| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is 52842521
Identifier: 52842521
GI number: 52842521
Start: 2610805
End: 2614308
Strand: Reverse
Name: 52842521
Synonym: lpg2311
Alternate gene names: NA
Gene position: 2614308-2610805 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52842523
Following gene: 52842520
Centisome position: 76.94
GC content: 39.21
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATAATAATGACTTTGGCTCTCATTTTTGGTAGAACGAAGCTATTTTGCCAAATAAGAGAGCCAGGAAACAAATGACAAGA AGGAGTAATCAATTGAACTC
Product: interaptin
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1167; Mature: 1167
Protein sequence:
>1167_residues MILEEYIRMAKNKEFFDALEEIAESAKNDETLRNELAKVLDDILKTDPSDPEAFRKIVAEHQEFWDEHDPSLMEFNEGRF FGKSRKQYLKSDDFLNSTDPTYNFQKLHQFAAEQRVKLGLEKSDTDTLVAILKNNPEECRAYIESKKPGLGNFSEGNVHG WLKEEYTPTIPPKAINKSTGVLSDEAIKRIKEQARDLLLLKLINSSGNTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGV LFLSREVVDALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHNALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPESEWERAQGVLGA RYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALITELKKPALLGPHDYIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKA LDGAKNLDKFKEVLGKLGITPADWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTKLPVEKQREILAKPQ QLRHLMNAYESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVAAINQALTTANSNPNT YTQATDYKILIDAIKTQSGSVNQKDFYNAFNLNDDGRAFTSSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNSGNKKLLAVLLS IEKPVTFSKDIVNRFLRPLKDSETPQDYADTLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRKQELLDTNPAHVMT AIKALSTELESIKGITGPIRTNADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCGLVVDQLRRQVVALEG HLKSLPKEGEFKAAGLTLEQKAEIKKLRTDLEAELSAVREDLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHP PVSRDQIPPLPNVPNPSLRSSTTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVT SKKGEISKVPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGSNPEELEYLYTAL VILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKERE KVDSKVQEITDKQSKMKKELNPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK
Sequences:
>Translated_1167_residues MILEEYIRMAKNKEFFDALEEIAESAKNDETLRNELAKVLDDILKTDPSDPEAFRKIVAEHQEFWDEHDPSLMEFNEGRF FGKSRKQYLKSDDFLNSTDPTYNFQKLHQFAAEQRVKLGLEKSDTDTLVAILKNNPEECRAYIESKKPGLGNFSEGNVHG WLKEEYTPTIPPKAINKSTGVLSDEAIKRIKEQARDLLLLKLINSSGNTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGV LFLSREVVDALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHNALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPESEWERAQGVLGA RYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALITELKKPALLGPHDYIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKA LDGAKNLDKFKEVLGKLGITPADWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTKLPVEKQREILAKPQ QLRHLMNAYESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVAAINQALTTANSNPNT YTQATDYKILIDAIKTQSGSVNQKDFYNAFNLNDDGRAFTSSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNSGNKKLLAVLLS IEKPVTFSKDIVNRFLRPLKDSETPQDYADTLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRKQELLDTNPAHVMT AIKALSTELESIKGITGPIRTNADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCGLVVDQLRRQVVALEG HLKSLPKEGEFKAAGLTLEQKAEIKKLRTDLEAELSAVREDLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHP PVSRDQIPPLPNVPNPSLRSSTTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVT SKKGEISKVPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGSNPEELEYLYTAL VILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKERE KVDSKVQEITDKQSKMKKELNPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK >Mature_1167_residues MILEEYIRMAKNKEFFDALEEIAESAKNDETLRNELAKVLDDILKTDPSDPEAFRKIVAEHQEFWDEHDPSLMEFNEGRF FGKSRKQYLKSDDFLNSTDPTYNFQKLHQFAAEQRVKLGLEKSDTDTLVAILKNNPEECRAYIESKKPGLGNFSEGNVHG WLKEEYTPTIPPKAINKSTGVLSDEAIKRIKEQARDLLLLKLINSSGNTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGV LFLSREVVDALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHNALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPESEWERAQGVLGA RYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALITELKKPALLGPHDYIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKA LDGAKNLDKFKEVLGKLGITPADWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTKLPVEKQREILAKPQ QLRHLMNAYESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVAAINQALTTANSNPNT YTQATDYKILIDAIKTQSGSVNQKDFYNAFNLNDDGRAFTSSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNSGNKKLLAVLLS IEKPVTFSKDIVNRFLRPLKDSETPQDYADTLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRKQELLDTNPAHVMT AIKALSTELESIKGITGPIRTNADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCGLVVDQLRRQVVALEG HLKSLPKEGEFKAAGLTLEQKAEIKKLRTDLEAELSAVREDLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHP PVSRDQIPPLPNVPNPSLRSSTTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVT SKKGEISKVPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGSNPEELEYLYTAL VILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKERE KVDSKVQEITDKQSKMKKELNPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 130788; Mature: 130788
Theoretical pI: Translated: 7.28; Mature: 7.28
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Important sites: NA
Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MILEEYIRMAKNKEFFDALEEIAESAKNDETLRNELAKVLDDILKTDPSDPEAFRKIVAE CCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH HQEFWDEHDPSLMEFNEGRFFGKSRKQYLKSDDFLNSTDPTYNFQKLHQFAAEQRVKLGL HHHHHHCCCCCHHEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC EKSDTDTLVAILKNNPEECRAYIESKKPGLGNFSEGNVHGWLKEEYTPTIPPKAINKSTG CCCCCHHEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCC VLSDEAIKRIKEQARDLLLLKLINSSGNTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCE LFLSREVVDALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHNALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDE EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCC PYKTYLPESEWERAQGVLGARYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALITELKKPALLGPHD CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHH YIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLDKFKEVLGKLGIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCC PADWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTKLPVEKQREILAKPQ HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHH QLRHLMNAYESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC DKQVAAINQALTTANSNPNTYTQATDYKILIDAIKTQSGSVNQKDFYNAFNLNDDGRAFT CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCC SSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNSGNKKLLAVLLSIEKPVTFSKDIVNRFLRPLK CCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHC DSETPQDYADTLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRKQELLDTNPAHVMT CCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH AIKALSTELESIKGITGPIRTNADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC SRDCGLVVDQLRRQVVALEGHLKSLPKEGEFKAAGLTLEQKAEIKKLRTDLEAELSAVRE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIPPLPNVPNPSLRS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC STTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVT CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH SKKGEISKVPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKD CCCCCCCCCCCCCEEHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KPIRLRGSNPEELEYLYTALVILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNS CCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEECCEEECCCCCCCEEEECCCCH LYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQEITDKQSKMKKEL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MILEEYIRMAKNKEFFDALEEIAESAKNDETLRNELAKVLDDILKTDPSDPEAFRKIVAE CCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH HQEFWDEHDPSLMEFNEGRFFGKSRKQYLKSDDFLNSTDPTYNFQKLHQFAAEQRVKLGL HHHHHHCCCCCHHEECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC EKSDTDTLVAILKNNPEECRAYIESKKPGLGNFSEGNVHGWLKEEYTPTIPPKAINKSTG CCCCCHHEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCC VLSDEAIKRIKEQARDLLLLKLINSSGNTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCE LFLSREVVDALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHNALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDE EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCC PYKTYLPESEWERAQGVLGARYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALITELKKPALLGPHD CHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHH YIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLDKFKEVLGKLGIT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCC PADWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTKLPVEKQREILAKPQ HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHH QLRHLMNAYESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC DKQVAAINQALTTANSNPNTYTQATDYKILIDAIKTQSGSVNQKDFYNAFNLNDDGRAFT CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCC SSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNSGNKKLLAVLLSIEKPVTFSKDIVNRFLRPLK CCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHC DSETPQDYADTLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRKQELLDTNPAHVMT CCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH AIKALSTELESIKGITGPIRTNADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC SRDCGLVVDQLRRQVVALEGHLKSLPKEGEFKAAGLTLEQKAEIKKLRTDLEAELSAVRE CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIPPLPNVPNPSLRS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC STTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVT CCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH SKKGEISKVPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKD CCCCCCCCCCCCCEEHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KPIRLRGSNPEELEYLYTALVILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNS CCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEECCEEECCCCCCCEEEECCCCH LYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQEITDKQSKMKKEL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA