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The map label for this gene is ylbB

Identifier: 15673086

GI number: 15673086

Start: 1111404

End: 1114094

Strand: Direct

Name: ylbB

Synonym: L111162

Alternate gene names: NA

Gene position: 1111404-1114094 (Clockwise)

Preceding gene: 15673085

Following gene: 15673089

Centisome position: 46.98

GC content: 33.74

Gene sequence:

>2691_bases
GTGGTAAGCTATGCGAAAAAAACTTTAAATAAAGAAATTCGCAGGTCAATTACGGGTTCATTAGGTCGCTTTATTTCTAT
TTTTTCCTTGATGTTGTTAGGGACTTTCGCTTTTGTCGGACTAAAAGTTTCTGGACCCGATATGAGAAGGACAGCGGAAG
ATTTTTATGCTCAACATCATTTAGCAGATTTGACGCTAACTTCAACTTTGGGATTGGACCATTCTGACCAGCAATTAATT
AACGAAACCAAGGGTGTAAAAAAAGCAGAATTTGGCTATTTTCAAGATTTGGTAATCAAAGGAAAAGAAAATAGTCTGCG
TTTATTTTCTAAACCAGATGAATTGTCAACTTATGAGTTAATGTCAGGCAAGTTGCCTCAAAAAGATTCAGAAATTGCTT
TAGATTATTTATATGATGGACAATATAAAATAGGACAAACCATTGATTTTACCCCTCCCAAATCTAAGGATTCTGATTTG
ATAAAAAATCATTCCTTTAAAATTGTTGGATTTGTGAAATCAAGTGAATATGTCGATAAAAGTGATTTTGGCTCAACGAC
AGTCGGAACGGGTAAACTTAATGGTTATGCGCTTGTTACCAAGGAAGCCTTTGATTCTGATGTTTATATGATTGCTCGCC
TATCCTATAAAAACTTACAAAATATCTCCATTTTTGATAGTAAATATGATAGCCGTTTAAAAACCGAACAAAAAACCTTA
GAAAATACTTTTAAGAATCAACCAGAAAAACGCTTGGCAGCACTGAAAACTGGCCCAGAAAAACAGATTAATGAAGCGAA
AAGTCAAATAGTTGAGGAAGAAAATCAACTCACTCAGCAAGAAAATCAATTAATCGCACAAAAGAATCAAATTGGGGAAA
ATGCATCCGCTCAAGCGATTGAGCAAATCAATGCAGGCCAAAATCAAAATAATGATGGAAAAGAAAAGATTGCTAAAGCT
AAAGCAGAGCTTGCAAAGCAGGAAACAGCCCTAAACCAGCTTGAAAAACCGACTTATCAAATTAATAATCTTAAAGAAGG
AAATCCGGGTTACAAGACATTTTTAGATGATTCAACAAGAATTGACAGTCTTTCAAATATTTTTCCAGTAGTTCTTTTTG
CGATTGCTTTATTAGTGAGTTTGACAACAATGACTCGTTTTGTGGAAGAAGAGCGAGGAAATCTTGGGTTACTGAAGGCT
TTGGGATATTCTAACCGTGATATTCGTAAGAAATTTATGGTCTATGGATTAGTTTCTAGCGGTTTAGGAGCTTTAGTAGG
AACAATTATTGGACATACCTTTTTGCCGATAGCGGTATTTAATGCTTACACAGCTTCATCTACCTTTAGCAATTTACGGT
TAACATTATCTCCTTTATGGACAATAGTTGCTTTTGCGATAGCTATAGCTTGTAGTCTTTTGCCAGCATATTGGGTTGTC
CGAATGGAACTAAAAGAAGTACCAGCCAGTCTCTTTTTAGCAAAAGTACCAAAAGCAGGCTCACGGATTCTTTTAGAGAA
AATTAATTTTATTTGGAAAAGAATGAGTTTTACTTATAAAGTGACGGCTCGAAATCTATTTCGCTATAAAAAGAGAATGT
TAATGACTATCTTTGGTGTCGCTGGCTGTACCGCTTTACTTGTCATGGGATTTGGAATTCGTGATTCCATTTCTGGTTTA
TCAAATAAACAATTTGGTCAAATTTTGCACTATGACATGATTACTATTGAAAAAAATAAAGTAAATGACAAAGAAAAAGA
AGAGATAGATAAAGAATTAGCCTCATCAGAAATTGAGAATTATTTGCCGATTGCCTTTGAAAATTTGACAAAAGAAGCCA
GTGGCAAATTAGAGAAACAAGAGGTTAACTTAATTGCGACAAATCGTTCTGATGATTTATCAAAATACATTAGCTTAAAA
TCTCGTAAAAATAGTCAAAAAATTGAATTAAATAACTCTGGAGCAGTCCTTTCAGAAAAATTTGCTGAACTTTTAGACCT
TAAAGTTGGTGATTCTCTGACACTAAAAGATAGTGAAAATCAGCCTCATAAGATAAAAGTAGCAGCAATTACTGAAATGT
ATATGGGCCATTATATTTTCATGAATCAATCGGTTTACCAAAAGGTTTTTAAAAAAGATTTTGTGGCAAATGCCCAATTG
ATTAAGTTGAAAAATGCGTCTACAAATAATATTCAAAAAATGTCAGCTCAATTTATGCAAGAAGACGGAATTCAAGCAGT
TTCACAAAATAGTGATCTCAAAAAGGTGATTGAATCCTTTATGTATGGCATTAATAGTGTCATGATTGTTTTGATTAGTT
GTGCCATTTTACTTGCGATTGTTGTCATATATAATTTAACAAATATCAATGTTTCCGAGAGAATTCGCGAATTAGCCACA
ATCAAAGTTTTAGGATTCTATGACCGTGAAGTCACACTTTATATTTATCGAGAAACGATTTTATTAAGCTTTTTAGGAAT
TCTGGTTGGTTTTGGTTTGGGGGATTATTTCCATCAGGTTATTATGAACCAATTGTCAGCTGACCAAATTATGTTTGCAC
CGGGATTACTTTGGACAAATCTTTTATTATCGGCAGCAATTACTTTTGCGACTACTCTTTTGCTAGCTATTGTTGTTCAT
TTCAAATTAAAAGCCGTGGATATGCTTGGGGCTTTGAAATCAGTAGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGCAATTGCTCCAATTGCCAACCGTGTCATTCAAATGCATGATGGAAAAATTAAACAAATTGATAATAATAGCCAACCA
GAAGATATCGATAGAATTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCATTAATATTTTTACTGACAGCTTTTTAAGAAATAAAAAAATTACTGACAGAAATTTCATCAGTAATTTTTTTATTATT
TTTCAACTTTACGTTTGAGG

Product: ABC transporter permease protein

Products: NA

Alternate protein names: Permease; ABC Transporter Permease; Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter; Efflux ABC Transporter Permease Protein; Permease Domain Protein; Antimicrobial Peptide ABC Transporter Permease; ABC-Type Antimicrobial Peptide Transport System Protein; Large Transmembrane Protein Possibly Involved In Transport; ABC-Type Transport System Permease; Efflux ABC Transporter Permease; ABC-Type Transport System; ABC Transporter Permease Component

Number of amino acids: Translated: 896; Mature: 896

Protein sequence:

>896_residues
MVSYAKKTLNKEIRRSITGSLGRFISIFSLMLLGTFAFVGLKVSGPDMRRTAEDFYAQHHLADLTLTSTLGLDHSDQQLI
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RMELKEVPASLFLAKVPKAGSRILLEKINFIWKRMSFTYKVTARNLFRYKKRMLMTIFGVAGCTALLVMGFGIRDSISGL
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IKVLGFYDREVTLYIYRETILLSFLGILVGFGLGDYFHQVIMNQLSADQIMFAPGLLWTNLLLSAAITFATTLLLAIVVH
FKLKAVDMLGALKSVD

Sequences:

>Translated_896_residues
MVSYAKKTLNKEIRRSITGSLGRFISIFSLMLLGTFAFVGLKVSGPDMRRTAEDFYAQHHLADLTLTSTLGLDHSDQQLI
NETKGVKKAEFGYFQDLVIKGKENSLRLFSKPDELSTYELMSGKLPQKDSEIALDYLYDGQYKIGQTIDFTPPKSKDSDL
IKNHSFKIVGFVKSSEYVDKSDFGSTTVGTGKLNGYALVTKEAFDSDVYMIARLSYKNLQNISIFDSKYDSRLKTEQKTL
ENTFKNQPEKRLAALKTGPEKQINEAKSQIVEEENQLTQQENQLIAQKNQIGENASAQAIEQINAGQNQNNDGKEKIAKA
KAELAKQETALNQLEKPTYQINNLKEGNPGYKTFLDDSTRIDSLSNIFPVVLFAIALLVSLTTMTRFVEEERGNLGLLKA
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RMELKEVPASLFLAKVPKAGSRILLEKINFIWKRMSFTYKVTARNLFRYKKRMLMTIFGVAGCTALLVMGFGIRDSISGL
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IKVLGFYDREVTLYIYRETILLSFLGILVGFGLGDYFHQVIMNQLSADQIMFAPGLLWTNLLLSAAITFATTLLLAIVVH
FKLKAVDMLGALKSVD
>Mature_896_residues
MVSYAKKTLNKEIRRSITGSLGRFISIFSLMLLGTFAFVGLKVSGPDMRRTAEDFYAQHHLADLTLTSTLGLDHSDQQLI
NETKGVKKAEFGYFQDLVIKGKENSLRLFSKPDELSTYELMSGKLPQKDSEIALDYLYDGQYKIGQTIDFTPPKSKDSDL
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ENTFKNQPEKRLAALKTGPEKQINEAKSQIVEEENQLTQQENQLIAQKNQIGENASAQAIEQINAGQNQNNDGKEKIAKA
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IKLKNASTNNIQKMSAQFMQEDGIQAVSQNSDLKKVIESFMYGINSVMIVLISCAILLAIVVIYNLTNINVSERIRELAT
IKVLGFYDREVTLYIYRETILLSFLGILVGFGLGDYFHQVIMNQLSADQIMFAPGLLWTNLLLSAAITFATTLLLAIVVH
FKLKAVDMLGALKSVD

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 100426; Mature: 100426

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: PS00012 PHOSPHOPANTETHEINE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVSYAKKTLNKEIRRSITGSLGRFISIFSLMLLGTFAFVGLKVSGPDMRRTAEDFYAQHH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
LADLTLTSTLGLDHSDQQLINETKGVKKAEFGYFQDLVIKGKENSLRLFSKPDELSTYEL
HHHEEEHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHEECCCCCEEEECCCCCCCHHHH
MSGKLPQKDSEIALDYLYDGQYKIGQTIDFTPPKSKDSDLIKNHSFKIVGFVKSSEYVDK
HCCCCCCCCCCEEEEEEECCCEECCCEEECCCCCCCCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCC
SDFGSTTVGTGKLNGYALVTKEAFDSDVYMIARLSYKNLQNISIFDSKYDSRLKTEQKTL
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHCCCCCEEEEEEHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHH
ENTFKNQPEKRLAALKTGPEKQINEAKSQIVEEENQLTQQENQLIAQKNQIGENASAQAI
HHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
GLGALVGTIIGHTFLPIAVFNAYTASSTFSNLRLTLSPLWTIVAFAIAIACSLLPAYWVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RMELKEVPASLFLAKVPKAGSRILLEKINFIWKRMSFTYKVTARNLFRYKKRMLMTIFGV
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YLPIAFENLTKEASGKLEKQEVNLIATNRSDDLSKYISLKSRKNSQKIELNNSGAVLSEK
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IMNQLSADQIMFAPGLLWTNLLLSAAITFATTLLLAIVVHFKLKAVDMLGALKSVD
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>Mature Secondary Structure
MVSYAKKTLNKEIRRSITGSLGRFISIFSLMLLGTFAFVGLKVSGPDMRRTAEDFYAQHH
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA