| Definition | Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002754 |
| Length | 2,992,245 |
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The map label for this gene is 15898329
Identifier: 15898329
GI number: 15898329
Start: 1352555
End: 1355674
Strand: Reverse
Name: 15898329
Synonym: SSO1500
Alternate gene names: NA
Gene position: 1355674-1352555 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15898332
Following gene: 15898324
Centisome position: 45.31
GC content: 34.94
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GTAAAATAGGGAAGAGGGGTTTGGGCTTCATTGAATTTTCATGAATTTGTATCCAATCCTCAGCCCTTGGGCTTCACCAA AGTCACGGACGTTCATCCCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1039; Mature: 1038
Protein sequence:
>1039_residues MTLYYNMREILKVSEIRRLIRRNKALIGGLPFSGKTTMIKKACEGYCEENGIQFIELPKKFVSIEELNQWKEKVKGVEKA IIEGRSYVIELLLGKVSIADTPSLQSLNLDLTGKVVSMKSLDAIKKIYNSGIRDDKAVSKILMYSTVAVPNYYTVIPKLV NEGIELYNQGKLDKTLEFVLGLKRLYYSFPKGDVSGEDSVIFALQQVVPRDIDFKTAWDELSETWKELVYYRLDSVLKLL PGSAERMINQKEIKPMGDKVNISDIDPFFVGLAEEGVSILLSGENLCIVGPIRSGKSTLANYVYSMANLGNIEVVDYNNY DLLGLKQKLSSESKRFIAVLTEDIYISLPLTCKVINLNTYINDFIKYQYLKENKYIRVGTYEIPRYYYSLYKLKYNMSDD QIIDEYKSDMTKYIINTIFGNNKELIDNYLPLLVLGKRYLPFPPRVSEIILKYFNRQIDETFVKWFSAFDFMGYKIEENK EIKAKENEVLRKVRDELIKEVKEKKLEDDLLKVFFHNLMAFKVAIANLNGFIATAQGRYSPIVEKLLYKPDIVDKLDLDL DRRLPEVCNSLKKIEDEFDKKKDKITIAGFLLLPEKLKEEKLTSYRLSIDYYASIYRILSSKGADIECLRRAFRVLKLFE TYFSDIFTYSKFENKIYSTALTTRDEELIRDYLKITFMHFVRYSIAYINKEHLERIAEISDYAKLGVKPILIPYEILAED LPIEKIGDPVDIYASLITFLYIEKLYSEIQKIDLFSRSYQYIEILYEKFTKSQRSISDKILSTIFDVAFSMWWDRRDLIL KYINDLVGFCGIKAGISTFYSYGKKSDFEKALEYVNMIINSRYAIISKEGKNTEEITKMLFDIYKVRLASALLASRYEYK TVLQDIMELQSKANIINDRSIRENIRLAYLISKLLLYKEVEETIPMSRKLILYKAALALMGGEKEKEEFFKEVESRRIGR RPITDIERVLPRLLTKEYLIPVLKAYFYLKGKGIEMTELDDYLENETIGIPMLVTNKIFDKIYAKENRNKFIASLILFI
Sequences:
>Translated_1039_residues MTLYYNMREILKVSEIRRLIRRNKALIGGLPFSGKTTMIKKACEGYCEENGIQFIELPKKFVSIEELNQWKEKVKGVEKA IIEGRSYVIELLLGKVSIADTPSLQSLNLDLTGKVVSMKSLDAIKKIYNSGIRDDKAVSKILMYSTVAVPNYYTVIPKLV NEGIELYNQGKLDKTLEFVLGLKRLYYSFPKGDVSGEDSVIFALQQVVPRDIDFKTAWDELSETWKELVYYRLDSVLKLL PGSAERMINQKEIKPMGDKVNISDIDPFFVGLAEEGVSILLSGENLCIVGPIRSGKSTLANYVYSMANLGNIEVVDYNNY DLLGLKQKLSSESKRFIAVLTEDIYISLPLTCKVINLNTYINDFIKYQYLKENKYIRVGTYEIPRYYYSLYKLKYNMSDD QIIDEYKSDMTKYIINTIFGNNKELIDNYLPLLVLGKRYLPFPPRVSEIILKYFNRQIDETFVKWFSAFDFMGYKIEENK EIKAKENEVLRKVRDELIKEVKEKKLEDDLLKVFFHNLMAFKVAIANLNGFIATAQGRYSPIVEKLLYKPDIVDKLDLDL DRRLPEVCNSLKKIEDEFDKKKDKITIAGFLLLPEKLKEEKLTSYRLSIDYYASIYRILSSKGADIECLRRAFRVLKLFE TYFSDIFTYSKFENKIYSTALTTRDEELIRDYLKITFMHFVRYSIAYINKEHLERIAEISDYAKLGVKPILIPYEILAED LPIEKIGDPVDIYASLITFLYIEKLYSEIQKIDLFSRSYQYIEILYEKFTKSQRSISDKILSTIFDVAFSMWWDRRDLIL KYINDLVGFCGIKAGISTFYSYGKKSDFEKALEYVNMIINSRYAIISKEGKNTEEITKMLFDIYKVRLASALLASRYEYK TVLQDIMELQSKANIINDRSIRENIRLAYLISKLLLYKEVEETIPMSRKLILYKAALALMGGEKEKEEFFKEVESRRIGR RPITDIERVLPRLLTKEYLIPVLKAYFYLKGKGIEMTELDDYLENETIGIPMLVTNKIFDKIYAKENRNKFIASLILFI >Mature_1038_residues TLYYNMREILKVSEIRRLIRRNKALIGGLPFSGKTTMIKKACEGYCEENGIQFIELPKKFVSIEELNQWKEKVKGVEKAI IEGRSYVIELLLGKVSIADTPSLQSLNLDLTGKVVSMKSLDAIKKIYNSGIRDDKAVSKILMYSTVAVPNYYTVIPKLVN EGIELYNQGKLDKTLEFVLGLKRLYYSFPKGDVSGEDSVIFALQQVVPRDIDFKTAWDELSETWKELVYYRLDSVLKLLP GSAERMINQKEIKPMGDKVNISDIDPFFVGLAEEGVSILLSGENLCIVGPIRSGKSTLANYVYSMANLGNIEVVDYNNYD LLGLKQKLSSESKRFIAVLTEDIYISLPLTCKVINLNTYINDFIKYQYLKENKYIRVGTYEIPRYYYSLYKLKYNMSDDQ IIDEYKSDMTKYIINTIFGNNKELIDNYLPLLVLGKRYLPFPPRVSEIILKYFNRQIDETFVKWFSAFDFMGYKIEENKE IKAKENEVLRKVRDELIKEVKEKKLEDDLLKVFFHNLMAFKVAIANLNGFIATAQGRYSPIVEKLLYKPDIVDKLDLDLD RRLPEVCNSLKKIEDEFDKKKDKITIAGFLLLPEKLKEEKLTSYRLSIDYYASIYRILSSKGADIECLRRAFRVLKLFET YFSDIFTYSKFENKIYSTALTTRDEELIRDYLKITFMHFVRYSIAYINKEHLERIAEISDYAKLGVKPILIPYEILAEDL PIEKIGDPVDIYASLITFLYIEKLYSEIQKIDLFSRSYQYIEILYEKFTKSQRSISDKILSTIFDVAFSMWWDRRDLILK YINDLVGFCGIKAGISTFYSYGKKSDFEKALEYVNMIINSRYAIISKEGKNTEEITKMLFDIYKVRLASALLASRYEYKT VLQDIMELQSKANIINDRSIRENIRLAYLISKLLLYKEVEETIPMSRKLILYKAALALMGGEKEKEEFFKEVESRRIGRR PITDIERVLPRLLTKEYLIPVLKAYFYLKGKGIEMTELDDYLENETIGIPMLVTNKIFDKIYAKENRNKFIASLILFI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 121125; Mature: 120994
Theoretical pI: Translated: 8.82; Mature: 8.82
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTLYYNMREILKVSEIRRLIRRNKALIGGLPFSGKTTMIKKACEGYCEENGIQFIELPKK CEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH FVSIEELNQWKEKVKGVEKAIIEGRSYVIELLLGKVSIADTPSLQSLNLDLTGKVVSMKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCEEHHHH LDAIKKIYNSGIRDDKAVSKILMYSTVAVPNYYTVIPKLVNEGIELYNQGKLDKTLEFVL HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH GLKRLYYSFPKGDVSGEDSVIFALQQVVPRDIDFKTAWDELSETWKELVYYRLDSVLKLL HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PGSAERMINQKEIKPMGDKVNISDIDPFFVGLAEEGVSILLSGENLCIVGPIRSGKSTLA CCCHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECCCCCCHHHHH NYVYSMANLGNIEVVDYNNYDLLGLKQKLSSESKRFIAVLTEDIYISLPLTCKVINLNTY HHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEEECCEEEEEEHHHH INDFIKYQYLKENKYIRVGTYEIPRYYYSLYKLKYNMSDDQIIDEYKSDMTKYIINTIFG HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NNKELIDNYLPLLVLGKRYLPFPPRVSEIILKYFNRQIDETFVKWFSAFDFMGYKIEENK CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC EIKAKENEVLRKVRDELIKEVKEKKLEDDLLKVFFHNLMAFKVAIANLNGFIATAQGRYS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHH PIVEKLLYKPDIVDKLDLDLDRRLPEVCNSLKKIEDEFDKKKDKITIAGFLLLPEKLKEE HHHHHHHCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCHHHHHH KLTSYRLSIDYYASIYRILSSKGADIECLRRAFRVLKLFETYFSDIFTYSKFENKIYSTA HHHHHEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTTRDEELIRDYLKITFMHFVRYSIAYINKEHLERIAEISDYAKLGVKPILIPYEILAED HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCC LPIEKIGDPVDIYASLITFLYIEKLYSEIQKIDLFSRSYQYIEILYEKFTKSQRSISDKI CCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSTIFDVAFSMWWDRRDLILKYINDLVGFCGIKAGISTFYSYGKKSDFEKALEYVNMIIN HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHC SRYAIISKEGKNTEEITKMLFDIYKVRLASALLASRYEYKTVLQDIMELQSKANIINDRS CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH IRENIRLAYLISKLLLYKEVEETIPMSRKLILYKAALALMGGEKEKEEFFKEVESRRIGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC RPITDIERVLPRLLTKEYLIPVLKAYFYLKGKGIEMTELDDYLENETIGIPMLVTNKIFD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH KIYAKENRNKFIASLILFI HHHHHCCCHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure TLYYNMREILKVSEIRRLIRRNKALIGGLPFSGKTTMIKKACEGYCEENGIQFIELPKK EEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH FVSIEELNQWKEKVKGVEKAIIEGRSYVIELLLGKVSIADTPSLQSLNLDLTGKVVSMKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCEEHHHH LDAIKKIYNSGIRDDKAVSKILMYSTVAVPNYYTVIPKLVNEGIELYNQGKLDKTLEFVL HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH GLKRLYYSFPKGDVSGEDSVIFALQQVVPRDIDFKTAWDELSETWKELVYYRLDSVLKLL HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PGSAERMINQKEIKPMGDKVNISDIDPFFVGLAEEGVSILLSGENLCIVGPIRSGKSTLA CCCHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECCCCCCHHHHH NYVYSMANLGNIEVVDYNNYDLLGLKQKLSSESKRFIAVLTEDIYISLPLTCKVINLNTY HHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEEECCEEEEEEHHHH INDFIKYQYLKENKYIRVGTYEIPRYYYSLYKLKYNMSDDQIIDEYKSDMTKYIINTIFG HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NNKELIDNYLPLLVLGKRYLPFPPRVSEIILKYFNRQIDETFVKWFSAFDFMGYKIEENK CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC EIKAKENEVLRKVRDELIKEVKEKKLEDDLLKVFFHNLMAFKVAIANLNGFIATAQGRYS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHH PIVEKLLYKPDIVDKLDLDLDRRLPEVCNSLKKIEDEFDKKKDKITIAGFLLLPEKLKEE HHHHHHHCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHCCHHHHHH KLTSYRLSIDYYASIYRILSSKGADIECLRRAFRVLKLFETYFSDIFTYSKFENKIYSTA HHHHHEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LTTRDEELIRDYLKITFMHFVRYSIAYINKEHLERIAEISDYAKLGVKPILIPYEILAED HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCC LPIEKIGDPVDIYASLITFLYIEKLYSEIQKIDLFSRSYQYIEILYEKFTKSQRSISDKI CCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSTIFDVAFSMWWDRRDLILKYINDLVGFCGIKAGISTFYSYGKKSDFEKALEYVNMIIN HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHC SRYAIISKEGKNTEEITKMLFDIYKVRLASALLASRYEYKTVLQDIMELQSKANIINDRS CCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH IRENIRLAYLISKLLLYKEVEETIPMSRKLILYKAALALMGGEKEKEEFFKEVESRRIGR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC RPITDIERVLPRLLTKEYLIPVLKAYFYLKGKGIEMTELDDYLENETIGIPMLVTNKIFD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH KIYAKENRNKFIASLILFI HHHHHCCCHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA