| Definition | Chlamydia muridarum Nigg, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002620 |
| Length | 1,072,950 |
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Identifier: 15835056
GI number: 15835056
Start: 516118
End: 526125
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: TC0438
Alternate gene names: 15835056
Gene position: 516118-526125 (Clockwise)
Preceding gene: 15835055
Following gene: 15835057
Centisome position: 48.1
GC content: 38.02
Gene sequence:
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Product: adherence factor
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 3335; Mature: 3334
Protein sequence:
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Sequences:
>Translated_3335_residues MPVSGSIVASKENTSASLQPATTLNNGSSVEFFQQITVYDDARNFTNHTTEDVIKIGEQLQRKFYNMTEGTQVPFTTSPA YHTGNWKTAFIYNLAQVIANLFPSTIQPIRVNSTRSSPFSTNSSVEKRNRFTSKDTKVQPPHTTRSVSPRKRKSVIVTRS VNIHNHTPDKKSSGESLRNISLEKPVLSRKRRDVEKNKEIKNEPSVNKYDLTYKNIAEKLGLSSEQQTSVKELLNKLRKA ITNYNALIEKNSSEGQSLLIRQAKLVEEIQEKISPAVSDKKGNEKKTEEKSKVSFIKDVADIIKAEFSGHLVPVDKIIHG IWIAGAPPEGIEQYMRVFLDTYPDYSFYFWVDSNAYGAAKFSGILKRMAFDVAIQELRDSTEESTKVFVKEYDDLKKKYE QRIAQTHSTKKKNEYLQDLQSLLEKYKTVSDEVRGRFDVLFLKNVVITQDNFFNYCLLKGVGNISDETRMEYLEKELKFS KEEIEEYRKLKESNKEKIASVVKKLNEQLGSARVHIKDIKELNSMKHSQNIYNYEMEMFLRWNYAAATDQVRMYMLEEYG GLYTDLDMMPAFSQEVLEVIKKHSVGDRMFEDMTSRRAISDAVLKLAVGETTTVSIEDIGKDIDISRLTEEDKTKLGELF KELEFFVKKDTQNSSKLGKAKSFFQPMNMDIVRDTMPILRRYHYYPELGWFVRGLNGLMVSHKGSAAVSHVIKGQQDAYQ ELAAMRQEVLSGEFFRSLEDLTHRQHKDLIGGHLVSDYLAKSLFFDYRQDSIMPEAVSTLGITGPDLVAQKLVELFKDWG PLGRDFLTPRGKKLGDMAFLGSYKKIPLDPSDPRKYTFDWMNPLTVGSNDVTPADESTWCGSKKRCVAELLFSDSSTKLS TNKLQGVTRTKIDTSTFTSLWKEESKKKLPPGLLESFNRFITEKTVDILKLSELDQKIYVTQSAIQDDNIAKASLFSLQL 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Specific function: Cytotoxin [H]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 18 cell wall-binding repeats [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018337 - InterPro: IPR007577 - InterPro: IPR020974 [H]
Pfam domain/function: PF01473 CW_binding_1; PF04488 Gly_transf_sug; PF11713 Peptidase_C80 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 376522; Mature: 376391
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Prosite motif: PS00599 AA_TRANSFER_CLASS_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPVSGSIVASKENTSASLQPATTLNNGSSVEFFQQITVYDDARNFTNHTTEDVIKIGEQL CCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHH QRKFYNMTEGTQVPFTTSPAYHTGNWKTAFIYNLAQVIANLFPSTIQPIRVNSTRSSPFS HHHHHCCCCCCCCCEECCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCC TNSSVEKRNRFTSKDTKVQPPHTTRSVSPRKRKSVIVTRSVNIHNHTPDKKSSGESLRNI CCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHCC SLEKPVLSRKRRDVEKNKEIKNEPSVNKYDLTYKNIAEKLGLSSEQQTSVKELLNKLRKA CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ITNYNALIEKNSSEGQSLLIRQAKLVEEIQEKISPAVSDKKGNEKKTEEKSKVSFIKDVA HCCCHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH DIIKAEFSGHLVPVDKIIHGIWIAGAPPEGIEQYMRVFLDTYPDYSFYFWVDSNAYGAAK HHHHHHHCCCEEEHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHH FSGILKRMAFDVAIQELRDSTEESTKVFVKEYDDLKKKYEQRIAQTHSTKKKNEYLQDLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLLEKYKTVSDEVRGRFDVLFLKNVVITQDNFFNYCLLKGVGNISDETRMEYLEKELKFS 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