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The map label for this gene is cbaA [H]

Identifier: 15920898

GI number: 15920898

Start: 657984

End: 659552

Strand: Direct

Name: cbaA [H]

Synonym: ST0676

Alternate gene names: 15920898

Gene position: 657984-659552 (Clockwise)

Preceding gene: 15920897

Following gene: 15920899

Centisome position: 24.42

GC content: 34.42

Gene sequence:

>1569_bases
ATGAACGGTTTAATAAAATTCATCGTGAACCTGTTCCAGTTAGATAAAGACTGGATCACAAAAATAACAATGGCTATGAT
TGTGCTAAGTATCATATGGGGATTACTAGGAATTATTGACGCTTTAATGGTTAGAATACAGGAGGCATCTTGGGGTTTGA
TGCAATTATTACCCCTAACGCCACAAGAGTATTATGCCTCTATAACACTTCATGGTATGAGAGATTTATTTGGTTTTGCA
CAGCAACTAGAGTTTGCAATTTTTACTTATTTCACGTTTAAAATGTTAAATATACAGCCAAGGGCAAAGTGGATATACAA
CCTTGCATTTATACTTTTCAACATTGCATTTATGTTACTTGAAGGACCTATTCTAATAACAGCAGCTCAAGGATTTGATA
ACTATTTTTCTGCAGAAGGCTGGTATTATTTATCGCCCCTTGGAATCCCTAATTACTCACTTTATGTAGTTTCACCATTA
TGGTATTATGGTTGGATGTTAATTGATATAGCGACATATATGCAGACTATTTGGCTGAGCTATCATTATTACGTTGCAAG
TAAAACTACTAAGGAAAAGTTACCGATCTTTTTAGTATTTGTGTTAATGGATATATTACTCTATGCTATAGGTTACTCTG
GTGAAACTGTAGCTAATGTTTGGGATATATTAGCTTTTGCCGGTATTGTTGGATTAAATGTAATTGCTAACCAAATTGCA
TTTGGAATTCTATGGCATGCGGTAGTTTATATGGCTTGGCTGCCAGCCGTTGCTGCAATGTATTTATTAATTCCAACTTT
AGCTAATAAACCTCTCTACAGTGACAGAATGGGTAGAGTTGCAGCAGTACTTTACTTAATTTTCTCTAACAACGTGCCCA
TTCACCATTTATATATGGTCGATTTGCCAATAGCAATAAAGGTCCTTACTGAGATACTTACTTATGGGGTAGTTTTACCT
TCATTAATGACATTCCTTAACTTATGGGCTACAGCTAAAGGTGCACAAGTTTCATGGAATATTCTTACAGCATTTACTGT
TATGTCATTTACTGGTTCAATTTTCTCTGGTGTAACTGGAATCTCTAATGCAACAATAACTTTTGATGCTGTAATCCATG
AAACTATGTGGGTTGTCGGTCATTTTCATGGTTTTATATTACTCTCTATAGTCCCAGCTGGTTTTGCAATACTATATTTA
ATGATACCAATGATGACTGGAAGGCAATGGTATTCCGCAAAGTTAATGTGGATTCACTTCTGGGGCTATTTGTTTGGGGC
ATCAATGGTAGTTATAGGGTTTGATGAACTAGGACTAACTGGTTTATTAAGAAGAGATGAGACTTATCCTTTAACCTCTA
CGTTTATTTCTGGTGAAGTTTTATCAACTGTAGGTGCAATAATAGCTGATTTAGCTACAGTTGCATGGTTATTTAATGTT
ATTTTAACTTTAATAAGAGGAAGGACTACTGTGGTTTCAAGTTTACAAGATTCAATTAATATCGTTATGGCTCAATCTAC
CATATCTAGAATAGAAATTGAAAAAATAGCAAGGAAATTAAAGATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTCATAAATTTCATAAATTTTTGATATACTATAAATGTAAAATTTCGCCAAAAATTTTATAATACAAATTTTTAATAT
CGCAATTCAACTCTGTTCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATTAGTTTTTTATTTTTTAACTCTCAATTTCTTTAGTGCTGAGGTGCCGCGGAACTGATTAATGATGATGTTTGACTGT
CTGAGTATAGTCTCGAGTGT

Product: cytochrome c oxidase polypeptide I

Products: NA

Alternate protein names: Cytochrome c ba(3) subunit I; Cytochrome c oxidase polypeptide I; Cytochrome cba3 subunit 1 [H]

Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 522

Protein sequence:

>522_residues
MNGLIKFIVNLFQLDKDWITKITMAMIVLSIIWGLLGIIDALMVRIQEASWGLMQLLPLTPQEYYASITLHGMRDLFGFA
QQLEFAIFTYFTFKMLNIQPRAKWIYNLAFILFNIAFMLLEGPILITAAQGFDNYFSAEGWYYLSPLGIPNYSLYVVSPL
WYYGWMLIDIATYMQTIWLSYHYYVASKTTKEKLPIFLVFVLMDILLYAIGYSGETVANVWDILAFAGIVGLNVIANQIA
FGILWHAVVYMAWLPAVAAMYLLIPTLANKPLYSDRMGRVAAVLYLIFSNNVPIHHLYMVDLPIAIKVLTEILTYGVVLP
SLMTFLNLWATAKGAQVSWNILTAFTVMSFTGSIFSGVTGISNATITFDAVIHETMWVVGHFHGFILLSIVPAGFAILYL
MIPMMTGRQWYSAKLMWIHFWGYLFGASMVVIGFDELGLTGLLRRDETYPLTSTFISGEVLSTVGAIIADLATVAWLFNV
ILTLIRGRTTVVSSLQDSINIVMAQSTISRIEIEKIARKLKI

Sequences:

>Translated_522_residues
MNGLIKFIVNLFQLDKDWITKITMAMIVLSIIWGLLGIIDALMVRIQEASWGLMQLLPLTPQEYYASITLHGMRDLFGFA
QQLEFAIFTYFTFKMLNIQPRAKWIYNLAFILFNIAFMLLEGPILITAAQGFDNYFSAEGWYYLSPLGIPNYSLYVVSPL
WYYGWMLIDIATYMQTIWLSYHYYVASKTTKEKLPIFLVFVLMDILLYAIGYSGETVANVWDILAFAGIVGLNVIANQIA
FGILWHAVVYMAWLPAVAAMYLLIPTLANKPLYSDRMGRVAAVLYLIFSNNVPIHHLYMVDLPIAIKVLTEILTYGVVLP
SLMTFLNLWATAKGAQVSWNILTAFTVMSFTGSIFSGVTGISNATITFDAVIHETMWVVGHFHGFILLSIVPAGFAILYL
MIPMMTGRQWYSAKLMWIHFWGYLFGASMVVIGFDELGLTGLLRRDETYPLTSTFISGEVLSTVGAIIADLATVAWLFNV
ILTLIRGRTTVVSSLQDSINIVMAQSTISRIEIEKIARKLKI
>Mature_522_residues
MNGLIKFIVNLFQLDKDWITKITMAMIVLSIIWGLLGIIDALMVRIQEASWGLMQLLPLTPQEYYASITLHGMRDLFGFA
QQLEFAIFTYFTFKMLNIQPRAKWIYNLAFILFNIAFMLLEGPILITAAQGFDNYFSAEGWYYLSPLGIPNYSLYVVSPL
WYYGWMLIDIATYMQTIWLSYHYYVASKTTKEKLPIFLVFVLMDILLYAIGYSGETVANVWDILAFAGIVGLNVIANQIA
FGILWHAVVYMAWLPAVAAMYLLIPTLANKPLYSDRMGRVAAVLYLIFSNNVPIHHLYMVDLPIAIKVLTEILTYGVVLP
SLMTFLNLWATAKGAQVSWNILTAFTVMSFTGSIFSGVTGISNATITFDAVIHETMWVVGHFHGFILLSIVPAGFAILYL
MIPMMTGRQWYSAKLMWIHFWGYLFGASMVVIGFDELGLTGLLRRDETYPLTSTFISGEVLSTVGAIIADLATVAWLFNV
ILTLIRGRTTVVSSLQDSINIVMAQSTISRIEIEKIARKLKI

Specific function: Cytochrome O Terminal Oxidase Complex Is The Component Of The Aerobic Respiratory Chain Of E.Coli That Predominates When Cells Are Grown At High Aeration. This Ubiquinol Oxidase Shows Proton Pump Activity Across The Membrane In Addition To The Electron T

COG id: COG0843

COG function: function code C; Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786634, Length=470, Percent_Identity=23.8297872340426, Blast_Score=62, Evalue=7e-11,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6226519, Length=254, Percent_Identity=24.0157480314961, Blast_Score=77, Evalue=7e-15,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000883 [H]

Pfam domain/function: PF00115 COX1 [H]

EC number: =1.9.3.1 [H]

Molecular weight: Translated: 58892; Mature: 58892

Theoretical pI: Translated: 7.04; Mature: 7.04

Prosite motif: PS50855 COX1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.6 %Met     (Translated Protein)
4.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.6 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNGLIKFIVNLFQLDKDWITKITMAMIVLSIIWGLLGIIDALMVRIQEASWGLMQLLPLT
CCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCC
PQEYYASITLHGMRDLFGFAQQLEFAIFTYFTFKMLNIQPRAKWIYNLAFILFNIAFMLL
CHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EGPILITAAQGFDNYFSAEGWYYLSPLGIPNYSLYVVSPLWYYGWMLIDIATYMQTIWLS
CCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YHYYVASKTTKEKLPIFLVFVLMDILLYAIGYSGETVANVWDILAFAGIVGLNVIANQIA
HHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGILWHAVVYMAWLPAVAAMYLLIPTLANKPLYSDRMGRVAAVLYLIFSNNVPIHHLYMV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEE
DLPIAIKVLTEILTYGVVLPSLMTFLNLWATAKGAQVSWNILTAFTVMSFTGSIFSGVTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ISNATITFDAVIHETMWVVGHFHGFILLSIVPAGFAILYLMIPMMTGRQWYSAKLMWIHF
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
WGYLFGASMVVIGFDELGLTGLLRRDETYPLTSTFISGEVLSTVGAIIADLATVAWLFNV
HHHHHCCCEEEEEEHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILTLIRGRTTVVSSLQDSINIVMAQSTISRIEIEKIARKLKI
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNGLIKFIVNLFQLDKDWITKITMAMIVLSIIWGLLGIIDALMVRIQEASWGLMQLLPLT
CCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCC
PQEYYASITLHGMRDLFGFAQQLEFAIFTYFTFKMLNIQPRAKWIYNLAFILFNIAFMLL
CHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EGPILITAAQGFDNYFSAEGWYYLSPLGIPNYSLYVVSPLWYYGWMLIDIATYMQTIWLS
CCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YHYYVASKTTKEKLPIFLVFVLMDILLYAIGYSGETVANVWDILAFAGIVGLNVIANQIA
HHEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FGILWHAVVYMAWLPAVAAMYLLIPTLANKPLYSDRMGRVAAVLYLIFSNNVPIHHLYMV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEE
DLPIAIKVLTEILTYGVVLPSLMTFLNLWATAKGAQVSWNILTAFTVMSFTGSIFSGVTG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ISNATITFDAVIHETMWVVGHFHGFILLSIVPAGFAILYLMIPMMTGRQWYSAKLMWIHF
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
WGYLFGASMVVIGFDELGLTGLLRRDETYPLTSTFISGEVLSTVGAIIADLATVAWLFNV
HHHHHCCCEEEEEEHHHCHHHHHCCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILTLIRGRTTVVSSLQDSINIVMAQSTISRIEIEKIARKLKI
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7657607; 10338009; 10775261 [H]