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The map label for this gene is 15899896

Identifier: 15899896

GI number: 15899896

Start: 2939133

End: 2940071

Strand: Reverse

Name: 15899896

Synonym: SSO3192

Alternate gene names: NA

Gene position: 2940071-2939133 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15899897

Following gene: 15899895

Centisome position: 98.26

GC content: 31.52

Gene sequence:

>939_bases
TTGGTGTGGTTTTTAATATTACAGCTGATAGTCTTACTTATTTTAGTTGCATTTTCAGCTACTTTAATGGCTAAGGGGAC
ACGAGAATTAGAAAGGTCTTTCGGCAAAGGAATAGCGGGAGGGTTAATATTAGGTTTCATAAATGCATTGCCGGAAACTA
TTATTGTGATTCAAGCTGTCTTAAACGGTTTTTATGATATTGCGTTAGGTTCTGCTTTAGGTGGAAATATATTATTACTT
ACCTTAGGGATAGGGCTTATCTCTATTTTCTATTATCTGAAGTACAAGTCTAATATTATTACTCTAGATAGCGATATAAA
TATAGAATATAGTTCATTTCTTTTGGCGGTAATAATTTTAGGTATAGCAATTGTATATGGTAAGTTAAACTACTACATAG
GACTCTTTTTGCTTTCTCCTTATATATACTATATTTATAGAAGATATAAAAATTATAGAGGTATATTAAAAAATGAAAAG
AACAAGGGTAATGCAATAAAAGGATTAGCCTATGTTATGATAGGAGGTTTACCACTGATTTTTATATCCAAGTATCTAAT
TTCTACTATAAGCAGTATTGCCAGTGTGTTTAATGTCCAACCATTAATCCTAGCAATACTAATAACTCCTATTGCAGCAG
AGTTAGAGGAAAATTTAACTGCAATAAAGTTGATATCCGATTCGCCATCAAGTGCAACTACAGCATTAATGAATTTTATA
GGCAGTAAATTGGAAAACATGACGCTACTCTTAAGTATAATAGGTATTTCTCAGACAGTTAGTCTTAGACCATCACTTCT
ATACCTTTTATTAATACTAGCTACGAGTCTATTGGCTTTAGGAATAATAAAGGATAGAAACATAAAAGTCAAAGAGGGAT
TATCTCTCTTCGGAATCTATGCAATTCTAATCGCAATTCTACTAAGGTTTTCAGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAATCAATAGTCTATAATTATAAAGGGAAAGGTATTTGGGAATACTTGTAATTTTTTAATTATAGCTTATAGGGAAGTA
AAACATAAATATTAATTAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGGAATTTCGTCACATTTCAGGTACGGTCGCTCTCTTCACTCAAACTTAAATTCTGTATTTTCCTATTTAAAAAATAATG
GTTCACGCTTGCACAAGAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Na(+)/Ca(2+) Exchanging Protein ; Sodium/Calcium Exchanger Protein

Number of amino acids: Translated: 312; Mature: 312

Protein sequence:

>312_residues
MVWFLILQLIVLLILVAFSATLMAKGTRELERSFGKGIAGGLILGFINALPETIIVIQAVLNGFYDIALGSALGGNILLL
TLGIGLISIFYYLKYKSNIITLDSDINIEYSSFLLAVIILGIAIVYGKLNYYIGLFLLSPYIYYIYRRYKNYRGILKNEK
NKGNAIKGLAYVMIGGLPLIFISKYLISTISSIASVFNVQPLILAILITPIAAELEENLTAIKLISDSPSSATTALMNFI
GSKLENMTLLLSIIGISQTVSLRPSLLYLLLILATSLLALGIIKDRNIKVKEGLSLFGIYAILIAILLRFSA

Sequences:

>Translated_312_residues
MVWFLILQLIVLLILVAFSATLMAKGTRELERSFGKGIAGGLILGFINALPETIIVIQAVLNGFYDIALGSALGGNILLL
TLGIGLISIFYYLKYKSNIITLDSDINIEYSSFLLAVIILGIAIVYGKLNYYIGLFLLSPYIYYIYRRYKNYRGILKNEK
NKGNAIKGLAYVMIGGLPLIFISKYLISTISSIASVFNVQPLILAILITPIAAELEENLTAIKLISDSPSSATTALMNFI
GSKLENMTLLLSIIGISQTVSLRPSLLYLLLILATSLLALGIIKDRNIKVKEGLSLFGIYAILIAILLRFSA
>Mature_312_residues
MVWFLILQLIVLLILVAFSATLMAKGTRELERSFGKGIAGGLILGFINALPETIIVIQAVLNGFYDIALGSALGGNILLL
TLGIGLISIFYYLKYKSNIITLDSDINIEYSSFLLAVIILGIAIVYGKLNYYIGLFLLSPYIYYIYRRYKNYRGILKNEK
NKGNAIKGLAYVMIGGLPLIFISKYLISTISSIASVFNVQPLILAILITPIAAELEENLTAIKLISDSPSSATTALMNFI
GSKLENMTLLLSIIGISQTVSLRPSLLYLLLILATSLLALGIIKDRNIKVKEGLSLFGIYAILIAILLRFSA

Specific function: Unknown

COG id: COG0530

COG function: function code P; Ca2+/Na+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 34130; Mature: 34130

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVWFLILQLIVLLILVAFSATLMAKGTRELERSFGKGIAGGLILGFINALPETIIVIQAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNGFYDIALGSALGGNILLLTLGIGLISIFYYLKYKSNIITLDSDINIEYSSFLLAVIIL
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
GIAIVYGKLNYYIGLFLLSPYIYYIYRRYKNYRGILKNEKNKGNAIKGLAYVMIGGLPLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHH
FISKYLISTISSIASVFNVQPLILAILITPIAAELEENLTAIKLISDSPSSATTALMNFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHH
GSKLENMTLLLSIIGISQTVSLRPSLLYLLLILATSLLALGIIKDRNIKVKEGLSLFGIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCHHHHHHH
AILIAILLRFSA
HHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MVWFLILQLIVLLILVAFSATLMAKGTRELERSFGKGIAGGLILGFINALPETIIVIQAV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNGFYDIALGSALGGNILLLTLGIGLISIFYYLKYKSNIITLDSDINIEYSSFLLAVIIL
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
GIAIVYGKLNYYIGLFLLSPYIYYIYRRYKNYRGILKNEKNKGNAIKGLAYVMIGGLPLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHH
FISKYLISTISSIASVFNVQPLILAILITPIAAELEENLTAIKLISDSPSSATTALMNFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHH
GSKLENMTLLLSIIGISQTVSLRPSLLYLLLILATSLLALGIIKDRNIKVKEGLSLFGIY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHCHHHHHHH
AILIAILLRFSA
HHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA