Definition Chlamydophila pneumoniae J138, complete genome.
Accession NC_002491
Length 1,226,565

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The map label for this gene is Not Available

Identifier: 15835828

GI number: 15835828

Start: 329571

End: 332348

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: CPj0293

Alternate gene names: NA

Gene position: 329571-332348 (Clockwise)

Preceding gene: 15835827

Following gene: 15835829

Centisome position: 26.87

GC content: 38.84

Gene sequence:

>2778_bases
ATGCAGAGAGTTTTGCGACTGCTGTTTAACCTACATCATGGGGAAGAAAAAAGGGCTTTCCTTTTTTTTCTCTTGGGATT
GGTCTGGGGGATAGGTTGTTACGGCACTCTCTCTCTAGCTGAAGGCTTATTCATTGAAAAATTAGGATCGGCAGAATTAC
CAAAAATTTATTTAGGTTCTTCTCTGATCCTTTGCGTTCTTTCATCCCTAATTCTTTACAATCTTTTTAAAAAACACATC
TCAGCAACAGCTCTTTTCTTAATTCCTGTTTCTTTATCTATCCTTTGTAATTTTTATCTTATTCTCTCTTCTATCTTTGC
TATCGATCCCCCCCGGTCTCCTCTGTTTTTCTATCGGATTGTAATTTGGAGTTTAACGATTCTCTCTTACACGAGTTTTT
GGGGATTTGTAGATCAATTTTTTAATTTACAAGATGGAAAACGACACTTCTGTATTTTTAATGCTATCATCTTCTTAGGA
GATGCTATCGGCAGCGGAATCATAGCTAGCCTGGTACACACAATAGGAATCCAGGGCATCCTGATTTTATTTACAGCAGC
CCTGGTCCTGACATTCCCTATCGTATTCTATGTTTCAAAATCTCTAAAGTCGCTTTCCGATGACCATGACCTTTTCATAG
ATACAGGCCACCCACCACCCTTATCAAAAGCATTGAAACTCTGTTTTTATGATAAATATACTTTTTATCTGCTTTGCTTT
TATTTTCTCATGCAATTGCTAGCGATTGCTACAGAGTTTAACTATTTAAAAATCTTTGAAATTCAATTTGCCTCTAAGGA
AGAATTCGAACTCGTCGCACACATAGGAAAGTGTTCCCTGTGGATTTCTTTAGGAAATATGTGCTTTGCTCTTTTCGCCT
ACAGTAGAATAGTAAAGCGTCTTGGAGTCAATAATATCATTTTATTTGCTCCGCTATGTTTCTTAAGCCTCTTTCTATTT
TGGACCTTTAAAACAACCCTAAGCATTGCTGTCCTTGCTATGGTAGTACGTGAAGGCGTTACCTACGCTCTTGATGACAA
CAACCTCCAACTACTCATCTATGGAGTCCCCAACAAAATCCGAAACCAAATTCGCATCGTAGTGGAATCCTTTATAGAAC
CTATCGGGATGTTGGTCTGGTCCTTAGTCTGTTTCTTGTCTTCTCAACAATATGTGTTCTGCCTAATCATCTCACTAATC
GCCACTATTCTGGTTTGCCTCGTACGCTCTTATTATGCGAAGGCGATTCTCAAAAATCTATCTGCACAAGCCCTACAACT
TACCCGCTCTATGCAAGATTGGATCAAATCTATGACAGTTAAACAAAAGAGACAAGTCGAACTCTTCTTACTTGCTCATC
TTAAACACCCCAGTGAGCGTCATCAAACCTTTGCTTTTCAACATCTCTTAAATCTAGCAAGCCGCAGTGTCCTTCCAAGC
CTCCTTGCCCATATGAACAAGCTCAGCCTCCCTAATAAACTCAAGACTATAGAAATGGTAAAATCTAGCTTATGGGCCAA
AGATTTTCTAACCTTAGAGCTCCTGAAACGTTGGACAAGTATTTTCCCCCATCCTGCCATCGCATCAGCAATACATCTTT
ATTTTGCAGAACACGATCTCCTACATATCACTCATATTGCTGAAGACCTCTATGATACTGTTGGTGATAGACTTCTTGCC
GCAATTCTTACAGTAAGAAGACAGGAAGCTTATGGGCCCTATCGAGACCTTGCAGACAAGCGCCTGAAAGAACTACTCAA
CTCGGATCAACCTGAAGATATAGTCATGGGGTTGACCATACTGAAATTAGAAAAGAATCCACAGAACTTCCCAATTCTTT
TAGACTTCTTGAACACCAAAAACGAAGATATCTTAATTGTCACCTGCAAAGCCCTACACACTTCTGTTAGAGCTAATCAT
AAACCTTATTGCCCCGAACTTCTGAAAAGACTACGACAATGCTCGCATAATGATGAAGCAAGTCAATATCTATTAAAAAC
AATTAGCATTGCTTTAGATATCTCATTCGTAAAAGACTTACTGATGACAACATCACAACTAAAAAACACCTCTAGAAAAT
ATGCTGAGGCTATGATTGGAGAGTTGGATAAAGAAGTCGCCCCAGCATTTCTCCAAGTCCTCACCGATGAGGGAACACAC
AATCGTTGTCGTATCCTTGCCGCCAAAGCCCTCTGTAAAATCGATAATTGGCTGCTGAAAAAACACGCGTATAAAATTGT
GAAGTCTAAAGCAAGTAAGGCTCTGTTCTATTCCTATCACGGCCATTACATTCAAAAGAAATACCCCACATACAACCTCA
GCTTGCTGGCAAACACATTAAATTCTAATTATTATGCAGAAGTAAACTTCATGCTCTCTCTCCTAGGGATTCTTGGTTCC
ATGGAGCACTCTGGTGTACTGATTCGAGCATTAACTAGTAAAAACCAAAAAATCAAAGCACAAGCACTAGAATCTTTAGA
AAAAAACTGCGATAGCCACTTATTCTCTTTACTAGAACCCTTTGTTAATCAACCAGGCATGTGCTATAGCGAAAAATACT
ACTTCAAATGTGGTGTGATTCCTCTAACTCTTAAAGAACTTTTAAATATGATGGAAAACTCCCCATCATCTTTAAACAAA
CTAACAGCACAGCAACTCAAAGAAGAACTTTCCTATTGCGATCCAGACTTCCAATCTGTAAATACAATCTATAACCAAGA
ACATGAAGACTTCAGGACAGAGGAATCAGAAACCCTAATATCTTTCTTATCTATCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGAATTAGAATAAGTAATAGTAATTTTCTTCATACCTCCCTTGCAATTAATCACTTTGTTCTTATAAAATGTCTTCTTT
TGCTTGGGTAGGTATGGAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTCAATGATTCCAATTTAGATATCCACAGAAAAACCTTGGGAAACTGAAGATTTAAAAAATCCAAGATTGATTTATAA
GTTTCGACTGCAAGAAAAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Lipoprotein

Number of amino acids: Translated: 925; Mature: 925

Protein sequence:

>925_residues
MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGSSLILCVLSSLILYNLFKKHI
SATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRIVIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLG
DAIGSGIIASLVHTIGIQGILILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF
YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKRLGVNNIILFAPLCFLSLFLF
WTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKIRNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLI
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LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDLLHITHIAEDLYDTVGDRLLA
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KPYCPELLKRLRQCSHNDEASQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH
NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTLNSNYYAEVNFMLSLLGILGS
MEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEPFVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNK
LTAQQLKEELSYCDPDFQSVNTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI

Sequences:

>Translated_925_residues
MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGSSLILCVLSSLILYNLFKKHI
SATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRIVIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLG
DAIGSGIIASLVHTIGIQGILILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF
YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKRLGVNNIILFAPLCFLSLFLF
WTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKIRNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLI
ATILVCLVRSYYAKAILKNLSAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS
LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDLLHITHIAEDLYDTVGDRLLA
AILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTILKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANH
KPYCPELLKRLRQCSHNDEASQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH
NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTLNSNYYAEVNFMLSLLGILGS
MEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEPFVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNK
LTAQQLKEELSYCDPDFQSVNTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI
>Mature_925_residues
MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGSSLILCVLSSLILYNLFKKHI
SATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRIVIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLG
DAIGSGIIASLVHTIGIQGILILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF
YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKRLGVNNIILFAPLCFLSLFLF
WTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKIRNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLI
ATILVCLVRSYYAKAILKNLSAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS
LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDLLHITHIAEDLYDTVGDRLLA
AILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTILKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANH
KPYCPELLKRLRQCSHNDEASQYLLKTISIALDISFVKDLLMTTSQLKNTSRKYAEAMIGELDKEVAPAFLQVLTDEGTH
NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTLNSNYYAEVNFMLSLLGILGS
MEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEPFVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNK
LTAQQLKEELSYCDPDFQSVNTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 105604; Mature: 105604

Theoretical pI: Translated: 8.57; Mature: 8.57

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
2.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGS
CHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCH
SLILCVLSSLILYNLFKKHISATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
VIWSLTILSYTSFWGFVDQFFNLQDGKRHFCIFNAIIFLGDAIGSGIIASLVHTIGIQGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LILFTAALVLTFPIVFYVSKSLKSLSDDHDLFIDTGHPPPLSKALKLCFYDKYTFYLLCF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKR
HHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGVNNIILFAPLCFLSLFLFWTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKI
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHH
RNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLIATILVCLVRSYYAKAILKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAQALQLTRSMQDWIKSMTVKQKRQVELFLLAHLKHPSERHQTFAFQHLLNLASRSVLPS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLAHMNKLSLPNKLKTIEMVKSSLWAKDFLTLELLKRWTSIFPHPAIASAIHLYFAEHDL
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCH
LHITHIAEDLYDTVGDRLLAAILTVRRQEAYGPYRDLADKRLKELLNSDQPEDIVMGLTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEE
LKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANHKPYCPELLKRLRQCSHNDEA
EEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHH
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHH
NSNYYAEVNFMLSLLGILGSMEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNKLTAQQLKEELSYCDPDFQSV
HHCCCCCEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI
HHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MQRVLRLLFNLHHGEEKRAFLFFLLGLVWGIGCYGTLSLAEGLFIEKLGSAELPKIYLGS
CHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCH
SLILCVLSSLILYNLFKKHISATALFLIPVSLSILCNFYLILSSIFAIDPPRSPLFFYRI
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YFLMQLLAIATEFNYLKIFEIQFASKEEFELVAHIGKCSLWISLGNMCFALFAYSRIVKR
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LGVNNIILFAPLCFLSLFLFWTFKTTLSIAVLAMVVREGVTYALDDNNLQLLIYGVPNKI
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEECCHHH
RNQIRIVVESFIEPIGMLVWSLVCFLSSQQYVFCLIISLIATILVCLVRSYYAKAILKNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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LKLEKNPQNFPILLDFLNTKNEDILIVTCKALHTSVRANHKPYCPELLKRLRQCSHNDEA
EEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHH
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NRCRILAAKALCKIDNWLLKKHAYKIVKSKASKALFYSYHGHYIQKKYPTYNLSLLANTL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHH
NSNYYAEVNFMLSLLGILGSMEHSGVLIRALTSKNQKIKAQALESLEKNCDSHLFSLLEP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVNQPGMCYSEKYYFKCGVIPLTLKELLNMMENSPSSLNKLTAQQLKEELSYCDPDFQSV
HHCCCCCEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NTIYNQEHEDFRTEESETLISFLSI
HHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA