| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
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The map label for this gene is 15921014
Identifier: 15921014
GI number: 15921014
Start: 759674
End: 760789
Strand: Direct
Name: 15921014
Synonym: ST0780
Alternate gene names: NA
Gene position: 759674-760789 (Clockwise)
Preceding gene: 15921006
Following gene: 15921016
Centisome position: 28.19
GC content: 35.3
Gene sequence:
>1116_bases ATGACTATTAAAAGGAGAAGTGAAGTATTAAAAATTTCATTTTCAGCTTTCTTTGCAGATTTAGGATATCAAGCCGCTGT AGCATCTTTTCCTATAATTTTCGTCTTCTACTTTCACGCCCCAATTTTCCTATACGGTATTGCTGAAGCCTTGAATTATG GTGGTGGAAGTCTAATGTCGATTCTTGGAGGTTATTTGGCTGATAAATACGGAAGGAAAATGATAGCAGTAATTGGAAAC GCGCTAATTGTCATTCTCTCTTTTACGGGTCTAGCAGTGAATTACATAGAAGCTTTATTTTTATTTATGTTTGGTTGGTG GTTTAGGAATTTTAGAACTCCAGCTAGAAGGGCTATGCTTTCTGAAGTTACAGAAGAGAGTGAAAGAAAGGAGGCTTATG GTATTCTACATGCTTTAGATATTGCTGGAGCTACATTGGCTGTTGCTTACTTAACTATTGCATTATATTTCGGAGTTAAA GCTACAGAGATTCTGATTTTTACCTCAATTCCCCTAATAATTTCTACGTTATTTTTAGTGTTTGTTAAAGCTGGCGGAAA AGGTATTCCGAAAAAGCCTGGTAAAGTTGCTTTAACTATTGTAATTTCTACAATGTTCTTTGCTTTTACTCAGTATAGTT TTGGATTTCCGATAATCACAACAGAAGAATTTACAAGAAGGTTTTACCTCGCGACACTAACGTATGGAGTATTCCTTGCA TCATCTTCGATATTCGGATACGTATTTGGAAAAATAAAGCTTGAAGAAGTTAAAGGATTAGCATTCTTAGGATATTTATT AGCTGGGCTTACCTCATTTGGATTTGCTTTTCTCTCTCCTTTAGGAGTTATATCAATATATCCATTATCTGTAATTATGG GAATTGCAGTAGCATCCACAGAAACCTTTGAACCAACAATAATATCTAAGCTGTCTAGAGGCGAAACTGGTACAGCAATG GGCGCCTTATCCTTTGGAAGAAGTATTGGAGTCTTGATAGGGAATACTATAATGGGATTCCTTTATCAGTACAGTTACTC ATATTCTTATATTTTTGCTGGAATAATGGGTATTATAGCATTCCTAATAGTTTTTACAGTCCTACTTAGAGGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAATAAACCAATCTCGTTCAATTTAACATCTGATATTAACCTTATCGAATATGCCTCTTCCGGCGTCATGCTTTTATAT AGTTTTTCGTTTTTTTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAATAGATGATCATTGCTTCTTGGGAAGAATTAACGCATCGGTAAATCATACTTTCTGACCTCTTCCCCGCCCTAAAGGG CGAGGGTTCCCTTAGGGCGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Multidrug Resistance Protein; Facilitator Superfamily Permease
Number of amino acids: Translated: 371; Mature: 370
Protein sequence:
>371_residues MTIKRRSEVLKISFSAFFADLGYQAAVASFPIIFVFYFHAPIFLYGIAEALNYGGGSLMSILGGYLADKYGRKMIAVIGN ALIVILSFTGLAVNYIEALFLFMFGWWFRNFRTPARRAMLSEVTEESERKEAYGILHALDIAGATLAVAYLTIALYFGVK ATEILIFTSIPLIISTLFLVFVKAGGKGIPKKPGKVALTIVISTMFFAFTQYSFGFPIITTEEFTRRFYLATLTYGVFLA SSSIFGYVFGKIKLEEVKGLAFLGYLLAGLTSFGFAFLSPLGVISIYPLSVIMGIAVASTETFEPTIISKLSRGETGTAM GALSFGRSIGVLIGNTIMGFLYQYSYSYSYIFAGIMGIIAFLIVFTVLLRG
Sequences:
>Translated_371_residues MTIKRRSEVLKISFSAFFADLGYQAAVASFPIIFVFYFHAPIFLYGIAEALNYGGGSLMSILGGYLADKYGRKMIAVIGN ALIVILSFTGLAVNYIEALFLFMFGWWFRNFRTPARRAMLSEVTEESERKEAYGILHALDIAGATLAVAYLTIALYFGVK ATEILIFTSIPLIISTLFLVFVKAGGKGIPKKPGKVALTIVISTMFFAFTQYSFGFPIITTEEFTRRFYLATLTYGVFLA SSSIFGYVFGKIKLEEVKGLAFLGYLLAGLTSFGFAFLSPLGVISIYPLSVIMGIAVASTETFEPTIISKLSRGETGTAM GALSFGRSIGVLIGNTIMGFLYQYSYSYSYIFAGIMGIIAFLIVFTVLLRG >Mature_370_residues TIKRRSEVLKISFSAFFADLGYQAAVASFPIIFVFYFHAPIFLYGIAEALNYGGGSLMSILGGYLADKYGRKMIAVIGNA LIVILSFTGLAVNYIEALFLFMFGWWFRNFRTPARRAMLSEVTEESERKEAYGILHALDIAGATLAVAYLTIALYFGVKA TEILIFTSIPLIISTLFLVFVKAGGKGIPKKPGKVALTIVISTMFFAFTQYSFGFPIITTEEFTRRFYLATLTYGVFLAS SSIFGYVFGKIKLEEVKGLAFLGYLLAGLTSFGFAFLSPLGVISIYPLSVIMGIAVASTETFEPTIISKLSRGETGTAMG ALSFGRSIGVLIGNTIMGFLYQYSYSYSYIFAGIMGIIAFLIVFTVLLRG
Specific function: Unknown
COG id: COG0477
COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 40624; Mature: 40492
Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78
Prosite motif: PS50850 MFS ; PS00216 SUGAR_TRANSPORT_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTIKRRSEVLKISFSAFFADLGYQAAVASFPIIFVFYFHAPIFLYGIAEALNYGGGSLMS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH ILGGYLADKYGRKMIAVIGNALIVILSFTGLAVNYIEALFLFMFGWWFRNFRTPARRAML HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SEVTEESERKEAYGILHALDIAGATLAVAYLTIALYFGVKATEILIFTSIPLIISTLFLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHH FVKAGGKGIPKKPGKVALTIVISTMFFAFTQYSFGFPIITTEEFTRRFYLATLTYGVFLA HHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSSIFGYVFGKIKLEEVKGLAFLGYLLAGLTSFGFAFLSPLGVISIYPLSVIMGIAVAST CCHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC ETFEPTIISKLSRGETGTAMGALSFGRSIGVLIGNTIMGFLYQYSYSYSYIFAGIMGIIA CCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH FLIVFTVLLRG HHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TIKRRSEVLKISFSAFFADLGYQAAVASFPIIFVFYFHAPIFLYGIAEALNYGGGSLMS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH ILGGYLADKYGRKMIAVIGNALIVILSFTGLAVNYIEALFLFMFGWWFRNFRTPARRAML HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SEVTEESERKEAYGILHALDIAGATLAVAYLTIALYFGVKATEILIFTSIPLIISTLFLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHH FVKAGGKGIPKKPGKVALTIVISTMFFAFTQYSFGFPIITTEEFTRRFYLATLTYGVFLA HHHCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SSSIFGYVFGKIKLEEVKGLAFLGYLLAGLTSFGFAFLSPLGVISIYPLSVIMGIAVAST CCHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC ETFEPTIISKLSRGETGTAMGALSFGRSIGVLIGNTIMGFLYQYSYSYSYIFAGIMGIIA CCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH FLIVFTVLLRG HHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA