Definition Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome.
Accession NC_002491
Length 1,226,565

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The map label for this gene is secD_secF

Identifier: 15836095

GI number: 15836095

Start: 649463

End: 653671

Strand: Reverse

Name: secD_secF

Synonym: CPj0564

Alternate gene names: 15836095

Gene position: 653671-649463 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15836096

Following gene: 15836094

Centisome position: 53.29

GC content: 40.63

Gene sequence:

>4209_bases
ATGAAACAGAAGGTTAAGCGAAACTTCGCTATCATTATTTGCGTGTTTGCTTTGGCTTTGTATTACGTTTTGCCTACATG
TTTATATTACGCCAAACCTCTGGATAAGAAAATAGATGGAAACGAAGCCGAACATATAATCAAATCTTTTACCAAGCAGG
CCCAGCAAGTTCGTAAGGATGTCATTCCTCGCGTCTCAGCGATCCTTTCGTCCCTACATTTACGTGGGCACATACAACAA
CATCCTGCGATTCCAGATATTGTCAGTGTGCGTTTTAAAAGAGGTGAAGATGCAGAGGACTTTATCGGGAACCTCGTTCA
TGGAGAGCCTAACGTTCCCATAAAGTCTGCAAGACTCCATGTGGTTGGCTATAGTCGAGAACACGACGACCATGTAATAC
AAGTAGCAAGCTCTATAAATACTTCCTTAGTAGAAAGTGATTTTTCTTTTGTTTCCTATTCTTCCGAAAATGAACAAGAG
ATGGCCTCAAGTATTTTGCAACGAGTCTATTCTGCATGTACTTTTCCGAAACAAAAAGACTGTTCTTGTAGTTACCCCTC
TATCTGGGAAACGGCACCTAAAGAACAATTGTTACAGTATGCCAAGAACCTTTCTTCAGGATTTGAGGTTTTTTCTTCGC
GACTTTCAGCGTTTTGCCAACAGTCCTTTTCTTCCAACCAAGATAGACTTGCGTTTTTATCACGCCTGTCTTCGTTGTCA
AACGACGCAGCAATCGATGTTGAAGATCAAAAGCTACTCAAGAGTGTATATGAAACTCTTTCTCAAACTGCATGCATTCG
TAGTTTAGATTGCCCTTATATTGAAGGGCTTCGATTAGATTGTAGTGAGTCCTCATTATTTTTTAGTTCCATAGAGTATT
GCCCTAAGGAACGTAAAATTTTCCTGACACTACATTCTGATTTGTTAGCACAGCGTACGTCTTTGTCTAAAGAACAACGC
TTAGATTTTGACAGTCGTTTGGCTGTTGAAAAACAAAAGCTCTCTAAGAACTTAACTGTTCAAGTAGAAGATTATAACAA
CGGATTTTCCTTCCAATGGATGGATAAAGATACTCAGGGAAAGATTATTCTCCAGGGAGAGCGTTTGCTCCAAGGAATCG
CAGAACATCTCACGGCATTAACTTTGCATAGGCCTGCAGCTGAATCTTGTGACCTGATTCCAGAAAATTTTCCTGTTTTC
TGTCGTCAACCTAGAGAAAGCGAAGCTTTTGGCTGTTACATCTTTTCTCCCAATACAGATTGCAAACACTTTTCTAAAGG
CTCCGTTTACATCTTATTGAAAGGACTCCGTTCTATCGTCGCGAAATATCAACAGGGAGGGGGTAAAGAACTCCAAAGTT
TCGAAAAAGATCTACAAAATCTCTATAACTGTTTTTCTCATACAGAAGCGATTTCCTGGACTCTAGGAGAAGATCAAGTC
TTAGAAATCCGGCACCCCTTGCAGCAATTTCTAGATGTATGGGGTGAGGGATTTGTCATAGGGAAAGAGGGCTGTGCCTT
TTTAGAAGTTAAAGACATTCAAGATCGCCTTGCAACTGTAAACCAAATCGAGAAGAATCGTCAAAGCGATTTAGTGCGTT
GGCATGAGCAATACCGACACGCAAAGTGTTCTATGGATCTTCAGGAACGTTTGAGTGCTCCGATTCCTTATCAAAATCTT
TTCTTAGAAAATATGAAACTCAACATGAGAAAATTTTCTCGTGGGGAGAACATACTACGTCTTGGTATTGATTTTGTTGG
TGGGCGTCAGCTGCTACTCTCTTTTAAAGATCATCAGGGAAAGCAGCTCACCGATAAGGAAGATATTCTTAAAGTTTCGG
ATGAGCTCTGTGCTCGATTAAATAAACTTGGAGTATCTGAAATCGAACTTCGCCGTGAGGGAGATTACATTCATCTCAGT
GTGCCAGGATCTTCTACGATCTCCTCATCTGAGATCTTGGGGACCTCAAAAATGAGTTTCCATGTGGTGAATGAGAGGTT
CTCTTCTTACAGCGCTTCCCGCTACGAAGTGCAAAGATTTTTAGACTATCTTTGGTTTACCTCTCAAGCTCAAGGAAAGA
CATCTCCCGAAGAAATCAATACCTTCGCTAGCGCCTTATTTAATGAGGAAGTCGATGTGCCTCCAAGTGTCCATGAGGCC
ATTACTAAGCTTAAAAGTGAGGGGTTGGCGTTCTCTCCTTCAGGATGCGAAACGCCTTCGACAGATTTAGATACGACGTT
TTCTATGATTGCTATTGGAAAAGATGCAGAACAAAAAGCAAATCCTTTAGTCATTGTTTTTAGAAATTATGCGTTAGATG
GAGCTTCCCTAAAAGACATTCGTCCAGAATTTGCTGCAGGGGAAGGTTATGTTTTAAATTTTTCAGTCAAAGATACAAGC
CCTAAGAAAATGGCAGAGAAACTTTCTCCTACAGAGAGTTTCCACACATGGACTTCCGCATATTGTCAGGAGGGGATCAG
CGGCACTGCTAATGGACAATATTCTGCAAACCGTGGATGGCGTATGGCTGTAGTGATTGACGGTTATATGGTCAGCAGCC
CTATTTTAAACGTCCCATTGAAAAATCATGCCAGTGTCTCAGGGAAATTTACCCACCGTGAAGTGAGCAAACTCGCCTCA
GATTTAAAATCTGGAGCGATGTCTTTTGTTCCCGAGGTTCTCAGTGAAGAGACGATCTCTTCTGATCTTGGGAAAAAACA
ATGTACACAAGGCATTATCTCAGCATGCTGTGGCTTGGCAATGCTTATTGTTTTGATGAGCGTATATTATAGATTTGGAG
GCGTCATCGCTTCGGGAGCTGTTCTTCTGAATCTTTTGCTTATCTGGGCAGCTCTACAGTATTTGGATGCGCCACTCACC
TTGTCAGGACTCGCTGGGATTGTTCTTGCTATGGGGATGGCCGTAGATGCAAATGTTCTTGTATTCGAAAGAATCCGAGA
GGAATTTTTATTGTCTCAAAGTCTTAAAAAATCTGTAGAAAAAGGATATACCAAGGCTTTTGGAGCCATTTTTGATTCTA
ACTTGACTACAGTATTGGCCTCAGCACTTCTTTTCTTCCTAGATACAGGGCCTATTAAAGGGTTTGCTTTGACATTGATT
TTAGGAATTTTCTCTTCAATGTTTACGGCTCTTTTCATGACTAAATTTTTCTTCATGCTGTGGATGAATAAGACCCAACA
TACACAGTTGCATATGATGAATAAGTTCGTGGGGATAAAGCATGATTTCTTGAGAGGATGCAAAAAACTTTGGGCTGTTT
CTGGAAGTGTTTTTCTTTTAGGTTGCGTTGCTCTCGGGTTTGGAGCCTGGAATTCCGTTTTGGGAATGGATTTTAAAGGA
GGGTATGCCTTTACCTTTAATCCAAAAGAGCATGGCATCAGCGATGTTGCTCAAATGCGTGGCAAAGTTGTGCATAAACT
ACAGGAAGCTGGTCTTTCTTCTAGAGACTTCCGTATTCAAACATTTGGATCTTCAGAAAAGATCAAAATCTATTTTAGTG
ATAAAGCTTTAAGCTATACTAAAGCAGATACGAGCCTCTCTCCTAAAATTAACGATCATGAGCTGGCGTTAGCTGTGGGA
TTGTTGTCAGAAACAGGCCTAGATTTCTCTACGGAAACTCTAAACGAAACGCAAAATTTTTGGTCAAAGGTAAGCAGCAA
ACTATCGAAGAAAATGCGTTATCAGGCGACCATCGGGCTTTTAGGAGCTTTGGCAATCATCTTGCTCTATGTGAGTTTGC
GCTTTGAATGGCAATATGCTTTCAGTGCCGTATGCGCTTTAATTCATGACCTTTTGGCTACCTGTGCAGTCTTGTTTATA
GCACATTTCTTTTTGAAGAAAATTCAAATAGATTTGCAAGCCATTGGTGCTTTAATGACTGTATTGGGGTATTCATTAAA
CAATACTTTGATCATTTTTGATCGTATTCGTGAAGATCGCCAAGCGAACCTGTTTACCCCTATGCATGTTTTAGTTAATG
ATGCCCTTCAAAAGACGTTCAGCCGCACGGTAATGACAACAGCTACAACTCTATCAGTTTTGTTAATGCTTTTGTTTATA
GGCGGCTCCTCTGTCTTTAATTTTGCATTTATTATGACCATAGGGATTCTTCTAGGAACTTTATCGTCTCTTTATATTGC
ACCACCTCTGTTGTTGTTTATGGTCCGTAAAGAAAATCGCTCAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGCTCTCTTTGAAGGTGGAGGGCTCCTCTTCGTTTGACGATTTTTTTTTCAACTGGTATTTTGGTTTTAATATTTCCTA
ATAAAAAGTAGAGCGGTGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTACCGTTAAACTTAATCTAACGTGTAGCAATATAAAAATCTCCTTTGGGACTTTAGTCCCAAAGGCCCCTGTGGTATTA
AATTTATGACAAATTCAGAT

Product: preprotein translocase subunits SecD/SecF

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1402; Mature: 1402

Protein sequence:

>1402_residues
MKQKVKRNFAIIICVFALALYYVLPTCLYYAKPLDKKIDGNEAEHIIKSFTKQAQQVRKDVIPRVSAILSSLHLRGHIQQ
HPAIPDIVSVRFKRGEDAEDFIGNLVHGEPNVPIKSARLHVVGYSREHDDHVIQVASSINTSLVESDFSFVSYSSENEQE
MASSILQRVYSACTFPKQKDCSCSYPSIWETAPKEQLLQYAKNLSSGFEVFSSRLSAFCQQSFSSNQDRLAFLSRLSSLS
NDAAIDVEDQKLLKSVYETLSQTACIRSLDCPYIEGLRLDCSESSLFFSSIEYCPKERKIFLTLHSDLLAQRTSLSKEQR
LDFDSRLAVEKQKLSKNLTVQVEDYNNGFSFQWMDKDTQGKIILQGERLLQGIAEHLTALTLHRPAAESCDLIPENFPVF
CRQPRESEAFGCYIFSPNTDCKHFSKGSVYILLKGLRSIVAKYQQGGGKELQSFEKDLQNLYNCFSHTEAISWTLGEDQV
LEIRHPLQQFLDVWGEGFVIGKEGCAFLEVKDIQDRLATVNQIEKNRQSDLVRWHEQYRHAKCSMDLQERLSAPIPYQNL
FLENMKLNMRKFSRGENILRLGIDFVGGRQLLLSFKDHQGKQLTDKEDILKVSDELCARLNKLGVSEIELRREGDYIHLS
VPGSSTISSSEILGTSKMSFHVVNERFSSYSASRYEVQRFLDYLWFTSQAQGKTSPEEINTFASALFNEEVDVPPSVHEA
ITKLKSEGLAFSPSGCETPSTDLDTTFSMIAIGKDAEQKANPLVIVFRNYALDGASLKDIRPEFAAGEGYVLNFSVKDTS
PKKMAEKLSPTESFHTWTSAYCQEGISGTANGQYSANRGWRMAVVIDGYMVSSPILNVPLKNHASVSGKFTHREVSKLAS
DLKSGAMSFVPEVLSEETISSDLGKKQCTQGIISACCGLAMLIVLMSVYYRFGGVIASGAVLLNLLLIWAALQYLDAPLT
LSGLAGIVLAMGMAVDANVLVFERIREEFLLSQSLKKSVEKGYTKAFGAIFDSNLTTVLASALLFFLDTGPIKGFALTLI
LGIFSSMFTALFMTKFFFMLWMNKTQHTQLHMMNKFVGIKHDFLRGCKKLWAVSGSVFLLGCVALGFGAWNSVLGMDFKG
GYAFTFNPKEHGISDVAQMRGKVVHKLQEAGLSSRDFRIQTFGSSEKIKIYFSDKALSYTKADTSLSPKINDHELALAVG
LLSETGLDFSTETLNETQNFWSKVSSKLSKKMRYQATIGLLGALAIILLYVSLRFEWQYAFSAVCALIHDLLATCAVLFI
AHFFLKKIQIDLQAIGALMTVLGYSLNNTLIIFDRIREDRQANLFTPMHVLVNDALQKTFSRTVMTTATTLSVLLMLLFI
GGSSVFNFAFIMTIGILLGTLSSLYIAPPLLLFMVRKENRSK

Sequences:

>Translated_1402_residues
MKQKVKRNFAIIICVFALALYYVLPTCLYYAKPLDKKIDGNEAEHIIKSFTKQAQQVRKDVIPRVSAILSSLHLRGHIQQ
HPAIPDIVSVRFKRGEDAEDFIGNLVHGEPNVPIKSARLHVVGYSREHDDHVIQVASSINTSLVESDFSFVSYSSENEQE
MASSILQRVYSACTFPKQKDCSCSYPSIWETAPKEQLLQYAKNLSSGFEVFSSRLSAFCQQSFSSNQDRLAFLSRLSSLS
NDAAIDVEDQKLLKSVYETLSQTACIRSLDCPYIEGLRLDCSESSLFFSSIEYCPKERKIFLTLHSDLLAQRTSLSKEQR
LDFDSRLAVEKQKLSKNLTVQVEDYNNGFSFQWMDKDTQGKIILQGERLLQGIAEHLTALTLHRPAAESCDLIPENFPVF
CRQPRESEAFGCYIFSPNTDCKHFSKGSVYILLKGLRSIVAKYQQGGGKELQSFEKDLQNLYNCFSHTEAISWTLGEDQV
LEIRHPLQQFLDVWGEGFVIGKEGCAFLEVKDIQDRLATVNQIEKNRQSDLVRWHEQYRHAKCSMDLQERLSAPIPYQNL
FLENMKLNMRKFSRGENILRLGIDFVGGRQLLLSFKDHQGKQLTDKEDILKVSDELCARLNKLGVSEIELRREGDYIHLS
VPGSSTISSSEILGTSKMSFHVVNERFSSYSASRYEVQRFLDYLWFTSQAQGKTSPEEINTFASALFNEEVDVPPSVHEA
ITKLKSEGLAFSPSGCETPSTDLDTTFSMIAIGKDAEQKANPLVIVFRNYALDGASLKDIRPEFAAGEGYVLNFSVKDTS
PKKMAEKLSPTESFHTWTSAYCQEGISGTANGQYSANRGWRMAVVIDGYMVSSPILNVPLKNHASVSGKFTHREVSKLAS
DLKSGAMSFVPEVLSEETISSDLGKKQCTQGIISACCGLAMLIVLMSVYYRFGGVIASGAVLLNLLLIWAALQYLDAPLT
LSGLAGIVLAMGMAVDANVLVFERIREEFLLSQSLKKSVEKGYTKAFGAIFDSNLTTVLASALLFFLDTGPIKGFALTLI
LGIFSSMFTALFMTKFFFMLWMNKTQHTQLHMMNKFVGIKHDFLRGCKKLWAVSGSVFLLGCVALGFGAWNSVLGMDFKG
GYAFTFNPKEHGISDVAQMRGKVVHKLQEAGLSSRDFRIQTFGSSEKIKIYFSDKALSYTKADTSLSPKINDHELALAVG
LLSETGLDFSTETLNETQNFWSKVSSKLSKKMRYQATIGLLGALAIILLYVSLRFEWQYAFSAVCALIHDLLATCAVLFI
AHFFLKKIQIDLQAIGALMTVLGYSLNNTLIIFDRIREDRQANLFTPMHVLVNDALQKTFSRTVMTTATTLSVLLMLLFI
GGSSVFNFAFIMTIGILLGTLSSLYIAPPLLLFMVRKENRSK
>Mature_1402_residues
MKQKVKRNFAIIICVFALALYYVLPTCLYYAKPLDKKIDGNEAEHIIKSFTKQAQQVRKDVIPRVSAILSSLHLRGHIQQ
HPAIPDIVSVRFKRGEDAEDFIGNLVHGEPNVPIKSARLHVVGYSREHDDHVIQVASSINTSLVESDFSFVSYSSENEQE
MASSILQRVYSACTFPKQKDCSCSYPSIWETAPKEQLLQYAKNLSSGFEVFSSRLSAFCQQSFSSNQDRLAFLSRLSSLS
NDAAIDVEDQKLLKSVYETLSQTACIRSLDCPYIEGLRLDCSESSLFFSSIEYCPKERKIFLTLHSDLLAQRTSLSKEQR
LDFDSRLAVEKQKLSKNLTVQVEDYNNGFSFQWMDKDTQGKIILQGERLLQGIAEHLTALTLHRPAAESCDLIPENFPVF
CRQPRESEAFGCYIFSPNTDCKHFSKGSVYILLKGLRSIVAKYQQGGGKELQSFEKDLQNLYNCFSHTEAISWTLGEDQV
LEIRHPLQQFLDVWGEGFVIGKEGCAFLEVKDIQDRLATVNQIEKNRQSDLVRWHEQYRHAKCSMDLQERLSAPIPYQNL
FLENMKLNMRKFSRGENILRLGIDFVGGRQLLLSFKDHQGKQLTDKEDILKVSDELCARLNKLGVSEIELRREGDYIHLS
VPGSSTISSSEILGTSKMSFHVVNERFSSYSASRYEVQRFLDYLWFTSQAQGKTSPEEINTFASALFNEEVDVPPSVHEA
ITKLKSEGLAFSPSGCETPSTDLDTTFSMIAIGKDAEQKANPLVIVFRNYALDGASLKDIRPEFAAGEGYVLNFSVKDTS
PKKMAEKLSPTESFHTWTSAYCQEGISGTANGQYSANRGWRMAVVIDGYMVSSPILNVPLKNHASVSGKFTHREVSKLAS
DLKSGAMSFVPEVLSEETISSDLGKKQCTQGIISACCGLAMLIVLMSVYYRFGGVIASGAVLLNLLLIWAALQYLDAPLT
LSGLAGIVLAMGMAVDANVLVFERIREEFLLSQSLKKSVEKGYTKAFGAIFDSNLTTVLASALLFFLDTGPIKGFALTLI
LGIFSSMFTALFMTKFFFMLWMNKTQHTQLHMMNKFVGIKHDFLRGCKKLWAVSGSVFLLGCVALGFGAWNSVLGMDFKG
GYAFTFNPKEHGISDVAQMRGKVVHKLQEAGLSSRDFRIQTFGSSEKIKIYFSDKALSYTKADTSLSPKINDHELALAVG
LLSETGLDFSTETLNETQNFWSKVSSKLSKKMRYQATIGLLGALAIILLYVSLRFEWQYAFSAVCALIHDLLATCAVLFI
AHFFLKKIQIDLQAIGALMTVLGYSLNNTLIIFDRIREDRQANLFTPMHVLVNDALQKTFSRTVMTTATTLSVLLMLLFI
GGSSVFNFAFIMTIGILLGTLSSLYIAPPLLLFMVRKENRSK

Specific function: Required for efficient translocation of secretory pre- proteins under conditions of hypersecretion but is not required for the release of mature proteins from the membrane [H]

COG id: COG0342

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecD

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: In the C-terminal section; belongs to the secD/secF family. SecF subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786609, Length=202, Percent_Identity=37.6237623762376, Blast_Score=144, Evalue=4e-35,
Organism=Escherichia coli, GI1786610, Length=317, Percent_Identity=32.4921135646688, Blast_Score=134, Evalue=3e-32,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005791
- InterPro:   IPR022813
- InterPro:   IPR022646
- InterPro:   IPR022645
- InterPro:   IPR005665 [H]

Pfam domain/function: PF07549 Sec_GG; PF02355 SecD_SecF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 156828; Mature: 156828

Theoretical pI: Translated: 7.69; Mature: 7.69

Prosite motif: PS00037 MYB_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKQKVKRNFAIIICVFALALYYVLPTCLYYAKPLDKKIDGNEAEHIIKSFTKQAQQVRKD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIPRVSAILSSLHLRGHIQQHPAIPDIVSVRFKRGEDAEDFIGNLVHGEPNVPIKSARLH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
VVGYSREHDDHVIQVASSINTSLVESDFSFVSYSSENEQEMASSILQRVYSACTFPKQKD
EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
CSCSYPSIWETAPKEQLLQYAKNLSSGFEVFSSRLSAFCQQSFSSNQDRLAFLSRLSSLS
CCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCC
NDAAIDVEDQKLLKSVYETLSQTACIRSLDCPYIEGLRLDCSESSLFFSSIEYCPKERKI
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCEE
FLTLHSDLLAQRTSLSKEQRLDFDSRLAVEKQKLSKNLTVQVEDYNNGFSFQWMDKDTQG
EEEEHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCC
KIILQGERLLQGIAEHLTALTLHRPAAESCDLIPENFPVFCRQPRESEAFGCYIFSPNTD
CEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCC
CKHFSKGSVYILLKGLRSIVAKYQQGGGKELQSFEKDLQNLYNCFSHTEAISWTLGEDQV
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHH
LEIRHPLQQFLDVWGEGFVIGKEGCAFLEVKDIQDRLATVNQIEKNRQSDLVRWHEQYRH
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKCSMDLQERLSAPIPYQNLFLENMKLNMRKFSRGENILRLGIDFVGGRQLLLSFKDHQG
HHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHCCCHHHEEEECCCCC
KQLTDKEDILKVSDELCARLNKLGVSEIELRREGDYIHLSVPGSSTISSSEILGTSKMSF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCHHH
HVVNERFSSYSASRYEVQRFLDYLWFTSQAQGKTSPEEINTFASALFNEEVDVPPSVHEA
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
ITKLKSEGLAFSPSGCETPSTDLDTTFSMIAIGKDAEQKANPLVIVFRNYALDGASLKDI
HHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHHEEECCCCHHHCCCEEEEEECCCCCCCCHHHC
RPEFAAGEGYVLNFSVKDTSPKKMAEKLSPTESFHTWTSAYCQEGISGTANGQYSANRGW
CCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCE
RMAVVIDGYMVSSPILNVPLKNHASVSGKFTHREVSKLASDLKSGAMSFVPEVLSEETIS
EEEEEEECEECCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SDLGKKQCTQGIISACCGLAMLIVLMSVYYRFGGVIASGAVLLNLLLIWAALQYLDAPLT
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LSGLAGIVLAMGMAVDANVLVFERIREEFLLSQSLKKSVEKGYTKAFGAIFDSNLTTVLA
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
SALLFFLDTGPIKGFALTLILGIFSSMFTALFMTKFFFMLWMNKTQHTQLHMMNKFVGIK
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
HDFLRGCKKLWAVSGSVFLLGCVALGFGAWNSVLGMDFKGGYAFTFNPKEHGISDVAQMR
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHCCHHHHHHHH
GKVVHKLQEAGLSSRDFRIQTFGSSEKIKIYFSDKALSYTKADTSLSPKINDHELALAVG
HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
LLSETGLDFSTETLNETQNFWSKVSSKLSKKMRYQATIGLLGALAIILLYVSLRFEWQYA
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSAVCALIHDLLATCAVLFIAHFFLKKIQIDLQAIGALMTVLGYSLNNTLIIFDRIREDR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHCCCC
QANLFTPMHVLVNDALQKTFSRTVMTTATTLSVLLMLLFIGGSSVFNFAFIMTIGILLGT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSSLYIAPPLLLFMVRKENRSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKQKVKRNFAIIICVFALALYYVLPTCLYYAKPLDKKIDGNEAEHIIKSFTKQAQQVRKD
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIPRVSAILSSLHLRGHIQQHPAIPDIVSVRFKRGEDAEDFIGNLVHGEPNVPIKSARLH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE
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EEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
CSCSYPSIWETAPKEQLLQYAKNLSSGFEVFSSRLSAFCQQSFSSNQDRLAFLSRLSSLS
CCCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCC
NDAAIDVEDQKLLKSVYETLSQTACIRSLDCPYIEGLRLDCSESSLFFSSIEYCPKERKI
CCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCEE
FLTLHSDLLAQRTSLSKEQRLDFDSRLAVEKQKLSKNLTVQVEDYNNGFSFQWMDKDTQG
EEEEHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCC
KIILQGERLLQGIAEHLTALTLHRPAAESCDLIPENFPVFCRQPRESEAFGCYIFSPNTD
CEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCC
CKHFSKGSVYILLKGLRSIVAKYQQGGGKELQSFEKDLQNLYNCFSHTEAISWTLGEDQV
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHH
LEIRHPLQQFLDVWGEGFVIGKEGCAFLEVKDIQDRLATVNQIEKNRQSDLVRWHEQYRH
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKCSMDLQERLSAPIPYQNLFLENMKLNMRKFSRGENILRLGIDFVGGRQLLLSFKDHQG
HHCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHHCCCHHHEEEECCCCC
KQLTDKEDILKVSDELCARLNKLGVSEIELRREGDYIHLSVPGSSTISSSEILGTSKMSF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHCCCCCHHH
HVVNERFSSYSASRYEVQRFLDYLWFTSQAQGKTSPEEINTFASALFNEEVDVPPSVHEA
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
ITKLKSEGLAFSPSGCETPSTDLDTTFSMIAIGKDAEQKANPLVIVFRNYALDGASLKDI
HHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHHEEECCCCHHHCCCEEEEEECCCCCCCCHHHC
RPEFAAGEGYVLNFSVKDTSPKKMAEKLSPTESFHTWTSAYCQEGISGTANGQYSANRGW
CCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCE
RMAVVIDGYMVSSPILNVPLKNHASVSGKFTHREVSKLASDLKSGAMSFVPEVLSEETIS
EEEEEEECEECCCCCEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SDLGKKQCTQGIISACCGLAMLIVLMSVYYRFGGVIASGAVLLNLLLIWAALQYLDAPLT
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LSGLAGIVLAMGMAVDANVLVFERIREEFLLSQSLKKSVEKGYTKAFGAIFDSNLTTVLA
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH
SALLFFLDTGPIKGFALTLILGIFSSMFTALFMTKFFFMLWMNKTQHTQLHMMNKFVGIK
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
HDFLRGCKKLWAVSGSVFLLGCVALGFGAWNSVLGMDFKGGYAFTFNPKEHGISDVAQMR
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHCCHHHHHHHH
GKVVHKLQEAGLSSRDFRIQTFGSSEKIKIYFSDKALSYTKADTSLSPKINDHELALAVG
HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
LLSETGLDFSTETLNETQNFWSKVSSKLSKKMRYQATIGLLGALAIILLYVSLRFEWQYA
HHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSAVCALIHDLLATCAVLFIAHFFLKKIQIDLQAIGALMTVLGYSLNNTLIIFDRIREDR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHCCCC
QANLFTPMHVLVNDALQKTFSRTVMTTATTLSVLLMLLFIGGSSVFNFAFIMTIGILLGT
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSSLYIAPPLLLFMVRKENRSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9694879; 9384377 [H]