| Definition | Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002754 |
| Length | 2,992,245 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 15899675
Identifier: 15899675
GI number: 15899675
Start: 2709181
End: 2710980
Strand: Direct
Name: 15899675
Synonym: SSO2965
Alternate gene names: NA
Gene position: 2709181-2710980 (Clockwise)
Preceding gene: 15899673
Following gene: 15899682
Centisome position: 90.54
GC content: 32.39
Gene sequence:
>1800_bases TTGATGGATTATGCATTGTTGAGCTTAATGTTACTTTTCACCTTACTACTTGCGTTCATCTTAACTAGGCTAAAGGTCTC GCCAGTTATTGCTTATCTTTTAGGTGGGTTAATATCTTTCAATTATTTTCATTTTGACTTTAACTCTTCATATTTTGAAA TATTAAACTTTCTAGCCCTAAACTTGTTGGCATTCGAGATTGGTACCTCTTTCGATATTTCTAGAGCTAAGGAGTTGTTT AGGAGGGCAATGGGAATTGCGTTGACTGAGTTAATACTTATAGTGTTAATTTCTTACTTCATTGGACTCTATTTACTACA CCTAGACCTATTTGCTTCATTATTCCTTGTAATGGCATCTATAGATACTAGCACTTCCATTTTGTACAAGATAATTGGGA ATAAAGTGGATAAGAACGATAGGGACTTATTAGTGGCAGTAGCTTCAGTTGAAGATATTGAAGTTTTCTTCTTATATTCT ATTGCCATAGCGCTTAACGGTTCCTTTAACGTTTTTAGAATATCGTTTGTAATCCTAGAAGTTTTCATAGCTTCACTGAT AATTTACGCTTTTGCGAAGTATTTTCTCACCGGATTGTCAATATTCAAGTTTACGAGTTTTGAAGATGAGAGTATATTGA TATTAGTACCAATAGTTTTAGTATTTGTATTTGAATATATTTCACAAGTTACTCAAGTCCCAGCTACTTTGACAATGATT TTAGCTGGTATAGCTTTTTCATCAATAAGTGGTAGTGAGAAAGTATTAAGGTATACTGGACCCATAAGGGAATTTTCCTT GATATTCTTTTTCCTTTCAGTAGGGAGTTATTTAAAAATAACTGCGGGTATATCTACATTTGTTTTAATATCCTTCATAA TTCTTGCAATAAAGTACTTTTCATTCAGCACTGCATCTTGGGTTTCCGGGACTACTTTAGTCAAGGCGTTTACTAATGGC TTATACATGTTGCCTTTAAGTGAATTTGGAATAATAGTTTCATTGCAAGCACTACAACAAGGCATAGACATTGCCATAGT CTATTACATTTCAGTAGTGGTTGTATTGGTATCGTCAATAATAGCCTCAATTTTAGCAGTTAGGGTGAACGTTCTTCAAA GAGTTATTGGAATAGTTTACTCCCGTTCATACTTTTTAAGACAACTAGATTCCACAATAATATGGCTCAATAAGACACTT AGTACAAATCTTTCTCCAATATTAAGGTCTGTATTGTTTAGGGGATTTGTAAAGATGTTCTTATATTTAATCCTGCCTTA TGTATTATTTCCTATCATAAACAGTATTGTTAAGAGTATAATTGATCCCATCAACAATTTAATTTTACAGTATTTGCTTT ACTCTGGAGAGATAGTTATTGCCCTCTTTCTCTTATATTTATTCCTATTAGAAGGATCTCGACTATATTCTATTATCAAT AATGAAATATTAGTTAGGATAGTCAGAGTAAGAAGCAGGCTATTTAAAGAGTTTTGGTTTGGACTAACCTCATTCTCTTC AACATTTTATACCATAATACTCACTATTATCTATATTATTTTTGAGATAATTCCTCTATTATACAACTTTCCAATAAGAC TAGTTTTCGTCCCTCTCTTAATAAGCTTATATTTCATTTACAGATATAGAGCCCCTCCCATAACGTATACGCGTATAGAT AATAAGGAGGCAGATAAAATAGTAAAGCTAAGTGTGAAAGTTATCAAGAAAATGAGAAAAAGGAGGAGCAAGAGGAGTAT AATATCAACAACAAAAACAGTAAGGAGAGAATGGTCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTGAGAATATATTTTCTTCAACTCAACAACTTTCATCAAATATAAAATATTCTCTTGGTAGTAAATAAACTTTTAATT TCTCTTAAGGAGTTTGTTGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTCTCATGATATTTTCACAACTATTATATGATAATGAGTAATTAATGTTGAAGATTATCGCCGTGCAAATTAGCCTCT ATTTAGTCACTTTTCGCAAT
Product: Na(+)/H(+) antiporter, putative
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 599; Mature: 599
Protein sequence:
>599_residues MMDYALLSLMLLFTLLLAFILTRLKVSPVIAYLLGGLISFNYFHFDFNSSYFEILNFLALNLLAFEIGTSFDISRAKELF RRAMGIALTELILIVLISYFIGLYLLHLDLFASLFLVMASIDTSTSILYKIIGNKVDKNDRDLLVAVASVEDIEVFFLYS IAIALNGSFNVFRISFVILEVFIASLIIYAFAKYFLTGLSIFKFTSFEDESILILVPIVLVFVFEYISQVTQVPATLTMI LAGIAFSSISGSEKVLRYTGPIREFSLIFFFLSVGSYLKITAGISTFVLISFIILAIKYFSFSTASWVSGTTLVKAFTNG LYMLPLSEFGIIVSLQALQQGIDIAIVYYISVVVVLVSSIIASILAVRVNVLQRVIGIVYSRSYFLRQLDSTIIWLNKTL STNLSPILRSVLFRGFVKMFLYLILPYVLFPIINSIVKSIIDPINNLILQYLLYSGEIVIALFLLYLFLLEGSRLYSIIN NEILVRIVRVRSRLFKEFWFGLTSFSSTFYTIILTIIYIIFEIIPLLYNFPIRLVFVPLLISLYFIYRYRAPPITYTRID NKEADKIVKLSVKVIKKMRKRRSKRSIISTTKTVRREWS
Sequences:
>Translated_599_residues MMDYALLSLMLLFTLLLAFILTRLKVSPVIAYLLGGLISFNYFHFDFNSSYFEILNFLALNLLAFEIGTSFDISRAKELF RRAMGIALTELILIVLISYFIGLYLLHLDLFASLFLVMASIDTSTSILYKIIGNKVDKNDRDLLVAVASVEDIEVFFLYS IAIALNGSFNVFRISFVILEVFIASLIIYAFAKYFLTGLSIFKFTSFEDESILILVPIVLVFVFEYISQVTQVPATLTMI LAGIAFSSISGSEKVLRYTGPIREFSLIFFFLSVGSYLKITAGISTFVLISFIILAIKYFSFSTASWVSGTTLVKAFTNG LYMLPLSEFGIIVSLQALQQGIDIAIVYYISVVVVLVSSIIASILAVRVNVLQRVIGIVYSRSYFLRQLDSTIIWLNKTL STNLSPILRSVLFRGFVKMFLYLILPYVLFPIINSIVKSIIDPINNLILQYLLYSGEIVIALFLLYLFLLEGSRLYSIIN NEILVRIVRVRSRLFKEFWFGLTSFSSTFYTIILTIIYIIFEIIPLLYNFPIRLVFVPLLISLYFIYRYRAPPITYTRID NKEADKIVKLSVKVIKKMRKRRSKRSIISTTKTVRREWS >Mature_599_residues MMDYALLSLMLLFTLLLAFILTRLKVSPVIAYLLGGLISFNYFHFDFNSSYFEILNFLALNLLAFEIGTSFDISRAKELF RRAMGIALTELILIVLISYFIGLYLLHLDLFASLFLVMASIDTSTSILYKIIGNKVDKNDRDLLVAVASVEDIEVFFLYS IAIALNGSFNVFRISFVILEVFIASLIIYAFAKYFLTGLSIFKFTSFEDESILILVPIVLVFVFEYISQVTQVPATLTMI LAGIAFSSISGSEKVLRYTGPIREFSLIFFFLSVGSYLKITAGISTFVLISFIILAIKYFSFSTASWVSGTTLVKAFTNG LYMLPLSEFGIIVSLQALQQGIDIAIVYYISVVVVLVSSIIASILAVRVNVLQRVIGIVYSRSYFLRQLDSTIIWLNKTL STNLSPILRSVLFRGFVKMFLYLILPYVLFPIINSIVKSIIDPINNLILQYLLYSGEIVIALFLLYLFLLEGSRLYSIIN NEILVRIVRVRSRLFKEFWFGLTSFSSTFYTIILTIIYIIFEIIPLLYNFPIRLVFVPLLISLYFIYRYRAPPITYTRID NKEADKIVKLSVKVIKKMRKRRSKRSIISTTKTVRREWS
Specific function: Unknown
COG id: COG0475
COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68432; Mature: 68432
Theoretical pI: Translated: 9.98; Mature: 9.98
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MMDYALLSLMLLFTLLLAFILTRLKVSPVIAYLLGGLISFNYFHFDFNSSYFEILNFLAL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHH NLLAFEIGTSFDISRAKELFRRAMGIALTELILIVLISYFIGLYLLHLDLFASLFLVMAS HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDTSTSILYKIIGNKVDKNDRDLLVAVASVEDIEVFFLYSIAIALNGSFNVFRISFVILE CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH VFIASLIIYAFAKYFLTGLSIFKFTSFEDESILILVPIVLVFVFEYISQVTQVPATLTMI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAGIAFSSISGSEKVLRYTGPIREFSLIFFFLSVGSYLKITAGISTFVLISFIILAIKYF HHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFSTASWVSGTTLVKAFTNGLYMLPLSEFGIIVSLQALQQGIDIAIVYYISVVVVLVSSI CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH IASILAVRVNVLQRVIGIVYSRSYFLRQLDSTIIWLNKTLSTNLSPILRSVLFRGFVKMF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLILPYVLFPIINSIVKSIIDPINNLILQYLLYSGEIVIALFLLYLFLLEGSRLYSIIN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH NEILVRIVRVRSRLFKEFWFGLTSFSSTFYTIILTIIYIIFEIIPLLYNFPIRLVFVPLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH ISLYFIYRYRAPPITYTRIDNKEADKIVKLSVKVIKKMRKRRSKRSIISTTKTVRREWS HHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MMDYALLSLMLLFTLLLAFILTRLKVSPVIAYLLGGLISFNYFHFDFNSSYFEILNFLAL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHH NLLAFEIGTSFDISRAKELFRRAMGIALTELILIVLISYFIGLYLLHLDLFASLFLVMAS HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDTSTSILYKIIGNKVDKNDRDLLVAVASVEDIEVFFLYSIAIALNGSFNVFRISFVILE CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH VFIASLIIYAFAKYFLTGLSIFKFTSFEDESILILVPIVLVFVFEYISQVTQVPATLTMI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAGIAFSSISGSEKVLRYTGPIREFSLIFFFLSVGSYLKITAGISTFVLISFIILAIKYF HHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFSTASWVSGTTLVKAFTNGLYMLPLSEFGIIVSLQALQQGIDIAIVYYISVVVVLVSSI CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH IASILAVRVNVLQRVIGIVYSRSYFLRQLDSTIIWLNKTLSTNLSPILRSVLFRGFVKMF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEECHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LYLILPYVLFPIINSIVKSIIDPINNLILQYLLYSGEIVIALFLLYLFLLEGSRLYSIIN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH NEILVRIVRVRSRLFKEFWFGLTSFSSTFYTIILTIIYIIFEIIPLLYNFPIRLVFVPLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH ISLYFIYRYRAPPITYTRIDNKEADKIVKLSVKVIKKMRKRRSKRSIISTTKTVRREWS HHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA