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Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13357890

GI number: 13357890

Start: 376048

End: 377031

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: UU330

Alternate gene names: NA

Gene position: 376048-377031 (Clockwise)

Preceding gene: 13357889

Following gene: 13357893

Centisome position: 50.03

GC content: 23.78

Gene sequence:

>984_bases
ATGAATTCAAGATTTAAATTTAACTATGATATAAATAATAAATTAGCATTATCCTTTACAAAGGATTTAATTGCTAATAA
AAAGCAAAAAAATAAAAAAAAATTTTTGCTTTTTTTATTTCCCTTTTATCCTTTAAAACTTTTTAAAACGATTAATTTAA
TCGTGGTTTTTGCTGTTTTAGTTGCAATTCGTTTAGGAATGGGATTTTTACATATTAAAATTCCTGGTTTTAATATGGTT
ATTTCTTTTACATGAATGGCATTAATGGTTTTAGGGTGGTATTTTGGACCATTAATTGGAATATTTGCTGGATTTTTAGT
TGATACTTTAGCATGATTAATTAGTGGTGGAATTTGGTTTTGAATGTATGCTATTCAAGAACCTATTGTAGGCTTTATTG
CTGGATTTCTAGGATCTGTAGCTACATTAAGAAAAAAAACTAAACGACCAATAATTGATCTAATAGTTAATCAAATCTTT
ATTTTATTTTTTAGTATATTAACATTGTTTATGATTTTGACCTTAGTTAATGATGGTAAAAACTCCTTATTTAGCATTCT
TAAAAAACGTGATAAAGAAATTAATGAAGATTGAATTAGTATTTTTAAATATTTAGCAATCGCTTTTTTAGCTACATTTG
TTTTGCTTGTTGAAGCTTTTGTTATCATTTATTATTTACGTAATAGAAATCGTTCAAAAGTACAGTTAATTAATTTTATT
TATTGCTCATTATTAGTAATTTTTTCAACAATGTTATTTTCGTTTGCACTAGGACCTTACGTAAGTGTAGCGTATTTAAA
ATATATAAAAGTCCCAATTACGAATTATTTAAAATACGGAGTTAATTACTATTTATTACCACGCATTATTAAAGAAAGCA
TTAAAACACCAATTTATATCATTTTATTATCTTCAATAATTAGTGCATTTGATTATGTCTTTCTAAATATTAAGCAAATT
AATATGCACAAATGAAAACATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTATTACAAGAAATTCATGATGATATTTTAACAGGTAAAATTGATCCTAATACATATTTAAGAACAAAAAATCCCTTTA
GAGACTTGTTTGGTTTTTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATACACTTTTGAAGGTATAAAATATAATCATAAGTTTTAAAAGAGAGATAAATGATAGTAGTTTATGGATTCTAAAAA
ATTTAATGATTTAGATTTAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 327; Mature: 327

Protein sequence:

>327_residues
MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVLVAIRLGMGFLHIKIPGFNMV
ISFTWMALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLAWLISGGIWFWMYAIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIF
ILFFSILTLFMILTLVNDGKNSLFSILKKRDKEINEDWISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFI
YCSLLVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLSSIISAFDYVFLNIKQI
NMHKWKH

Sequences:

>Translated_327_residues
MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVLVAIRLGMGFLHIKIPGFNMV
ISFT*MALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLA*LISGGIWF*MYAIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIF
ILFFSILTLFMILTLVNDGKNSLFSILKKRDKEINED*ISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFI
YCSLLVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLSSIISAFDYVFLNIKQI
NMHK*KH
>Mature_327_residues
MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVLVAIRLGMGFLHIKIPGFNMV
ISFT*MALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLA*LISGGIWF*MYAIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIF
ILFFSILTLFMILTLVNDGKNSLFSILKKRDKEINED*ISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFI
YCSLLVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLSSIISAFDYVFLNIKQI
NMHK*KH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR009825 [H]

Pfam domain/function: PF07155 DUF1393 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 37094; Mature: 37094

Theoretical pI: Translated: 10.55; Mature: 10.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVL
CCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCHHCCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAIRLGMGFLHIKIPGFNMVISFTMALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLALISGGIWFMY
HHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
AIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIFILFFSILTLFMILTLVNDGKNSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
FSILKKRDKEINEDISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFIYCSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SIISAFDYVFLNIKQINMHKKH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVL
CCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCHHCCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAIRLGMGFLHIKIPGFNMVISFTMALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLALISGGIWFMY
HHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
AIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIFILFFSILTLFMILTLVNDGKNSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
FSILKKRDKEINEDISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFIYCSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SIISAFDYVFLNIKQINMHKKH
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8675025; 8948633 [H]