| Definition | Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002754 |
| Length | 2,992,245 |
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The map label for this gene is 15897310
Identifier: 15897310
GI number: 15897310
Start: 319315
End: 320832
Strand: Direct
Name: 15897310
Synonym: SSO0376
Alternate gene names: NA
Gene position: 319315-320832 (Clockwise)
Preceding gene: 15897308
Following gene: 15897311
Centisome position: 10.67
GC content: 32.28
Gene sequence:
>1518_bases ATGGTATCATTGCTTCTGATTTCCTTGTTATATCTAGGAATAATGTTGATAGCTGCTAAGATATCTGAGGAGATATTCAG AAGAATTGGTTTAGTAACTTTTGTTGGCCCTATATTAATGGGCATTCTACTTGGAAACGGTGTATTTGGAGTCATACAGA TTAATGAGATTATCTCATTTATTACATCTCTTGGTATAGTTTTTCTATTATTCTTGGCTGGAGCTGAAGAGTTTAACGTC GAAAATAGACCTAATGCTAACGTATTTCTAGCGGTGATATTAGAGTCAATTATACCATTTTCGGTAATACTCGTTGCGAT CTATATTATAGGCTTTAAGAACTACCTAATTCTCATAGTCCCATTAGCAATGAGTAGTGCTGGTCCCTTATCCAGAATGC TGATGGACGTTAAGATTTCTGATAACAGAATTTCTAACTTAATTTTCCAACAAGTAATCTTAATAGAAATAATTTTTGTG ATATTGTTTGCAATACTCTTAAAGACTAGTGAAATTCTGATTACAATAATTGAAATTTTCTTGGTATTCGCATTTACGAT AATGTTTGGTAGAACTTTAGCTAAGATTCTAGAGAAAATAGAGTATTATTTTAAGGCGAGAGAAATAGAGTTTGCCTCGC TTATTGCAATAATTTTAATCATAGGTTATTTAGCAGAATTATACAAATTTAATTCAGCCATATCAGCCTTTTTCCTGGGT ATATTATTAAAGGATTATTTAAAAGATAGGCCAGAATTACTGGAGAGGCTTCACGCATTTACATATGGATTCTTTGAACC ATTATTCTTTTTAGGTATAGGCTTATATGTTACTAAAATTAACGCATCCATTATTCTTTTTAGCTTGCTCTTCTTCTCAC TAATAATTGCTTCTAAATTCCTTGCCGGCTTTATTTCATCGAAGATTCTAAATATTAAGGGGAAGATAAATGGATTTGCA ACTAGCGTAAAAGGAGGAGTTGATTCATCACTATTGCTTACTGGACTAACTTTAGGGTATATAAACGAATTCATGTACTC GTTTTCAATTTTAGCGATTTCGCTTTCAGCATTAATAGTTCCCCTCCTATTTCAAATTAATTTTAAAATTAGTAATAAAA TTTCAGAGAGTAAAAAGGTGAAACTCTCTCAAGAGGTAATTAAGCTTCAGATAAAGCCACTTTACGCTTCATGTGAAGAG AACTTGAGATCGGTAATTAGTAAAATTAGTGAAAGAGGTGTTAGGGGAATAGTTGTTGTAAATTATGAGAATAAACCTCT AGGTTATGTTTCAATACAAACTTTACTTGAAATTGACCCCGAACTATATGAGAGTACTAAAGCTTGCGAGGTACCACTGG ATGAGGTTCCAATAGAATACGATAACGTGAAAGTTATAGATCTTCTAAGAAAATTTAGGGAAACTGAGAAACCGGTAATA GCAATTATAAATAAGGAAGGAGTCTTAGTCACTACAGTATATGAAAGAGAACTGGCGAGGTTTTTAATTTCCTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GGTGGAGAGCCTAGATCAAGCTTCACATATTATATGTAGTAGGATTAAGTCTCAAAAGGATAAACTCTTAATAATTAGGG TATTACTTACTTAGCTTATT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCATTAAGATCTTATGACAGTTTGGTATACTGGAACTGGTGATAAGGGTAAGACGAAATTACCTTCAGTTGGCGAGATTT GGAAGGATGATGATATTGTA
Product: Na(+)/H(+) antiporter
Products: NA
Alternate protein names: MjNapA [H]
Number of amino acids: Translated: 505; Mature: 505
Protein sequence:
>505_residues MVSLLLISLLYLGIMLIAAKISEEIFRRIGLVTFVGPILMGILLGNGVFGVIQINEIISFITSLGIVFLLFLAGAEEFNV ENRPNANVFLAVILESIIPFSVILVAIYIIGFKNYLILIVPLAMSSAGPLSRMLMDVKISDNRISNLIFQQVILIEIIFV ILFAILLKTSEILITIIEIFLVFAFTIMFGRTLAKILEKIEYYFKAREIEFASLIAIILIIGYLAELYKFNSAISAFFLG ILLKDYLKDRPELLERLHAFTYGFFEPLFFLGIGLYVTKINASIILFSLLFFSLIIASKFLAGFISSKILNIKGKINGFA TSVKGGVDSSLLLTGLTLGYINEFMYSFSILAISLSALIVPLLFQINFKISNKISESKKVKLSQEVIKLQIKPLYASCEE NLRSVISKISERGVRGIVVVNYENKPLGYVSIQTLLEIDPELYESTKACEVPLDEVPIEYDNVKVIDLLRKFRETEKPVI AIINKEGVLVTTVYERELARFLISF
Sequences:
>Translated_505_residues MVSLLLISLLYLGIMLIAAKISEEIFRRIGLVTFVGPILMGILLGNGVFGVIQINEIISFITSLGIVFLLFLAGAEEFNV ENRPNANVFLAVILESIIPFSVILVAIYIIGFKNYLILIVPLAMSSAGPLSRMLMDVKISDNRISNLIFQQVILIEIIFV ILFAILLKTSEILITIIEIFLVFAFTIMFGRTLAKILEKIEYYFKAREIEFASLIAIILIIGYLAELYKFNSAISAFFLG ILLKDYLKDRPELLERLHAFTYGFFEPLFFLGIGLYVTKINASIILFSLLFFSLIIASKFLAGFISSKILNIKGKINGFA TSVKGGVDSSLLLTGLTLGYINEFMYSFSILAISLSALIVPLLFQINFKISNKISESKKVKLSQEVIKLQIKPLYASCEE NLRSVISKISERGVRGIVVVNYENKPLGYVSIQTLLEIDPELYESTKACEVPLDEVPIEYDNVKVIDLLRKFRETEKPVI AIINKEGVLVTTVYERELARFLISF >Mature_505_residues MVSLLLISLLYLGIMLIAAKISEEIFRRIGLVTFVGPILMGILLGNGVFGVIQINEIISFITSLGIVFLLFLAGAEEFNV ENRPNANVFLAVILESIIPFSVILVAIYIIGFKNYLILIVPLAMSSAGPLSRMLMDVKISDNRISNLIFQQVILIEIIFV ILFAILLKTSEILITIIEIFLVFAFTIMFGRTLAKILEKIEYYFKAREIEFASLIAIILIIGYLAELYKFNSAISAFFLG ILLKDYLKDRPELLERLHAFTYGFFEPLFFLGIGLYVTKINASIILFSLLFFSLIIASKFLAGFISSKILNIKGKINGFA TSVKGGVDSSLLLTGLTLGYINEFMYSFSILAISLSALIVPLLFQINFKISNKISESKKVKLSQEVIKLQIKPLYASCEE NLRSVISKISERGVRGIVVVNYENKPLGYVSIQTLLEIDPELYESTKACEVPLDEVPIEYDNVKVIDLLRKFRETEKPVI AIINKEGVLVTTVYERELARFLISF
Specific function: This is probably a Na(+)/H(+) antiporter [H]
COG id: COG0475
COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006153 [H]
Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56672; Mature: 56672
Theoretical pI: Translated: 8.09; Mature: 8.09
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVSLLLISLLYLGIMLIAAKISEEIFRRIGLVTFVGPILMGILLGNGVFGVIQINEIISF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHH ITSLGIVFLLFLAGAEEFNVENRPNANVFLAVILESIIPFSVILVAIYIIGFKNYLILIV HHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE PLAMSSAGPLSRMLMDVKISDNRISNLIFQQVILIEIIFVILFAILLKTSEILITIIEIF EHHCCCCCCHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVFAFTIMFGRTLAKILEKIEYYFKAREIEFASLIAIILIIGYLAELYKFNSAISAFFLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILLKDYLKDRPELLERLHAFTYGFFEPLFFLGIGLYVTKINASIILFSLLFFSLIIASKF HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAGFISSKILNIKGKINGFATSVKGGVDSSLLLTGLTLGYINEFMYSFSILAISLSALIV HHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLLFQINFKISNKISESKKVKLSQEVIKLQIKPLYASCEENLRSVISKISERGVRGIVVV HHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE NYENKPLGYVSIQTLLEIDPELYESTKACEVPLDEVPIEYDNVKVIDLLRKFRETEKPVI EECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE AIINKEGVLVTTVYERELARFLISF EEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MVSLLLISLLYLGIMLIAAKISEEIFRRIGLVTFVGPILMGILLGNGVFGVIQINEIISF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHH ITSLGIVFLLFLAGAEEFNVENRPNANVFLAVILESIIPFSVILVAIYIIGFKNYLILIV HHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE PLAMSSAGPLSRMLMDVKISDNRISNLIFQQVILIEIIFVILFAILLKTSEILITIIEIF EHHCCCCCCHHHHHHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVFAFTIMFGRTLAKILEKIEYYFKAREIEFASLIAIILIIGYLAELYKFNSAISAFFLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILLKDYLKDRPELLERLHAFTYGFFEPLFFLGIGLYVTKINASIILFSLLFFSLIIASKF HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAGFISSKILNIKGKINGFATSVKGGVDSSLLLTGLTLGYINEFMYSFSILAISLSALIV HHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLLFQINFKISNKISESKKVKLSQEVIKLQIKPLYASCEENLRSVISKISERGVRGIVVV HHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEE NYENKPLGYVSIQTLLEIDPELYESTKACEVPLDEVPIEYDNVKVIDLLRKFRETEKPVI EECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEE AIINKEGVLVTTVYERELARFLISF EEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]