| Definition | Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002942 |
| Length | 3,397,754 |
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The map label for this gene is 52842370
Identifier: 52842370
GI number: 52842370
Start: 2410554
End: 2416334
Strand: Direct
Name: 52842370
Synonym: lpg2156
Alternate gene names: NA
Gene position: 2410554-2416334 (Clockwise)
Preceding gene: 52842369
Following gene: 52842371
Centisome position: 70.95
GC content: 39.27
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: Sid related protein-like
Products: NA
Alternate protein names: Sid Related Protein-Like; Sid -Like Protein; SdeC Protein; Sid Proteins; SdeA Protein; SidE Protein
Number of amino acids: Translated: 1926; Mature: 1925
Protein sequence:
>1926_residues MGESKMPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHPEIKSGTIYNGVPTIDQEALDKQGFMPVLTGVGPKRDSGHWIMLIKGSGNQ YHLFDPMGKISGEGYQDILATQLPKGSTLSVIPNEPGLNKGLCGYWVASVGLKACSALNKDNPPNLETLGQITTDAMKDE LTDNGYLKITGWLKAVADKFPEGDPQPDAKALRQTTEKDLHIEIPSPVSPVKDTAPKEVSTKPTAPQVAPKYSLDSKLLE NDDDVLDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAEVMIEEARKAQLRGETLGKAK NGQTLADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKRNFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAI ILDKNHEWDATPAHILINQGHMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVVLKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDD PSRGGPYENPYSGEKFVIVDDKVPASKKDLPKAVNRDYKLKDNERFLTIKEYYAFPDVQQTYPGYKTRLEASSYYFPTPF AGECEQNPAKCLGAIQKARSKLQTDAIKNGFQSSSEKERRQPNMDEIAAARIIQQIMANPDCIHDDHVLINGQKLEEKFF RDLLAKCDMAVVGSLLNDTDIKNIDTLMRHEKNTEFHSTDPKAVPVKIGDAWENRIRTKGGDVTQMKHDLIFLMQNDAWY FSRVNAIAQNRDKGSNFKEVLFTTLMTPLTNKSLIDTSHVPAPKKLYRGLNLPQEFTNKLINQSNAIIANTENTLFTDLS AEAFKQIKLNDFSQMSGKTCASTTKNMKLLTDIWGSNVIFEMLDPDGLLHPKQVGTHMTGSEDEFSVYLPEDVALVPTKV TLEGKTDTGEDRYIFTLVAVKSPDFIPRHESGYAVEPFMKMQKEKVTQALDAIEKDKDSYNIDEQLKSLRTEMVRQAKLP LREGVFDRLSHRFSLETSDNKISPERRDFLNQHVIPVLQECHIALRTNNMEMMQKALAKFPTDKQWSAFKSGEAVRAKAQ MDVLKQQIEKKIMLQTQIIPALTECGEALDKQNVTEALQALNKLPAEKEIGKAKGIGQELRGQIVGVKQELTGNLESLQR AVTTPVVKDAEKMRVRYETLLTDVTKRVTDFEKIKPANLDGYNKAIADLNNIQQELNLLRNEKIRMHTDKDKAVDFSDIE ALEKRLKEAQPNLYPSLVEGTTKGIQELEKIPKSISFDDVKSMTSKINGYLETLEFIRNERVKKHGESTEPLDMSDLDKL KNQLQGVSQHLAQILLNGAKNSLDKIKDPVTLEKEGQYIKRCLDHFAELEKTLDSSVKGMKQKEDFNTYKNSLMEKQEKA YPEMLQLQYKSEALITQLRNLCNIHHDNLAKTREEQQQLLNKTGGILGGFFSQITTAISQAESKKANEFARFKTELNNDK SDVSQLIQFLVKKKPSELEENLGISKENAEQLHGLLKQLDAKATPIDKLQENTRLIDEISTKMGSKPVSPEHVAATKARE YYQFLLYGATQKIGNFEKIKPIDPESYKKAMSDLNNMQEALQFLRSEKSRIHDGKEKAVEFSDIEALEKRVQNAQPKLLT ALLDKTTREISALVKIPRKLTFEDIKSMTTKLNSYLETLELIRNERIKQHGKSPELLDMSDLDSLKGQLQTFNQNLTGMI LNATKDGLDRINDRANFKEGEPYVKACLDLLTELEKTLDSSVKGMKQKEDISACRNSLLDKQEKANSGMLDLQSKSKDLV TQLRDICKIHHGNLAEARRTRLHSLDNQEGGLLGGLWSVTNKLGVTTDTVGIERMQIKMKEQALARFKTELNNDKYDTNQ VIAFLANKKPSELEEGLGISKENAEELHGLLSKLTSKMTSKIEIEENTQLIDEISTKIGTEPVKLESTHTVDEDERDTYH RESGYF
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 216958; Mature: 216826
Theoretical pI: Translated: 6.61; Mature: 6.61
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGESKMPKYVEGVELTQEGMHAIFARMGHPEIKSGTIYNGVPTIDQEALDKQGFMPVLTG CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHC VGPKRDSGHWIMLIKGSGNQYHLFDPMGKISGEGYQDILATQLPKGSTLSVIPNEPGLNK CCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCC GLCGYWVASVGLKACSALNKDNPPNLETLGQITTDAMKDELTDNGYLKITGWLKAVADKF CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHC PEGDPQPDAKALRQTTEKDLHIEIPSPVSPVKDTAPKEVSTKPTAPQVAPKYSLDSKLLE CCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHC NDDDVLDTIKYVHKEYLGKPYPGPLKNPKAPEEGRLPPNEGPDRGPHGLAHTVRTMACAE CCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH VMIEEARKAQLRGETLGKAKNGQTLADVTPEELKKILIAQAFFVVGRDDERSGYDDVHKR HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH NFYAEYHEKSEQAFRKYVEDNKLIGKIFKDQKEVDFYAAIILDKNHEWDATPAHILINQG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHCEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEECCC HMVDLMRTKAPAEVALERTYNTLKGTVGSKGAEVVLKAHRDFFFATGAVVPLVNPEAIDD 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