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The map label for this gene is ydgH [H]

Identifier: 57234349

GI number: 57234349

Start: 799295

End: 802240

Strand: Direct

Name: ydgH [H]

Synonym: DET0872

Alternate gene names: 57234349

Gene position: 799295-802240 (Clockwise)

Preceding gene: 57234350

Following gene: 57234347

Centisome position: 54.38

GC content: 48.13

Gene sequence:

>2946_bases
ATGTTCAAGACTATTGCAAATTGGGTTATCAAATTTAAATATCTGGTAGTCAGTTTCTGGGTGATACTGGCTGCGGTAAT
GGCGCTTTCCGCCCCATCTTTGCAGGATGCAAGCACACTGGACCAGTCCGGCTTTATGCCCTCAGACTCAGATTCAGTTA
AGGCTGATGCTCTTTTAAAACAGTATTTCCCGGATGATATTTCCTCGGTTTTCGGTCTCTATCTAATCCTGTTTAACCAG
TCTAGCCTGAGCCAGACTGATATGGATTATGCCGAATCTTTAAGTGACTGGCTCTCTTCCGGGGATGCGCCCGCCGGCAT
TGGGGAAGTAGATTCGGTATTTAACAACCCCCAGTTAGCCGGCCGCCTTATCAGCCCGGATAATACTACCATGCTGATAA
ATATAAGCCTCATGCAGGCCGCCGAGGACAGCCGGACAGAAAAAATCATAACCGCCATTCATTCTCAGCTGGCAGATACG
CCCGCAGGGCTTGAAGTATTTGTTTCCGGCGAAGCCGGCATATTAAATGACCTTTTTGCCGCTTTGGCGGACAGTATAGA
CCTGACCACCATTGTTACCATTGTGCTGGTTTCGGTCTTGCTGCTTATTATTTACCGCTCACCGGTAGCTTCACTGGTAC
CGCTTTTAACCATAGGCATTGCTTATCTGGTTAGCCGGGGCGTGCTGGGCTATATGGCTGAAGCCGGAGTAAATATCTGG
TCACAGCTGGATATATTTATAGTGGTACTGATATTTGGGGTAGGCACGGACTACTGTTTGTTTCTTATGTCACGTTTCCG
CGAAGAACTCCACAACAACCAAAACCGCTGGGATGCACTTAAAACCGCTTTGGGGCGGATAGGGGCTGTCATATCTGCCA
GCGCCATAGCCCTTATTGTGGGTTTGATGGGCATGTCAATCGCCCGCTACCAGATGATTCAAACCATGGGGCCTTCACTG
AGTGTGACCATTGCCATTACCCTGCTGTGTGCTTTAACAATCACCCCTGCGCTGGCATCTATATTCGGCGGTAAAATATT
TTGGCCCAGCAAATTTGATAAAAACCAGAAGGAAAAGCAGCCGGATGCACCGCCTAAAAACAAATTCCACTTCTGGAGCT
GGATAGGCAATATCACCACCAAACACCCTCTGCCCATAGCACTGGTTATTATCGGGCTTCTTTTCGTACCCTATACCCAG
CTGTCACGCCAACAAGTTTCGTTTGATACTATAAGTGAACTGCCCCAGGATGCCGAATCGGTAATCGGTTTTAATAAACT
GCTGGAGCATTTTAATATAGGCGAAATGATGCCAGCCACTCTGGTACTGGCTGATAGCAACGGCGAAGACCTAAGTTCCG
CCGCTATACTTGAGGAACTGGCTGATTTAACCGCCAGCCTGGAAAATATTAAGGGGATAAGCGGTATCCAGTCTGTGCTT
CAGCCGGACGGGACTTCCGTTTCCGGTTCAGCGCTTTTGGCCGCCAACCAGATACTGGGTCTGATACCAGATGCATCTTC
CGGGAATCTTGACCCCGCTGATTTGGTTTCTGACCAGACTTTAGCAAGTTTCGGCTTTATAAAAACTTACCTGCTGGAAC
TAGGTCAGAGTTTTTCATGGCTTGCAGATGAGACAGCCTATCAGGACTGCCTAACCTCTATAAACAATATAACCGATATA
CTTACAAGTATCCGCCACAATGCCCAAATAGATACCCAGCTAACTGCCTTGACTGAAAAAATCCGTCAGACCGCAGATGC
TTTGAGGCTGGGCTATCCGGCTCAAGCTGAAATAGCCTTTGCGGTAAAAGCCTATCTGGAAGAAAGCGCACAGGCATACA
GCTTTATTGCTGATTTATATGACTACCAGCAGGCCATGCAAAAGATTGATACACTTGCCCTCCTTATTGCCCAGTCCAGC
AATGACGGCAGTATTGTTTCCGGATTATACAGTCTGGCCTACTCCACCGAACACCTGTCATTCGTGATTGGCAGTGAGGG
TGTCTTCTATTTCTTCCCCCAATCCCTCCCGTCAGACAGTGCCTCTGATAATGCCGCTGCAATGCTGCTCAGTGAAATAA
GCGCATTCGGACAGAATATGTATTTATTAAGCAGCACTCTGGCGGACAACGGCAACCCGTATTTTATATCTCAAGCTCTT
ATGCAGGCCTCTCCCGAACTGCGCAGCCTGGTGGATGCATTTTATTCACAGGACAGGTCAGGAATACGTTTGTTCCTGAT
ACTGGCTGATTCGCCCTACAGCAATGAAGCCATGGATACCATTTCCGATGTAAAAGCCCTGCTCCAGCAGGACATGACAG
AAGGACAGCTTTCCGGTCTGGAATACGGCATTCAGGGTACCAGCGCCACCAGCCAGGACGTCCGGGGTATGATTGAAGAA
GATTTCACCCATATCCAGATGATAATTCTGGGCGGGGTATTCTTGGTTTTGCTTACCCTTTTACGAAGTATAGTTGCCCC
CATTTATCTGCTCCTGACCGTGATGCTAAGCTACGGTGCAACTATGGGCATAATAACCTGGCTGTTCCAGGATGTATTAG
GGCACGCCGGTATAAGCTTTATGCTGCCCATCATATTATTTACCCTGATAGTAGCGCTGGGTTCAGATTACAATATCCTG
CTTGTATCACGTATCCGCGAGGAATCAGAGACTAAACCCATCAGGGAAGCTGTCAAAAATGCAATTTCCTCAACCGGCGG
GGTTATCGTGGCTTGCAGCTTTATTCTGGGTGGTACATTCGCAGCCATGCTCACTTCACCCATACTTACCATGTACCAGC
TGGGGGCGGCGGTCGCCATTGGCATTATAATGGATACCGTCATTGTCAGAGGTATCCTGGTACCTTCACTGGCTACTATA
ATCGGCTGTTGGAACTGGTGGCCGTTCCATCAGAAAAATACTAGCAGCAGAAAGAGTGAAAACTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACGAAGGCTTATCCATAATCCGGAATGGGTTTTGCCAGCTTGAAAAATCCATTGCCAATAAATTAACAGCGGCAGAAAG
TACTGACAGGATTTAAAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCTAAATTACTTTACATTTGTAGCTTAAAAGTATTTTCCCCAGGACCTTTATCTCGGTCAGCGGCAGATTACGGTTTGT
GCCATTTCCGTCTGAAATAC

Product: MmpL family membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 981; Mature: 981

Protein sequence:

>981_residues
MFKTIANWVIKFKYLVVSFWVILAAVMALSAPSLQDASTLDQSGFMPSDSDSVKADALLKQYFPDDISSVFGLYLILFNQ
SSLSQTDMDYAESLSDWLSSGDAPAGIGEVDSVFNNPQLAGRLISPDNTTMLINISLMQAAEDSRTEKIITAIHSQLADT
PAGLEVFVSGEAGILNDLFAALADSIDLTTIVTIVLVSVLLLIIYRSPVASLVPLLTIGIAYLVSRGVLGYMAEAGVNIW
SQLDIFIVVLIFGVGTDYCLFLMSRFREELHNNQNRWDALKTALGRIGAVISASAIALIVGLMGMSIARYQMIQTMGPSL
SVTIAITLLCALTITPALASIFGGKIFWPSKFDKNQKEKQPDAPPKNKFHFWSWIGNITTKHPLPIALVIIGLLFVPYTQ
LSRQQVSFDTISELPQDAESVIGFNKLLEHFNIGEMMPATLVLADSNGEDLSSAAILEELADLTASLENIKGISGIQSVL
QPDGTSVSGSALLAANQILGLIPDASSGNLDPADLVSDQTLASFGFIKTYLLELGQSFSWLADETAYQDCLTSINNITDI
LTSIRHNAQIDTQLTALTEKIRQTADALRLGYPAQAEIAFAVKAYLEESAQAYSFIADLYDYQQAMQKIDTLALLIAQSS
NDGSIVSGLYSLAYSTEHLSFVIGSEGVFYFFPQSLPSDSASDNAAAMLLSEISAFGQNMYLLSSTLADNGNPYFISQAL
MQASPELRSLVDAFYSQDRSGIRLFLILADSPYSNEAMDTISDVKALLQQDMTEGQLSGLEYGIQGTSATSQDVRGMIEE
DFTHIQMIILGGVFLVLLTLLRSIVAPIYLLLTVMLSYGATMGIITWLFQDVLGHAGISFMLPIILFTLIVALGSDYNIL
LVSRIREESETKPIREAVKNAISSTGGVIVACSFILGGTFAAMLTSPILTMYQLGAAVAIGIIMDTVIVRGILVPSLATI
IGCWNWWPFHQKNTSSRKSEN

Sequences:

>Translated_981_residues
MFKTIANWVIKFKYLVVSFWVILAAVMALSAPSLQDASTLDQSGFMPSDSDSVKADALLKQYFPDDISSVFGLYLILFNQ
SSLSQTDMDYAESLSDWLSSGDAPAGIGEVDSVFNNPQLAGRLISPDNTTMLINISLMQAAEDSRTEKIITAIHSQLADT
PAGLEVFVSGEAGILNDLFAALADSIDLTTIVTIVLVSVLLLIIYRSPVASLVPLLTIGIAYLVSRGVLGYMAEAGVNIW
SQLDIFIVVLIFGVGTDYCLFLMSRFREELHNNQNRWDALKTALGRIGAVISASAIALIVGLMGMSIARYQMIQTMGPSL
SVTIAITLLCALTITPALASIFGGKIFWPSKFDKNQKEKQPDAPPKNKFHFWSWIGNITTKHPLPIALVIIGLLFVPYTQ
LSRQQVSFDTISELPQDAESVIGFNKLLEHFNIGEMMPATLVLADSNGEDLSSAAILEELADLTASLENIKGISGIQSVL
QPDGTSVSGSALLAANQILGLIPDASSGNLDPADLVSDQTLASFGFIKTYLLELGQSFSWLADETAYQDCLTSINNITDI
LTSIRHNAQIDTQLTALTEKIRQTADALRLGYPAQAEIAFAVKAYLEESAQAYSFIADLYDYQQAMQKIDTLALLIAQSS
NDGSIVSGLYSLAYSTEHLSFVIGSEGVFYFFPQSLPSDSASDNAAAMLLSEISAFGQNMYLLSSTLADNGNPYFISQAL
MQASPELRSLVDAFYSQDRSGIRLFLILADSPYSNEAMDTISDVKALLQQDMTEGQLSGLEYGIQGTSATSQDVRGMIEE
DFTHIQMIILGGVFLVLLTLLRSIVAPIYLLLTVMLSYGATMGIITWLFQDVLGHAGISFMLPIILFTLIVALGSDYNIL
LVSRIREESETKPIREAVKNAISSTGGVIVACSFILGGTFAAMLTSPILTMYQLGAAVAIGIIMDTVIVRGILVPSLATI
IGCWNWWPFHQKNTSSRKSEN
>Mature_981_residues
MFKTIANWVIKFKYLVVSFWVILAAVMALSAPSLQDASTLDQSGFMPSDSDSVKADALLKQYFPDDISSVFGLYLILFNQ
SSLSQTDMDYAESLSDWLSSGDAPAGIGEVDSVFNNPQLAGRLISPDNTTMLINISLMQAAEDSRTEKIITAIHSQLADT
PAGLEVFVSGEAGILNDLFAALADSIDLTTIVTIVLVSVLLLIIYRSPVASLVPLLTIGIAYLVSRGVLGYMAEAGVNIW
SQLDIFIVVLIFGVGTDYCLFLMSRFREELHNNQNRWDALKTALGRIGAVISASAIALIVGLMGMSIARYQMIQTMGPSL
SVTIAITLLCALTITPALASIFGGKIFWPSKFDKNQKEKQPDAPPKNKFHFWSWIGNITTKHPLPIALVIIGLLFVPYTQ
LSRQQVSFDTISELPQDAESVIGFNKLLEHFNIGEMMPATLVLADSNGEDLSSAAILEELADLTASLENIKGISGIQSVL
QPDGTSVSGSALLAANQILGLIPDASSGNLDPADLVSDQTLASFGFIKTYLLELGQSFSWLADETAYQDCLTSINNITDI
LTSIRHNAQIDTQLTALTEKIRQTADALRLGYPAQAEIAFAVKAYLEESAQAYSFIADLYDYQQAMQKIDTLALLIAQSS
NDGSIVSGLYSLAYSTEHLSFVIGSEGVFYFFPQSLPSDSASDNAAAMLLSEISAFGQNMYLLSSTLADNGNPYFISQAL
MQASPELRSLVDAFYSQDRSGIRLFLILADSPYSNEAMDTISDVKALLQQDMTEGQLSGLEYGIQGTSATSQDVRGMIEE
DFTHIQMIILGGVFLVLLTLLRSIVAPIYLLLTVMLSYGATMGIITWLFQDVLGHAGISFMLPIILFTLIVALGSDYNIL
LVSRIREESETKPIREAVKNAISSTGGVIVACSFILGGTFAAMLTSPILTMYQLGAAVAIGIIMDTVIVRGILVPSLATI
IGCWNWWPFHQKNTSSRKSEN

Specific function: Unknown

COG id: COG2409

COG function: function code R; Predicted drug exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mmpL family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004869
- InterPro:   IPR000731 [H]

Pfam domain/function: PF03176 MMPL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106238; Mature: 106238

Theoretical pI: Translated: 4.21; Mature: 4.21

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKTIANWVIKFKYLVVSFWVILAAVMALSAPSLQDASTLDQSGFMPSDSDSVKADALLK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
QYFPDDISSVFGLYLILFNQSSLSQTDMDYAESLSDWLSSGDAPAGIGEVDSVFNNPQLA
HHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHC
GRLISPDNTTMLINISLMQAAEDSRTEKIITAIHSQLADTPAGLEVFVSGEAGILNDLFA
CEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHH
ALADSIDLTTIVTIVLVSVLLLIIYRSPVASLVPLLTIGIAYLVSRGVLGYMAEAGVNIW
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQLDIFIVVLIFGVGTDYCLFLMSRFREELHNNQNRWDALKTALGRIGAVISASAIALIV
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLMGMSIARYQMIQTMGPSLSVTIAITLLCALTITPALASIFGGKIFWPSKFDKNQKEKQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCHHHCC
PDAPPKNKFHFWSWIGNITTKHPLPIALVIIGLLFVPYTQLSRQQVSFDTISELPQDAES
CCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHH
VIGFNKLLEHFNIGEMMPATLVLADSNGEDLSSAAILEELADLTASLENIKGISGIQSVL
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
QPDGTSVSGSALLAANQILGLIPDASSGNLDPADLVSDQTLASFGFIKTYLLELGQSFSW
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LADETAYQDCLTSINNITDILTSIRHNAQIDTQLTALTEKIRQTADALRLGYPAQAEIAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
AVKAYLEESAQAYSFIADLYDYQQAMQKIDTLALLIAQSSNDGSIVSGLYSLAYSTEHLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHE
FVIGSEGVFYFFPQSLPSDSASDNAAAMLLSEISAFGQNMYLLSSTLADNGNPYFISQAL
EEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
MQASPELRSLVDAFYSQDRSGIRLFLILADSPYSNEAMDTISDVKALLQQDMTEGQLSGL
HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCH
EYGIQGTSATSQDVRGMIEEDFTHIQMIILGGVFLVLLTLLRSIVAPIYLLLTVMLSYGA
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TMGIITWLFQDVLGHAGISFMLPIILFTLIVALGSDYNILLVSRIREESETKPIREAVKN
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
AISSTGGVIVACSFILGGTFAAMLTSPILTMYQLGAAVAIGIIMDTVIVRGILVPSLATI
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGCWNWWPFHQKNTSSRKSEN
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKTIANWVIKFKYLVVSFWVILAAVMALSAPSLQDASTLDQSGFMPSDSDSVKADALLK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHH
QYFPDDISSVFGLYLILFNQSSLSQTDMDYAESLSDWLSSGDAPAGIGEVDSVFNNPQLA
HHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHC
GRLISPDNTTMLINISLMQAAEDSRTEKIITAIHSQLADTPAGLEVFVSGEAGILNDLFA
CEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHH
ALADSIDLTTIVTIVLVSVLLLIIYRSPVASLVPLLTIGIAYLVSRGVLGYMAEAGVNIW
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SQLDIFIVVLIFGVGTDYCLFLMSRFREELHNNQNRWDALKTALGRIGAVISASAIALIV
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLMGMSIARYQMIQTMGPSLSVTIAITLLCALTITPALASIFGGKIFWPSKFDKNQKEKQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCHHHCC
PDAPPKNKFHFWSWIGNITTKHPLPIALVIIGLLFVPYTQLSRQQVSFDTISELPQDAES
CCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHH
VIGFNKLLEHFNIGEMMPATLVLADSNGEDLSSAAILEELADLTASLENIKGISGIQSVL
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QPDGTSVSGSALLAANQILGLIPDASSGNLDPADLVSDQTLASFGFIKTYLLELGQSFSW
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
LADETAYQDCLTSINNITDILTSIRHNAQIDTQLTALTEKIRQTADALRLGYPAQAEIAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
AVKAYLEESAQAYSFIADLYDYQQAMQKIDTLALLIAQSSNDGSIVSGLYSLAYSTEHLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHE
FVIGSEGVFYFFPQSLPSDSASDNAAAMLLSEISAFGQNMYLLSSTLADNGNPYFISQAL
EEECCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
MQASPELRSLVDAFYSQDRSGIRLFLILADSPYSNEAMDTISDVKALLQQDMTEGQLSGL
HHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCH
EYGIQGTSATSQDVRGMIEEDFTHIQMIILGGVFLVLLTLLRSIVAPIYLLLTVMLSYGA
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TMGIITWLFQDVLGHAGISFMLPIILFTLIVALGSDYNILLVSRIREESETKPIREAVKN
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
AISSTGGVIVACSFILGGTFAAMLTSPILTMYQLGAAVAIGIIMDTVIVRGILVPSLATI
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGCWNWWPFHQKNTSSRKSEN
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]