTTCTGGTACTTAGCAATAATGTTCGCTGTAGCATTATTTGTTT
CAAGGTATTTTATGGCTATAGCGTTTGATAAAGCAATGCCAACTATAGTTTCTTATGTTAGCGAAAGATTTCACTCTCCA
GTTGTTGCTCATCTAATTGATGAGGTAATAACTATAGGTAGTTTAGTAGCAATAACTGTAACACCATTAAGTGCGGTATT
CTTCTACGGTATGGATACAGCTGATGCTATGGCATTACTTTTCGGATTTATTATAGTGATTATTGCTTCTATAGTAGCTA
ATATAAGAGGTAATGGGATGGAGTTAGGGAATAGAGGGCTAATGCTAGTAATATCTGTAATAGATCTTGTTGTCATGAGT
TTATATGGTTATATTTGGTTCGGAAATTCTACTGTGTATTTAGGAATAGTTATGAATCCAGAAACCTGGACGATAATAGC
TTCTCCATTCATTGCTGGTATTGTAATTTATTACGTTATGAGATGGTATAGATTAAGGAAAGAAGGTATTGATATAAAGT
ACACTTTCACTGAAATACCACCAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAGTTGAAAGTAAACATTTACGTAAAAAGCAGTCTAAAGATTTAAGATAAAAATGAAAAATGTTTAAAAATTGGTT
TTTATAAATTAAAACTTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGAAAGAAAAATTTTTTCCTTTTTAAACTAACTTTACATAATCTCAGTGGGACTACTATTTTTTCTTTCTCCTTTTAC
TGATGGTGCTTCAACTGTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 542; Mature: 542

Protein sequence:

>542_residues
MKNQFIFIRDLNLYLPMAVDKKSDKKEVKSLLFARESSGLVREINWLTAMFISMGFIAFYVLPISYLTGLSVSPNGLIVL
GALLSWIVLLPHSYLWTKISEKYQRSAADYVFASRVLPPAIGVGVGLVFGISQMIFDAAIVYDDVGQLQTGFSALAVNFG
NPYASIASTLSNPYVILLVGALTFSTVIAINIFLPKYTNHIMGGVTIIALITFVLAGALMHFVAPSAINSAGFDYSSIVS
SASKAVPLFTNPILATLGLMVFTASFLPFVNGATSVAGEVRGGSRSFKIGVFGALVVSGLLITYFIASSVSSLQPAFFIG
AGVLSSTSSSYSALLNPIFDTVVAFKSLPLDLFLVIGSYFWYLAIMFAVALFVSRYFMAIAFDKAMPTIVSYVSERFHSP
VVAHLIDEVITIGSLVAITVTPLSAVFFYGMDTADAMALLFGFIIVIIASIVANIRGNGMELGNRGLMLVISVIDLVVMS
LYGYIWFGNSTVYLGIVMNPETWTIIASPFIAGIVIYYVMRWYRLRKEGIDIKYTFTEIPPE

Sequences:

>Translated_542_residues
MKNQFIFIRDLNLYLPMAVDKKSDKKEVKSLLFARESSGLVREINWLTAMFISMGFIAFYVLPISYLTGLSVSPNGLIVL
GALLSWIVLLPHSYLWTKISEKYQRSAADYVFASRVLPPAIGVGVGLVFGISQMIFDAAIVYDDVGQLQTGFSALAVNFG
NPYASIASTLSNPYVILLVGALTFSTVIAINIFLPKYTNHIMGGVTIIALITFVLAGALMHFVAPSAINSAGFDYSSIVS
SASKAVPLFTNPILATLGLMVFTASFLPFVNGATSVAGEVRGGSRSFKIGVFGALVVSGLLITYFIASSVSSLQPAFFIG
AGVLSSTSSSYSALLNPIFDTVVAFKSLPLDLFLVIGSYFWYLAIMFAVALFVSRYFMAIAFDKAMPTIVSYVSERFHSP
VVAHLIDEVITIGSLVAITVTPLSAVFFYGMDTADAMALLFGFIIVIIASIVANIRGNGMELGNRGLMLVISVIDLVVMS
LYGYIWFGNSTVYLGIVMNPETWTIIASPFIAGIVIYYVMRWYRLRKEGIDIKYTFTEIPPE
>Mature_542_residues
MKNQFIFIRDLNLYLPMAVDKKSDKKEVKSLLFARESSGLVREINWLTAMFISMGFIAFYVLPISYLTGLSVSPNGLIVL
GALLSWIVLLPHSYLWTKISEKYQRSAADYVFASRVLPPAIGVGVGLVFGISQMIFDAAIVYDDVGQLQTGFSALAVNFG
NPYASIASTLSNPYVILLVGALTFSTVIAINIFLPKYTNHIMGGVTIIALITFVLAGALMHFVAPSAINSAGFDYSSIVS
SASKAVPLFTNPILATLGLMVFTASFLPFVNGATSVAGEVRGGSRSFKIGVFGALVVSGLLITYFIASSVSSLQPAFFIG
AGVLSSTSSSYSALLNPIFDTVVAFKSLPLDLFLVIGSYFWYLAIMFAVALFVSRYFMAIAFDKAMPTIVSYVSERFHSP
VVAHLIDEVITIGSLVAITVTPLSAVFFYGMDTADAMALLFGFIIVIIASIVANIRGNGMELGNRGLMLVISVIDLVVMS
LYGYIWFGNSTVYLGIVMNPETWTIIASPFIAGIVIYYVMRWYRLRKEGIDIKYTFTEIPPE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58844; Mature: 58844

Theoretical pI: Translated: 8.46; Mature: 8.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNQFIFIRDLNLYLPMAVDKKSDKKEVKSLLFARESSGLVREINWLTAMFISMGFIAFY
CCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLPISYLTGLSVSPNGLIVLGALLSWIVLLPHSYLWTKISEKYQRSAADYVFASRVLPPA
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
IGVGVGLVFGISQMIFDAAIVYDDVGQLQTGFSALAVNFGNPYASIASTLSNPYVILLVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEEHH
ALTFSTVIAINIFLPKYTNHIMGGVTIIALITFVLAGALMHFVAPSAINSAGFDYSSIVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHH
SASKAVPLFTNPILATLGLMVFTASFLPFVNGATSVAGEVRGGSRSFKIGVFGALVVSGL
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHH
LITYFIASSVSSLQPAFFIGAGVLSSTSSSYSALLNPIFDTVVAFKSLPLDLFLVIGSYF
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
WYLAIMFAVALFVSRYFMAIAFDKAMPTIVSYVSERFHSPVVAHLIDEVITIGSLVAITV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TPLSAVFFYGMDTADAMALLFGFIIVIIASIVANIRGNGMELGNRGLMLVISVIDLVVMS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
LYGYIWFGNSTVYLGIVMNPETWTIIASPFIAGIVIYYVMRWYRLRKEGIDIKYTFTEIP
HHHEEEECCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC
PE
CC
>Mature Secondary Structure
MKNQFIFIRDLNLYLPMAVDKKSDKKEVKSLLFARESSGLVREINWLTAMFISMGFIAFY
CCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLPISYLTGLSVSPNGLIVLGALLSWIVLLPHSYLWTKISEKYQRSAADYVFASRVLPPA
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
IGVGVGLVFGISQMIFDAAIVYDDVGQLQTGFSALAVNFGNPYASIASTLSNPYVILLVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEEECCCHHHHHHHHHCCCEEEEEHH
ALTFSTVIAINIFLPKYTNHIMGGVTIIALITFVLAGALMHFVAPSAINSAGFDYSSIVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCHHHHHH
SASKAVPLFTNPILATLGLMVFTASFLPFVNGATSVAGEVRGGSRSFKIGVFGALVVSGL
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHH
LITYFIASSVSSLQPAFFIGAGVLSSTSSSYSALLNPIFDTVVAFKSLPLDLFLVIGSYF
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
WYLAIMFAVALFVSRYFMAIAFDKAMPTIVSYVSERFHSPVVAHLIDEVITIGSLVAITV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TPLSAVFFYGMDTADAMALLFGFIIVIIASIVANIRGNGMELGNRGLMLVISVIDLVVMS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
LYGYIWFGNSTVYLGIVMNPETWTIIASPFIAGIVIYYVMRWYRLRKEGIDIKYTFTEIP
HHHEEEECCCEEEEEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCC
PE
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA