| Definition | Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002754 |
| Length | 2,992,245 |
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The map label for this gene is 15898230
Identifier: 15898230
GI number: 15898230
Start: 1228221
End: 1231316
Strand: Direct
Name: 15898230
Synonym: SSO1388
Alternate gene names: NA
Gene position: 1228221-1231316 (Clockwise)
Preceding gene: 15898229
Following gene: 15898232
Centisome position: 41.05
GC content: 30.04
Gene sequence:
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>100_bases AATCCCGAGATGCTATATAAATTTAGAACCCATTAGACTAATTTGTCCCAGACTCCACTAACCACAATGCTTTAATTCTA TGTTTAAACATGAATTTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTTCTATATTTTAATAAATTATAATGGAAATAATAGTTGTCCTTCCTCAGTCTCATCGAGCTGGTCTGAATTAAGGAG TCACACTCTTCTTTTCCATA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1031; Mature: 1031
Protein sequence:
>1031_residues MRRIFKAEQIEEMLSNRNKVFIGGLPFSGKTTLINKFYNKHKNEEIQFIELPKKFNSTDELNEWKNKIKGIRRGIIEGRT YIIELLLGKVSIATTPSLQSPYLDFRGNAVSMRSIDAIKRIYKNGIKDDKVVSKILMYSTITTPNYFTIIPKLVNEGIEL YKQGKLDKVLEIVLGVKRLYSSFPKIDINGEDSITYALGSVLPRNIDFKTAWSELSETWKELVYYRLDSALRLLPGSAEK IIGQKDIKPLGDKVEVVDIEPFFVDLVEWGKSIILDGNNLCIVGPLRSAKSSLANYIYSMVNSKDVSLLDYNNYDLLSLD KKIKSENKKYIAVLTDDIFYSIPVECKVIESRSYIKDFIDYLYLKNNVRRVKGANPNVPIHYYYLYKLKYNMSDEQIYNE YKSDMNKYITNTIFGNNKELINNYLSLLILGKKYLLLPVKVSEIVLNSLNKQIDKTFINWFSVFDFTDYDVDANEEMEKA VYEALYKVREELIRVVKENRFEEDLLKVYFDAISRYPTDNDTRIDEFIKTGYGHYSPIVYLLLYNPDIIEEFNWDLGERV NQACSSLKSLEDIIWKGITSSKDIVDKLLEEVMNFAEYKPSNYASIYEILSSENVNIECLRKAFNILKWYISTLDDRLVF LKFENKLYNVILKTKDDKLINYYLKMSFKGTTRSAIYINPEHISKIAEISDNARLEALPLVILNKAINDEKEIDKIIDPI ETYAALLAIMRLEIDAIAEGKIETIIKYYRYLDELYDKFVKKDVRKIDEKVLFTLYDIAFDLNVNEKREILDFLAEEKEF VDSGYGLIMFYYYKVKDNLKEVLDYITTLIEPYYNLLIKIRRMYNDEDVYELFEAYKIKLAKTLITSRYDYKLVLQDIID LLSKANISDRALKRRILGAYYISKFLLYGEAKKIKVRGPEEILYRVALALTGNEEMKKEFYKTVENMEINDKLIVENLDY TLENLASNDYLIPILEIYFYLKGDNEKLSKVMKYVEKELLGVPTFILHKLFNEINVKGNRNKYIASLILFI
Sequences:
>Translated_1031_residues MRRIFKAEQIEEMLSNRNKVFIGGLPFSGKTTLINKFYNKHKNEEIQFIELPKKFNSTDELNEWKNKIKGIRRGIIEGRT YIIELLLGKVSIATTPSLQSPYLDFRGNAVSMRSIDAIKRIYKNGIKDDKVVSKILMYSTITTPNYFTIIPKLVNEGIEL YKQGKLDKVLEIVLGVKRLYSSFPKIDINGEDSITYALGSVLPRNIDFKTAWSELSETWKELVYYRLDSALRLLPGSAEK IIGQKDIKPLGDKVEVVDIEPFFVDLVEWGKSIILDGNNLCIVGPLRSAKSSLANYIYSMVNSKDVSLLDYNNYDLLSLD KKIKSENKKYIAVLTDDIFYSIPVECKVIESRSYIKDFIDYLYLKNNVRRVKGANPNVPIHYYYLYKLKYNMSDEQIYNE YKSDMNKYITNTIFGNNKELINNYLSLLILGKKYLLLPVKVSEIVLNSLNKQIDKTFINWFSVFDFTDYDVDANEEMEKA VYEALYKVREELIRVVKENRFEEDLLKVYFDAISRYPTDNDTRIDEFIKTGYGHYSPIVYLLLYNPDIIEEFNWDLGERV NQACSSLKSLEDIIWKGITSSKDIVDKLLEEVMNFAEYKPSNYASIYEILSSENVNIECLRKAFNILKWYISTLDDRLVF LKFENKLYNVILKTKDDKLINYYLKMSFKGTTRSAIYINPEHISKIAEISDNARLEALPLVILNKAINDEKEIDKIIDPI ETYAALLAIMRLEIDAIAEGKIETIIKYYRYLDELYDKFVKKDVRKIDEKVLFTLYDIAFDLNVNEKREILDFLAEEKEF VDSGYGLIMFYYYKVKDNLKEVLDYITTLIEPYYNLLIKIRRMYNDEDVYELFEAYKIKLAKTLITSRYDYKLVLQDIID LLSKANISDRALKRRILGAYYISKFLLYGEAKKIKVRGPEEILYRVALALTGNEEMKKEFYKTVENMEINDKLIVENLDY TLENLASNDYLIPILEIYFYLKGDNEKLSKVMKYVEKELLGVPTFILHKLFNEINVKGNRNKYIASLILFI >Mature_1031_residues MRRIFKAEQIEEMLSNRNKVFIGGLPFSGKTTLINKFYNKHKNEEIQFIELPKKFNSTDELNEWKNKIKGIRRGIIEGRT YIIELLLGKVSIATTPSLQSPYLDFRGNAVSMRSIDAIKRIYKNGIKDDKVVSKILMYSTITTPNYFTIIPKLVNEGIEL YKQGKLDKVLEIVLGVKRLYSSFPKIDINGEDSITYALGSVLPRNIDFKTAWSELSETWKELVYYRLDSALRLLPGSAEK IIGQKDIKPLGDKVEVVDIEPFFVDLVEWGKSIILDGNNLCIVGPLRSAKSSLANYIYSMVNSKDVSLLDYNNYDLLSLD KKIKSENKKYIAVLTDDIFYSIPVECKVIESRSYIKDFIDYLYLKNNVRRVKGANPNVPIHYYYLYKLKYNMSDEQIYNE YKSDMNKYITNTIFGNNKELINNYLSLLILGKKYLLLPVKVSEIVLNSLNKQIDKTFINWFSVFDFTDYDVDANEEMEKA VYEALYKVREELIRVVKENRFEEDLLKVYFDAISRYPTDNDTRIDEFIKTGYGHYSPIVYLLLYNPDIIEEFNWDLGERV NQACSSLKSLEDIIWKGITSSKDIVDKLLEEVMNFAEYKPSNYASIYEILSSENVNIECLRKAFNILKWYISTLDDRLVF LKFENKLYNVILKTKDDKLINYYLKMSFKGTTRSAIYINPEHISKIAEISDNARLEALPLVILNKAINDEKEIDKIIDPI ETYAALLAIMRLEIDAIAEGKIETIIKYYRYLDELYDKFVKKDVRKIDEKVLFTLYDIAFDLNVNEKREILDFLAEEKEF VDSGYGLIMFYYYKVKDNLKEVLDYITTLIEPYYNLLIKIRRMYNDEDVYELFEAYKIKLAKTLITSRYDYKLVLQDIID LLSKANISDRALKRRILGAYYISKFLLYGEAKKIKVRGPEEILYRVALALTGNEEMKKEFYKTVENMEINDKLIVENLDY TLENLASNDYLIPILEIYFYLKGDNEKLSKVMKYVEKELLGVPTFILHKLFNEINVKGNRNKYIASLILFI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 120699; Mature: 120699
Theoretical pI: Translated: 6.07; Mature: 6.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRRIFKAEQIEEMLSNRNKVFIGGLPFSGKTTLINKFYNKHKNEEIQFIELPKKFNSTDE CCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHCCCCHH LNEWKNKIKGIRRGIIEGRTYIIELLLGKVSIATTPSLQSPYLDFRGNAVSMRSIDAIKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHH IYKNGIKDDKVVSKILMYSTITTPNYFTIIPKLVNEGIELYKQGKLDKVLEIVLGVKRLY HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH SSFPKIDINGEDSITYALGSVLPRNIDFKTAWSELSETWKELVYYRLDSALRLLPGSAEK HCCCCEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH IIGQKDIKPLGDKVEVVDIEPFFVDLVEWGKSIILDGNNLCIVGPLRSAKSSLANYIYSM HCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH VNSKDVSLLDYNNYDLLSLDKKIKSENKKYIAVLTDDIFYSIPVECKVIESRSYIKDFID HCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEECCCEEEEECCHHHHHHHHH YLYLKNNVRRVKGANPNVPIHYYYLYKLKYNMSDEQIYNEYKSDMNKYITNTIFGNNKEL HHHHHCCHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH INNYLSLLILGKKYLLLPVKVSEIVLNSLNKQIDKTFINWFSVFDFTDYDVDANEEMEKA HHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH VYEALYKVREELIRVVKENRFEEDLLKVYFDAISRYPTDNDTRIDEFIKTGYGHYSPIVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEE LLLYNPDIIEEFNWDLGERVNQACSSLKSLEDIIWKGITSSKDIVDKLLEEVMNFAEYKP EEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SNYASIYEILSSENVNIECLRKAFNILKWYISTLDDRLVFLKFENKLYNVILKTKDDKLI CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCHHE NYYLKMSFKGTTRSAIYINPEHISKIAEISDNARLEALPLVILNKAINDEKEIDKIIDPI EEEEEEEECCCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ETYAALLAIMRLEIDAIAEGKIETIIKYYRYLDELYDKFVKKDVRKIDEKVLFTLYDIAF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE DLNVNEKREILDFLAEEKEFVDSGYGLIMFYYYKVKDNLKEVLDYITTLIEPYYNLLIKI ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RRMYNDEDVYELFEAYKIKLAKTLITSRYDYKLVLQDIIDLLSKANISDRALKRRILGAY HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH YISKFLLYGEAKKIKVRGPEEILYRVALALTGNEEMKKEFYKTVENMEINDKLIVENLDY HHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHH TLENLASNDYLIPILEIYFYLKGDNEKLSKVMKYVEKELLGVPTFILHKLFNEINVKGNR HHHHHCCCCCEEEEEHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC NKYIASLILFI HHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MRRIFKAEQIEEMLSNRNKVFIGGLPFSGKTTLINKFYNKHKNEEIQFIELPKKFNSTDE CCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHCCCCHH LNEWKNKIKGIRRGIIEGRTYIIELLLGKVSIATTPSLQSPYLDFRGNAVSMRSIDAIKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHH IYKNGIKDDKVVSKILMYSTITTPNYFTIIPKLVNEGIELYKQGKLDKVLEIVLGVKRLY HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH SSFPKIDINGEDSITYALGSVLPRNIDFKTAWSELSETWKELVYYRLDSALRLLPGSAEK HCCCCEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH IIGQKDIKPLGDKVEVVDIEPFFVDLVEWGKSIILDGNNLCIVGPLRSAKSSLANYIYSM HCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH VNSKDVSLLDYNNYDLLSLDKKIKSENKKYIAVLTDDIFYSIPVECKVIESRSYIKDFID HCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEEECCCEEEEECCHHHHHHHHH YLYLKNNVRRVKGANPNVPIHYYYLYKLKYNMSDEQIYNEYKSDMNKYITNTIFGNNKEL HHHHHCCHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH INNYLSLLILGKKYLLLPVKVSEIVLNSLNKQIDKTFINWFSVFDFTDYDVDANEEMEKA HHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH VYEALYKVREELIRVVKENRFEEDLLKVYFDAISRYPTDNDTRIDEFIKTGYGHYSPIVY HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEE LLLYNPDIIEEFNWDLGERVNQACSSLKSLEDIIWKGITSSKDIVDKLLEEVMNFAEYKP EEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC SNYASIYEILSSENVNIECLRKAFNILKWYISTLDDRLVFLKFENKLYNVILKTKDDKLI CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCHHE NYYLKMSFKGTTRSAIYINPEHISKIAEISDNARLEALPLVILNKAINDEKEIDKIIDPI EEEEEEEECCCCCEEEEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH ETYAALLAIMRLEIDAIAEGKIETIIKYYRYLDELYDKFVKKDVRKIDEKVLFTLYDIAF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE DLNVNEKREILDFLAEEKEFVDSGYGLIMFYYYKVKDNLKEVLDYITTLIEPYYNLLIKI ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RRMYNDEDVYELFEAYKIKLAKTLITSRYDYKLVLQDIIDLLSKANISDRALKRRILGAY HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH YISKFLLYGEAKKIKVRGPEEILYRVALALTGNEEMKKEFYKTVENMEINDKLIVENLDY HHHHHHHHCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHH TLENLASNDYLIPILEIYFYLKGDNEKLSKVMKYVEKELLGVPTFILHKLFNEINVKGNR HHHHHCCCCCEEEEEHEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCC NKYIASLILFI HHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA