Definition Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome.
Accession NC_002754
Length 2,992,245

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The map label for this gene is 15898778

Identifier: 15898778

GI number: 15898778

Start: 1794085

End: 1796007

Strand: Direct

Name: 15898778

Synonym: SSO1983

Alternate gene names: NA

Gene position: 1794085-1796007 (Clockwise)

Preceding gene: 15898777

Following gene: 15898779

Centisome position: 59.96

GC content: 46.8

Gene sequence:

>1923_bases
TTGAGGAGAGATGTTGATGAGTCCCTTGGTGATGCTTTAAGGGAATGCGATGTTGATTATTACCTACTCGTTGGTAACGA
AATACCGCCATTAATAATAGGTCTAGTAATAATGGGTCTAGCTTATACACTTGCCTTGACCTTAGCATTCATCGATAGGT
ACAATGAGGCCGTTGCCGAGGTGAATAGGATCCTTAACATCGCCAGGGGTAGGGGCAGTATTTATGACGCTGAGAGTTTT
TATGGTCTTGGGCTAGCCTCAATAATCGCCAACGCCGCCAGGTTAGGCAGGGATGTCAAGCCCGGCGATGCCGATATAGC
ATTGCGCATAGCGTCATTCACTATACAACGTGTTGCATCACCAGACCTCATTAAGTCAGTGCTAGGTGCCTTAGAACCGT
TGCATGGTAAGGCACCACATAGGTACCTCGAACTACTAGCCGCCGCATTGAATATGGAGAACCTCGACCTTATCACAGTT
AGGTACATATTTGATAAGCTGAATGAGATTTTAGACAATTACTGTGATGTGGTTAGGGGGTATGCCTGGTCCCTCGTACA
TGCAATAATTGCCTACGCCAACCTGCTTAGTAGATACTTTGGTCATTTCAATAGTGAGGAAGTTGGGGATATGGTTGGTA
GGGTTGTTGATTTGCTCAATGAGTTGGGTAGGTTCAAGTCCAGCCTGGGCGTCATTGCTCGGGCGGATGCTTTAGCCCCA
GCGTTAGATAGTGAGTATGTGAGGGGGCTTATGAAGGAGAAACTAGGCATTGATGTGGTTGGTAAGGCTAGTGAGATCCT
TGAGGAACTAAACGATATGAGAGAGAGGGTTCAGGAGTTAATGGGCGATAAGGAATTCATGAGCTACATCGAATCCAGGT
CCGTAAAGGCTGATGAGGAGGCAGTTAGGAGATCAATCCTTGAGGCAGCATCGCATCTCAAGCACGCATTGGTGTTTTAT
AGGCTTGATAATAATGAGCTTGATGAGGCGAGGGACCTATTTAACGAGGCAGCTGAGGAGCGTAGGGAGATCGGTGATTA
CGAAGACTACCTAGTTGCACGTAGTTTGGCATTGCGTGTTGAGGCGATTAAGGGCTCGTTGGTTGGCGAAAAGTTGGTTG
ATGGGTTTAGGCAATTGTATGAGGAAGCTTTTAATAAGAAGCGTTTCTCCATGCCCACGGCTAGGTATCTCAGTTTTGCA
TCGGGTATACTTGGTGAGTACCTCGTGTCCCTGGCCCTAACGGGTGATCACGAAACGATAAACAAGTTGCTTGAGGGGCA
TTTGTGGGTGCTGAACGCCGTTAGGAGCGTCTCGGTCCTGACTAGGCTTATGCTCAACGCCCTACTCAGTCCAAGGGGTA
GGTTAAGCAGCGAGCTTAAGGGTAAGCTTAGCGTCAACCCTGAGGAGTTGATTTATGCCTTTGGATATGATAAGCTTCGT
AAGTACCTGCCTGCGTTAAGGGTTGCCCTTGGTATTGCGAAGCCTGAGGTTGGAATTAAGTTGTGTGAAGAGTTTAACGA
TGAAGTTTGCATAGATTTCGTCTTGGCAGTTAAGGGAAACAGTGCTGTTGTTAAACAGTTAAGAGAAGGAGTAATTAATG
CTTTTAACAATTCGCTTAAGGGATTTGGTTTTGACGTTGAGTCGTTGATTAATGAGTTTAGGGGGTTGGTGAGCGGGCTT
GATGGCAGGTCCCTAGTCCAACTAATCGCCCCCTCAAACTCAATGGCTCAGTTAGCCCTAATGCTCCGCGCATTGATTAA
TGGTAATAAGGAACTAGCCAAGGCACACGCACTCTATGGAGCTATTTATTATTCCAGGAAGTTGCTCAGGAGGTTGTACC
TTGAGGTCTATAAGGAGTGTTGCGACTTGGAGAGTGAGTCGTTTAGGCTTGCCTTAGCCAGGCTCTTCTTCTTCCACGTT
TAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGATTTCAGCAATGAGTGCTGGAAGAGGGCCGCGTTAATCATTGGGTATGCCTCGGCTGGGCGTGTTTCAGTGCCTAGGC
ACGAGGACTTACCTTAGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCCTGGGGAGTCAGTCTCGGAGTTCTGGTCTGTTCTCATTGTCTAGTTGGCACGGCTTGTGTAATCGAGGTTGTAGTCAG
GGTGGTGAATTGATGCTTAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 640; Mature: 640

Protein sequence:

>640_residues
MRRDVDESLGDALRECDVDYYLLVGNEIPPLIIGLVIMGLAYTLALTLAFIDRYNEAVAEVNRILNIARGRGSIYDAESF
YGLGLASIIANAARLGRDVKPGDADIALRIASFTIQRVASPDLIKSVLGALEPLHGKAPHRYLELLAAALNMENLDLITV
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SGILGEYLVSLALTGDHETINKLLEGHLWVLNAVRSVSVLTRLMLNALLSPRGRLSSELKGKLSVNPEELIYAFGYDKLR
KYLPALRVALGIAKPEVGIKLCEEFNDEVCIDFVLAVKGNSAVVKQLREGVINAFNNSLKGFGFDVESLINEFRGLVSGL
DGRSLVQLIAPSNSMAQLALMLRALINGNKELAKAHALYGAIYYSRKLLRRLYLEVYKECCDLESESFRLALARLFFFHV

Sequences:

>Translated_640_residues
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YGLGLASIIANAARLGRDVKPGDADIALRIASFTIQRVASPDLIKSVLGALEPLHGKAPHRYLELLAAALNMENLDLITV
RYIFDKLNEILDNYCDVVRGYAWSLVHAIIAYANLLSRYFGHFNSEEVGDMVGRVVDLLNELGRFKSSLGVIARADALAP
ALDSEYVRGLMKEKLGIDVVGKASEILEELNDMRERVQELMGDKEFMSYIESRSVKADEEAVRRSILEAASHLKHALVFY
RLDNNELDEARDLFNEAAEERREIGDYEDYLVARSLALRVEAIKGSLVGEKLVDGFRQLYEEAFNKKRFSMPTARYLSFA
SGILGEYLVSLALTGDHETINKLLEGHLWVLNAVRSVSVLTRLMLNALLSPRGRLSSELKGKLSVNPEELIYAFGYDKLR
KYLPALRVALGIAKPEVGIKLCEEFNDEVCIDFVLAVKGNSAVVKQLREGVINAFNNSLKGFGFDVESLINEFRGLVSGL
DGRSLVQLIAPSNSMAQLALMLRALINGNKELAKAHALYGAIYYSRKLLRRLYLEVYKECCDLESESFRLALARLFFFHV
>Mature_640_residues
MRRDVDESLGDALRECDVDYYLLVGNEIPPLIIGLVIMGLAYTLALTLAFIDRYNEAVAEVNRILNIARGRGSIYDAESF
YGLGLASIIANAARLGRDVKPGDADIALRIASFTIQRVASPDLIKSVLGALEPLHGKAPHRYLELLAAALNMENLDLITV
RYIFDKLNEILDNYCDVVRGYAWSLVHAIIAYANLLSRYFGHFNSEEVGDMVGRVVDLLNELGRFKSSLGVIARADALAP
ALDSEYVRGLMKEKLGIDVVGKASEILEELNDMRERVQELMGDKEFMSYIESRSVKADEEAVRRSILEAASHLKHALVFY
RLDNNELDEARDLFNEAAEERREIGDYEDYLVARSLALRVEAIKGSLVGEKLVDGFRQLYEEAFNKKRFSMPTARYLSFA
SGILGEYLVSLALTGDHETINKLLEGHLWVLNAVRSVSVLTRLMLNALLSPRGRLSSELKGKLSVNPEELIYAFGYDKLR
KYLPALRVALGIAKPEVGIKLCEEFNDEVCIDFVLAVKGNSAVVKQLREGVINAFNNSLKGFGFDVESLINEFRGLVSGL
DGRSLVQLIAPSNSMAQLALMLRALINGNKELAKAHALYGAIYYSRKLLRRLYLEVYKECCDLESESFRLALARLFFFHV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71533; Mature: 71533

Theoretical pI: Translated: 5.40; Mature: 5.40

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRRDVDESLGDALRECDVDYYLLVGNEIPPLIIGLVIMGLAYTLALTLAFIDRYNEAVAE
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VNRILNIARGRGSIYDAESFYGLGLASIIANAARLGRDVKPGDADIALRIASFTIQRVAS
HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
PDLIKSVLGALEPLHGKAPHRYLELLAAALNMENLDLITVRYIFDKLNEILDNYCDVVRG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YAWSLVHAIIAYANLLSRYFGHFNSEEVGDMVGRVVDLLNELGRFKSSLGVIARADALAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDSEYVRGLMKEKLGIDVVGKASEILEELNDMRERVQELMGDKEFMSYIESRSVKADEE
HCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCHHH
AVRRSILEAASHLKHALVFYRLDNNELDEARDLFNEAAEERREIGDYEDYLVARSLALRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
EAIKGSLVGEKLVDGFRQLYEEAFNKKRFSMPTARYLSFASGILGEYLVSLALTGDHETI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
NKLLEGHLWVLNAVRSVSVLTRLMLNALLSPRGRLSSELKGKLSVNPEELIYAFGYDKLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCHHHHH
KYLPALRVALGIAKPEVGIKLCEEFNDEVCIDFVLAVKGNSAVVKQLREGVINAFNNSLK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GFGFDVESLINEFRGLVSGLDGRSLVQLIAPSNSMAQLALMLRALINGNKELAKAHALYG
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
AIYYSRKLLRRLYLEVYKECCDLESESFRLALARLFFFHV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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YAWSLVHAIIAYANLLSRYFGHFNSEEVGDMVGRVVDLLNELGRFKSSLGVIARADALAP
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GFGFDVESLINEFRGLVSGLDGRSLVQLIAPSNSMAQLALMLRALINGNKELAKAHALYG
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
AIYYSRKLLRRLYLEVYKECCDLESESFRLALARLFFFHV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA