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Definition Chlamydophila pneumoniae AR39, complete genome.
Accession NC_002179
Length 1,229,853

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Identifier: 16752314

GI number: 16752314

Start: 28270

End: 30708

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: CP0020

Alternate gene names: NA

Gene position: 28270-30708 (Clockwise)

Preceding gene: 16752312

Following gene: 16752315

Centisome position: 2.3

GC content: 41.37

Gene sequence:

>2439_bases
ATGCATTCTTTTGCACAAAGACACAGGGAATCTTTAGAACATATCGCTAATTATGAGAAGACTACAGCGGAACGTGACAT
ACTAAAACGGTTGATCGAAGTTTTGGATCAGAGGGCGAGCGAGCGCTACCGCTCTGCCGTCGAGAAGCTACACAAATATG
AAGTGGAGCGTGCGACAGTAGCGAAGTCTATTCCTGTGGCAGCCATTCATGAGAAACCTCTTTCCTCTACACATGCATCT
GTTCAGGTTACAGCAAGTACGCCAGCAGCTACAGGATCTGGAGTCGGGGCCTATTATAACGCAGTAAAACAGAAGTGGGC
GCAAGATCTTATCGTTGAGCTTAATACGGTTATGACCACTATCATGGCCTCAGTTAATAGTAAGAATCCTGCAAATAAAG
ATGTCTTTGATAAATTAAATACTGAACTTCAGGCTTTAGTCGCTGCGGGGAATAATTTAACAGAAGAGAATTTTCAGACT
CTCTACAATTTCCCAGAGGAGATCTTCACTGCAATCCAACGAGCAGATACGTTTACTGGGGGAATGAAAACAGACTTTAC
GAACCAGTTGGCAGGCAAATATGGAAATCAAGCTACTTTAACTCAAACGTTTGCAGACGGTAGAGTCGAAGGGTTCAAAG
ACATCCTTACAGCGGTACAAGGAGTCCTTACACCAGAGCAGTTTACTATCTTTGCTGAGATTGCGACAGAGCTGCAGGCT
TTAGCAGATCATGTAGGTAATTTTGATGAAGCAGGATTACAACGGATTGAGGATGCTGGAGAAAAACTCGCCGCAGTCAT
TAATTCTTCTGACCTGACTAGAAATGATAAAATTATGTTCTGTCAACATATAACAGACTTATACTCAGATCAAGTTGCGG
CTTTAGGATCCTTTGATACGGTACTTGATGCAAGTATCTATGTTAACCAGCATCAAGGAACGATGTTTTCCAATTTGTCT
AGCTTTGTTGGCTCTTTAATTGGAACTTTTGCTCCAATTGATCTGAGTTCCTCTCAAGGTGATATTAGTAGTGCGGCTTT
AGCTGGAGCTCTACAAACAGCCCGAGGGTTAAATTCTCGTTTCAATGAGTTAACTGCTGAGCAACAGAAACTGATTAATG
AGTGTATAAAATCTTTGGTTACCTTTAAGTGTGGTGAGCACCTTGGTGCTATCTGGGCTTATTTTACAGCATCTACTGTA
GTTGCTTTAAACCCTACTGCAACCATGGACCACGTTAAAGCTGCTATCCTTGAAGAAGCTAAAGAATTAGATAACTCTAG
TTTTCAGTTAGCATCATCTATAAAATCCGCGATGACTTCAATTGTAAATTCAAGCGGTTCCTTTTCCGTAACGGTGAACT
CAAGTACCTTACAATATACTATATATTCTGAGAAAAACGGCAAAGTTGAGATTAATCAAATCCTGTTAAATTATGGATCT
ACAGGATTTTTGCCAGAAATTACGAAACTAGCAAAAACAAACGCCGAATCTACGGCACGAAGTTATTTTCGGTTTAAGGC
TCTTGCTGCTGTAGAATCAGAAAATGTACAGAACAAAATCGAAGATCTTCAGAGTCAATTGCAACAATTCACCAATATGA
AAACAGAACTGTTTGATGGGCAATTGTTATCACAGGCTAGTGAATTACGGGCTCTCCCCCTACCTTCGGCAGTCGCCTCT
GTGTTGATCGATCGTTATATGCCTAAAGAGGTCGATTATCTAAATGAAATCTATAAGAAGCTATATTATAGCAACTTAGG
ATCTTCTGTCGGAAATTCCATTATTGATGCGATTTCTCAATATGTCAATGGAGCTACGTATTTCAATTTTGCTAGTTATG
TGGGACAACAGCCGGCAGTAGGTGCTGGGGGAGCGAATGCCTTCCCAGGATCTCAAGAAAGCGCTCAGGCAAAGTTGGAT
CAGGAGCGAAAGCAAGCTGCTTTGTATCTCCAAGAAACACGGGGAGCTCTTACAGTTATTGAAGAACAAAGAGCTAGAGT
GCTTAAAGATGATAAAATCACGAATGAGCAGCGCTCCACGATTTTAGATTCCTTAAGGAACTACGAGGACAACATCAATT
CTATCTCAGGTTCTTTAGTGTTATTGCAAAATTACTTACAGCCTTTGTCTATAGCTGGAGGTTCTGTAGCAGGAACTTTT
GAAGTTAAAGAGGGGCAAGAGCAATGGCAAGCGCGATTGCAGATTCTTGAAGAAGCTTTAGTGTCCGGGTTAGTAGGAAA
TATGATTAATGGGGGTATGTTCCCACTGCAATCTACAATACAGTCAGACCAGCAATCTTTTGCGGATATGGGACAGAACT
TCCAGTTAGATTTGCAGATGCACCTGACTTCTATGCAGCAGGAGTGGACTGTAGTCGCGACTTCTCTACAGCTTTTAAAT
CAAATGTACTTAAGTTTAGCACGAAGCCTGACAGGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTAATTAAAAATAACACTGTTCTTATCTAAGCAGACATTGATATGATTTATAGCACTTCTATTTCAACATTTTATAAAA
AACTCTCTCTAGTGTCTTCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTCAATTTCTAAACTTGGATTTCTAAATCTTAAAAAAATTTTAATCTTGCGGAGATGTTGGCATGTTTTTCGCTCCT
CTTCTTTATGAATCGTTACG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 812; Mature: 812

Protein sequence:

>812_residues
MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHAS
VQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQT
LYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA
LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLS
SFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTV
VALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS
TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVAS
VLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLD
QERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF
EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLN
QMYLSLARSLTG

Sequences:

>Translated_812_residues
MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHAS
VQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQT
LYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA
LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLS
SFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTV
VALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS
TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVAS
VLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLD
QERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF
EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLN
QMYLSLARSLTG
>Mature_812_residues
MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATVAKSIPVAAIHEKPLSSTHAS
VQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTTIMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQT
LYNFPEEIFTAIQRADTFTGGMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA
LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDTVLDASIYVNQHQGTMFSNLS
SFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSRFNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTV
VALNPTATMDHVKAAILEEAKELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS
TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDGQLLSQASELRALPLPSAVAS
VLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQYVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLD
QERKQAALYLQETRGALTVIEEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF
EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQMHLTSMQQEWTVVATSLQLLN
QMYLSLARSLTG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88903; Mature: 88903

Theoretical pI: Translated: 4.75; Mature: 4.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTT
HHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTG
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
GMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA
CCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDT
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
VLDASIYVNQHQGTMFSNLSSFVGSLIGTFAPIDLSSSQGDISSAALAGALQTARGLNSR
HHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH
KELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCEEEEEEEECCCCCEEHHHHHHHCCC
TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDG
CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCC
QLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQ
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
YVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVI
HHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
EEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQM
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH
HLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MHSFAQRHRESLEHIANYEKTTAERDILKRLIEVLDQRASERYRSAVEKLHKYEVERATV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKSIPVAAIHEKPLSSTHASVQVTASTPAATGSGVGAYYNAVKQKWAQDLIVELNTVMTT
HHCCCHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMASVNSKNPANKDVFDKLNTELQALVAAGNNLTEENFQTLYNFPEEIFTAIQRADTFTG
HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
GMKTDFTNQLAGKYGNQATLTQTFADGRVEGFKDILTAVQGVLTPEQFTIFAEIATELQA
CCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LADHVGNFDEAGLQRIEDAGEKLAAVINSSDLTRNDKIMFCQHITDLYSDQVAALGSFDT
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
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FNELTAEQQKLINECIKSLVTFKCGEHLGAIWAYFTASTVVALNPTATMDHVKAAILEEA
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KELDNSSFQLASSIKSAMTSIVNSSGSFSVTVNSSTLQYTIYSEKNGKVEINQILLNYGS
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TGFLPEITKLAKTNAESTARSYFRFKALAAVESENVQNKIEDLQSQLQQFTNMKTELFDG
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QLLSQASELRALPLPSAVASVLIDRYMPKEVDYLNEIYKKLYYSNLGSSVGNSIIDAISQ
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YVNGATYFNFASYVGQQPAVGAGGANAFPGSQESAQAKLDQERKQAALYLQETRGALTVI
HHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
EEQRARVLKDDKITNEQRSTILDSLRNYEDNINSISGSLVLLQNYLQPLSIAGGSVAGTF
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE
EVKEGQEQWQARLQILEEALVSGLVGNMINGGMFPLQSTIQSDQQSFADMGQNFQLDLQM
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHH
HLTSMQQEWTVVATSLQLLNQMYLSLARSLTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA