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The map label for this gene is nrfE [H]

Identifier: 15601892

GI number: 15601892

Start: 23544

End: 25469

Strand: Direct

Name: nrfE [H]

Synonym: PM0027

Alternate gene names: 15601892

Gene position: 23544-25469 (Clockwise)

Preceding gene: 15601891

Following gene: 15601893

Centisome position: 1.04

GC content: 42.58

Gene sequence:

>1926_bases
ATGATCCCAGAACTTGGTTTTTTGGCTTTACTGATCGCTTCTTTGTGTGCGTTCTTGCTTGCGCTAGTGCCACAAGTCGG
CATTTTTTTGCGTAAGCCGTATATGATTGGTACTGCGTGGAATTTGAGTTATCTCTTTGGGATATTTACCTGTATAGCGT
TATTCTGCCTTGCCTATGCCTTTGCACTCGATGATTTTTCTGTGCAATATGTGGCACATCATTCTAATTCACAACTGCCA
ATTTTCTTTAAAGTGTCTGCTACTTGGGGTGGACATGAAGGGTCGATGCTATTTTGGTTGTTTGCTTTAGCACTCTGGTT
GATGCTCTTTGCGTTTTCCAGTCGTCATAAAGATCCGATTATTTGTGCGCGTGCACTTTCAGTGCTTGGGCTCATTTGTT
TTGGTTTTTGTCTCTTTATTTTATTTTTATCAAATCCATTTGAACGCAGTTTTCCACAAGCATTTGAAGGGCGTGATTTA
AATCCGATGTTGCAAGATGTGGGGCTGATTTTTCATCCGCCTTTATTGTATTTGGGCTATGTGGGCTTTGCCGTCAATTT
TGCTATTACCATTTCTGCTTTAGTGAGTGGGCATTTAGATGCCGCCGTGGCTCGCATGATGCGCCCTTGGGTTTTGCTAT
CTTGGTTATTTTTAACTTTAGGGATTGTGTTAGGGTCTTGGTGGGCGTATTACGAACTAGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTT
TGGGATCCGGTCGAAAACGCCTCATTGATGCCTTGGTTATTAGGTTTGGCATTATTACATAGTCTATCTATCACAGAACA
GCGTGGCATTTTTAGTTACTGGACGCTGCTATTTTCACTTTTGGCATTTTCTTTCAGTTTACTGGGTACCTTCATCGTGC
GCTCGGGCGTCTTAACTTCTGTGCACGCGTTTGCAGTAGATGGTGATCGGGGAATTGCCTTACTGATTTTATTCTTTTTG
TTGACTGTGAGTGCATTCACTTTATTTGCATTAAAGGTTAACTTGCCACAAAGTGCGGTACGTTTCCGTTTAATTTCGAA
GGAAAATGCCCTGTTGCTTCTCAATATTTTATTGACGATTGCCACGGTCAGTGTCTTTTTAGGCACTTTTTATCCGATTG
TCTTTACCGCATTACAATGGGGATCTATTTCAGTCGGCGCGCCGTATTTTAATACAATTTTTCTGCCACTGTTTGTGATG
GCAATGCTTGCTATGATTTTGGTGTTGTCTTTACGTTGGAAAACACTGAATAAAAAACCGTTTATTCAACGTACGTTATT
GTTATTTCCCGCGCTTATATTGGCTTATGGATTAATCCGTTATTATGTAGATCATAACCAAGGGTTGCCTTTCAATTTCA
GCGCTTATGGCTTGTTAAGCTTGTCGATTTGGTTAATTCTGGCGACGTTATGGCTCCCATGGACGCAGCTGAAACTGAAA
CAGCTCGCCATGGTGATCGCGCATTTAGGTGTAGCGATAACGGCAATTGGGGCGATCATGAGTAGCTATTACAGCAGTGA
GATTGGCGTGCGCTTGGCACCGCAACAACGCCAAAAACTCGGTGATTACGAGTTTCACTATCAGGGTTTTCAGCATGTGT
TAGGTCCGAATTACACCAGTGAAAAAGCCCATTTTGTGGTGACAAAGCAAAACCAAGCTTATGCTGAGATTTACCCAGAA
CGCCGTTATTATGATGTGCGTACTATGAACATGAGCGAAGTTGGGATTGATTGGGGATGGCTTGGTGATGTCTATATTGT
AATGGGCGATAAATTGGGACAAGGCGAATTTACTTTCCGCTTGCAATATAAACCTTTTATCCGTTGGTTATGGTTTGGCG
GGCTTTTAATGGCACTAGGCGCCTTGCTTGCCATATTTTCCTTGCGCAATAGCAATAAACTAAAACCACGTCGTCAATCA
GATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGCAGGACAAATGACGCTAGCATAAATGCTTCATTTTATGAGAAGGCGAACCTAAGTTCGCCTTTTTGATACAGCTTTT
CAAATTTGTTTATATTCACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAACAGGTGAGAGTATGAGTATGCTACATCAGCAAAAAAGAAAAAATCACTTTGTATTTTTACCGCTTGTGATCCTGT
TAGCCGTATGCGCTTTATTA

Product: NrfE

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 641; Mature: 641

Protein sequence:

>641_residues
MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYAFALDDFSVQYVAHHSNSQLP
IFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPIICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDL
NPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTSVHAFAVDGDRGIALLILFFL
LTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTIATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVM
AMLAMILVLSLRWKTLNKKPFIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK
QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTSEKAHFVVTKQNQAYAEIYPE
RRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFRLQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLRNSNKLKPRRQS
D

Sequences:

>Translated_641_residues
MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYAFALDDFSVQYVAHHSNSQLP
IFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPIICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDL
NPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTSVHAFAVDGDRGIALLILFFL
LTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTIATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVM
AMLAMILVLSLRWKTLNKKPFIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK
QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTSEKAHFVVTKQNQAYAEIYPE
RRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFRLQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLRNSNKLKPRRQS
D
>Mature_641_residues
MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYAFALDDFSVQYVAHHSNSQLP
IFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPIICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDL
NPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTSVHAFAVDGDRGIALLILFFL
LTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTIATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVM
AMLAMILVLSLRWKTLNKKPFIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK
QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTSEKAHFVVTKQNQAYAEIYPE
RRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFRLQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLRNSNKLKPRRQS
D

Specific function: Required for the biogenesis of c-type cytochromes. Possible subunit of a heme lyase [H]

COG id: COG1138

COG function: function code O; Cytochrome c biogenesis factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ccmF/cycK/ccl1/nrfE/ccsA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788524, Length=649, Percent_Identity=43.9137134052388, Blast_Score=498, Evalue=1e-142,
Organism=Escherichia coli, GI1790511, Length=577, Percent_Identity=38.9948006932409, Blast_Score=346, Evalue=3e-96,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002541
- InterPro:   IPR003567
- InterPro:   IPR003568
- InterPro:   IPR003570
- InterPro:   IPR017563 [H]

Pfam domain/function: PF01578 Cytochrom_C_asm [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 72617; Mature: 72617

Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALDDFSVQYVAHHSNSQLPIFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPI
HHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDLNPMLQDVGLIFHPPLLYLGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHCCHHHCCHHHHHHH
VGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEECCCCEEE
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTS
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VHAFAVDGDRGIALLILFFLLTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTI
HHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
ATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVMAMLAMILVLSLRWKTLNKKP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
FIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
EKAHFVVTKQNQAYAEIYPERRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFR
CCCEEEEEECCCHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEE
LQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLRNSNKLKPRRQSD
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALDDFSVQYVAHHSNSQLPIFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPI
HHHCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDLNPMLQDVGLIFHPPLLYLGY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHCCCCCCHHHHHCCHHHCCHHHHHHH
VGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHEEECCCCEEE
WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTS
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VHAFAVDGDRGIALLILFFLLTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTI
HHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
ATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVMAMLAMILVLSLRWKTLNKKP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
FIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
EKAHFVVTKQNQAYAEIYPERRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFR
CCCEEEEEECCCHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEE
LQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLRNSNKLKPRRQSD
EECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]