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The map label for this gene is ywdD

Identifier: 15674141

GI number: 15674141

Start: 2234286

End: 2236409

Strand: Reverse

Name: ywdD

Synonym: L19128

Alternate gene names: 15674141

Gene position: 2236409-2234286 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15674142

Following gene: 15674140

Centisome position: 94.54

GC content: 32.11

Gene sequence:

>2124_bases
ATGATTAATTACCTAAAAAATCCACTGTTCCTGACTTGGATGCTTACCAACAAATGTAATTTAAGGTGTAAATTTTGTTA
TTTGGAAGATTATCAAGGAAAAGAGTTGGAGCTTGATGAAATAAATCAGGTCCTAGATATTATACAAGATAAAGAATTTA
CCCAAGTTTCTCTATTGGGCGGTGAACCGACAGAATGTGAGTACTTTGAATATATTATTATTCAACTAGAAAAATTGAGA
ATTTCATACTCATTTTCAACTAATGGTCAAAAACTATTTAGAAATGAAGAGTTAATTAGAATACTTTCTAAATCCAAATA
TTTAAAAGAGGTTCAAATTTCTTTAGAGTCTCCCCAAAAGTTAATCAATGACGCAGTCAGAGGGAAAGGAACATTTGAAA
GTGCAATAAAAAGTGTAGCACTATTAGTAAAAGAGAATGTTCCTACACGGCTTGCTATGGTCGTGACAAAAGAAAATAAT
TCTACCATTCAACAAATGATTGATATGTGTGCCACATTAGGGTGTAGAGAATTGCGATTAATGCCATTTATGCCCATGGG
AACGGGATTATTAGAAAAAGAACGCCTATTCATGGATTATGAAGGTTTAGTTCGAGCATGCTCAGATTTAAAAATACCAG
ATAATCTAATTGTCACAACTTACCTAAAAGAAGAGAATACCGCTGAAACTTTAGGTTGTGGTGCTGGAACAACTGCCTGC
GTTATAAATAGTGACTTGACACTTTCAGCCTGTCCTGTAGTATCTCAAACCCAAAAATCTATCGAAAAATTAGGTAACGA
TGGTTCAAGTTTTGATTACATATGGGGAACAAGTTCGATTTTTAATATATGGAGAGCGGGAAAATATCGAAAATCAACCT
CGTGTAACTTATGTCCGCTATTTGAGGAATGTGGGGGGGTACCAATGACTCAATTTTTCAATGGTCAGAAAATTTTATTC
ATAAATAGAATACTTTTTGATGATGCATTTATAACGGTTGTAGAGGTTATATTTTTCAGTGTGTATTTAAAGCTTTCTTT
TTCAGATTTTTCAAGTATTATGGGCTTATGTTTGTTAATTTCGTTGTTAGTTCAGATTCCAACAGGTTACTTATCCGATA
AGTTCGATAGGAAATTAATGTTAGTATTAGGAAATGGTGCGGAAATTGTGTGTCTTATAACTTTACTTTTTCTTCCTAGT
TTGATAAAAGGCTCTTTATTTATTCCAGTTTTAATTATAGAAATTATAAGAACAGGCATGTTGGCTTTAGCGAGTGGTAT
TTTTGAAGTGTTAATATTTAATATGTTTAAGAGAGAAGGAAAAACTGAAAAAGATTTTATGGAGAAATCAGCCTCATATT
TTTCCATAGGAGCGATTATAGCAGCAATTTCTGGATTTGTTTCCACGGTTCTATTTTCCTATCTAGTGATTTTGCCACTT
ATATTGGATTTATCGATAAAAATCATCAAATTATTATCTGCTATTTTCATGTGTTCTGAAGCGATACATAAAGAAATGAC
AAAAATAAAAATGAAAGTAAAGTCCTTAAATCATAAATTGTTATTTCTCTTGTTCTCGCTTGCCCTTTTATTTTGTATTT
CAAGGGGGACATTTTCTTTATACCAACCAGTTATGACTTCATTAGGTATTCCTCTTTATTATTATGGCCTACTTATTATG
ATAGTGAACCTGTCGATATTCGTTCTTTTGAGAGTTTTGAAAAAGAAAGTATCGCTGTTCAAACTTTCAACATTACTCCT
TGTTTCTTTTGCGGTTCTTACTTTTCAAGGAGTATTGGTAATTGAACATTTTATACCAGGAAATCTTTTTCGTTTTTTGA
TTGTAGCGATAATATTTTCAAGTATGCAGATTATCAGACTATTTTCAGAAGGACTCTCCTCTTATTTTATCAACACCGCG
ATTAAGGATAGAGACGATAAAACAACTATTTTTTCTCTTTATTCTACAATGGCCCAGCTTTTACTATCTGCTTCTTTCTT
CCTGATGGGTGTTGTTCAAGGGGGAGTTGATAACTATTTGATGACCTATTTATATATTAGTGCAATTTTTGTCCTAATTA
TTATGGCTTTAGGTATCTTTGGAAAGGGGAAAAAATATGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTGGCATATATTCCAAAAGAAAATTTCCACCCAATTTTATATGTTAAGATACAGATAATAAAAATTATCTGTATTTTT
TTATAGATTGGAGAAGTAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATGACGAACTTTTTTTACCAATTAAGGTGTATATATATTTAACTAATCATTGTCATTACGAATGTGATTACTGCTTCC
TTAAAGAAATGAAGATGTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 707; Mature: 707

Protein sequence:

>707_residues
MINYLKNPLFLTWMLTNKCNLRCKFCYLEDYQGKELELDEINQVLDIIQDKEFTQVSLLGGEPTECEYFEYIIIQLEKLR
ISYSFSTNGQKLFRNEELIRILSKSKYLKEVQISLESPQKLINDAVRGKGTFESAIKSVALLVKENVPTRLAMVVTKENN
STIQQMIDMCATLGCRELRLMPFMPMGTGLLEKERLFMDYEGLVRACSDLKIPDNLIVTTYLKEENTAETLGCGAGTTAC
VINSDLTLSACPVVSQTQKSIEKLGNDGSSFDYIWGTSSIFNIWRAGKYRKSTSCNLCPLFEECGGVPMTQFFNGQKILF
INRILFDDAFITVVEVIFFSVYLKLSFSDFSSIMGLCLLISLLVQIPTGYLSDKFDRKLMLVLGNGAEIVCLITLLFLPS
LIKGSLFIPVLIIEIIRTGMLALASGIFEVLIFNMFKREGKTEKDFMEKSASYFSIGAIIAAISGFVSTVLFSYLVILPL
ILDLSIKIIKLLSAIFMCSEAIHKEMTKIKMKVKSLNHKLLFLLFSLALLFCISRGTFSLYQPVMTSLGIPLYYYGLLIM
IVNLSIFVLLRVLKKKVSLFKLSTLLLVSFAVLTFQGVLVIEHFIPGNLFRFLIVAIIFSSMQIIRLFSEGLSSYFINTA
IKDRDDKTTIFSLYSTMAQLLLSASFFLMGVVQGGVDNYLMTYLYISAIFVLIIMALGIFGKGKKYV

Sequences:

>Translated_707_residues
MINYLKNPLFLTWMLTNKCNLRCKFCYLEDYQGKELELDEINQVLDIIQDKEFTQVSLLGGEPTECEYFEYIIIQLEKLR
ISYSFSTNGQKLFRNEELIRILSKSKYLKEVQISLESPQKLINDAVRGKGTFESAIKSVALLVKENVPTRLAMVVTKENN
STIQQMIDMCATLGCRELRLMPFMPMGTGLLEKERLFMDYEGLVRACSDLKIPDNLIVTTYLKEENTAETLGCGAGTTAC
VINSDLTLSACPVVSQTQKSIEKLGNDGSSFDYIWGTSSIFNIWRAGKYRKSTSCNLCPLFEECGGVPMTQFFNGQKILF
INRILFDDAFITVVEVIFFSVYLKLSFSDFSSIMGLCLLISLLVQIPTGYLSDKFDRKLMLVLGNGAEIVCLITLLFLPS
LIKGSLFIPVLIIEIIRTGMLALASGIFEVLIFNMFKREGKTEKDFMEKSASYFSIGAIIAAISGFVSTVLFSYLVILPL
ILDLSIKIIKLLSAIFMCSEAIHKEMTKIKMKVKSLNHKLLFLLFSLALLFCISRGTFSLYQPVMTSLGIPLYYYGLLIM
IVNLSIFVLLRVLKKKVSLFKLSTLLLVSFAVLTFQGVLVIEHFIPGNLFRFLIVAIIFSSMQIIRLFSEGLSSYFINTA
IKDRDDKTTIFSLYSTMAQLLLSASFFLMGVVQGGVDNYLMTYLYISAIFVLIIMALGIFGKGKKYV
>Mature_707_residues
MINYLKNPLFLTWMLTNKCNLRCKFCYLEDYQGKELELDEINQVLDIIQDKEFTQVSLLGGEPTECEYFEYIIIQLEKLR
ISYSFSTNGQKLFRNEELIRILSKSKYLKEVQISLESPQKLINDAVRGKGTFESAIKSVALLVKENVPTRLAMVVTKENN
STIQQMIDMCATLGCRELRLMPFMPMGTGLLEKERLFMDYEGLVRACSDLKIPDNLIVTTYLKEENTAETLGCGAGTTAC
VINSDLTLSACPVVSQTQKSIEKLGNDGSSFDYIWGTSSIFNIWRAGKYRKSTSCNLCPLFEECGGVPMTQFFNGQKILF
INRILFDDAFITVVEVIFFSVYLKLSFSDFSSIMGLCLLISLLVQIPTGYLSDKFDRKLMLVLGNGAEIVCLITLLFLPS
LIKGSLFIPVLIIEIIRTGMLALASGIFEVLIFNMFKREGKTEKDFMEKSASYFSIGAIIAAISGFVSTVLFSYLVILPL
ILDLSIKIIKLLSAIFMCSEAIHKEMTKIKMKVKSLNHKLLFLLFSLALLFCISRGTFSLYQPVMTSLGIPLYYYGLLIM
IVNLSIFVLLRVLKKKVSLFKLSTLLLVSFAVLTFQGVLVIEHFIPGNLFRFLIVAIIFSSMQIIRLFSEGLSSYFINTA
IKDRDDKTTIFSLYSTMAQLLLSASFFLMGVVQGGVDNYLMTYLYISAIFVLIIMALGIFGKGKKYV

Specific function: Required for production of the bacteriocin subtilosin. May activate a metalloenzyme that catalyzes a modification of prosubtilosin [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006638
- InterPro:   IPR008792
- InterPro:   IPR007197 [H]

Pfam domain/function: PF05402 PqqD; PF04055 Radical_SAM [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 79703; Mature: 79703

Theoretical pI: Translated: 8.35; Mature: 8.35

Prosite motif: PS01305 MOAA_NIFB_PQQE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINYLKNPLFLTWMLTNKCNLRCKFCYLEDYQGKELELDEINQVLDIIQDKEFTQVSLLG
CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEC
GEPTECEYFEYIIIQLEKLRISYSFSTNGQKLFRNEELIRILSKSKYLKEVQISLESPQK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
LINDAVRGKGTFESAIKSVALLVKENVPTRLAMVVTKENNSTIQQMIDMCATLGCRELRL
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHC
MPFMPMGTGLLEKERLFMDYEGLVRACSDLKIPDNLIVTTYLKEENTAETLGCGAGTTAC
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCEEE
VINSDLTLSACPVVSQTQKSIEKLGNDGSSFDYIWGTSSIFNIWRAGKYRKSTSCNLCPL
EEECCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
FEECGGVPMTQFFNGQKILFINRILFDDAFITVVEVIFFSVYLKLSFSDFSSIMGLCLLI
HHHHCCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLLVQIPTGYLSDKFDRKLMLVLGNGAEIVCLITLLFLPSLIKGSLFIPVLIIEIIRTGM
HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LALASGIFEVLIFNMFKREGKTEKDFMEKSASYFSIGAIIAAISGFVSTVLFSYLVILPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILDLSIKIIKLLSAIFMCSEAIHKEMTKIKMKVKSLNHKLLFLLFSLALLFCISRGTFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
YQPVMTSLGIPLYYYGLLIMIVNLSIFVLLRVLKKKVSLFKLSTLLLVSFAVLTFQGVLV
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IEHFIPGNLFRFLIVAIIFSSMQIIRLFSEGLSSYFINTAIKDRDDKTTIFSLYSTMAQL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LLSASFFLMGVVQGGVDNYLMTYLYISAIFVLIIMALGIFGKGKKYV
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MINYLKNPLFLTWMLTNKCNLRCKFCYLEDYQGKELELDEINQVLDIIQDKEFTQVSLLG
CCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEC
GEPTECEYFEYIIIQLEKLRISYSFSTNGQKLFRNEELIRILSKSKYLKEVQISLESPQK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
LINDAVRGKGTFESAIKSVALLVKENVPTRLAMVVTKENNSTIQQMIDMCATLGCRELRL
HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHC
MPFMPMGTGLLEKERLFMDYEGLVRACSDLKIPDNLIVTTYLKEENTAETLGCGAGTTAC
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHCCCCCCEEE
VINSDLTLSACPVVSQTQKSIEKLGNDGSSFDYIWGTSSIFNIWRAGKYRKSTSCNLCPL
EEECCCCEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
FEECGGVPMTQFFNGQKILFINRILFDDAFITVVEVIFFSVYLKLSFSDFSSIMGLCLLI
HHHHCCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLLVQIPTGYLSDKFDRKLMLVLGNGAEIVCLITLLFLPSLIKGSLFIPVLIIEIIRTGM
HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LALASGIFEVLIFNMFKREGKTEKDFMEKSASYFSIGAIIAAISGFVSTVLFSYLVILPL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILDLSIKIIKLLSAIFMCSEAIHKEMTKIKMKVKSLNHKLLFLLFSLALLFCISRGTFSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
YQPVMTSLGIPLYYYGLLIMIVNLSIFVLLRVLKKKVSLFKLSTLLLVSFAVLTFQGVLV
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IEHFIPGNLFRFLIVAIIFSSMQIIRLFSEGLSSYFINTAIKDRDDKTTIFSLYSTMAQL
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LLSASFFLMGVVQGGVDNYLMTYLYISAIFVLIIMALGIFGKGKKYV
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9353933; 9384377; 10572140; 10809709; 10809710 [H]