Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15927070

Identifier: 15927070

GI number: 15927070

Start: 1527514

End: 1529676

Strand: Reverse

Name: 15927070

Synonym: SA1320

Alternate gene names: NA

Gene position: 1529676-1527514 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15927071

Following gene: 15927069

Centisome position: 54.34

GC content: 29.68

Gene sequence:

>2163_bases
ATGAATAAAATTAATGATAGAGACTTAACAGAATTGAGTAGTTACTGGGTTTATCAAGACATCAATAAAGATAATGATTT
TACAGTTAACGGAAAAAGATTTAAGCAGGTTGATGAATATAATGATAATGGAAATAAAAATAAAAAAGGTGCCTCAGATT
TAAAAATTTATGAATTGTTGGATGAAAAAGGAAAACCAACTGGTGAACAAACCATGATTTATCAAGGAACATCTAATGAG
GCAATAAACCCTAATAATCCATTAAAATCTTTAGATATCGGAGATGATTGGTTACAAAATGCGAAATTAATGGATAATAG
TAATAAGTCAACGGATTATCTTAAGCAATCAGACGAATTTGCAGATTTATATAGAGACAAACTAAATGACGCTAATAAAT
TAAGTAAGTATAACTTTACACAAAAATATGGTGTTAGTCCAAATAATTACAAAAACAAAACCATTGTGGCGGATGGCGGT
AATTCGGAAGGCGGTGCAGGAGCAAAATATCAAGGAGCGAAACATCCAAATGAAAAAGTTGTTGCTACTGACCCAGCAAT
GGTACCTTATGCTGCTTGGCAGAAATTTGCTAGACCACGCTTTGATAATATGATTAGTTTTAATAGTACCAACGATTTAT
TAACATGGTTACAAGATCCATTCATCAAAGATATGCCAGGAAAACGCGTTAACATTAGTGATGGTGTGCCCAGGTTAGAT
GCTTTAATAGACAGCCATGTAGGTTATAAAAGGAAGTTAAATAGAAAAGACAACACATACGATACTGTACCACTAATCAA
AATTAAGTCGGTAAAAGATACAGAAATTAAAAATGGAAAAAAAGTAAAAAAGACTATTAACATAACATTAGATATGGATG
GGCGAATTCCGATAAATGTTTGGACAGGGGATTCGATTGCACGTTCTGGAAGAGGAACTTTAATTAAACTTAATTTAGAA
AATCTTGATGCGTTGAGTAAACTGATTACTGGTGAAACTAGTGGTATGTTAGCAGAATGCGTAATCTTTTTAAATGAAAG
TTTTAACATCTCAGAAAATGAAAATAAAAATTTTGCAGATAGAAAGCAACAATTATCAGAAGGATTTAAGGATAAGATTA
ACTTATTTCAATTAGAAGAAATGGAAAGAACTTTAATTAGTAAAATAAACTCACTTGAAGAAGTTGCAGATGAAACAATA
GAAAGTATTAGTGCTGTTAAACACTTATTACCTGATTTTGCATTGGATGCATTAAAAGAAAGAATTAATGAGTTGTTTAA
AGGTATAAAATCTTTTATAGAAAAAGTGTATGATAGTATAGATAATGAAATTTTAGAAATTTTCAAAAATATAGATCACG
ACTTCAGAGATGGAGTATCTGAAGAAATGATGAAACATTTGAAAGTAGTGAAACAGAATATAGAGCGAATAAAAAATCAA
AATGATATTTATGGTAGGCAAATTGCAGAAATTAGAAGTATTATGAAACAACAAGATGCAACAATTTTAGATGGGAATTT
CCAAATTAATTGTAGCGGCGAAAATATGGTACAGGGTCTAGTTATACCTTCTAATTATTTAGGAAGAAAAATGAAAATAT
TAAAAGACCATATCGATGATGGTATTAAAAAAATAGCAGACTATGTTCAAAGTATATATGATGAATATGCATCGAAAATT
GTTGATGTAATAAAATATTTGATTAATACAATTCCCAAAATACGTAAGAATTTAAGACATGCAATTGAAATGTTAAATGT
AAAAAAGAAAGAATTTTTGTCCCTGATTCCTAATGTAACTTGTAATTATATTAAAACTAAATTAGAAGAATTAGATAATA
CTTTAGGCAAATGGGAGCCATTTCTTAATGATTTAAAAGCAGTGTCACCAATTTTAGATAACCATTTAGATGATATTGTT
AAGAACATGAAGCCTTTGATTGTACAGATGTTATTTGAACCATCACATTATGATGATATGTTTATTTTAAACACACAAGC
TCATGCACGTCTTGATCAAATGGCACAACAGTTTGAAGTTGTTTGTAATGGCTTGAACGAAAATGAAGGACAAGCAATTC
AAACGATGGATCAATCTGCCTCTCTAATACGGTCAAACTTAATTCAAGTTAAAGAACAATTAGAAAAACTAGCTGTATAC
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAAGAATACTATAACTACTCAATTAGGAAATAAACTTATTGGCACAAAAAAAGCTCGTTTTGATGATAAGAAAGTAGT
GTCGTTTGGAGCATTTGAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAATTTATTAAATGCTACTTGTTTTCTTTGAGAATAAGTAGTTTTTTTAACATAAAAGTTTTACAAACACATAAATGGG
TGATGAGCTATGTTTAAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720

Protein sequence:

>720_residues
MNKINDRDLTELSSYWVYQDINKDNDFTVNGKRFKQVDEYNDNGNKNKKGASDLKIYELLDEKGKPTGEQTMIYQGTSNE
AINPNNPLKSLDIGDDWLQNAKLMDNSNKSTDYLKQSDEFADLYRDKLNDANKLSKYNFTQKYGVSPNNYKNKTIVADGG
NSEGGAGAKYQGAKHPNEKVVATDPAMVPYAAWQKFARPRFDNMISFNSTNDLLTWLQDPFIKDMPGKRVNISDGVPRLD
ALIDSHVGYKRKLNRKDNTYDTVPLIKIKSVKDTEIKNGKKVKKTINITLDMDGRIPINVWTGDSIARSGRGTLIKLNLE
NLDALSKLITGETSGMLAECVIFLNESFNISENENKNFADRKQQLSEGFKDKINLFQLEEMERTLISKINSLEEVADETI
ESISAVKHLLPDFALDALKERINELFKGIKSFIEKVYDSIDNEILEIFKNIDHDFRDGVSEEMMKHLKVVKQNIERIKNQ
NDIYGRQIAEIRSIMKQQDATILDGNFQINCSGENMVQGLVIPSNYLGRKMKILKDHIDDGIKKIADYVQSIYDEYASKI
VDVIKYLINTIPKIRKNLRHAIEMLNVKKKEFLSLIPNVTCNYIKTKLEELDNTLGKWEPFLNDLKAVSPILDNHLDDIV
KNMKPLIVQMLFEPSHYDDMFILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY

Sequences:

>Translated_720_residues
MNKINDRDLTELSSYWVYQDINKDNDFTVNGKRFKQVDEYNDNGNKNKKGASDLKIYELLDEKGKPTGEQTMIYQGTSNE
AINPNNPLKSLDIGDDWLQNAKLMDNSNKSTDYLKQSDEFADLYRDKLNDANKLSKYNFTQKYGVSPNNYKNKTIVADGG
NSEGGAGAKYQGAKHPNEKVVATDPAMVPYAAWQKFARPRFDNMISFNSTNDLLTWLQDPFIKDMPGKRVNISDGVPRLD
ALIDSHVGYKRKLNRKDNTYDTVPLIKIKSVKDTEIKNGKKVKKTINITLDMDGRIPINVWTGDSIARSGRGTLIKLNLE
NLDALSKLITGETSGMLAECVIFLNESFNISENENKNFADRKQQLSEGFKDKINLFQLEEMERTLISKINSLEEVADETI
ESISAVKHLLPDFALDALKERINELFKGIKSFIEKVYDSIDNEILEIFKNIDHDFRDGVSEEMMKHLKVVKQNIERIKNQ
NDIYGRQIAEIRSIMKQQDATILDGNFQINCSGENMVQGLVIPSNYLGRKMKILKDHIDDGIKKIADYVQSIYDEYASKI
VDVIKYLINTIPKIRKNLRHAIEMLNVKKKEFLSLIPNVTCNYIKTKLEELDNTLGKWEPFLNDLKAVSPILDNHLDDIV
KNMKPLIVQMLFEPSHYDDMFILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY
>Mature_720_residues
MNKINDRDLTELSSYWVYQDINKDNDFTVNGKRFKQVDEYNDNGNKNKKGASDLKIYELLDEKGKPTGEQTMIYQGTSNE
AINPNNPLKSLDIGDDWLQNAKLMDNSNKSTDYLKQSDEFADLYRDKLNDANKLSKYNFTQKYGVSPNNYKNKTIVADGG
NSEGGAGAKYQGAKHPNEKVVATDPAMVPYAAWQKFARPRFDNMISFNSTNDLLTWLQDPFIKDMPGKRVNISDGVPRLD
ALIDSHVGYKRKLNRKDNTYDTVPLIKIKSVKDTEIKNGKKVKKTINITLDMDGRIPINVWTGDSIARSGRGTLIKLNLE
NLDALSKLITGETSGMLAECVIFLNESFNISENENKNFADRKQQLSEGFKDKINLFQLEEMERTLISKINSLEEVADETI
ESISAVKHLLPDFALDALKERINELFKGIKSFIEKVYDSIDNEILEIFKNIDHDFRDGVSEEMMKHLKVVKQNIERIKNQ
NDIYGRQIAEIRSIMKQQDATILDGNFQINCSGENMVQGLVIPSNYLGRKMKILKDHIDDGIKKIADYVQSIYDEYASKI
VDVIKYLINTIPKIRKNLRHAIEMLNVKKKEFLSLIPNVTCNYIKTKLEELDNTLGKWEPFLNDLKAVSPILDNHLDDIV
KNMKPLIVQMLFEPSHYDDMFILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82295; Mature: 82295

Theoretical pI: Translated: 5.95; Mature: 5.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKINDRDLTELSSYWVYQDINKDNDFTVNGKRFKQVDEYNDNGNKNKKGASDLKIYELL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
DEKGKPTGEQTMIYQGTSNEAINPNNPLKSLDIGDDWLQNAKLMDNSNKSTDYLKQSDEF
HHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
ADLYRDKLNDANKLSKYNFTQKYGVSPNNYKNKTIVADGGNSEGGAGAKYQGAKHPNEKV
HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCE
VATDPAMVPYAAWQKFARPRFDNMISFNSTNDLLTWLQDPFIKDMPGKRVNISDGVPRLD
EECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHCCHHHCCCCCEEECCCCCHHHH
ALIDSHVGYKRKLNRKDNTYDTVPLIKIKSVKDTEIKNGKKVKKTINITLDMDGRIPINV
HHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEE
WTGDSIARSGRGTLIKLNLENLDALSKLITGETSGMLAECVIFLNESFNISENENKNFAD
ECCCHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHH
RKQQLSEGFKDKINLFQLEEMERTLISKINSLEEVADETIESISAVKHLLPDFALDALKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RINELFKGIKSFIEKVYDSIDNEILEIFKNIDHDFRDGVSEEMMKHLKVVKQNIERIKNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NDIYGRQIAEIRSIMKQQDATILDGNFQINCSGENMVQGLVIPSNYLGRKMKILKDHIDD
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEEECCCCHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
GIKKIADYVQSIYDEYASKIVDVIKYLINTIPKIRKNLRHAIEMLNVKKKEFLSLIPNVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCH
CNYIKTKLEELDNTLGKWEPFLNDLKAVSPILDNHLDDIVKNMKPLIVQMLFEPSHYDDM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
FILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNKINDRDLTELSSYWVYQDINKDNDFTVNGKRFKQVDEYNDNGNKNKKGASDLKIYELL
CCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
DEKGKPTGEQTMIYQGTSNEAINPNNPLKSLDIGDDWLQNAKLMDNSNKSTDYLKQSDEF
HHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
ADLYRDKLNDANKLSKYNFTQKYGVSPNNYKNKTIVADGGNSEGGAGAKYQGAKHPNEKV
HHHHHHHCCCHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCE
VATDPAMVPYAAWQKFARPRFDNMISFNSTNDLLTWLQDPFIKDMPGKRVNISDGVPRLD
EECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHCCHHHCCCCCEEECCCCCHHHH
ALIDSHVGYKRKLNRKDNTYDTVPLIKIKSVKDTEIKNGKKVKKTINITLDMDGRIPINV
HHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEE
WTGDSIARSGRGTLIKLNLENLDALSKLITGETSGMLAECVIFLNESFNISENENKNFAD
ECCCHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHH
RKQQLSEGFKDKINLFQLEEMERTLISKINSLEEVADETIESISAVKHLLPDFALDALKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RINELFKGIKSFIEKVYDSIDNEILEIFKNIDHDFRDGVSEEMMKHLKVVKQNIERIKNQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NDIYGRQIAEIRSIMKQQDATILDGNFQINCSGENMVQGLVIPSNYLGRKMKILKDHIDD
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCEEEEECCCCHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
GIKKIADYVQSIYDEYASKIVDVIKYLINTIPKIRKNLRHAIEMLNVKKKEFLSLIPNVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCH
CNYIKTKLEELDNTLGKWEPFLNDLKAVSPILDNHLDDIVKNMKPLIVQMLFEPSHYDDM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
FILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY
EEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA