| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is 52842429
Identifier: 52842429
GI number: 52842429
Start: 2500553
End: 2502325
Strand: Reverse
Name: 52842429
Synonym: lpg2216
Alternate gene names: NA
Gene position: 2502325-2500553 (Counterclockwise)
Preceding gene: 52842430
Following gene: 52842428
Centisome position: 73.65
GC content: 35.14
Gene sequence:
>1773_bases ATGAAGAGTAAAGAAGAACGATTTAATGAATGGCGCCAAGAAAAGGCGAAATCAGAACAGGCATATATTAAAACTGTTCC ATTAGTGGAAGAATACATTAAATCATTTGATACCTTGGCTGAGCTCAGAAATGATGTGGCTAATCCTAATTCTGAAAAAA TTAAAAAAATGGACGCCCATAAAAGGCGCACTCTGGGTGTTTTACTCTATGCCAAATTAAAACTGGATGAAGTGATAGAA AAAATTTCGGATTCTGATAGCCAGGAAAAGGATTTATTAATTGAGTTAAATAATACTCTGAGCAAAGCGTATGATAATCC CAAATCGGACGCCAAAAACAGAGTAAAAATTTTAATAGAAACGACAGAACACTTATTGAATATCGAACATCACTCTTATC CACAATTGGCTAAAGAATTATGCGCAGATCTATATGCTCTATTATGTATTGCGAAGAGATCGCTTAAGAAAAATGAAATA CTGGCAAGCTGGTTCATCGATGTTCATGAAATTAATAAAAAACTGGAAGAATTATTAGCAAAAACAGAAGAAAAAGTCGA AAGTTTGGACAAAATCCTGTCAGAAAAACTCAATGAATCACTTGAGACTTCCCCAAAAGACAGAACGATACAAGAACATT TTAATGAGCGTTTCACCGAAATTTTAAGTGGGGACGAGAAACAAAGAACAAAACTGGATAAGTTAAAAATGAGCCTTAAG GAAGTAGCTGAGGGACTATCAGGTATTGTGGAGTTAAGAAAAGAGAAGGCTACGATTGGTGAAAAAATTAAAAAAATTGA AGCTTTACTGAAAACAGTAGAAGAAAACGATAAAAAAGTTACAGGAAGACAATATTTTTTAGACTTACTAGCCAGCCATA AAGACCATTTTAATACTCTAATGAGTACTGAGGGTGGGGAGTTAAAAAAACAGTTAGCAGGGAAAATAGAACAACTCAAG AACCCGGATTTTTATCAAACTGTTTCTTCGACCCTTTTATGGGGCGCAAGCTGGGCTACTTCTTTGGGTACAGTCATTTA TCGCCAGATAACTCCTCAAGCAGTTCAGGATAGAGTTAGCGCTTATGCTCCTGCAACACTGGATAGTGAAGCAAAAGCTC TTTTGCAGGAATTGGCAAGACAACAGTTAATTGAGTTAAAAAAACAACAAAGTCTCAAAAGGGATGAGTTGGTTCAGAGA TATAGCCAACTATCAAGCGGTAGCCCTGAGTTGGAAAAATTGATAATCAACGCCACTTCAGACCATCTTGAGCAAATTGC TGCAGCAACAACAGAAACAAGCAAAGTTCTTGATGGATATGATCAAATTGAGATTAAACTCAAAGATAATGTAGAAAAAC TTAAGGGAAATCAGTTAACTCGAAAGCAATTATCTGATTTTATTGAAAAAAATGACACCTGGATAGTAAAATTATCCAAC TGGCTTGCAGAAAATATCCATGAGATATTTAAGTCTGATACGGCTCGCATGATTGATAAGGCTAGAAAAGCACAACAAAA GCTGGGAGAATTTGAAAGACAATATCAAACGGAAATTGAAAGTGAAAAAGCAAAAATTGAAAATAATGATTCATTGTCCT CAGAGATGAAAGTTTTTTTAAAAAATCAGTTTGAAGAAACAAAAAAAACAGGTGGAATGGAGCAGAAACCACAGAAAAAT CTCAGCAAGGAAACTCTTCAGAAATTATTTGTTAGCCTGTTGCCTGAACATGAAGAGATCTCATCTGGGGTAATATTCAG TCCGTTTAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATATTTAGATAATAATAGATGCATATACTGGAGTTAAGATTTAGCGGGTATTTCTCCATTTATTGTTTGGAAGAGTGCTA ACTGGCAATTAGGGTTAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCAGGGATTAGAGCGATGATATGAGTCAATCGGTTGATCAAAGTCAAGTCATTGATCGATTAAATCGGTATCTCAAATGG CATAATATGCCAGTTAGCAT
Product: purine NTPase, putative
Products: NA
Alternate protein names: Purine NTPase
Number of amino acids: Translated: 590; Mature: 590
Protein sequence:
>590_residues MKSKEERFNEWRQEKAKSEQAYIKTVPLVEEYIKSFDTLAELRNDVANPNSEKIKKMDAHKRRTLGVLLYAKLKLDEVIE KISDSDSQEKDLLIELNNTLSKAYDNPKSDAKNRVKILIETTEHLLNIEHHSYPQLAKELCADLYALLCIAKRSLKKNEI LASWFIDVHEINKKLEELLAKTEEKVESLDKILSEKLNESLETSPKDRTIQEHFNERFTEILSGDEKQRTKLDKLKMSLK EVAEGLSGIVELRKEKATIGEKIKKIEALLKTVEENDKKVTGRQYFLDLLASHKDHFNTLMSTEGGELKKQLAGKIEQLK NPDFYQTVSSTLLWGASWATSLGTVIYRQITPQAVQDRVSAYAPATLDSEAKALLQELARQQLIELKKQQSLKRDELVQR YSQLSSGSPELEKLIINATSDHLEQIAAATTETSKVLDGYDQIEIKLKDNVEKLKGNQLTRKQLSDFIEKNDTWIVKLSN WLAENIHEIFKSDTARMIDKARKAQQKLGEFERQYQTEIESEKAKIENNDSLSSEMKVFLKNQFEETKKTGGMEQKPQKN LSKETLQKLFVSLLPEHEEISSGVIFSPFN
Sequences:
>Translated_590_residues MKSKEERFNEWRQEKAKSEQAYIKTVPLVEEYIKSFDTLAELRNDVANPNSEKIKKMDAHKRRTLGVLLYAKLKLDEVIE KISDSDSQEKDLLIELNNTLSKAYDNPKSDAKNRVKILIETTEHLLNIEHHSYPQLAKELCADLYALLCIAKRSLKKNEI LASWFIDVHEINKKLEELLAKTEEKVESLDKILSEKLNESLETSPKDRTIQEHFNERFTEILSGDEKQRTKLDKLKMSLK EVAEGLSGIVELRKEKATIGEKIKKIEALLKTVEENDKKVTGRQYFLDLLASHKDHFNTLMSTEGGELKKQLAGKIEQLK NPDFYQTVSSTLLWGASWATSLGTVIYRQITPQAVQDRVSAYAPATLDSEAKALLQELARQQLIELKKQQSLKRDELVQR YSQLSSGSPELEKLIINATSDHLEQIAAATTETSKVLDGYDQIEIKLKDNVEKLKGNQLTRKQLSDFIEKNDTWIVKLSN WLAENIHEIFKSDTARMIDKARKAQQKLGEFERQYQTEIESEKAKIENNDSLSSEMKVFLKNQFEETKKTGGMEQKPQKN LSKETLQKLFVSLLPEHEEISSGVIFSPFN >Mature_590_residues MKSKEERFNEWRQEKAKSEQAYIKTVPLVEEYIKSFDTLAELRNDVANPNSEKIKKMDAHKRRTLGVLLYAKLKLDEVIE KISDSDSQEKDLLIELNNTLSKAYDNPKSDAKNRVKILIETTEHLLNIEHHSYPQLAKELCADLYALLCIAKRSLKKNEI LASWFIDVHEINKKLEELLAKTEEKVESLDKILSEKLNESLETSPKDRTIQEHFNERFTEILSGDEKQRTKLDKLKMSLK EVAEGLSGIVELRKEKATIGEKIKKIEALLKTVEENDKKVTGRQYFLDLLASHKDHFNTLMSTEGGELKKQLAGKIEQLK NPDFYQTVSSTLLWGASWATSLGTVIYRQITPQAVQDRVSAYAPATLDSEAKALLQELARQQLIELKKQQSLKRDELVQR YSQLSSGSPELEKLIINATSDHLEQIAAATTETSKVLDGYDQIEIKLKDNVEKLKGNQLTRKQLSDFIEKNDTWIVKLSN WLAENIHEIFKSDTARMIDKARKAQQKLGEFERQYQTEIESEKAKIENNDSLSSEMKVFLKNQFEETKKTGGMEQKPQKN LSKETLQKLFVSLLPEHEEISSGVIFSPFN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67786; Mature: 67786
Theoretical pI: Translated: 6.61; Mature: 6.61
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSKEERFNEWRQEKAKSEQAYIKTVPLVEEYIKSFDTLAELRNDVANPNSEKIKKMDAH CCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH KRRTLGVLLYAKLKLDEVIEKISDSDSQEKDLLIELNNTLSKAYDNPKSDAKNRVKILIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH TTEHLLNIEHHSYPQLAKELCADLYALLCIAKRSLKKNEILASWFIDVHEINKKLEELLA HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTEEKVESLDKILSEKLNESLETSPKDRTIQEHFNERFTEILSGDEKQRTKLDKLKMSLK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH EVAEGLSGIVELRKEKATIGEKIKKIEALLKTVEENDKKVTGRQYFLDLLASHKDHFNTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MSTEGGELKKQLAGKIEQLKNPDFYQTVSSTLLWGASWATSLGTVIYRQITPQAVQDRVS HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH AYAPATLDSEAKALLQELARQQLIELKKQQSLKRDELVQRYSQLSSGSPELEKLIINATS HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCHH DHLEQIAAATTETSKVLDGYDQIEIKLKDNVEKLKGNQLTRKQLSDFIEKNDTWIVKLSN HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH WLAENIHEIFKSDTARMIDKARKAQQKLGEFERQYQTEIESEKAKIENNDSLSSEMKVFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH KNQFEETKKTGGMEQKPQKNLSKETLQKLFVSLLPEHEEISSGVIFSPFN HHHHHHHHHCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCC >Mature Secondary Structure MKSKEERFNEWRQEKAKSEQAYIKTVPLVEEYIKSFDTLAELRNDVANPNSEKIKKMDAH CCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH KRRTLGVLLYAKLKLDEVIEKISDSDSQEKDLLIELNNTLSKAYDNPKSDAKNRVKILIE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH TTEHLLNIEHHSYPQLAKELCADLYALLCIAKRSLKKNEILASWFIDVHEINKKLEELLA HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTEEKVESLDKILSEKLNESLETSPKDRTIQEHFNERFTEILSGDEKQRTKLDKLKMSLK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH EVAEGLSGIVELRKEKATIGEKIKKIEALLKTVEENDKKVTGRQYFLDLLASHKDHFNTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MSTEGGELKKQLAGKIEQLKNPDFYQTVSSTLLWGASWATSLGTVIYRQITPQAVQDRVS HCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH AYAPATLDSEAKALLQELARQQLIELKKQQSLKRDELVQRYSQLSSGSPELEKLIINATS HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCHH DHLEQIAAATTETSKVLDGYDQIEIKLKDNVEKLKGNQLTRKQLSDFIEKNDTWIVKLSN HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEEHHCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH WLAENIHEIFKSDTARMIDKARKAQQKLGEFERQYQTEIESEKAKIENNDSLSSEMKVFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH KNQFEETKKTGGMEQKPQKNLSKETLQKLFVSLLPEHEEISSGVIFSPFN HHHHHHHHHCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA